竹林慎一郎 (Shin-ichiro Takebayashi) - マイポータル

基本情報

所属: 三重大学大学院生物資源学研究科教授

学位: 博士（学術）(三重大学)

研究者番号: 50392022
ORCID ID: https://orcid.org/0000-0002-1968-9800
J-GLOBAL ID: 200901059637615923
researchmap会員ID: 5000101500

外部リンク: http://kyoin.mie-u.ac.jp/profile/2922.html

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研究分野

経歴

2023年8月 - 現在

三重大学, 大学院生物資源学研究科, 教授
2017年5月 - 現在

国立研究開発法人理化学研究所, 客員研究員（兼任）
2019年3月 - 2023年7月

三重大学, 大学院生物資源学研究科, 准教授
2014年4月 - 2019年2月

三重大学, 大学院医学系研究科, 講師
2013年5月 - 2014年3月

熊本大学, 大学院先導機構, 特任助教
2012年7月 - 2013年4月

熊本大学, 発生医学研究所, 研究員
2007年10月 - 2012年6月

米国フロリダ州立大学, 生物科学部門, ポストドクトラルフェロー
2002年4月 - 2007年9月

独立行政法人理化学研究所, 発生再生科学総合研究センター, 研究員
1999年4月 - 2002年3月

独立行政法人日本学術振興会, 特別研究員 (DC1)

学歴

1999年4月 - 2002年3月

三重大学大学院, 生物資源学研究科, 生物機能応用化学専攻
1997年4月 - 1999年3月

三重大学大学院, 生物資源学研究科, 生物資源利用学専攻
1993年4月 - 1997年3月

三重大学, 生物資源学部, 生物資源学科農芸化学コース

論文

Embryonic genome instability upon DNA replication timing program emergence.

Saori Takahashi, Hirohisa Kyogoku, Takuya Hayakawa, Hisashi Miura, Asami Oji, Yoshiko Kondo, Shin-Ichiro Takebayashi, Tomoya S Kitajima, Ichiro Hiratani

Nature 2024年8月28日
Reorganization of the DNA replication landscape during adipogenesis is closely linked with adipogenic gene expression.

Takuya Hayakawa, Asahi Yamamoto, Taiki Yoneda, Sakino Hori, Nanami Okochi, Kazuhiro Kagotani, Katsuzumi Okumura, Shin-Ichiro Takebayashi

Journal of cell science 136(2) 2023年1月15日
scRepli-Seq: A Powerful Tool to Study Replication Timing and Genome Instability.

Megumi Sakamoto, Sakino Hori, Asahi Yamamoto, Taiki Yoneda, Kenji Kuriya, Shin-Ichiro Takebayashi

Cytogenetic and genome research 162(4) 161-170 2022年
The Temporal Order of DNA Replication Shaped by Mammalian DNA Methyltransferases.

Shin-Ichiro Takebayashi, Tyrone Ryba, Kelsey Wimbish, Takuya Hayakawa, Morito Sakaue, Kenji Kuriya, Saori Takahashi, Shin Ogata, Ichiro Hiratani, Katsuzumi Okumura …

Cells 10(2) 2021年1月29日
Camptothecin-Induced Replication Stress Affects DNA Replication Profiling by E/L Repli-Seq.

Takuya Hayakawa, Rino Suzuki, Kazuhiro Kagotani, Katsuzumi Okumura, Shin-Ichiro Takebayashi

Cytogenetic and genome research 161(8-9) 437-444 2021年
Mapping replication timing domains genome wide in single mammalian cells with single-cell DNA replication sequencing.

Hisashi Miura, Saori Takahashi, Takahiro Shibata, Koji Nagao, Chikashi Obuse, Katsuzumi Okumura, Masato Ogata, Ichiro Hiratani, Shin-Ichiro Takebayashi

Nature protocols 15(12) 4058-4100 2020年12月
The NSD2/WHSC1/MMSET methyltransferase prevents cellular senescence-associated epigenomic remodeling.

Hiroshi Tanaka, Tomoka Igata, Kan Etoh, Tomoaki Koga, Shin-Ichiro Takebayashi, Mitsuyoshi Nakao

Aging cell 2020年6月22日査読有り
Single-cell DNA replication profiling identifies spatiotemporal developmental dynamics of chromosome organization.

Hisashi Miura, Saori Takahashi, Rawin Poonperm, Akie Tanigawa, Shin-Ichiro Takebayashi, Ichiro Hiratani

Nature genetics 51(9) 1356-1368 2019年9月査読有り
DNAメチル化解析によるヒト椎間板変性の分子生物学的機序

明田浩司, 生野彰宏, 岩崎竜也, 須藤隆夫, 山田淳一, 竹上徳彦, 竹林慎一郎, 島岡要, 奥村克純, 須藤啓広

日本整形外科学会雑誌 93(8) S1779-S1779 2019年9月
ゲノムワイドなDNAメチル化状態の変化はヒト椎間板変性に関与する

明田浩司, 生野彰宏, 竹林慎一郎, 奥村克純, 島岡要, 岩崎竜也, 須藤隆夫, 佐野友彦, 竹上徳彦, 須藤啓広

日本整形外科学会雑誌 93(3) S1177-S1177 2019年3月
ヒト椎間板変性に対するエピジェネティクスの関与ゲノムワイドDNAメチル化解析

明田浩司, 生野彰宏, 竹林慎一郎, 奥村克純, 島岡要, 岩崎竜也, 須藤隆夫, 竹上徳彦, 須藤啓広

Journal of Spine Research 10(3) 157-157 2019年3月
Genome-wide stability of the DNA replication program in single mammalian cells.

Saori Takahashi, Hisashi Miura, Takahiro Shibata, Koji Nagao, Katsuzumi Okumura, Masato Ogata, Chikashi Obuse, Shin-Ichiro Takebayashi, Ichiro Hiratani

Nature genetics 51(3) 529-540 2019年3月査読有り
Genome-wide analysis of DNA methylation profile identifies differentially methylated loci associated with human intervertebral disc degeneration.

Akihiro Ikuno, Koji Akeda, Shin-Ichiro Takebayashi, Motomu Shimaoka, Katsuzumi Okumura, Akihiro Sudo

PloS one 14(9) e0222188 2019年査読有り
ヒト椎間板変性に対するゲノムワイドDNAメチル化解析

生野彰宏, 明田浩司, 竹林慎一郎, 島岡要, 須藤啓広, 奥村克純

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 91回 [2P-235] 2018年9月
ヒト椎間板変性に対するゲノムワイドDNAメチル化解析

明田浩司, 生野彰宏, 竹林慎一郎, 奥村克純, 島岡要, 須藤隆夫, 佐野友彦, 竹上徳彦, 須藤啓広

日本整形外科学会雑誌 92(8) S1885-S1885 2018年8月
Mapping mammalian replication domains using the ion torrent semiconductor sequencing platform.

Takebayashi, S. I, Ogata, S, Ogata, M, Okumura, K

Biosci. Biotechnol. Biochem. 82 2098-2100 2018年査読有り
Correlation between histone acetylation and expression of Notch1 in human lung carcinoma and its possible role in combined small-cell lung carcinoma

Wael Abdo Hassan, Shin-Ichiro Takebayashi, Mohamed Osama Ali Abdalla, Kosuke Fujino, Shinji Kudoh, Yamoto Motooka, Yonosuke Sato, Yoshiki Naito, Koichi Higaki, Joeji Wakimoto …

LABORATORY INVESTIGATION 97(8) 913-921 2017年8月査読有り
Anatomy of Mammalian Replication Domains

Shin-ichiro Takebayashi, Masato Ogata, Katsuzumi Okumura

GENES 8(4) E110 2017年4月査読有り
The SETD8/PR-Set7 Methyltransferase Functions as a Barrier to Prevent Senescence-Associated Metabolic Remodeling

Hiroshi Tanaka, Shin-ichiro Takebayashi, Akihisa Sakamoto, Tomoka Igata, Yuko Nakatsu, Noriko Saitoh, Shinjiro Hino, Mitsuyoshi Nakao

CELL REPORTS 18(9) 2148-2161 2017年2月査読有り
Direct visualization of replication dynamics in early zebrafish embryos

Kenji Kuriya, Eriko Higashiyama, Eriko Avsar-Ban, Nanami Okochi, Kaede Hattori, Shin Ogata, Shin-ichiro Takebayashi, Masato Ogata, Yutaka Tamaru, Katsuzumi Okumura

BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY 80(5) 945-948 2016年5月査読有り

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MISC

メチル化CpG結合蛋白質PCM1 isoformによる遺伝子の不活性化

藤田直之, 竹林慎一郎, 奥村克純, 佐谷秀行, 中尾光善

日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 21 225-225 1998年12月1日
HL60細胞におけるSNRPN遺伝子の核内配置

野上正弘, 香田淳, 竹林慎一郎, 奥村克純, 田口寛, 中尾光善, 池村淑道

日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 21 476-476 1998年12月1日

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

栄養膜巨細胞に内在するゲノムコピー数調節原理の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2024年6月 - 2027年3月

竹林慎一郎
潜在的不安定性から読み解くゲノム設計原理

科学技術振興機構戦略的創造研究推進事業 CREST 2024年4月 - 2026年3月

平谷伊智朗, 京極博久, 近藤周, 白井温子, 炭竈享司, 竹林慎一郎
遺伝子の機能的発現を可能にするクロマチンドメインの構築原理解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2022年4月 - 2025年3月

竹林慎一郎
動物細胞染色体の構築原理とその制御機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2021年4月 - 2024年3月

奥村克純, 竹林慎一郎, 栗谷健志
非ゲノム複製の破綻がもたらすDNA損傷メカニズムの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2020年4月 - 2022年3月

竹林慎一郎
In vivo単一細胞解析から明らかにする染色体機能ドメインの可塑性とその意義

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2019年4月 - 2022年3月

竹林慎一郎, 平谷伊智朗
肥満と老化による代謝変化を慢性炎症に変換する新規病態制御機構の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2017年4月 - 2020年3月

緒方正人, 竹林慎一郎, 大隈貞嗣
染色体機能ドメイン制御の可塑性とその意義

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2016年4月 - 2018年3月

竹林慎一郎
がん抑制遺伝子Rbによるミトコンドリア代謝制御を介した腫瘍抑制メカニズムの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 若手研究(B) 2014年4月 - 2016年3月

竹林慎一郎
胚発生におけるゲノムDNAメチル化の機能と調節機構

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究特定領域研究 2003年 - 2007年

岡野正樹, 竹林慎一郎, 小田昌朗
動物細胞ゲノムの核内構造と遺伝子の機能的発現に関する研究

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 1999年 - 2001年

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