小林牧 (Maki Kobayashi) - マイポータル

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所属: 京都大学大学院医学研究科特定准教授

J-GLOBAL ID: 200901028486302917
researchmap会員ID: 5000101964

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ライフサイエンス / 医化学 /

論文

Ago2 and a miRNA reduce Topoisomerase 1 for enhancing DNA cleavage in antibody diversification by activation-induced cytidine deaminase

Maki Kobayashi, Hiroyuki Wakaguri, Masakazu Shimizu, Koichiro Higasa, Fumihiko Matsuda, Tasuku Honjo

Proceedings of the National Academy of Sciences 120(18) e2216918120 2023年4月24日査読有り筆頭著者責任著者
Necessity of HuR/ELAVL1 for the activation-induced cytidine deaminase-dependent decrease in topoisomerase 1 in antibody diversification

Wajid Amin, Shoki Nishio, Tasuku Honjo, Maki Kobayashi

International Immunology 2023年4月22日査読有り筆頭著者最終著者
SAMHD 1‐mediated dNTP degradation is required for efficient DNA repair during antibody class switch recombination

Afzal Husain, Jianliang Xu, Hodaka Fujii, Mikiyo Nakata, Maki Kobayashi, Ji‐Yang Wang, Jan Rehwinkel, Tasuku Honjo, Nasim A Begum

The EMBO Journal 39(15) 2020年8月3日
RNA-binding motifs of hnRNP K are critical for induction of antibody diversification by activation-induced cytidine deaminase

Ziwei Yin, Maki Kobayashi, Wenjun Hu, Koichi Higashi, Nasim A. Begum, Ken Kurokawa, Tasuku Honjo

Proceedings of the National Academy of Sciences 117(21) 11624-11635 2020年5月26日査読有り筆頭著者
Native Co-immunoprecipitation Assay to Identify Interacting Partners of Chromatin-associated Proteins in Mammalian Cells

Afzal Husain, Nasim Begum, Maki Kobayashi, Tasuku Honjo

BIO-PROTOCOL 10(23) 2020年
Apurinic/apyrimidinic endonuclease 1 (APE1) is dispensable for activation-induced cytidine deaminase (AID)-dependent somatic hypermutation in the immunoglobulin gene

Helena Islam, Maki Kobayashi, Tasuku Honjo

International Immunology 31(8) 543-554 2019年7月30日査読有り筆頭著者
Depletion of recombination-specific cofactors by the C-terminal mutant of the activation-induced cytidine deaminase causes the dominant negative effect on class switch recombination

Azza Al Ismail, Afzal Husain, Maki Kobayashi, Tasuku Honjo, Nasim A Begum

International Immunology 29(11) 525-537 2017年12月30日
The novel activation-induced deoxycytidine deaminase (AID) mutants, AIDv and AIDvΔ15 are defective in SHM and CSR

Maki Kobayashi, Misao Takemoto, Tasuku Honjo

DNA Repair 53 1-3 2017年5月筆頭著者
Chromatin remodeller SMARCA4 recruits topoisomerase 1 and suppresses transcription-associated genomic instability

Husain Afzal, Begum Nasim A., Taniguchi Takako, Taniguchi Hisaaki, Kobayashi Maki, Honjo Tasuku

Nature Communications 7(1) 2016年4月
LSD1/KDM1A promotes hematopoietic commitment of hemangioblasts through downregulation of Etv2

Takeuchi Miki, Fuse Yuji, Watanabe Mana, Andrea Christina-Sylvia, Takeuchi Miho, Nakajima Hitomi, Ohashi Ken, Kaneko Hiroshi, Kobayashi-Osaki Maki, Yamamoto Masayuki …

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 112(45) 13922-13927 2015年11月10日
Molecular Mechanisms of AID Function

Nasim A. Begum, Hitoshi Nagaoka, Maki Kobayashi, Tasuku Honjo

Molecular Biology of B Cells 305-344 2015年
APE1 is dispensable for S-region cleavage but required for its repair in class switch recombination

Jianliang Xu, Afzal Husain, Wenjun Hu, Tasuku Honjo, Maki Kobayashi

Proceedings of the National Academy of Sciences 111(48) 17242-17247 2014年12月2日最終著者
Activation-induced cytidine deaminase is dispensable for virus-mediated liver and skin tumor development in mouse models

Tung Nguyen, Jianliang Xu, Shunsuke Chikuma, Hiroshi Hiai, Kazuo Kinoshita, Kyoji Moriya, Kazuhiko Koike, Gian Paolo Marcuzzi, Herbert Pfister, Tasuku Honjo …

International Immunology 26(7) 397-406 2014年7月最終著者
C-terminal region of activation-induced cytidine deaminase (AID) is required for efficient class switch recombination and gene conversion

Somayeh Sabouri, Maki Kobayashi, Nasim A. Begum, Jianliang Xu, Kouji Hirota, Tasuku Honjo

Proceedings of the National Academy of Sciences 111(6) 2253-2258 2014年2月11日
GATA factor switching from GATA2 to GATA1 contributes to erythroid differentiation

Mikiko Suzuki, Maki Kobayashi-Osaki, Shuichi Tsutsumi, Xiaoqing Pan, Shin'ya Ohmori, Jun Takai, Takashi Moriguchi, Osamu Ohneda, Kinuko Ohneda, Ritsuko Shimizu …

Genes to Cells 18(11) 921-933 2013年11月
In Vivo Analysis of Aicda Gene Regulation: A Critical Balance between Upstream Enhancers and Intronic Silencers Governs Appropriate Expression

Le Thi Huong, Maki Kobayashi, Mikiyo Nakata, Go Shioi, Hitoshi Miyachi, Tasuku Honjo, Hitoshi Nagaoka

PLoS ONE 8(4) 2013年4月16日査読有り
An Evolutionary View of the Mechanism for Immune and Genome Diversity

Lucia Kato, Andre Stanlie, Nasim A. Begum, Maki Kobayashi, Masatoshi Aida, Tasuku Honjo

JOURNAL OF IMMUNOLOGY 188(8) 3559-3566 2012年4月査読有り
The AID dilemma: infection, or cancer?

Honjo Tasuku, Kobayashi Maki, Begum Nasim, Kotani Ai, Sabouri Somayeh, Nagaoka Hitoshi

Advances in cancer research 113 1-44 2012年査読有り
The AID Dilemma: Infection, or Cancer?

Tasuku Honjo, Maki Kobayashi, Nasim Begum, Ai Kotani, Somayeh Sabouri, Hitoshi Nagaoka

ADVANCES IN CANCER RESEARCH, VOL 113 113 1-44 2012年査読有り
Decrease in topoisomerase I is responsible for activation-induced cytidine deaminase (AID)-dependent somatic hypermutation

M. Kobayashi, Z. Sabouri, S. Sabouri, Y. Kitawaki, Y. Pommier, T. Abe, H. Kiyonari, T. Honjo

Proceedings of the National Academy of Sciences 108(48) 19305-19310 2011年11月29日査読有り筆頭著者

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MISC

Preventing AID, a physiological mutator, from deleterious activation : regulation of the genomic instability that is associated with antibody diversity

NAGAOKA Hitoshi, TRAN Thinh Huy, KOBAYASHI Maki, AIDA Masatoshi, HONJO Tasuku

International immunology 22(4) 227-235 2010年4月1日

共同研究・競争的資金等の研究課題

Bリンパ球抗体遺伝子組換えにおけるRNA濃縮体「組換え小体」の構造と機能の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2026年4月 - 2029年3月

小林牧
抗体遺伝子組換えにおけるDNAシナプトソーム形成とゲノム不安定化の分子機構

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2025年4月 - 2029年3月

本庶佑, 小林牧, Begum NasimAra
効率的な抗体遺伝子組換えにおける液ー液相分離複合体の重要性の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2022年4月 - 2025年3月

小林牧
ワクチン接種による抗体産生に必須なAID-recombinosome形成機構解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2022年4月 - 2025年3月

本庶佑, 小林牧, Begum NasimAra
AIDのRNA編集による抗体遺伝子多様化機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2019年4月 - 2022年3月

本庶佑, 小林牧, Begum NasimAra
RNA干渉による転写依存的な抗体遺伝子の不安定化機構

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2019年4月 - 2022年3月

小林牧
RNA編集を介した内因性ゲノム不安定化の分子機構

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2016年4月 - 2019年3月

小林牧
AID依存性RNA編集により誘導される、トポイソメラーゼ１を介したゲノム不安定性

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2013年4月 - 2016年3月

小林牧
ＡＩＤによるｔｏｐｏｉｓｏｍｅｒａｓｅ１を介したゲノム不安定性誘導のメカニズム

日本学術振興会科学研究費助成事業特別推進研究 2010年 - 2015年

本庶佑, 長岡仁, ベーガムナシムアラ, 小林牧
ゲノム不安定を導くトポイソメラーゼ1の小RNA分子による調節機構

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2010年 - 2012年

小林牧
ΑΙＤによる抗原刺激依存性抗体遺伝子改編機構の研究

日本学術振興会科学研究費助成事業特別推進研究 2005年 - 2009年

本庶佑, 錦織桃子, 新藏礼子, ベガムナシム, 長岡仁, 鄭一美, 小林牧, 土井知光, 新藏礼子, ベガムナシム
造血幹細胞の転写因子GATA-2の転写調節機構と発癌

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2002年 - 2004年

小林牧
造血系転写因子GATA-2の転写調節機構

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2000年 - 2001年

小林牧

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