椎村祐樹 (Yuki Shiimura) - マイポータル

基本情報

所属: 久留米大学　分子生命科学研究所遺伝情報研究部門講師
: 京都大学大学院医学研究科分子細胞情報学客員研究員

学位: 博士（医学）(久留米大学)

J-GLOBAL ID: 201901013602353265
researchmap会員ID: B000354219

研究キーワード

研究分野

経歴

2025年4月 - 現在

久留米大学, 分子生命科学研究所遺伝情報研究部門, 講師
2017年4月 - 現在

京都大学大学院医学研究科, 分子細胞情報学, 客員研究員
2017年4月 - 2025年3月

久留米大学, 分子生命科学研究所遺伝情報研究部門, 助教（任期制）
2023年6月 - 2023年12月

スタンフォード大学医学部, Kobilka研究室 (客員研究員)
2021年9月 - 2022年8月

スタンフォード大学医学部, Kobilka研究室, 客員研究員
2016年4月 - 2017年3月

京都大学大学院医学研究科分子細胞情報学, 特定研究員
2014年4月 - 2016年3月

日本学術振興会特別研究員
2009年4月 - 2011年3月

九州保健福祉大学薬学部薬学科, 助手

学歴

2011年4月 - 2015年3月

久留米大学大学院医学研究科博士課程分子生命科学専攻
2007年4月 - 2009年3月

鹿児島大学大学院医歯学総合研究科修士課程医科学専攻
2003年4月 - 2007年3月

九州保健福祉大学薬学部薬学科

委員歴

2024年7月 - 現在

日本内分泌学会, 中堅若手の会世話人
2024年10月 - 2026年7月

11th International Congress of Neuroendocrinology, ICN2026 Emerging Researchers Committee

受賞

論文

Discovery of Feeding Regulatory Peptides and The Importance of Peptide Discovery Research.

Takanori Ida, Kazuma Matsui, Sayaka Nagata, Tomoya Nakamachi, Yuki Shiimura, Takahiro Sato, Masayasu Kojima

The Kurume medical journal 2025年4月18日
How the ghrelin receptor recognizes the acyl-modified orexigenic hormone

Yuki Shiimura, Masayasu Kojima, Takahiro Sato

Frontiers in Molecular Neuroscience 18 2025年4月7日査読有り招待有り筆頭著者責任著者
Virtual library docking for cannabinoid-1 receptor agonists with reduced side effects.

Tia A Tummino, Christos Iliopoulos-Tsoutsouvas, Joao M Braz, Evan S O'Brien, Reed M Stein, Veronica Craik, Ngan K Tran, Suthakar Ganapathy, Fangyu Liu, Yuki Shiimura …

Nature communications 16(1) 2237-2237 2025年3月6日査読有り
A cryptic pocket in CB1 drives peripheral and functional selectivity.

Vipin Ashok Rangari, Evan S O'Brien, Alexander S Powers, Richard A Slivicki, Zachariah Bertels, Kevin Appourchaux, Deniz Aydin, Nokomis Ramos-Gonzalez, Juliet Mwirigi, Li Lin …

Nature 2025年3月5日査読有り
The structure and function of the ghrelin receptor coding for drug actions

Yuki Shiimura, Dohyun Im, Ryosuke Tany, Hidetsugu Asada, Ryoji Kise, Eon Kurumiya, Hideko Wakasugi-Masuho, Satoshi Yasuda, Kazuma Matsui, Jun-ichi Kishikawa …

Nature Structural & Molecular Biology 2025年3月筆頭著者責任著者
Ghrelin–LEAP2 interactions along the stomach–liver axis

Katsuya Sakai, Yuki Nakazato, Yuki Shiimura, Weidong Zhang, Masamitsu Nakazato

Endocrine Journal 2025年査読有り
Neurotransmitter recognition by human vesicular monoamine transporter 2.

Dohyun Im, Mika Jormakka, Narinobu Juge, Jun-Ichi Kishikawa, Takayuki Kato, Yukihiko Sugita, Takeshi Noda, Tomoko Uemura, Yuki Shiimura, Takaaki Miyaji …

Nature communications 15(1) 7661-7661 2024年9月16日査読有り
A µ-opioid receptor modulator that works cooperatively with naloxone.

Evan S O'Brien, Vipin Ashok Rangari, Amal El Daibani, Shainnel O Eans, Haylee R Hammond, Elizabeth White, Haoqing Wang, Yuki Shiimura, Kaavya Krishna Kumar, Qianru Jiang …

Nature 631(8021) 686-693 2024年7月査読有り
Acyl modifications in bovine, porcine, and equine ghrelins.

Takanori Ida, Hatsumi Tominaga, Eri Iwamoto, Akito Kurogi, Ayaka Okura, Kengo Shimada, Johji Kato, Atsutoshi Kuwano, Hirotaka Ode, Sayaka Nagata …

Frontiers in endocrinology 15 1411483-1411483 2024年査読有り
Structural insights into the agonists binding and receptor selectivity of human histamine H4 receptor.

Dohyun Im, Jun-Ichi Kishikawa, Yuki Shiimura, Hiromi Hisano, Akane Ito, Yoko Fujita-Fujiharu, Yukihiko Sugita, Takeshi Noda, Takayuki Kato, Hidetsugu Asada …

Nature communications 14(1) 6538-6538 2023年10月20日査読有り
Insights Into the Regulation of Offspring Growth by Maternally Derived Ghrelin.

Takahiro Sato, Takanori Ida, Yuki Shiimura, Kazuma Matsui, Kanae Oishi, Masayasu Kojima

Frontiers in endocrinology 13 852636-852636 2022年査読有り
Endogenous agonist–bound S1PR3 structure reveals determinants of G protein–subtype bias

Shintaro Maeda, Yuki Shiimura, Hidetsugu Asada, Kunio Hirata, Fangjia Luo, Eriko Nango, Nobuo Tanaka, Masayasu Toyomoto, Asuka Inoue, Junken Aoki …

Science Advances 7(24) 2021年6月査読有り
Structure of the dopamine D2 receptor in complex with the antipsychotic drug spiperone

Dohyun Im, Asuka Inoue, Takaaki Fujiwara, Takanori Nakane, Yasuaki Yamanaka, Tomoko Uemura, Chihiro Mori, Yuki Shiimura, Kanako Terakado Kimura, Hidetsugu Asada …

Nature Communications 11(1) 6442-6442 2020年12月査読有り
Structure of an antagonist-bound ghrelin receptor reveals possible ghrelin recognition mode

Yuki Shiimura, Shoichiro Horita, Akie Hamamoto, Hidetsugu Asada, Kunio Hirata, Misuzu Tanaka, Kenji Mori, Tomoko Uemura, Takuya Kobayashi, So Iwata …

Nature Communications 11(1) 4160-4160 2020年8月査読有り筆頭著者
The Crystal Structure of Angiotensin II Type 2 Receptor with Endogenous Peptide Hormone

Hidetsugu Asada, Asuka Inoue, Francois Marie Ngako Kadji, Kunio Hirata, Yuki Shiimura, Dohyun Im, Tatsuro Shimamura, Norimichi Nomura, Hiroko Iwanari, Takao Hamakubo, Osamu Kusano-Arai, Hiromi Hisano, Tomoko Uemura, Chiyo Suno, Junken Aoki, So Iwata

Structure 28(4) 418-425.e4 2020年4月査読有り
Expression of the ghrelin/growth hormone secretagogue receptor axis and its functional role in promoting tumor growth in primary central nervous system lymphomas

Hiroko Muta, Yasuo Sugita, Takuya Furuta, Yuki Shiimura, Koichi Ohshima, Kazutaka Nakashima, Kensaku Sato, Motohiro Morioka, Hideyuki Abe, Takanori Nozawa, Yukihiko Fujii, Akiyoshi Kakita

Neuropathology 40(3) 232-239 2020年1月10日査読有り
Ligand binding to human prostaglandin E receptor EP4 at the lipid-bilayer interface

Yosuke Toyoda, Kazushi Morimoto, Ryoji Suno, Shoichiro Horita, Keitaro Yamashita, Kunio Hirata, Yusuke Sekiguchi, Satoshi Yasuda, Mitsunori Shiroishi, Tomoko Shimizu …

Nature Chemical Biology 15(1) 18-26 2019年1月査読有り
Crystal structure of the human angiotensin II type 2 receptor bound to an angiotensin II analog

Hidetsugu Asada, Shoichiro Horita, Kunio Hirata, Mitsunori Shiroishi, Yuki Shiimura, Hiroko Iwanari, Takao Hamakubo, Tatsuro Shimamura, Norimichi Nomura, Osamu Kusano-Arai …

Nature Structural & Molecular Biology 25(7) 570-576 2018年7月査読有り
Regulation of the Human Ghrelin Promoter Activity by Transcription Factors, NF-kappa B and Nkx2.2

Yuki Shiimura, Hideko Ohgusu, Takahiro Sato, Masayasu Kojima

INTERNATIONAL JOURNAL OF ENDOCRINOLOGY 2015 580908 2015年査読有り筆頭著者
FABP3 and brown adipocyte-characteristic mitochondrial fatty acid oxidation enzymes are induced in beige cells in a different pathway from UCP1

Yuki Nakamura, Takahiro Sato, Yuki Shiimura, Yoshiki Miura, Masayasu Kojima

BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS 441(1) 42-46 2013年11月査読有り

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MISC

心脈管疾患の予防と治療の新戦略立体構造から探るグレリン受容体の分子認識機構と活性化機構

椎村祐樹, 林到げん, 谷猪遼介, 浅田秀基, 木瀬亮二, 松井一真, 佐藤貴弘, 岩田想, 増保生郎, 児島将康

血管 48(1) 49-49 2025年1月
構造情報に立脚したグレリン受容体アゴニストの薬理プロファイル解析

椎村祐樹, イム・ドヒョン, 谷猪遼介, 浅田秀基, 松井一真, 岩田想, 増保生郎, 児島将康

日本内分泌学会雑誌 100(3) 774-774 2024年6月
構造情報を基づいたグレリン受容体アゴニストのシグナル活性の比較

椎村祐樹, イム・ドヒョン, 谷猪遼介, 木瀬亮次, 松井一真, 浅田秀基, 岩田想, 児島将康, 増保生郎

日本内分泌学会雑誌 99(5) 1420-1420 2024年4月
グレリン受容体のリガンド認識機構および活性化機構の構造学的洞察

椎村祐樹, 椎村祐樹, IM Dohyun, 浅田秀基, 松井一真, 岩田想, 児島将康

日本薬学会年会要旨集(Web) 144th 2024年
肥満における5G(GLP-1、GIP、Glucagon、Ghrelin、Gut hormone) 基礎研究と臨床研究グレリン受容体の構造的洞察(The 5Gs in Obesity(GLP-1, GIP, Glucagon, Ghrelin and Gut hormone): Basic and Clinical Research Structural Insights into Ghrelin Receptor)

椎村祐樹, Im Dohyun, Tany Ryosuke, Asada Hidetsugu, Matsui Kazuma, Masuho Ikuo, Iwata So, Kojima Masayasu

肥満研究 29(合同学術集会抄録集) 157-157 2023年11月
グレリン受容体のリガンド認識機構の構造基盤

椎村祐樹

日本心血管内分泌代謝学会学術総会プログラム及び抄録集 27th (CD-ROM)(5) 1590-1590 2023年
臓器連関のメディエーター-生理活性ペプチド-

佐藤貴弘, 井田隆徳, 椎村祐樹, 児島将康

循環器内科 92(6) 668-674 2022年
食欲制御のコンダクター：グレリン

佐藤貴弘, 椎村祐樹, 梶谷宇, 岩田想, 児島将康

生体の科学 72(5) 485-488 2021年10月
立体構造情報に基づいた、グレリン受容体のリガンド認識機構の解明

椎村祐樹, 児島将康

血管 44(1) 58-58 2021年6月
グレリン受容体のX線結晶構造解析から分かったこと

椎村祐樹, 児島将康

亜鉛栄養治療 11(2) 258-264 2021年3月
グレリン受容体のX線結晶構造解析から分かったこと

椎村祐樹, 児島将康

亜鉛栄養治療 11(2) 258-261 2021年3月招待有り筆頭著者
Protein Crystallography: Crystal structure of an antagonist-bound ghrelin receptor.

Yuki Shiimura, So Iwata, Masayasu Kojima

Spring-8/SACLA Research Frontiers 2020 18-19 2021年筆頭著者
分泌タンパク質オクタノイル化

椎村祐樹, 佐藤貴弘, 児島将康

生体の科学 69(5) 506-507 2018年10月招待有り
グレリン受容体の立体構造を認識するモノクローナル抗体作製の試み

椎村祐樹, 堀田彰一朗, 浅田秀基, 平田邦生, 小林拓也, 岩田想, 児島将康

日本心血管内分泌代謝学会学術総会プログラム及び抄録集 22nd(4) 1573-1573 2018年
グレリンのプロモーター活性は,NF-κBおよびNkx2.2によって制御される

椎村祐樹

久留米医学会雑誌 79(1/2) 36-36 2016年
Physiological roles of ghrelin on obesity

Takahiro Sato, Takanori Ida, Yuki Nakamura, Yuki Shiimura, Kenji Kangawa, Masayasu Kojima

OBESITY RESEARCH & CLINICAL PRACTICE 8(5) E405-E413 2014年9月査読有り
グレリンとその受容体、およびグレリン脂肪酸転移酵素の比較内分泌学

椎村祐樹, 中村祐樹, 佐藤貴弘, 児島将康

比較内分泌学 39(150) 159-164 2013年8月
中枢性摂食異常症に関する調査研究熱代謝の調節におけるグレリン作用の解析

児島将康, 佐藤貴弘, 椎村祐樹, 中村祐樹, 大石佳苗

中枢性摂食異常症に関する調査研究平成24年度総括・分担研究報告書 2013年
Structure, regulation and function of ghrelin

Takahiro Sato, Yuki Nakamura, Yuki Shiimura, Hideko Ohgusu, Kenji Kangawa, Masayasu Kojima

JOURNAL OF BIOCHEMISTRY 151(2) 119-128 2012年2月査読有り
虚血性腎障害におけるセロトニンを介した活性酸素の発生

武藤純平, 椎村祐樹, 井上公博, 榎木裕紀, 岡本文恵, 春日由貴, 堀之内彩, 佐藤圭創, 比佐博彰

日本薬学会年会要旨集 132nd(3) 178-178 2012年

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講演・口頭発表等

立体構造から探るグレリン受容体の分子認識機構と活性化機構

椎村祐樹

第54回日本心脈管作動物質学会 2025年2月1日招待有り
Structural Insights into Ghrelin Receptor

椎村祐樹, 林到炫, 谷猪遼介, 浅田秀基, 松井一真, 増保生郎, 岩田想, 児島将康

第44回日本肥満学会日韓台肥満学会合同シンポジウム 2023年11月26日招待有り

担当経験のある科目(授業)

2024年8月 - 現在

Research Mind Cultivation Program
2022年4月 - 現在

生命科学 (オムニバス)
2019年4月 - 2021年3月

分子生物学 (オムニバス)

所属学協会

2024年7月 - 現在

日本心脈管作動物質学会
2024年6月 - 現在

日本薬理学会
2023年9月 - 現在

日本肥満学会
2020年 - 現在

日本心血管内分泌代謝学会
2019年 - 現在

日本神経内分泌学会
2019年 - 現在

日本薬学会
2016年 - 現在

日本内分泌学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

GPCRが細胞内シグナル因子を選択する初期会合過程の構造研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2024年4月 - 2028年3月

堤尚孝, 椎村祐樹
タンパク質工学と創薬化学の融合による次世代型GPCR標的医薬品の創出

日本医療研究開発機構 (AMED) 創薬基盤推進事業 2023年4月 - 2026年3月
グレリン受容体のシグナル伝達選択機構の構造基盤

日本学術振興会科学研究費助成事業国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B)) 2022年10月 - 2026年3月

浅田秀基, 椎村祐樹, 堤尚孝
膜結合型酵素によるグレリン活性化機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2022年4月 - 2025年3月

椎村祐樹
Gタンパク質共役型受容体のバイアスドリガンドの探索

公益財団法人小林財団第11回 (令和4年度) 研究助成 2023年3月 - 2025年3月

椎村祐樹、林到炫
グレリンの脂肪酸修飾基は、なぜグレリン受容体の活性化に必要なのか？

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2020年4月 - 2023年3月

児島将康, 椎村祐樹
創薬応用を見据えたグレリン受容体の構造基盤の構築

武田科学振興財団医学系研究助成 (基礎) 2022年 - 2023年
Cryo-EM法を用いたグレリン受容体-Gqタンパク質複合体の構造解析

日本学術振興会科学研究費助成事業国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(A)) 国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(A)) 2021年9月 - 2022年11月

椎村祐樹
グレリン受容体の結晶構造解析: なぜオクタン酸グレリンが受容体を刺激できるのか？

日本学術振興会若手研究 2018年4月 - 2021年3月

椎村祐樹
グレリン受容体発現細胞の免疫による立体構造認識抗体および機能性抗体の作出.

日本学術振興会若手研究（B） 2016年4月 - 2018年3月

椎村祐樹
グレリン受容体を活性化するモノクローナル抗体の作製と受容体結晶構造解析への応用

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2014年4月 - 2017年3月

児島将康, 椎村祐樹
GOAT及びグレリン受容体の立体構造に基づいたグレリン脂肪酸修飾・認識機構の解明.

日本学術振興会特別研究員 2014年4月 - 2016年3月

椎村祐樹
消化管幹細胞に特異的に発現するオーファン受容体LGR5のリガンド探索.

公益財団法人日本科学協会笹川科学研究助成 2012年4月 - 2013年3月

椎村祐樹

学術貢献活動

GPCR研究の多階層クロストークから創薬を考える

パネル司会・セッションチェア等

2025年3月19日

その他

スポーツファーマシスト

2025年4月 - 現在

椎村祐樹

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

委員歴

受賞

論文

MISC

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

学術貢献活動

その他

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