日下部りえ (Rie Kusakabe) - マイポータル

基本情報

所属: 関西大学化学生命工学部生命・生物工学科准教授

学位: 博士（理学）

J-GLOBAL ID: 200901001178835933
researchmap会員ID: 5000072970

広島市生まれ。関西大学化学生命工学部准教授。京都大学理学部、カリフォルニア大学バークレー校にて学部時代を過ごし、北海道大学大学院理学研究科博士課程修了、博士（理学）。専門は動物の発生生物学・進化発生学。主な実験材料はメダカで、初期胚を使った実験、遺伝子工学的な手法を使って生命の謎に迫ろうとしている。

研究キーワード

研究分野

経歴

2023年4月 - 現在

関西大学, 化学生命工学部生命・生物工学科, 准教授
2020年4月 - 2023年3月

関西大学, 化学生命工学部, 特別任用教授
2014年5月 - 2023年3月

国立研究開発法人理化学研究所, 形態進化研究チーム, 研究員
2013年4月 - 2014年4月

神戸大学, 大学院理学研究科, 理学研究科研究員
2010年4月

神戸大学理学(系)研究科(研究院), 助教
2007年11月 - 2010年3月

神戸大学, プロジェクト奨励研究員
2000年4月

?2003年３月日本学術振興会特別研究員(PD)、2003年４月?独立行政法人理化学研究所研究員

学歴

- 2000年

北海道大学, 理学研究科, 生物科学専攻

論文

円口類ヤツメウナギの遺伝子から探る脊椎動物の進化

日下部りえ

遺伝子医学 47 107-113 2024年1月
Thyroid and endostyle development in cyclostomes provides new insights into the evolutionary history of vertebrates

Wataru Takagi, Fumiaki Sugahara, Shinnosuke Higuchi, Rie Kusakabe, Juan Pascual-Anaya, Iori Sato, Yasuhiro Oisi, Nobuhiro Ogawa, Hiroshi Miyanishi, Noritaka Adachi …

BMC Biology 20(1) 2022年12月査読有り
Developmental Evolution of Hypaxial Muscles: Insights From Cyclostomes and Chondrichthyans

Rie Kusakabe, Masako Tanaka, Shigeru Kuratani

Frontiers in Cell and Developmental Biology 9 2021年9月28日査読有り
Developmental fates of shark head cavities reveal mesodermal contributions to tendon progenitor cells in extraocular muscles

Shunya Kuroda, Noritaka Adachi, Rie Kusakabe, Shigeru Kuratani

Zoological Letters 2021年2月15日査読有り
Novel developmental bases for the evolution of hypobranchial muscles in vertebrates.

Rie Kusakabe, Shinnosuke Higuchi, Masako Tanaka, Mitsutaka Kadota, Osamu Nishimura, Shigeru Kuratani

BMC biology 18(1) 120-120 2020年9月9日査読有り
Developmental mechanisms of migratory muscle precursors in medaka pectoral fin formation.

Tani-Matsuhana S, Kusakabe R, Inoue K

Development genes and evolution 2018年7月査読有り
The neural crest and evolution of the head/trunk interface in vertebrates

Shigeru Kuratani, Rie Kusakabe, Tatsuya Hirasawa

Developmental Biology 2018年査読有り
Migratory appendicular muscles precursor cells in the common ancestor to all vertebrates.

Eri Okamoto, Rie Kusakabe, Shigehiro Kuraku, Susumu Hyodo, Alexandre Robert-Moreno, Koh Onimaru, James Sharpe, Shigeru Kuratani, Mikiko Tanaka

Nature ecology & evolution 1(11) 1731-1736 2017年11月査読有り
Publisher Correction: Migratory appendicular muscles precursor cells in the common ancestor to all vertebrates.

Eri Okamoto, Rie Kusakabe, Shigehiro Kuraku, Susumu Hyodo, Alexandre Robert-Moreno, Koh Onimaru, James Sharpe, Shigeru Kuratani, Mikiko Tanaka

Nature ecology & evolution 1(11) 1784-1784 2017年11月査読有り
Developmental regulation and evolution of muscle-specific microRNAs

Rie Kusakabe, Kunio Inoue

SEMINARS IN CELL & DEVELOPMENTAL BIOLOGY 47-48 9-16 2015年12月査読有り
Complete genome sequence of the mitochondrial DNA of the river lamprey, Lethenteron japonicum

Yuri L. Kawai, Kei Yura, Miyuki Shindo, Rie Kusakabe, Keiko Hayashi, Kenichiro Hata, Kazuhiko Nakabayashi, Kohji Okamura

MITOCHONDRIAL DNA 26(6) 863-864 2015年査読有り
MiR-124 is Involved in Post-transcriptional Regulation of Polypyrimidine Tract Binding Protein 1 (PTBP1) During Neural Development in the Medaka, Oryzias latipes

Yumiko Kato, Rie Kusakabe, Kunio Inoue, Shin Tochinai

ZOOLOGICAL SCIENCE 30(11) 891-900 2013年11月査読有り
Body wall development in lamprey and a new perspective on the origin of vertebrate paired fins

Frank J. Tulenko, David W. McCauley, Ethan L. MacKenzie, Sylvie Mazan, Shigeru Kuratani, Fumiaki Sugahara, Rie Kusakabe, Ann C. Burke

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 110(29) 11899-11904 2013年7月16日査読有り
Developmental expression and evolution of muscle-specific microRNAs conserved in vertebrates

Tani, Saori, Kuraku, Shigehiro, Sakamoto, Hiroshi, Inoue, Kunio, Kusakabe, Rie

Evolution & Development 15(4) 293-304 2013年査読有り
Characterization of the compact bicistronic microRNA precursor, miR-1/miR-133, expressed specifically in Ciona muscle tissues

Rie Kusakabe, Saori Tani, Koki Nishitsuji, Miyuki Shindo, Kohji Okamura, Yuki Miyamoto, Kenta Nakai, Yutaka Suzuki, Takehiro G. Kusakabe, Kunio Inoue

GENE EXPRESSION PATTERNS 13(1-2) 43-50 2013年1月査読有り
Expression and interaction of muscle-related genes in the lamprey imply the evolutionary scenario for vertebrate skeletal muscle, in association with the acquisition of the neck and fins.

Rie Kusakabe, Shigehiro Kuraku, Shigeru Kuratani

Developmental biology 350(1) 217-27 2011年2月1日査読有り
Genomic organization and embryonic expression of miR-430 in medaka (Oryzias latipes): Insights into the post-transcriptional gene regulation in early development (vol 449, pg 41, 2010)

Saori Tani, Rie Kusakabe, Kiyoshi Naruse, Hiroshi Sakamoto, Kunio Inoue

GENE 457(1-2) 50-51 2010年6月査読有り
Genomic organization and embryonic expression of miR-430 in medaka (Oryzias latipes): Insights into the post-transcriptional gene regulation in early development

Saori Tani, Rie Kusakabe, Kiyoshi Naruse, Hiroshi Sakamoto, Kunio Inoue

GENE 449(1-2) 41-49 2010年1月査読有り
Evolution of vertebrate skeletal myogenesis: Insights from the cyclostome lamprey

Kusakabe, Rie, Kuraku, Shigehiro, Kuratani, Shigeru

Developmental Biology 344(1) 2010年査読有り
Evolution of vertebrate myogenesis, with special reference to the morphological variety of skeletal muscles

Kusakabe, Rie, Kuraku, Shigehiro, Kuratani, Shigeru, Inoue, Kunio

Mechanisms of Development 126 2009年査読有り

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MISC

Body Wall Formation in Lamprey

F. J. Tulenko, R. Kusakabe, S. Kuratani, A. C. Burke

INTEGRATIVE AND COMPARATIVE BIOLOGY 49 E173-E173 2009年2月
Evolutionary pathway of developmental mechanisms of skeletal muscles, with special reference to the lampreys

Rie Kusakabe, Shigeru Kuratani

JOURNAL OF MORPHOLOGY 268(12) 1096-1096 2007年12月
The origin of epaxial/hypaxial distinction of trunk skeletal muscle: Implications from the gene expression patterns in the lamprey embryos

Rie Kusakabe, Shigeru Kuratani

ZOOLOGICAL SCIENCE 22(12) 1402-1402 2005年12月
Evolution of epaxial/hypaxial skeletal muscle implicated by the expression pattern of lamprey muscle-specific genes

Rie Kusakabe, Shigeru Kuratani

ZOOLOGICAL SCIENCE 21(12) 1271-1271 2004年12月
EXPRESSION OF CONTRACTILE PROTEIN GENES SPECIFICALLY EXPRESSED IN THE LAMPREY SKELETAL MUSCLE(Taxonomy and Systematics,Abstracts of papers presented at the 74^<th> Annual Meeting of the Zoological Society of Japan) :

Kusakabe Rie, Kuratani Shigeru

Zoological science 20(12) 1534-1534 2003年
Analysis of expression of foreign genes introduced into embryos of the lamprey, Lampetra japonica: a new technique to analyze evolutionary changes in gene regulation.

R Kusakabe, S Tochinai, S Kuratani

INTEGRATIVE AND COMPARATIVE BIOLOGY 42(6) 1260-1260 2002年12月
Development, function, and molecules of photoreceptive organs in ascidians: insights into the origin and evolution of vertebrate eyes.

T Kusakabe, R Kusakabe, Y Nakashima, T Horie, M Nagawa, M Tsuda

INTEGRATIVE AND COMPARATIVE BIOLOGY 42(6) 1260-1260 2002年12月
1R1330 ホヤ神経系特異的遺伝子の転写調節領域の網羅的比較解析(22.生命情報科学,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)

日下部岳広, 吉田麗子, 津田基之

生物物理 42(supplement2) S96 2002年
CHARACTERIZATION OF A NOVEL RETINAL PHOTOISOMERASE THAT CO-LOCALIZE WITH VISUAL CYCLE PROTEINS IN THE BRAIN OF THE ASCIDIAN CIONA INTESTINALIS(Physiology)(Proceedings of the Seventy-Third Annual Meeting of the Zoological Society of Japan) :

Kusakabe Takehiro, Nakashima Yuki, Horie Takeo, Kusakabe Rie, Terakita Akihisa, Shichida Yoshinori, Tsuda Motoyuki

Zoological science 19(12) 1466-1466 2002年
INTRODUCTION AND EXPRESSION OF FOREIGN GENES INTO EGGS AND EMBRYOS OF THE LAMPREY, LAMPETRA JAPONICA(Developmental Biology)(Proceedings of the Seventy-Third Annual Meeting of the Zoological Society of Japan) :

Kusakabe Rie, Fujimori Toshihiko, Tochinai Shin, Kuratani Shigeru

Zoological science 19(12) 1452-1452 2002年
Ci-opsin1, a vertebrate-type opsin gene, expressed in the larval ocellus of the ascidian Ciona intestinalis (vol 506, pg 69, 2001)

T Kusakabe, R Kusakabe, Kawakami, I, Y Satou, N Satoh, M Tsuda

FEBS LETTERS 508(1) 162-162 2001年11月
EXPRESSION PATTERNS OF THREE BRAIN VESICLE-SPECIFIC GENES DURING EMBRYOGENESIS OF THE ASCIDIAN CIONA INTESTINALIS(Developmental Biology)(Proceeding of the Seventy-Third Annual Meeting of the Zoological Society of Japan) :

Kusakabe R., Kusakabe T., Kawakami I., Satou Y., Satoh N., Tsuda M.

Zoological science 18 69-69 2001年
GENE EXPRESSION PROFILES IN THE ASCIDIAN CIONA INTESTINALIS. IV. THE TADPOLE-LARVA STAGE(Developmental Biology)(Proceeding of the Seventy-Third Annual Meeting of the Zoological Society of Japan) :

Kusakabe T., Yoshida R., Kawakami I., Kusakabe R., Mochizuki Y., Yamada L., Shin-i T., Kohara Y., Satoh N., Tsuda M. …

Zoological science 18 66-66 2001年
3L1415 ホヤ幼生の脳神経系で特異的に発現しているGタンパク質遺伝子

吉田麗子, 川上功, 岩佐達郎, 日下部岳広, 津田基之

生物物理 40(supplement) S213 2000年
Characterization of cDNA clones for the actin multigene family of lamprey, Lampetra japonica(Taxonomy and Systematics)Proceedings of the Seventy-First Annual Meeting of the Zoological Society of Japan :

Kusakabe R., Takechi M., Tochinai S.

Zoological science 17 44-44 2000年
FUNCTIONAL ANALYSIS OF UPSTREAM REGIONS OF THE MEDAKA MUSCLE ACTIN GENES(Developmental Biology)(Proceedings of the Sixty-Ninth Annual Meeting of the Zoological Society of Japan) :

Kusakabe R., Kusakabe T., Suzuki N.

Zoological science 15 67-67 1998年
Differential gene expression and intracellular mRNA localization of amphioxus actin isoforms throughout development: Implications for conserved mechanisms of chordate development

R Kusakabe, T Kusakabe, N Satoh, ND Holland, LZ Holland

DEVELOPMENT GENES AND EVOLUTION 207(4) 203-215 1997年9月
Differential expression of actin genes during amphioxus development.

R Kusakabe, T Kusakabe, N Satoh, ND Holland, LZ Holland

MOLECULAR BIOLOGY OF THE CELL 7 706-706 1996年12月

書籍等出版物

Evolutionary Developmental Biology - A Reference Guide

(担当:分担執筆, 範囲:Acquisition of the neck and neck muscles)

2020年
動物学の百科事典

公益社団法人日本動物学会

丸善出版 2018年9月28日 (ISBN: 4621303090)
岩波生物学辞典第5版

巌佐庸, 倉谷滋, 斎藤成也, 塚谷裕一

岩波書店 2013年2月27日 (ISBN: 9784000803144)
ウォルパート発生生物学

武田洋幸, 田村宏治

メディカルサイエンスインターナショナル 2012年10月1日 (ISBN: 4895927164)
Medaka : biology, management, and experimental protocols

木下政人

Wiley-Blackwell 2009年 (ISBN: 9780813808710)
動物の形態進化のメカニズム (シリーズ 21世紀の動物科学)

倉谷滋, 佐藤矩行

培風館 2007年7月 (ISBN: 456308283X)