山田陸裕 (Rikuhiro Yamada) - マイポータル

基本情報

所属: 久留米大学分子生命科学研究所（個体システム生物学研究部門）准教授
: 東京大学大学院医学系研究科客員研究員

学位: 博士（理学）(2009年3月東京工業大学)

研究者番号: 90469924
J-GLOBAL ID: 202001012232726886
researchmap会員ID: R000010635

研究キーワード

研究分野

経歴

2024年4月 - 現在

久留米大学, 分子生命科学研究所, 准教授
2020年8月 - 現在

東京大学, 大学院医学系研究科機能生物学専攻システムズ薬理, 客員研究員
2019年10月 - 現在

株式会社CUBICStars (上級研究員)
2023年4月 - 2026年3月

国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, 客員研究員
2023年4月 - 2024年3月

大阪大学, 大学院医学系研究科, 特任研究員
2021年4月 - 2024年3月

株式会社ACCELStars (上級研究員)
2021年4月 - 2023年3月

大阪大学, 大学院医学系研究科, 招へい准教授
2014年10月 - 2023年3月

特定国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, 上級研究員
2011年4月 - 2014年9月

理化学研究所, 発生・再生科学総合研究センター, 研究員
2008年4月 - 2011年3月

理化学研究所, 発生・再生科学総合研究センター, 基礎科学特別研究員
2007年4月 - 2008年3月

理化学研究所, 発生・再生科学総合研究センター, リサーチアソシエイト

学歴

受賞

2011年

研究奨励賞, 時計の転写ネットワークの動作原理の解明, 理化学研究所

論文

A whole-brain single-cell atlas of circadian neural activity in mice

Katsunari Yamashita, Fukuaki L. Kinoshita, Shota Y. Yoshida, Katsuhiko Matsumoto, Tomoki T. Mitani, Hiroshi Fujishima, Yoichi Minami, Eiichi Morii, Rikuhiro G. Yamada, Seiji Okada …

Science 2025年11月13日
A unified framework to model synaptic dynamics during the sleep–wake cycle

Fukuaki L. Kinoshita, Rikuhiro G. Yamada, Koji L. Ode, Hiroki R. Ueda

PLOS Biology 23(6) e3003198-e3003198 2025年6月12日
Isoflurane activates the type 1 ryanodine receptor to induce anesthesia in mice

Hiroyuki J. Kanaya, Ken Kuwajima, Yuko Ito, Yuta Shinohara, Yohei Okubo, Shinnosuke Shiono, Fumiya Tatsuki, Rei-ichiro Ohno, Hideki Ukai, Maki Ukai-Tadenuma …

PLOS Biology 23(6) e3003172-e3003172 2025年6月3日
Whole‐brain Cellome‐Wide Association Study (CWAS) Unveils Ultra‐Early Neurodegeneration Phenomena in a 3D Spatial Cell Atlas

Tomoki T Mitani, Kosei Yamaura, Katsuhiko Matsumoto, Rikuhiro Yamada, Etsuo A Susaki, Hiroki R Ueda

Alzheimer's & Dementia 20(S1) 2024年12月
Postsynaptic competition between calcineurin and PKA regulates mammalian sleep–wake cycles

Yimeng Wang, Siyu Cao, Daisuke Tone, Hiroshi Fujishima, Rikuhiro G. Yamada, Rei-ichiro Ohno, Shoi Shi, Kyoko Matsuzawa, Saori Yada, Mari Kaneko …

Nature 636(8042) 412-421 2024年11月6日
An automated sleep staging tool based on simple statistical features of mice electroencephalography (EEG) and electromyography (EMG) data

Rikuhiro G. Yamada, Kyoko Matsuzawa, Koji L. Ode, Hiroki R. Ueda

European Journal of Neuroscience 60(7) 5467-5486 2024年7月28日
Cortical parvalbumin neurons are responsible for homeostatic sleep rebound through CaMKII activation

Kazuhiro Kon, Koji L. Ode, Tomoyuki Mano, Hiroshi Fujishima, Riina R. Takahashi, Daisuke Tone, Chika Shimizu, Shinnosuke Shiono, Saori Yada, Kyoko Matsuzawa …

Nature Communications 15(1) 2024年7月18日
Circadian ribosome profiling reveals a role for the Period2 upstream open reading frame in sleep

Arthur Millius, Rikuhiro G. Yamada, Hiroshi Fujishima, Kazuhiko Maeda, Daron M. Standley, Kenta Sumiyama, Dimitri Perrin, Hiroki R. Ueda

Proceedings of the National Academy of Sciences 120(40) 2023年9月28日
Distinct phosphorylation states of mammalian CaMKIIβ control the induction and maintenance of sleep

Daisuke Tone, Koji L. Ode, Qianhui Zhang, Hiroshi Fujishima, Rikuhiro G. Yamada, Yoshiki Nagashima, Katsuhiko Matsumoto, Zhiqing Wen, Shota Y. Yoshida, Tomoki T. Mitani …

PLOS Biology 20(10) e3001813-e3001813 2022年10月4日
The circadian clock ticks in organoids

Rikuhiro G Yamada, Hiroki R Ueda

The EMBO Journal 41(2) 2022年1月17日
CUBIC-Cloud provides an integrative computational framework toward community-driven whole-mouse-brain mapping

Tomoyuki Mano, Ken Murata, Kazuhiro Kon, Chika Shimizu, Hiroaki Ono, Shoi Shi, Rikuhiro G. Yamada, Kazunari Miyamichi, Etsuo A. Susaki, Kazushige Touhara …

Cell Reports Methods 1(2) 100038-100038 2021年6月
A Microfluidic Platform Based on Robust Gas and Liquid Exchange for Long-term Culturing of Explanted Tissues

Nobutoshi Ota, Genki N. Kanda, Hiroyuki Moriguchi, Yusufu Aishan, Yigang Shen, Rikuhiro G. Yamada, Hiroki R. Ueda, Yo Tanaka

ANALYTICAL SCIENCES 35(10) 1141-1147 2019年10月査読有り
Molecular Mechanisms of REM Sleep.

Rikuhiro G Yamada, Hiroki R Ueda

Frontiers in neuroscience 13 1402-1402 2019年査読有り
Muscarinic Acetylcholine Receptors Chrm1 and Chrm3 Are Essential for REM Sleep.

Yasutaka Niwa, Genki N Kanda, Rikuhiro G Yamada, Shoi Shi, Genshiro A Sunagawa, Maki Ukai-Tadenuma, Hiroshi Fujishima, Naomi Matsumoto, Koh-Hei Masumoto, Mamoru Nagano …

Cell reports 24(9) 2231-2247 2018年8月28日査読有り
Temperature-Sensitive Substrate and Product Binding Underlie Temperature-Compensated Phosphorylation in the Clock.

Yuta Shinohara, Yohei M Koyama, Maki Ukai-Tadenuma, Takatsugu Hirokawa, Masaki Kikuchi, Rikuhiro G Yamada, Hideki Ukai, Hiroshi Fujishima, Takashi Umehara, Kazuki Tainaka …

Molecular cell 67(5) 783-798 2017年9月7日査読有り
Compass in the data ocean: Toward chronotherapy.

Rikuhiro G Yamada, Hiroki R Ueda

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 114(20) 5069-5071 2017年5月16日招待有り
Metabolites as clock hands: Estimation of internal body time using blood metabolomics

Hitoshi Iuchi, Rikuhiro G. Yamada, Hiroki R. Ueda

Neuromethods 105 245-254 2016年査読有り
A MICROFLUIDIC PLATFORM TO GENERATE A ROBUST GAS-LIQUID INTERFACE FOR ORGANOTYPIC SLICE CULTURE OVER A LONG PERIOD

G.N. Kanda, H. Moriguchi, R.G. Yamada, Y. Tanaka, H.R. Ueda

MicroTAS 2013 1063-1065 2013年10月
Different circadian expression of major matrix-related genes in various types of cartilage: modulation by light-dark conditions

Kiyomasa K. Honda, Takeshi Kawamoto, Hiroki R. Ueda, Ayumu Nakashima, Taichi Ueshima, Rikuhiro G. Yamada, Masahiro Nishimura, Ryo Oda, Shigeo Nakamura, Tomoko Kojima …

JOURNAL OF BIOCHEMISTRY 154(4) 373-381 2013年10月査読有り
A simple process for long-term culture of adherent mammalian cells in micro-flow chamber based on PDMS and polystyrene

Rikuhiro G. Yamada

Proceedings of 2011 International Conference on Microtechnologies in Medicine and Biology 2011年5月査読有り

もっとみる

MISC

プレシナプス遺伝子の変異体導入はノンレム睡眠中のデルタパワーを増大させる

山本敬太, 山本敬太, 山本敬太, 山本敬太, 戸根大輔, 山田陸裕, 木下福章, 大出晃士, BALLESTER ROIG Maria Neus, 藤島博史 …

時間生物学 31(2) 2025年
マウス全脳における概日神経活動の単一細胞アトラス

山下勝成, 山下勝成, 山下勝成, 木下福章, 木下福章, 吉田将太, 吉田将太, 吉田将太, 吉田将太, 松本桂彦 …

日本ヒト細胞学会学術集会 43rd 2025年
マウス全脳における概日神経活動の単一細胞3Dアトラス

山下勝成, 山下勝成, 山下勝成, 木下福章, 木下福章, 吉田将太, 吉田将太, 松本桂彦, 松本桂彦, 山田陸裕 …

時間生物学 31(2) 2025年
プレシナプス機能に着目した哺乳類の睡眠覚醒制御メカニズムの解明

山本敬太, 山本敬太, JIANG Yilin, 戸根大輔, 戸根大輔, 山田陸裕, 山田陸裕, 上田泰己, 上田泰己, 上田泰己 …

日本薬学会年会要旨集(Web) 145th 2025年
全脳への遺伝子導入系を利用した哺乳類睡眠覚醒サイクルに関わるシナプスタンパク質機能の解析

山本敬太, 山本敬太, JIANG Yilin, 戸根大輔, 戸根大輔, 山田陸裕, 山田陸裕, 上田泰己, 上田泰己, 上田泰己

日本薬学会年会要旨集(Web) 144th 2024年
睡眠・覚醒サイクルにおけるプレシナプスの機能的ダイナミクスとリン酸化の役割

山本敬太, 山本敬太, JIANG Yilin, 戸根大輔, 山田陸裕, 山田陸裕, 上田泰己, 上田泰己, 上田泰己, 上田泰己

時間生物学 30(2) 2024年
プレシナプスタンパク質による哺乳類の睡眠制御

山本敬太, 山本敬太, JIANG Yilin, 戸根大輔, 戸根大輔, 山田陸裕, 山田陸裕, 上田泰己, 上田泰己, 上田泰己

日本生物学的精神医学会(Web) 46th 2024年
睡眠覚醒調節に関与するシナプス蛋白質の脱リン酸化調節に関する研究【JST・京大機械翻訳】|||

曹思ぎょく, 戸根大輔, 山田陸裕, 隅山健太, 上田泰己, 上田泰己

日本薬理学雑誌 158(Supplement) 2023年
Investigating roles of pore-loop cation channels for cortical neuronal synchrony and sleep quality and time

バイエステロッチマリアネウス, 史蕭逸, 戸根大輔, 大出晃士, 藤島博史, 山田陸裕, 隅山健太, 上田泰己

時間生物学 29(2) 2023年
アルツハイマー病関連因子による睡眠要求量制御機構の解析

山浦港生, 山浦港生, 戸根大輔, 山田陸裕, 山田陸裕, 山田陸裕, 木下福章, 木下福章, 上田泰己, 上田泰己 …

時間生物学 29(2) 2023年
in vitro睡眠評価系を用いた神経伝達と睡眠制御の解析

山本敬太, 山本敬太, YILIN Jiang, 戸根大輔, 戸根大輔, 山田陸裕, 山田陸裕, 上田泰己, 上田泰己, 上田泰己

時間生物学 29(2) 2023年
レム睡眠の分子機構

山田陸裕, 上田泰己

月刊細胞 52(10) 17-20 2020年9月筆頭著者
【細胞の少数性と多様性に挑む-シングルセルアナリシス】次世代シーケンサーを用いた細胞多様性の解明生体リズム・発生現象における1細胞シーケンスを用いた細胞多様性の解明

山田陸裕, 洲崎悦生, 上田泰己

生体の科学 65(2) 138-143 2014年4月
時計遺伝子研究とその展望

神田元紀, 山田陸裕, 上田泰己

内分泌・糖尿病・代謝内科 38(2) 201-206 2014年2月
酸素プラズマパターニングを利用したシンプルなPDMSバルブの開発

森口裕之, 川井隆之, 神田元紀, 山田陸裕, 上田泰己, 田中陽

化学とマイクロ・ナノシステム学会研究会講演要旨集 30th 2014年
哺乳類視交叉上核に対する時間シグナル

山田陸裕, 升本宏平, 上田泰己

時間生物学 19(2) 2013年
【細胞を創る・生命システムを創る合成生物学が挑む生命機能の再構築と計算機シミュレーション、医療・社会との関わり】第4章遺伝子ネットワークを創る概日時計の転写ネットワークの再構成

鵜飼磨貴[蓼沼], 山田陸裕

実験医学 29(7) 1112-1119 2011年5月
正しい知識が捏造を防ぐデータを正確に解釈するための6つのポイント大規模データの解析における問題点 DNAマイクロアレイによる遺伝子発現量の測定を例として

山田陸裕, 上田泰己

蛋白質・核酸・酵素 54(10) 1307-1317 2009年8月
哺乳類概日時計の周期決定因子の探索

礒島康史, 礒島康史, 鵜飼英樹, 藤島博史, 山田陸裕, 中嶋正人, 升本宏平, 木内玲子, 木内玲子, 南陽一 …

日本人類遺伝学会大会プログラム・抄録集 53rd 2008年
ショウジョウバエの新規時計遺伝子clockwork orangeの発見

松本顕, 鵜飼磨貴[蓼沼], 山田陸裕, 上田泰己

細胞工学 26(11) 1278-1279 2007年10月

もっとみる

講演・口頭発表等

高効率なマウス遺伝学と表現型解析による睡眠研究

山田陸裕

日本実験動物技術者協会第3 回三支部交流会 2026年2月21日招待有り
ポストシナプスにおけるカルシニューリンとPKAの拮抗による睡眠覚醒制御機構

山田陸裕

ERATO UK-Japan Joint Symposium On Circadian rhythms and Sleep 2024年3月12日招待有り
夢見る睡眠研究

山田陸裕

第75回理研イブニングセミナー 2019年11月6日
Sleep measurement 次世代遺伝学と表現型解析

山田陸裕

第4回バイオインフォマティクスアゴラ 2018年
生物試料組織透明化技術（CUBIC法）の開発と展開

メディカルジャパン２０１６ 2016年
マウス視交叉上核における環境時間コーディングメカニズム

山田陸裕

第22回日本時間生物学会学術大会 2015年
培養SCNの環境因子応答

山田陸裕

Neuroscience 2013年
哺乳類害日時計のシステム生物学と合成生物学

山田陸裕, 上田泰己

2012年
The transcriptional-level delayed-feedback loop in mammalian circadian clock and an approach for tissue-level analysis

山田陸裕

The 34th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan 2011年
哺乳類概日時計：遅れを持った負の転写フィードバック機構と組織レベル解析へ向けて

山田陸裕

生理学研究所研究会「超階層シグナル伝達研究の新展開」 2011年
環境時間情報処理システムの解明に向けたSCN培養観察系

山田陸裕

第19回日本時間生物学会学術大会 2010年
A Functional genomics strategy reveals clockwork orange as a transcriptional regulator in the Drosophila circadian clock

山田陸裕

日本神経科学学会 2008年
TilingArray を用いた Drosophila 概日時計システムの解析", 第２回バイオメディカル研究会

第２回バイオメディカル研究会 2006年

共同研究・競争的資金等の研究課題

マウス睡眠EEG/EMGデータ自動ステージ判定アルゴリズムと周辺ソフトウェア開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2021年4月 - 2024年3月

山田陸裕
哺乳類生体リズム振動体の設計

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(S) 基盤研究(S) 2018年6月 - 2023年3月

上田泰己, 洲崎悦生, 大出晃士, 清成寛, 史蕭逸, 山田陸裕
緩やかな環境時間変化検出機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究挑戦的萌芽研究 2014年4月 - 2017年3月

山田陸裕

山田陸裕

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

受賞

論文

MISC

講演・口頭発表等

共同研究・競争的資金等の研究課題

メニュー

共著者の一覧