林武司 (Hayashi Takeshi) - マイポータル

基本情報

学位: 農学(東京大学)

J-GLOBAL ID: 201301044260627722
researchmap会員ID: B000226757

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統計遺伝学を基盤として、連鎖解析、QTL解析、GWASなどの遺伝解析の手法開発に取り組んでいます。

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研究分野

経歴

論文

108

イネ近代育成品種群のハプロタイプ可視化手法の開発

權娟大, 鐘ヶ江弘美, 後藤明俊, 松下景, 林武司, 米丸淳一, 菊井玄一郎, 矢野昌裕

育種学研究 27(2) 150-158 2025年12月1日査読有り
Modelling and Using Spatial Effects in Nationwide Historical Data Improve Genomic Prediction of Rice Heading Date in Japan

Shoji Taniguchi, Takeshi Hayashi, Hiroshi Nakagawa, Kei Matsushita, Hiromi Kajiya-Kanegae, Jun-Ichi Yonemaru, Akitoshi Goto

Rice 18(1) 2025年4月11日
Haplotype Bias Detection Using Pedigree-Based Transmission Simulation: Traces of Selection That Occurred in Apple Breeding

Hideto Mochizuki, Mai F. Minamikawa, Kosuke Hamazaki, Miyuki Kunihisa, Shigeki Moriya, Koji Noshita, Takeshi Hayashi, Yuichi Katayose, Toshiya Yamamoto, Hiroyoshi Iwata

2025年3月17日
Genome-wide association studies using chromosome-scale genomes of male and female lines redefines two sex-linked loci in linkage disequilibrium in Ficus carica L.

Hidetoshi Ikegami, Kenta Shirasawa, Hiroshi Yakushiji, Atsuhi Toyoda, Takeshi Hayashi, Shiori Yabe, Kazuki Mori, Chiharu Hirata, Hitoshi Nogata, Kosuke Tashiro

Scientia Horticulturae 336 2024年10月1日
Three-dimensional image analysis specifies the root distribution for drought avoidance in the early growth stage of rice

Yuko Numajiri, Saki Yoshida, Takeshi Hayashi, Yusaku Uga

Annals of Botany 2024年6月22日
Bayesian estimation of multi-allele QTLs for agricultural traits in tomato using recombinant inbred lines derived from two F-1 hybrid cultivars

Akio Ohyama, Hiroshi Matsunaga, Yasushi Kawasaki, Kenta Shirasawa, Satomi Negoro, Koji Miyatake, Hirotaka Yamaguchi, Tsukasa Nunome, Hiroyoshi Iwata, Hiroyuki Fukuoka …

EUPHYTICA 219(1) 2023年1月
Detecting a novel locus associated with pellicle peelability in Japanese chestnut populations preselected for a major peelability gene

Sogo Nishio, Takeshi Hayashi, Kenta Shirasawa, Shingo Terakami, Norio Takada, Yukie Takeuchi, Atsushi Imai, Toshihiro Saito

SCIENTIA HORTICULTURAE 306 2022年12月査読有り
A novel index to evaluate resource allocation pattern in panicles in Japanese rice cultivars

Shiori Yabe, Hiroe Yoshida, Erina Fushimi, Masanori Yamasaki, Hideo Maeda, Takeshi Hayashi, Hiroshi Nakagawa

PLANT PRODUCTION SCIENCE 25(2) 195-210 2022年4月査読有り
Hamiltonian Monte Carlo method for estimating variance components.

Aisaku Arakawa, Takeshi Hayashi, Masaaki Taniguchi, Satoshi Mikawa, Motohide Nishio

Animal science journal = Nihon chikusan Gakkaiho 92(1) e13575 2021年12月査読有り
Genome-wide association study of individual sugar content in fruit of Japanese pear (Pyrus spp.)

Sogo Nishio, Takeshi Hayashi, Kenta Shirasawa, Toshihiro Saito, Shingo Terakami, Norio Takada, Yukie Takeuchi, Shigeki Moriya, Akihiko Itai

BMC Plant Biology 21(1) 378-378 2021年12月査読有り
Role of an Atypical Cadherin Gene, Cdh23 in Prepulse Inhibition, and Implication of CDH23 in Schizophrenia.

Shabeesh Balan, Tetsuo Ohnishi, Akiko Watanabe, Hisako Ohba, Yoshimi Iwayama, Manabu Toyoshima, Tomonori Hara, Yasuko Hisano, Yuki Miyasaka, Tomoko Toyota …

Schizophrenia bulletin 47(4) 1190-1200 2021年7月8日査読有り
iPOTs: Internet of Things‐based pot system controlling optional treatment of soil water condition for plant phenotyping under drought stress

Yuko Numajiri, Kanami Yoshino, Shota Teramoto, Atsushi Hayashi, Ryo Nishijima, Tsuyoshi Tanaka, Takeshi Hayashi, Taiji Kawakatsu, Takanari Tanabata, Yusaku Uga

The Plant Journal 2021年7月査読有り
Tracing founder haplotypes of Japanese apple varieties: application in genomic prediction and genome-wide association study

Mai F. Minamikawa, Miyuki Kunihisa, Koji Noshita, Shigeki Moriya, Kazuyuki Abe, Takeshi Hayashi, Yuichi Katayose, Toshimi Matsumoto, Chikako Nishitani, Shingo Terakami …

HORTICULTURE RESEARCH 8(1) 49-49 2021年3月査読有り
Genome-wide association study for apple flesh browning: detection, validation, and physiological roles of QTLs

Miyuki Kunihisa, Takeshi Hayashi, Yoshimichi Hatsuyama, Tomoko Fukasawa-Akada, Hirohide Uenishi, Toshimi Matsumoto, Tomoyuki Kon, Satoshi Kasai, Tsuyoshi Kudo, Hidemi Oshino …

TREE GENETICS & GENOMES 17(1) 2021年2月査読有り
Analysis of the Segregation Distortion of FcRAN1 Genotypes Based on Whole-Genome Resequencing of Fig (Ficus carica L.) Breeding Parents.

Hidetoshi Ikegami, Kenta Shirasawa, Hiroshi Yakushiji, Shiori Yabe, Masaru Sato, Takeshi Hayashi, Kosuke Tashiro, Hitoshi Nogata

Frontiers in plant science 12 647599-647599 2021年査読有り
日本のイネ品種を背景とした準同質遺伝子系統の比較栽培による収量関連9対立遺伝子の遺伝的効果

上田忠正, 石丸健, 後藤明俊, 一家崇志, 近藤勝彦, 松原一樹, 林武司, 山本敏央, 田中淳一

育種学研究 2021年査読有り
Predicting biomass of rice with intermediate traits: Modeling method combining crop growth models and genomic prediction models

Yusuke Toda, Hitomi Wakatsuki, Toru Aoike, Hiromi Kajiya-Kanegae, Masanori Yamasaki, Takuma Yoshioka, Kaworu Ebana, Takeshi Hayashi, Hiroshi Nakagawa, Toshihiro Hasegawa …

PLOS ONE 15(6) e0233951 2020年6月査読有り
Genetic Deciphering of Prepulse Inhibition Reveals the Putative Role of an Atypical Cadherin in Schizophrenia Pathogenesis

Shabeesh Balan, Tetsuo Ohnishi, Akiko Watanabe, Hisako Ohba, Yoshimi Iwayama, Yasuko Hisano, Tomoko Toyota, Manabu Toyoshima, Tomomi Shimogori, Takeshi Hayashi …

BIOLOGICAL PSYCHIATRY 87(9) S398-S398 2020年5月
De novo Genome Assembly of the indica Rice Variety IR64 Using Linked-Read Sequencing and Nanopore Sequencing

Tsuyoshi Tanaka, Ryo Nishijima, Shota Teramoto, Yuka Kitomi, Takeshi Hayashi, Yusaku Uga, Taiji Kawakatsu

G3-GENES GENOMES GENETICS 10(5) 1495-1501 2020年5月査読有り
Multifamily QTL analysis and comprehensive design of genotypes for high-quality soft wheat

Goro Ishikawa, Takeshi Hayashi, Kazuhiro Nakamura, Tsuyoshi Tanaka, Fuminori Kobayashi, Mika Saito, Hiroyuki Ito, Sachiko Ikenaga, Yoshinori Taniguchi, Toshiki Nakamura

PLOS ONE 15(3) e0230326 2020年3月査読有り

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MISC

132

育種データを秘密計算AIに適用した育種形質予測の検証・評価

橋本順子, 太田賢治, 米丸淳一, 鐘ケ江弘美, 松下景, 林武司

育種学研究 25 2023年
水稲育種ビックデータを活用した品種ゲノム情報と気象環境情報双方による出穂期予測モデル開発

後藤明俊, 後藤明俊, 谷口昇志, 林武司, 中川博視, 松下景, 鐘ケ江弘美, 矢野昌裕, 米丸淳一

育種学研究 25 2023年
育種データの秘密計算AI適用に関する見える化・データ加工・学習モデル作成の検討

太田賢治, 橋本順子, 米丸淳一, 鐘ケ江弘美, 松下景, 林武司

育種学研究 25 2023年
イネ全国データを対象に空間効果を考慮したゲノミック予測モデルの開発

谷口昇志, 林武司, 中川博視, 松下景, 鐘ケ江弘美, 矢野昌裕, 米丸淳一, 米丸淳一, 後藤明俊, 後藤明俊

育種学研究 25 2023年
「Pedigree Finder」を用いた系譜情報解析-近縁係数の算出および家系解析による表現型伝達の可視化-

鐘ケ江弘美, 林武司, 米丸淳一

育種学研究 25 2023年
植物科学と育種ビッグデータの融合による新たな情報解析

鐘ケ江弘美, 松下景, 林武司, 米丸淳一

日本植物バイオテクノロジー学会大会講演要旨集(Web) 40th 2023年
形質値のシミュレーションによるイネ交配後代集団のゲノミック予測手法の検証

谷口昇志, 林武司, 鐘ケ江弘美, 松下景, 矢野昌裕, 米丸淳一, 米丸淳一, 後藤明俊, 後藤明俊

育種学研究 24 2022年
水稲ヒストリカルデータを用いた交配シミュレーターの作成と実測値をもちいた検証

後藤明俊, 後藤明俊, 林武司, 谷口昇志, 鐘ヶ江弘美, 松下景, 菊井玄一郎, 矢野昌裕, 米丸淳一, 米丸淳一

育種学研究 24 2022年
知識グラフを用いた作物の形質予測手法の開発

鐘ケ江弘美, 菊井玄一郎, 松下景, 矢野昌裕, 林武司, 米丸淳一, 米丸淳一

育種学研究 24 2022年
リンゴの果肉褐変性は3箇所の染色体領域に制御される

國久美由紀, 田沢純子, 林武司, 初山慶道, 赤田(深澤)朝子, 上西博英, 松本敏美, 今智之, 葛西智, 工藤剛 …

農研機構果樹茶業研究部門成果情報(Web) 2021 2021年
系譜とマーカー情報に基づく育種過程で生じた起源ハプロタイプの偏りの推定:リンゴ品種群への適用

望月秀斗, 南川舞, 國久美由紀, 野下浩司, 野下浩司, 森谷茂樹, 阿部和幸, 林武司, 片寄裕一, 山本俊哉 …

育種学研究 23 2021年
系譜情報グラフデータベース「Pedigree Finder」

鐘ヶ江弘美, 松下景, 松下景, 林武司, 竹崎あかね, 矢野昌裕, 菊井玄一郎, 米丸淳一, 米丸淳一

育種学研究 23 2021年
イネ近代育成品種群のハプロタイプ可視化ツールの開発

KWON Y., 鐘ヶ江弘美, 林武司, 松下景, 松下景, 後藤明俊, 後藤明俊, 菊井玄一郎, 矢野昌裕, 米丸淳一 …

育種学研究 23 2021年
国内で育成されたイネ500系統以上のゲノムビッグデータ解析

鐘ケ江弘美, 松下景, 松下景, 林武司, 後藤明俊, 後藤明俊, 菊井玄一郎, 矢野昌裕, 米丸淳一, 米丸淳一

育種学研究 23 2021年
高解像全ゲノム関連解析によるイチジク果皮色形質原因遺伝子候補の同定

池上秀利, 矢部志央理, 林武司, 白澤健太, 吉川郁恵, 石橋美咲, 白武勝裕, 佐藤大, 田代康介, 野方仁

園芸学研究別冊 20(2) 2021年
iPOTs:干ばつ条件での植物フェノタイピングを可能にするIoTベース土壌水分制御ポットシステムの開発

沼尻侑子, 吉野花奈美, 寺本翔太, 林篤司, 西嶋遼, 田中剛, 林武司, 川勝泰二, 七夕高也, 宇賀優作

育種学研究 23 2021年
Cytoscape.jsライブラリを用いた作物形質オントロジーの可視化

法隆大輔, 小野木章雄, 林武司

育種学研究 23 2021年
リンゴ祖先ハプロタイプ情報を用いたゲノミック予測とゲノムワイド関連解析

南川舞, 國久美由紀, 野下浩司, 野下浩司, 森谷茂樹, 阿部和幸, 林武司, 片寄裕一, 山本俊哉, 岩田洋佳

育種学研究 22 2020年
ニホンナシ成熟果実における糖組成のゲノムワイドアソシエーション解析

西尾聡悟, 齋藤寿広, 林武司, 白澤健太, 寺上伸吾, 高田教臣, 竹内由季恵, 加藤秀憲, 板井章浩

園芸学研究別冊 19(1) 2020年
イチジクFcRAN1座アレルにおける分離比歪みの観察とその遺伝的要因の解析

池上秀利, 白澤健太, 薬師寺博, 矢部志央理, 佐藤大, 林武司, 田代康介, 野方仁

育種学研究 22 2020年

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共同研究・競争的資金等の研究課題

イチジク遺伝資源を用いた果実の味・香り制御遺伝子の網羅的解析と食味科学への展開

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2019年4月 - 2022年3月

池上秀利, 田代康介, 佐藤大, 白澤健太, 矢部志央理, 林武司
環境適応型品種をデザインするための統合的モデル化手法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2013年4月 - 2016年3月

岩田洋佳, 長谷川利拡, 江花薫子, 山崎将紀, 中川博視, 林武司
ゲノミックセレクションを活用した革新的作物育種システムの構築

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2010年 - 2012年

岩田洋佳, 江花薫子, 林武司
作物生育モデルと遺伝モデルの連携による作物環境応答の生態遺伝的メカニズムの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2007年 - 2009年

長谷川利拡, 中川博視, 望月俊宏, 岩田洋佳, 大澤良, 林武司, 二宮正士

林武司

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共同研究・競争的資金等の研究課題

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