林武司 (Hayashi Takeshi) - マイポータル

基本情報

所属: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構農業情報研究センター AI研究推進室多変量解析チーム研究員

学位: 農学(東京大学)

J-GLOBAL ID: 201301044260627722
researchmap会員ID: B000226757

外部リンク

統計遺伝学を基盤として、連鎖解析、QTL解析、GWASなどの遺伝解析の手法開発に取り組んでいます。

研究キーワード

研究分野

経歴

論文

Hamiltonian Monte Carlo method for estimating variance components.

Aisaku Arakawa, Takeshi Hayashi, Masaaki Taniguchi, Satoshi Mikawa, Motohide Nishio

Animal science journal = Nihon chikusan Gakkaiho 92(1) e13575 2021年12月
Genome-wide association study of individual sugar content in fruit of Japanese pear (Pyrus spp.)

Sogo Nishio, Takeshi Hayashi, Kenta Shirasawa, Toshihiro Saito, Shingo Terakami, Norio Takada, Yukie Takeuchi, Shigeki Moriya, Akihiko Itai

BMC Plant Biology 21(1) 378-378 2021年12月
Role of an Atypical Cadherin Gene, Cdh23 in Prepulse Inhibition, and Implication of CDH23 in Schizophrenia.

Shabeesh Balan, Tetsuo Ohnishi, Akiko Watanabe, Hisako Ohba, Yoshimi Iwayama, Manabu Toyoshima, Tomonori Hara, Yasuko Hisano, Yuki Miyasaka, Tomoko Toyota, Chie Shimamoto-Mitsuyama, Motoko Maekawa, Shusuke Numata, Tetsuro Ohmori, Tomomi Shimogori, Yoshiaki Kikkawa, Takeshi Hayashi, Takeo Yoshikawa

Schizophrenia bulletin 47(4) 1190-1200 2021年7月8日
iPOTs: Internet of Things‐based pot system controlling optional treatment of soil water condition for plant phenotyping under drought stress

Yuko Numajiri, Kanami Yoshino, Shota Teramoto, Atsushi Hayashi, Ryo Nishijima, Tsuyoshi Tanaka, Takeshi Hayashi, Taiji Kawakatsu, Takanari Tanabata, Yusaku Uga

The Plant Journal 2021年7月
Tracing founder haplotypes of Japanese apple varieties: application in genomic prediction and genome-wide association study

Mai F. Minamikawa, Miyuki Kunihisa, Koji Noshita, Shigeki Moriya, Kazuyuki Abe, Takeshi Hayashi, Yuichi Katayose, Toshimi Matsumoto, Chikako Nishitani, Shingo Terakami, Toshiya Yamamoto, Hiroyoshi Iwata

HORTICULTURE RESEARCH 8(1) 49-49 2021年3月査読有り
Genome-wide association study for apple flesh browning: detection, validation, and physiological roles of QTLs

Miyuki Kunihisa, Takeshi Hayashi, Yoshimichi Hatsuyama, Tomoko Fukasawa-Akada, Hirohide Uenishi, Toshimi Matsumoto, Tomoyuki Kon, Satoshi Kasai, Tsuyoshi Kudo, Hidemi Oshino, Toshiya Yamamoto, Junko Tazawa

TREE GENETICS & GENOMES 17(1) 2021年2月査読有り
Analysis of the Segregation Distortion of FcRAN1 Genotypes Based on Whole-Genome Resequencing of Fig (Ficus carica L.) Breeding Parents.

Hidetoshi Ikegami, Kenta Shirasawa, Hiroshi Yakushiji, Shiori Yabe, Masaru Sato, Takeshi Hayashi, Kosuke Tashiro, Hitoshi Nogata

Frontiers in plant science 12 647599-647599 2021年
日本のイネ品種を背景とした準同質遺伝子系統の比較栽培による収量関連9対立遺伝子の遺伝的効果

上田忠正, 石丸健, 後藤明俊, 一家崇志, 近藤勝彦, 松原一樹, 林武司, 山本敏央, 田中淳一

育種学研究 2021年
Predicting biomass of rice with intermediate traits: Modeling method combining crop growth models and genomic prediction models

Yusuke Toda, Hitomi Wakatsuki, Toru Aoike, Hiromi Kajiya-Kanegae, Masanori Yamasaki, Takuma Yoshioka, Kaworu Ebana, Takeshi Hayashi, Hiroshi Nakagawa, Toshihiro Hasegawa, Hiroyoshi Iwata

PLOS ONE 15(6) e0233951 2020年6月査読有り
De novo Genome Assembly of the indica Rice Variety IR64 Using Linked-Read Sequencing and Nanopore Sequencing

Tsuyoshi Tanaka, Ryo Nishijima, Shota Teramoto, Yuka Kitomi, Takeshi Hayashi, Yusaku Uga, Taiji Kawakatsu

G3-GENES GENOMES GENETICS 10(5) 1495-1501 2020年5月査読有り
Multifamily QTL analysis and comprehensive design of genotypes for high-quality soft wheat

Goro Ishikawa, Takeshi Hayashi, Kazuhiro Nakamura, Tsuyoshi Tanaka, Fuminori Kobayashi, Mika Saito, Hiroyuki Ito, Sachiko Ikenaga, Yoshinori Taniguchi, Toshiki Nakamura

PLOS ONE 15(3) e0230326 2020年3月査読有り
Towards a deeper integrated multi-omics approach in the root system to develop climate-resilient rice

Kanami Yoshino, Yuko Numajiri, Shota Teramoto, Naoki Kawachi, Takanari Tanabata, Tsuyoshi Tanaka, Takeshi Hayashi, Taiji Kawakatsu, Yusaku Uga

MOLECULAR BREEDING 39(12) 2019年12月査読有り
QTL analysis of resistance to bacterial wilt caused by Ralstonia solanacearum in potato

Ippei Habe, Koji Miyatake, Tsukasa Nunome, Masanori Yamasaki, Takeshi Hayashi

BREEDING SCIENCE 69(4) 592-600 2019年査読有り
QTL mapping of fruit nutritional and flavor components in tomato (Solanum lycopersicum) using genome-wide SSR markers and recombinant inbred lines (RILs) from an intra-specific cross

Junji Kimbara, Akio Ohyama, Hiroshi Chikano, Hirotaka Ito, Katsutoshi Hosoi, Satomi Negoro, Koji Miyatake, Hirotaka Yamaguchi, Tsukasa Nunome, Hiroyuki Fukuoka, Takeshi Hayashi

EUPHYTICA 214(11) 2018年11月査読有り
Description of grain weight distribution leading to genomic selection for grain-filling characteristics in rice

Shiori Yabe, Hiroe Yoshida, Hiromi Kajiya-Kanegae, Masanori Yamasaki, Hiroyoshi Iwata, Kaworu Ebana, Takeshi Hayashi, Hiroshi Nakagawa

PLOS ONE 13(11) e0207627 2018年11月査読有り
Bayesian genome-wide association study of nut traits in Japanese chestnut

Sogo Nishio, Takeshi Hayashi, Toshiya Yamamoto, Shingo Terakami, Hiroyoshi Iwata, Atsushi Imai, Norio Takada, Hidenori Kato, Toshihiro Saito

MOLECULAR BREEDING 38(8) 2018年8月査読有り
Predicting segregation of multiple fruit-quality traits by using accumulated phenotypic records in citrus breeding

Atsushi Imai, Takeshi Kuniga, Terutaka Yoshioka, Keisuke Nonaka, Nobuhito Mitani, Hiroshi Fukamachi, Naofumi Hiehata, Masashi Yamamoto, Takeshi Hayashi

PLOS ONE 13(8) 2018年8月査読有り
Genome-wide association study and genomic prediction using parental and breeding populations of Japanese pear (Pyrus pyrifolia Nakai)

Mai F. Minamikawa, Norio Takada, Shingo Terakami, Toshihiro Saito, Akio Onogi, Hiromi Kajiya-Kanegae, Takeshi Hayashi, Toshiya Yamamoto, Hiroyoshi Iwata

SCIENTIFIC REPORTS 8(1) 11994-11994 2018年8月査読有り
Bayesian QTL mapping using genome-wide SSR markers and segregating population derived from a cross of two commercial F-1 hybrids of tomato

Akio Ohyama, Kenta Shirasawa, Hiroshi Matsunaga, Satomi Negoro, Koji Miyatake, Hirotaka Yamaguchi, Tsukasa Nunome, Hiroyoshi Iwata, Hiroyuki Fukuoka, Takeshi Hayashi

THEORETICAL AND APPLIED GENETICS 130(8) 1601-1616 2017年8月査読有り
Genome-wide association study and genomic prediction in citrus: Potential of genomics-assisted breeding for fruit quality traits

Mai F. Minamikawa, Keisuke Nonaka, Eli Kaminuma, Hiromi Kajiya-Kanegae, Akio Onogi, Shingo Goto, Terutaka Yoshioka, Atsushi Imai, Hiroko Hamada, Takeshi Hayashi, Satomi Matsumoto, Yuichi Katayose, Atsushi Toyoda, Asao Fujiyama, Yasukazu Nakamura, Tokurou Shimizu, Hiroyoshi Iwata

SCIENTIFIC REPORTS 7(1) 4721-4721 2017年7月査読有り

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MISC

iPOTs:干ばつ条件での植物フェノタイピングを可能にするIoTベース土壌水分制御ポットシステムの開発

沼尻侑子, 吉野花奈美, 寺本翔太, 林篤司, 西嶋遼, 田中剛, 林武司, 川勝泰二, 七夕高也, 宇賀優作

育種学研究 23 2021年
Cytoscape.jsライブラリを用いた作物形質オントロジーの可視化

法隆大輔, 小野木章雄, 林武司

育種学研究 23 2021年
リンゴ祖先ハプロタイプ情報を用いたゲノミック予測とゲノムワイド関連解析

南川舞, 國久美由紀, 野下浩司, 野下浩司, 森谷茂樹, 阿部和幸, 林武司, 片寄裕一, 山本俊哉, 岩田洋佳

育種学研究 22 2020年
ニホンナシ成熟果実における糖組成のゲノムワイドアソシエーション解析

西尾聡悟, 齋藤寿広, 林武司, 白澤健太, 寺上伸吾, 高田教臣, 竹内由季恵, 加藤秀憲, 板井章浩

園芸学研究別冊 19(1) 2020年
イチジクFcRAN1座アレルにおける分離比歪みの観察とその遺伝的要因の解析

池上秀利, 白澤健太, 薬師寺博, 矢部志央理, 佐藤大, 林武司, 田代康介, 野方仁

育種学研究 22 2020年
ゲノム予測にむけた過去の育種試験で蓄積されたイネの形質データ整備

松下景, 松下景, 小野木章雄, 小野木章雄, 小野木章雄, 鐘ケ江弘美, 林武司, KWON Y., 保田浩, 太田久稔, 太田久稔, 藤村健太郎, 長岡一朗, 後藤明俊, KIM D., KIM D., 笹原英樹, 竹内善信, 石井卓朗, 菊井玄一郎, 矢野昌裕, 米丸淳一, 米丸淳一

育種学研究 22 2020年
イチジクのゲノミック予測に基づくF₁分離予測

矢部志央理, 白澤健太, 池上秀利, 姫野修一, 野方仁, 田代康介, 林武司

育種学研究 21 68 2019年9月6日
Single-step genomic prediction of fruit-quality traits using phenotypic records of non-genotyped relatives in citrus

Atsushi Imai, Takeshi Kuniga, Terutaka Yoshioka, Keisuke Nonaka, Nobuhito Mitani, Hiroshi Fukamachi, Naofumi Hiehata, Masashi Yamamoto, Takeshi Hayashi

PLOS ONE 14(8) 2019年8月
ゲノム編集技術による穂発芽耐性の改良されたコムギ育種素材

安倍史高, ハクエムダドウル, 久野裕, 田中剛, 神谷容子, 三上雅史, 川浦香奈子, 遠藤真咲, 大西一光, 林武司, 佐藤和広

農研機構次世代作物開発研究センター成果情報(Web) 2019 2019年
イネ穂構造と粒重分布の関係の遺伝統計学的推定

矢部志央理, 林武司, 中川博視, 吉田ひろえ, 鐘ケ江弘美, 山本英司, 山崎将紀, 岩田洋佳, 江花薫子, 伏見栄利奈, 前田英郎

日本作物学会講演会要旨集 247 193-193 2019年
イチジク品種・系統群の全ゲノム配列情報を用いたGWASによる果皮色関連ゲノム領域の探索

池上秀利, 白澤健太, 林武司, 薬師寺博, 姫野修一

園芸学研究別冊 17(2) 402 2018年9月22日
パンコムギにおけるCRISPR/Cas9を用いたTaQsd1全同祖遺伝子のゲノム編集:3.編集ホモ系統の形質評価

HAQUE E, 安倍史高, 林武司, 久野裕, 田中剛, 神谷容子, 川浦香奈子, 佐藤和広

育種学研究 20 162 2018年9月22日
キャベツ4元交雑集団を利用したゲノムワイドSNP開発と抽だい性・結球性のQTL解析

畠山勝徳, 白澤健太, 小貫律子, 田中剛, 山本英司, 山本英司, 片寄裕一, 福岡浩之, 松元哲, 柿崎智博, 林武司

育種学研究別冊 20(2) 148 2018年9月
高品質多収トマト育成における育種技術的展望

大山暁男, 松永啓, 林武司

農業および園芸 93(7) 626-631 2018年7月
複数のアルゴリズムを組み合わせた祖先ハプロタイプの推定:リンゴデータへの適用

南川舞, 國久美由紀, 野下浩司, 森谷茂樹, 阿部和幸, 林武司, 片寄裕一, 山本俊哉, 岩田洋佳

育種学研究 20 2018年
トマトF1品種間交雑に由来するRILsを育種母集団としたゲノミックセレクションの実践と効果検証

大山暁男, 山本英司, 松永啓, 宮武宏治, 山口博隆, 布目司, 福岡浩之, 福岡浩之, 林武司

育種学研究 19 176 2017年10月7日
ニホンナシの複数育種集団を利用した,ゲノムワイド関連解析とゲノミックセレクションの予測精度評価

南川舞, 寺上伸吾, 高田教臣, 齋藤寿広, 小野木章雄, 鐘ケ江弘美, 林武司, 山本俊哉, 岩田洋佳

園芸学研究別冊 16(2) 354 2017年9月2日
日本水稲品種群における粒重分布と穂構造の関係

矢部志央理, 矢部志央理, 吉田ひろえ, 山崎将紀, 岩田洋佳, 江花薫子, 林武司, 中川博視

育種学研究 19 254 2017年3月29日
リンゴのゲノミックセレクションにおけるハプロタイプ情報利用の効果

國久美由紀, 森谷茂樹, 阿部和幸, 林武司, 岩田洋佳, 野下浩司, 南川舞, 片寄裕一, 西谷千佳子, 寺上伸吾, 山本俊哉

育種学研究 19 66 2017年3月29日
日本水稲品種群を用いた粒重分布の特徴記述と品種間差の解析

矢部志央理, 矢部志央理, 吉田ひろえ, 山崎将紀, 林武司, 中川博視

育種学研究 18 197 2016年9月24日

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