森田陸離 (Rikuri Morita) - マイポータル

基本情報

所属: 筑波大学計算科学研究センター研究員

学位: 博士（理学）(2020年3月筑波大学)

連絡先: moritaccs.tsukuba.ac.jp
研究者番号: 90896268
ORCID ID: https://orcid.org/0000-0002-0465-5528
J-GLOBAL ID: 202001002213124586
researchmap会員ID: R000001743

外部リンク: https://sites.google.com/view/morita-rikuri/

研究キーワード

研究分野

経歴

2020年4月 - 現在

筑波大学, 計算科学研究センター, 研究員

学歴

2017年4月 - 2020年3月

筑波大学, 生命環境科学研究科, 生物科学専攻博士後期課程
2015年4月 - 2017年3月

筑波大学, 生命環境科学研究科, 生物科学専攻博士前期課程
2011年4月 - 2015年3月

筑波大学, 生命環境学群生物学類

受賞

2021年7月

若手優秀研究発表賞, 新学術領域研究「生命金属科学」領域会議第４回地方巡業（東京）
2019年6月

優秀ポスター賞, 第４６回生体分子科学討論会
2018年1月

ポスター賞, 国際細胞生物学会 2018
2017年3月

専攻長表彰, 筑波大学生命環境科学研究科生物科学専攻
2017年3月

研究科長表彰, 筑波大学生命環境科学研究科

論文

Latrunculin resistance mechanism of non‐conventional actin NAP1 uncovered by molecular dynamics simulations

Rikuri Morita, Yasuteru Shigeta, Ryuhei Harada

Cytoskeleton 2024年2月査読有り筆頭著者責任著者
Pathological mutations promote proteolysis of mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1 (MTU1) via mitochondrial caseinolytic peptidase (CLPP).

Raja Norazireen Raja Ahmad, Long-Teng Zhang, Rikuri Morita, Haruna Tani, Yong Wu, Takeshi Chujo, Akiko Ogawa, Ryuhei Harada, Yasuteru Shigeta, Kazuhito Tomizawa …

Nucleic acids research 2023年12月19日
Yeast PRPP amidotransferase assembles into fine granules to promotede novopurine synthesis through intermolecular substrate channeling

Masak Takaine, Rikuri Morita

2023年6月6日
Efficient screening of protein-ligand complexes in lipid bilayers using LoCoMock score.

Rikuri Morita, Yasuteru Shigeta, Ryuhei Harada

Journal of computer-aided molecular design 2023年3月21日査読有り筆頭著者責任著者
Free-Energy Profiles for Membrane Permeation of Compounds Calculated Using Rare-Event Sampling Methods.

Ryuhei Harada, Rikuri Morita, Yasuteru Shigeta

Journal of chemical information and modeling 63(1) 259-269 2023年1月9日査読有り
Protein Structure Validation Derives a Smart Conformational Search in a Physically Relevant Configurational Subspace

Takunori Yasuda, Rikuri Morita, Yasuteru Shigeta, Ryuhei Harada

Journal of Chemical Information and Modeling 62(23) 2022年12月12日
Identifying antibiotics based on structural differences in the conserved allostery from mitochondrial heme-copper oxidases

Yuya Nishida, Sachiko Yanagisawa, Rikuri Morita, Hideki Shigematsu, Kyoko Shinzawa-Itoh, Hitomi Yuki, Satoshi Ogasawara, Ken Shimuta, Takashi Iwamoto, Chisa Nakabayashi …

Nature Communications 13(1) 2022年12月8日査読有り
Autism-associated mutation in Hevin/Sparcl1 induces endoplasmic reticulum stress through structural instability

Takumi Taketomi, Takunori Yasuda, Rikuri Morita, Jaehyun Kim, Yasuteru Shigeta, Cagla Eroglu, Ryuhei Harada, Fuminori Tsuruta

Scientific Reports 12(1) 2022年12月査読有り
Structural Validation by the G-Factor Properly Regulates Boost Potentials Imposed in Conformational Sampling of Proteins

Takunori Yasuda, Rikuri Morita, Yasuteru Shigeta, Ryuhei Harada

Journal of Chemical Information and Modeling 62(14) 2022年7月25日
Phosphorylation in the accessory domain of yeast histone chaperone protein 1 exposes the nuclear export signal sequence.

Sho Ashida, Rikuri Morita, Yasuteru Shigeta, Ryuhei Harada

Proteins 90(2) 317-321 2022年2月査読有り筆頭著者
Histone H3 Inhibits Ubiquitin-Ubiquitin Intermolecular Interactions to Enhance Binding to DNA Methyl Transferase 1.

Takunori Yasuda, Rikuri Morita, Yasuteru Shigeta, Ryuhei Harada

Journal of molecular biology 434(2) 167371-167371 2022年1月30日
Structural Variations of Metallothionein with or without Zinc Ions Elucidated by All-Atom Molecular Dynamics Simulations.

Rikuri Morita, Yasuteru Shigeta, Ryuhei Harada

The journal of physical chemistry. B 125(46) 12712-12717 2021年11月25日査読有り筆頭著者責任著者
A post-process to estimate an approximated minimal free energy path based on local centroids

Rikuri Morita, Yasuteru Shigeta, Ryuhei Harada

CHEMICAL PHYSICS LETTERS 782 2021年11月査読有り筆頭著者責任著者
Integrate in silico studies on the role of nicotinamide adenine dinucleotide (NADH) binding in activating C-terminal binding protein 2 (CtBP2)

Tsukasa Aoyagi, Ryunosuke Yoshino, Yuki Mitsuta, Rikuri Morita, Ryuhei Harada, Yasuteru Shigeta

Chemistry Letters 2021年10月14日査読有り
In silico mutational analyses reveal different ligand-binding abilities of double pockets of medaka fish taste receptor type 1 essential for efficient taste recognition.

Hayato Aida, Rikuri Morita, Yasuteru Shigeta, Ryuhei Harada

Physical chemistry chemical physics : PCCP 23(36) 20398-20405 2021年9月22日査読有り筆頭著者
Independent Nontargeted Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics (Ino-PaCS-MD) to Enhance the Conformational Sampling of Proteins.

Takunori Yasuda, Rikuri Morita, Yasuteru Shigeta, Ryuhei Harada

Journal of chemical theory and computation 17(9) 5933-5943 2021年9月14日査読有り
Comprehensive predictions of secondary structures for comparative analysis in different species.

Rikuri Morita, Yasuteru Shigeta, Ryuhei Harada

Journal of structural biology 213(2) 107735-107735 2021年6月査読有り筆頭著者責任著者
Cell cycle-dependent phosphorylation of IQGAP is involved in assembly and stability of the contractile ring in fission yeast.

Rikuri Morita, Osamu Numata, Kentaro Nakano, Masak Takaine

Biochemical and biophysical research communications 534 1026-1032 2021年1月1日査読有り筆頭著者
Rearrangements of Water Molecules in Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics Enhance Structural Explorations of Proteins

Rikuri Morita, Yasuteru Shigeta, Ryuhei Harada

BULLETIN OF THE CHEMICAL SOCIETY OF JAPAN 94(1) 97-105 2021年1月15日査読有り筆頭著者責任著者
Molecular Mechanism for the Actin-Binding Domain of α-Actinin Ain1 Elucidated by Molecular Dynamics Simulations and Mutagenesis Experiments

Rikuri Morita, Kentaro Nakano, Yasuteru Shigeta, Ryuhei Harada

The Journal of Physical Chemistry B 124(39) 8495-8503 2020年10月1日査読有り筆頭著者責任著者

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所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

アクチン細胞骨格の機能的品質と量を保障する分子機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2023年4月 - 2027年3月

中野賢太郎, 松田真弥, 森田陸離
分子動力学計算とモデル生物で導き出す減数分裂開始機構の実態

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2023年4月 - 2026年3月

松田真弥, 森田陸離
生体膜の両親媒効果を取り込んだドッキングシミュレーション手法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2023年4月 - 2025年3月

森田陸離
任意のタンパク質に蛍光能を付加する分子設計

株式会社モルシス第1回 MOLSIS-CCG GRANT 2022年10月 - 2023年9月
プリン生合成を制御する細胞内構造体プリノソームの形成機構と役割の解明

群馬大学生体調節研究所令和4年度内分泌・代謝学共同研究拠点共同研究 2022年4月 - 2023年3月

森田陸離, 高稲正勝
プリン生合成を制御する細胞内構造体プリノソームの形成機構と役割の解明

群馬大学生体調節研究所令和3年度内分泌・代謝学共同研究拠点共同研究（若手） 2021年4月 - 2022年3月

森田陸離, 高稲正勝

メディア報道

膜タンパク質に対して創薬シミュレーションを可能にする計算手法を開発

筑波大学計算科学研究センター 2023年3月22日インターネットメディア
呼吸鎖酵素に隠された阻害機構の解明〜病原菌特異的な新規抗菌薬の合理的創出を目指して〜

国立循環器病研究センター 2022年12月16日インターネットメディア
自閉症責任遺伝子の変異が小胞体ストレスを誘導するメカニズムを発見

筑波大学 2022年7月15日インターネットメディア
薬剤の膜透過メカニズムを解明する計算手法を提案

筑波大学計算科学研究センターインターネットメディア

森田陸離

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