渋谷理紗 (Risa Shibuya) - マイポータル

基本情報

所属: 大阪大学大学院工学研究科特任助教

ORCID iD: https://orcid.org/0000-0002-1337-9334
J-GLOBAL ID: 202301005070434326
researchmap会員ID: R000059753

経歴

2022年4月 - 現在

大阪大学, 大学院工学研究科, 特任助教（常勤）
2020年4月 - 2022年3月

国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域バイオメディカル研究部門, 特別研究員

論文

Quantitative Analysis and Predictive Modeling of Nonspecific Adsorption of Recombinant Adeno-Associated Virus onto Solid Surfaces

Yuki Ueda, Risa Shibuya, Koichi Shibata, Airi Murai, Yasuo Tsunaka, Mitsuko Fukuhara, Susumu Uchiyama

Langmuir 2026年3月10日
Experimental determination of extinction coefficients by sedimentation velocity analytical ultracentrifugation for accurate quantification of recombinant adeno-associated virus

Yuki Yamaguchi, Takahiro Maruno, Takaaki Kurinomaru, Risa Shibuya, Mitsuko Fukuhara, Yasuo Tsunaka, Susumu Uchiyama

Journal of Pharmaceutical Sciences 2026年2月
Variation of VP2 stoichiometry and deamidation of VP1 during production and their impacts on the transduction efficiency of AAV vectors.

Takahiro Maruno, Mitsuko Fukuhara, Yasuo Tsunaka, Aoba Matsushita, Kiichi Hirohata, Karin Bandoh, Megumi Onaka, Risa Shibuya, Yuki Yamaguchi, Haruka Nishiumi …

Molecular therapy. Methods & clinical development 33(4) 101581-101581 2025年12月11日
Unfolding of viral protein 1 N-termini facilitates genome ejection from recombinant adeno-associated virus serotype 8.

Yuki Yamaguchi, Saki Shimojo, Tomohiko Ikeda, Mitsuko Fukuhara, Yasuo Tsunaka, Risa Shibuya, Mark Allen Vergara Rocafort, Ryoji Nakatsuka, Kiichi Hirohata, Tetsuo Torisu …

Molecular therapy. Methods & clinical development 33(2) 101480-101480 2025年6月12日
Direct Identification and Quantification of Recombinant Adeno-Associated Virus in Crude Cell Lysate and Conditioned Medium by Mass Photometry

Yuki Yamaguchi, Saki Shimojo, Risa Shibuya, Karin Bandoh, Aoba Matsushita, Mitsuko Fukuhara, Yasuo Tsunaka, Tetsuo Torisu, Susumu Uchiyama

Analytical Chemistry 2025年5月20日
Hierarchical clustering of therapeutic proteins based on agitation-induced aggregation propensity and its relation to physicochemical parameters

Rio Okada, Kosei Shibata, Risa Shibuya, Tetsuo Torisu, Susumu Uchiyama

European Journal of Pharmaceutical Sciences 2025年5月
Glycosylation of recombinant adeno-associated virus serotype 6

Yuki Yamaguchi, Kentaro Ishii, Sachiko Koizumi, Hiroaki Sakaue, Takahiro Maruno, Mitsuko Fukuhara, Risa Shibuya, Yasuo Tsunaka, Aoba Matsushita, Karin Bandoh …

Molecular Therapy - Methods & Clinical Development 32(2) 101256-101256 2024年6月
Applications and Limitations of Equilibrium Density Gradient Analytical Ultracentrifugation for the Quantitative Characterization of Adeno-Associated Virus Vectors

Kiichi Hirohata, Yuki Yamaguchi, Takahiro Maruno, Risa Shibuya, Tetsuo Torisu, Takayuki Onishi, Hideto Chono, Junichi Mineno, Yuan Yuzhe, Kiyoko Higashiyama …

Analytical Chemistry 2024年1月16日
Optimization of Flow Imaging Microscopy Setting Using Spherical Beads with Optical Properties Similar to Those of Biopharmaceuticals.

Takaaki Kurinomaru, Kimitoshi Takeda, Megumi Onaka, Yuki Kuruma, Keiji Takahata, Kayori Takahashi, Hiromu Sakurai, Akira Sasaki, Naohiro Noda, Shinya Honda …

Journal of pharmaceutical sciences 2023年10月7日
Determination of the optimal connector length to enhance stability of backbone-circularized granulocyte colony-stimulating factor.

Yosuke Yasuzawa, Risa Shibuya, Yukako Senga, Takamitsu Miyafusa, Shinya Honda

FEBS open bio 13(10) 1910-1921 2023年10月
A special issue of the Australian society for Biophysics.

Cristobal Dos Remedios, Charles Cranfield, Donna Whelan, Charles Cox, Keith Shearwin, Joshua Ho, Toby Allen, Risa Shibuya, Emi Hibino, Kumiko Hayashi …

Biophysical reviews 14(1) 1-2 2022年2月
Effect of backbone circularization on colloidal stability: Compaction of unfolded structures improves aggregation resistance of granulocyte colony-stimulating factor.

Risa Shibuya, Takamitsu Miyafusa, Hiroshi Imamura, Ayako Ooishi, Shinya Honda

International journal of pharmaceutics 605 120774-120774 2021年8月10日
Announcing the call for the Special Issue on "The Australian Society for Biophysics (ASB) - 2021 Meeting".

Charles Cranfield, Donna Whelan, Charles Cox, Keith Shearwin, Joshua Ho, Toby Allen, Risa Shibuya, Emi Hibino, Kumiko Hayashi, Cristobal Dos Remedios …

Biophysical reviews 13(4) 485-486 2021年8月
Stabilization of backbone-circularized protein is attained by synergistic gains in enthalpy of folded structure and entropy of unfolded structure.

Risa Shibuya, Takamitsu Miyafusa, Shinya Honda

The FEBS journal 287(8) 1554-1575 2020年4月
CH2 domain orientation of human immunoglobulin G in solution: Structural comparison of glycosylated and aglycosylated Fc regions using small-angle X-ray scattering.

Seiki Yageta, Hiroshi Imamura, Risa Shibuya, Shinya Honda

mAbs 11(3) 453-462 2019年4月
Structural insights into the backbone-circularized granulocyte colony-stimulating factor containing a short connector.

Takamitsu Miyafusa, Risa Shibuya, Shinya Honda

Biochemical and biophysical research communications 500(2) 224-228 2018年6月2日
Backbone Circularization Coupled with Optimization of Connecting Segment in Effectively Improving the Stability of Granulocyte-Colony Stimulating Factor.

Takamitsu Miyafusa, Risa Shibuya, Wataru Nishima, Rie Ohara, Chuya Yoshida, Shinya Honda

ACS chemical biology 12(10) 2690-2696 2017年10月20日
Conformational and Colloidal Stabilities of Human Immunoglobulin G Fc and Its Cyclized Variant: Independent and Compensatory Participation of Domains in Aggregation of Multidomain Proteins.

Seiki Yageta, Risa Shibuya, Hiroshi Imamura, Shinya Honda

Molecular pharmaceutics 14(3) 699-711 2017年3月6日

MISC

環状体サイトカインの結合末端ループ長の最適化

渋谷理紗, 宮房孝光, 二島渉, 本田真也

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 16th 2016年
顆粒球コロニー刺激因子の溶液小角X線散乱

渋谷理紗, 今村比呂志, 八桁清樹, 本田真也, 本田真也

KEK Progress Report (Web) (2017-10) 2017年
主鎖環状化を利用したG-CSFの安定化改変

宮房孝光, 渋谷理紗, 二島渉, 大原璃恵, 吉田昼也, 本田真也, 本田真也

日本生化学会大会(Web) 90th 2017年
G-CSFの主鎖環状化が構造安定性に及ぼす熱力学的効果

渋谷理紗, 宮房孝光, 本田真也, 本田真也

日本生化学会大会(Web) 90th 2017年
酸性および中性下の免疫グロブリンGの溶液構造

今村比呂志, 八桁清樹, 渋谷理紗, 本田真也, 本田真也

KEK Progress Report (Web) (2016-8) 2017年
主鎖環状化G-CSFが持つ熱力学的安定性と構造安定性の解析

渋谷理紗, 宮房孝光, 本田真也, 本田真也

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 18th 2018年
X線小角散乱測定によるglycosylatedおよびaglycosylated IgG1-Fcの高次構造解析

八桁清樹, 今村比呂志, 今村比呂志, 渋谷理紗, 本田真也, 本田真也, 本田真也

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 18th 2018年
主鎖環状化サイトカインの設計と物性評価

宮房孝光, 渋谷理紗, 二島渉, 大原璃恵, 吉田昼也, 本田真也, 本田真也

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 18th 2018年
免疫グロブリンGのFc領域の糖鎖の除去でopen構造は誘起されない:溶液小角X線散乱による証明

今村比呂志, 今村比呂志, 八桁清樹, 渋谷理紗, 本田真也, 本田真也

KEK Progress Report (Web) (2019-7) 2019年
主鎖環状化顆粒球コロニー刺激因子の結晶構造解析と分子内相互作用の評価

渋谷理紗, 宮房孝光, 本田真也, 本田真也

KEK Progress Report (Web) (2019-7) 2019年
主鎖環状化したG-CSFはループの長さで熱安定性が異なる

安澤葉介, 渋谷理沙, 宮房孝光, 本田真也, 本田真也

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 43rd 2020年
主鎖環状化顆粒球コロニー刺激因子の結晶構造解析と天然構造安定化効果の評価

渋谷理紗, 宮房孝光, 本田真也, 本田真也

KEK Progress Report (Web) (2020-6) 2020年
SAXSを用いた主鎖環状化顆粒球コロニー刺激因子の溶液構造と凝集体のサイズ解析

渋谷理紗, 渋谷理紗, 今村比呂志, 今村比呂志, 宮房孝光, 宮房孝光, 大石郁子, 本田真也, 本田真也

KEK Progress Report (Web) (2021-4) 2021年
顆粒球コロニー刺激因子の局所的に不規則変化した構造の探索

渋谷理紗, 渋谷理紗, 山守優, 富井健太郎, 富井健太郎, 本田真也, 本田真也

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 22nd (Web) 2022年
Correlation Analyses of the Quality Attributes of Adeno-Associated Virus Vectors Revealed the Positive Impact of the Viral Protein 2 Ratio on Transduction Efficiency

Takahiro Maruno, Mitsuko Fukuhara, Yasuo Tsunaka, Aoba Matsushita, Kiichi Hirohata, Karin Bandoh, Megumi Onaka, Risa Shibuya, Yuki Yamaguchi, Yoshiki Nagashima …

MOLECULAR THERAPY 32(4) 291-292 2024年4月22日
Mucin-Type O-Glycosylation in Viral Protein 2 Indirectly Affects the Transduction Efficiency of Recombinant Adeno-Associated Virus Serotype 6

Yuki Yamaguchi, Kentaro Ishii, Sachiko Koizumi, Hiroaki Sakaue, Takahiro Maruno, Mitsuko Fukuhara, Risa Shibuya, Yasuo Tsunaka, Aoba Matsushita, Karin Bandoh …

MOLECULAR THERAPY 32(4) 688-689 2024年4月22日
Direct Monitoring of rAAVs in Crude Cell Lysate and Conditioned Medium

Yuki Yamaguchi, Saki Shimojo, Risa Shibuya, Karin Bandoh, Aoba Matsushita, Mitsuko Fukuhara, Yasuo Tsunaka, Tetsuo Torisu, Susumu Uchiyama

MOLECULAR THERAPY 33(4) 2025年4月28日
Investigation of the Variations in Viral Protein 2 Stoichiometric Ratio and Deamidation of Viral Protein 1 and Their Impacts on Transduction Efficiency of Adeno-Associated Virus 8 Vectors

Takahiro Maruno, Mitsuko Fukuhara, Yasuo Tsunaka, Aoba Matsushita, Kiichi Hirohata, Karin Bandoh, Megumi Onaka, Risa Shibuya, Yuki Yamaguchi, Haruka Nishiumi …

MOLECULAR THERAPY 33(4) 2025年4月28日
The influence of VP1 N-termini on heat-induced genome release of adeno-associated virus serotype 8

Yuki Yamaguchi, Saki Shimojo, Tomohiko Ikeda, Mitsuko Fukuhara, Yasuo Tsunaka, Risa Shibuya, Mark Allen Rocafort, Ryoji Nakatsuka, Kiichi Hirohata, Tetsuo Torisu …

MOLECULAR THERAPY 33(4) 2025年4月28日
Serotype-Dependent Optimization of Formulation for AAV Vectors Based on Stability against Aggregation

Risa Shibuya, Kosei Shibata, Amane Yamaguchi, Kazuto Chino, Mitsuko Fukuhara, Yasuo Tsunaka, Tetsuo Torisu, Susumu Uchiyama

MOLECULAR THERAPY 33(4) 2025年4月28日

書籍等出版物

遺伝子治療開発研究ハンドブック第2版

日本遺伝子細胞治療学会, 藤堂, 具紀監修

エヌ・ティー・エス 2023年4月 (ISBN: 9784860438401)

渋谷理紗

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論文

MISC

書籍等出版物

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