川勝泰二 (Kawakatsu Taiji) - マイポータル

基本情報

所属: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構生物機能利用研究部門上級研究員

学位: 博士(東京大学)

研究者番号: 30435614
J-GLOBAL ID: 201601009792262377
researchmap会員ID: B000259347

全ての生命現象は適切なタイミングで遺伝子の働きがオン・オフに制御されることで成立しています。このプログラムはゲノムの本体であるDNAの配列だけでなく、DNAの化学修飾やDNAが巻きつくヒストンタンパク質の化学修飾といったエピゲノムにも大きく依存しています。私はこれまでに、イネの形が作られる仕組みやコメに蓄積される貯蔵タンパク質が蓄積する仕組み、またシロイヌナズナのエピゲノム多様性について研究を進めてきました。現在はコメが作られるプログラムを解明し、胚乳品質を向上させるための基盤技術開発に取り組んでいます。

研究キーワード

研究分野

経歴

2021年4月 - 現在

国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構生物機能利用研究部門作物生長機構研究領域作物環境適応機構グループ上級研究員
2019年10月 - 2021年3月

国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構生物機能利用研究部門新産業開拓領域有用物質生産作物開発ユニット上級研究員
2016年4月 - 2019年9月

国立研究開発法人農業・食品産業総合技術研究機構生物機能利用研究部門新産業開拓領域有用物質生産作物開発ユニット主任研究員
2011年4月 - 2016年3月

独立行政法人農業生物資源研究所遺伝子組換え研究センター機能性作物研究開発ユニット主任研究員
2012年10月 - 2014年10月

Salk Institute for Biological Studies, Plant Molecular Biology/Genomic Analysis Lab, Research Associate (JSPS海外特別研究員)
2011年4月 - 2012年3月

独立行政法人農業生物資源研究所副研究主幹
2006年4月 - 2011年3月

独立行政法人農業生物資源研究所遺伝子組換え作物開発センター任期付研究員

学歴

2001年4月 - 2006年3月

東京大学大学院農学生命科学研究科生産・環境生物学専攻
1997年4月 - 2001年3月

東京大学農学部応用生物学専修

委員歴

2022年 - 現在

Plant and Cell Physiology Editor
2018年9月 - 現在

植物インフォマティクス研究会運営委員

受賞

2018年4月

若手科学者賞植物におけるエピゲノム多様性の研究 H30年度文部科学大臣表彰

川勝泰二

論文

Multi-layered epigenetic control of persistent and stage-specific imprinted genes in rice endosperm

Kaoru Tonosaki, Akemi Ono, Hiroki Nagata, Hiroyasu Furuumi, Ken-ichi Nonomura, Yutaka Sato, Luca Comai, Katsunori Hatakeyama, Taiji Kawakatsu, Tetsu Kinoshita

2023年1月11日
Genome-wide cis-decoding for expression design in tomato using cistrome data and explainable deep learning.

Takashi Akagi, Kanae Masuda, Eriko Kuwada, Kouki Takeshita, Taiji Kawakatsu, Tohru Ariizumi, Yasutaka Kubo, Koichiro Ushijima, Seiichi Uchida

The Plant cell 34(6) 2174-2187 2022年5月24日
Reinvention of hermaphroditism via activation of a RADIALIS-like gene in hexaploid persimmon.

Kanae Masuda, Yoko Ikeda, Takakazu Matsuura, Taiji Kawakatsu, Ryutaro Tao, Yasutaka Kubo, Koichiro Ushijima, Isabelle M Henry, Takashi Akagi

Nature plants 8(3) 217-224 2022年3月
Temporal Changes in Transcripts of MITE Transposable Elements during Rice Endosperm Development

Hiroki Nagata, Akemi Ono, Kaoru Tonosaki, Taiji Kawakatsu, Kentaro Yano, Yuji Kishima, Tetsu Kinoshita

2021年9月28日
iPOTs: Internet of Things-based pot system controlling optional treatment of soil water condition for plant phenotyping under drought stress.

Yuko Numajiri, Kanami Yoshino, Shota Teramoto, Atsushi Hayashi, Ryo Nishijima, Tsuyoshi Tanaka, Takeshi Hayashi, Taiji Kawakatsu, Takanari Tanabata, Yusaku Uga

The Plant journal : for cell and molecular biology 107(5) 1569-1580 2021年9月
Mutation of the imprinted gene OsEMF2a induces autonomous endosperm development and delayed cellularization in rice.

Kaoru Tonosaki, Akemi Ono, Megumi Kunisada, Megumi Nishino, Hiroki Nagata, Shingo Sakamoto, Saku T Kijima, Hiroyasu Furuumi, Ken-Ichi Nonomura, Yutaka Sato, Masaru Ohme-Takagi, Masaki Endo, Luca Comai, Katsunori Hatakeyama, Taiji Kawakatsu, Tetsu Kinoshita

The Plant cell 33(1) 85-103 2021年3月22日
The transcriptomic landscapes of rice cultivars with diverse root system architectures grown in upland field conditions.

Taiji Kawakatsu, Shota Teramoto, Satoko Takayasu, Natsuko Maruyama, Ryo Nishijima, Yuka Kitomi, Yusaku Uga

The Plant journal : for cell and molecular biology 106(4) 1177-1190 2021年3月9日
De Novo Genome Assembly of the indica Rice Variety IR64 Using Linked-Read Sequencing and Nanopore Sequencing.

Tsuyoshi Tanaka, Ryo Nishijima, Shota Teramoto, Yuka Kitomi, Takeshi Hayashi, Yusaku Uga, Taiji Kawakatsu

G3 (Bethesda, Md.) 10(5) 1495-1501 2020年3月17日査読有り最終著者責任著者
Low-cost RNA extraction method for highly scalable transcriptome studies

Yoshino Kanami, Nishijima Ryo, Kawakatsu Taiji

Breeding Science 70(4) 481-486 2020年査読有り
Common alleles of CMT2 and NRPE1 are major determinants of CHH methylation variation in Arabidopsis thaliana.

Eriko Sasaki, Taiji Kawakatsu, Joseph R Ecker, Magnus Nordborg

PLoS genetics 15(12) e1008492 2019年12月査読有り
Gene networks orchestrated by MeGI: a single-factor mechanism underlying sex determination in persimmon.

Yang HW, Akagi T, Kawakatsu T, Tao R

The Plant journal : for cell and molecular biology 98(1) 97-111 2019年4月査読有り
Transgene-independent heredity of RdDM-mediated transcriptional gene silencing of endogenous genes in rice.

Yuhya Wakasa, Taiji Kawakatsu, Takeo Harada, Fumio Takaiwa

Plant biotechnology journal 16(12) 2007-2015 2018年12月査読有り
Dynamic DNA methylation reconfiguration during seed development and germination

Taiji Kawakatsu, Joseph R. Nery, Rosa Castanon, Joseph R. Ecker

GENOME BIOLOGY 18 2017年9月査読有り
Divergent cytosine DNA methylation patterns in single-cell, soybean root hairs

Md Shakhawat Hossain, Taiji Kawakatsu, Kyung Do Kim, Ning Zhang, Cuong T. Nguyen, Saad M. Khan, Josef M. Batek, Trupti Joshi, Jeremy Schmutz, Jane Grimwood, Robert J. Schmitz, Dong Xu, Scott A. Jackson, Joseph R. Ecker, Gary Stacey

NEW PHYTOLOGIST 214(2) 808-819 2017年4月査読有り筆頭著者
Epigenomic Diversity in a Global Collection of Arabidopsis thaliana Accessions

Taiji Kawakatsu, Shao-shan Carol Huang, Florian Jupe, Eriko Sasaki, Robert J. Schmitz, Mark A. Urich, Rosa Castanon, Joseph R. Nery, Cesar Barragan, Yupeng He, Huaming Chen, Manu Dubin, Cheng-Ruei Lee, Congmao Wang, Felix Bemm, Claude Becker, Ryan O'Neil, Ronan C. O'Malley, Danjuma X. Quarless, Nicholas J. Schork, Detlef Weigel, Magnus Nordborg, Joseph R. Ecker

CELL 166(2) 492-505 2016年7月査読有り
Unique cell-type-specific patterns of DNA methylation in the root meristem

Taiji Kawakatsu, Tim Stuart, Manuel Valdes, Natalie Breakfield, Robert J. Schmitz, Joseph R. Nery, Mark A. Urich, Xinwei Han, Ryan Lister, Philip N. Benfey, Joseph R. Ecker

Nature Plants 2(5) 2016年5月4日査読有り
RNA silencing is induced by the expression of foreign recombinant products in transgenic rice

Lijun Yang, Taiji Kawakatsu, Yuhya Wakasa, Masato Yoine, Fumio Takaiwa

PLANT SCIENCE 225 138-146 2014年8月査読有り
A Whole-Genome Analysis of a Transgenic Rice Seed-Based Edible Vaccine Against Cedar Pollen Allergy

Taiji Kawakatsu, Yoshihiro Kawahara, Takeshi Itoh, Fumio Takaiwa

DNA RESEARCH 20(6) 623-631 2013年12月査読有り
Transgenic rice seeds accumulating recombinant hypoallergenic birch pollen allergen bet v 1 generate giant protein bodies

Shuyi Wang, Hideyuki Takahashi, Hiroyuki Kajiura, Taiji Kawakatsu, Kazuhito Fujiyama, Fumio Takaiwa

Plant and Cell Physiology 54(6) 917-933 2013年6月査読有り
Identification of a cis-element that mediates multiple pathways of the endoplasmic reticulum stress response in rice

Shimpei Hayashi, Hideyuki Takahashi, Yuhya Wakasa, Taiji Kawakatsu, Fumio Takaiwa

PLANT JOURNAL 74(2) 248-257 2013年4月査読有り

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MISC

異なる根系を持つイネの品種間干ばつ応答発現プロファイルの比較

吉野花奈美, 沼尻侑子, 寺本翔太, 吉田沙樹, 西嶋遼, 宇賀優作, 川勝泰二

育種学研究 23 2021年
畑作条件で栽培した世界のイネ品種の根系フェノーム解析

寺本翔太, 高安聡子, 丸山奈津子, 木富悠花, 西嶋遼, 川勝泰二, 宇賀優作

育種学研究 23 2021年
3Dクリノスタットによる微小重力処理後のイネ根端における重力刺激応答遺伝子の網羅的探索

久家徳之, 木富悠花, 西嶋遼, 川勝泰二, 宇賀優作

育種学研究 23 2021年
RNA-Directed DNA Methylation Links Viral Disease and Plant Architecture in Rice.

Taiji Kawakatsu

Molecular plant 13(6) 814-816 2020年6月1日査読有り
Whole-Genome Bisulfite Sequencing and Epigenetic Variation in Cereal Methylomes.

Kawakatsu T

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 2072 119-128 2020年査読有り
Towards a deeper integrated multi-omics approach in the root system to develop climate-resilient rice

Kanami Yoshino, Yuko Numajiri, Shota Teramoto, Naoki Kawachi, Takanari Tanabata, Tsuyoshi Tanaka, Takeshi Hayashi, Taiji Kawakatsu, Yusaku Uga

Molecular Breeding 39(165) 2019年11月査読有り
Diversity and dynamics of DNA methylation: epigenomic resources and tools for crop breeding.

Kawakatsu T, Ecker JR

Breeding science 69(2) 191-204 2019年6月査読有り
Nanopore sequencingとLinked-read sequencingによるインディカ水稲品種「IR64」ゲノムのde novoアセンブリ

田中剛, 西嶋遼, 寺本翔太, 木富悠花, 林武司, 宇賀優作, 川勝泰二

育種学研究 20 2018年
An overview on the strategies to exploit rice endosperm as production platform for biopharmaceuticals

Fumio Takaiwa, Yuhya Wakasa, Shimpei Hayashi, Taiji Kawakatsu

PLANT SCIENCE 263 201-209 2017年10月査読有り
Proteins

Kawakatsu Taiji, Takaiwa Fumio

Encyclopedia of Advanced Plant Science 2 100-105 2017年招待有り
Cereal seed storage protein synthesis: fundamental processes for recombinant protein production in cereal grains

Taiji Kawakatsu, Fumio Takaiwa

PLANT BIOTECHNOLOGY JOURNAL 8(9) 939-953 2010年12月査読有り
イネbZIP型転写因子RISBZ1とDOF型転写因子RPBFの種子登熟における補償作用および相互作用

川勝泰二, 山本将之, 東野(百瀬)悟, 保田浩, 高岩文雄

日本植物生理学会年会要旨集 51st 204 2010年3月12日
スギ花粉症緩和米の安全性確保への取り組み : 大規模隔離ほ場栽培と生物多様性影響評価

廣瀬咲子, 高木英典, 川勝泰二, 若佐雄也, 土門英司, 遠藤雄士, 村岡賢一, 平井一男, 渡邊朋也, 服部誠, 立石剣, 高岩文雄

育種学研究 = Breeding research 10(1) 23-30 2008年3月1日
PLASTOCHRON2 affects the rate of leaf initiation and the duration of vegetative phase through regulating leaf maturation in rice

T Kawakatsu, JI Itoh, K Miyoshi, N Kurata, Y Nagato

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY 47 S116-S116 2006年

所属学協会

産業財産権

US8552256 B2 Gene capable of being expressed specifically in endosperm of plant, promoter for the gene, and use of the gene and the promoter

Takaiwa Fumio, Kawakatsu Taiji
特許5158639 植物の内胚乳に特異的に発現する遺伝子および該遺伝子のプロモーター、並びにそれらの利用

高岩文雄, 川勝泰二

川勝泰二