水内良 (Ryo Mizuuchi) - マイポータル

基本情報

所属: 早稲田大学理工学術院先進理工学部電気・情報生命工学科専任講師

J-GLOBAL ID: 201901012109167243
researchmap会員ID: B000351779

研究キーワード

研究分野

経歴

2023年4月 - 現在

JST 創発研究者
2023年4月 - 現在

早稲田大学, 理工学術院電気・情報生命工学科, 専任講師
2019年10月 - 2023年3月

JST さきがけ研究者
2019年4月 - 2023年3月

東京大学大学院総合文化研究科先進科学研究機構, 特任助教
2018年4月 - 2019年3月

日本学術振興会海外特別研究員（ポートランド州立大学化学科）
2015年4月 - 2018年3月

日本学術振興会特別研究員DC1（大阪大学大学院情報科学研究科）
2015年8月 - 2016年2月

NASA エイムズ研究センター, Research Scholar

学歴

2013年4月 - 2018年3月

大阪大学大学院, 情報科学研究科, バイオ情報工学専攻
2009年4月 - 2013年3月

大阪大学, 工学部応用自然科学科, 応用生物工学コース

受賞

2023年12月

早稲田大学リサーチアワード（国際研究発信力）

水内良
2023年11月

日本生物物理学会若手奨励賞

水内良
2023年10月

Reviewer of the Month, Communications Chemistry, Nature Portfolio

水内良
2023年4月

文部科学大臣表彰若手科学者賞

水内良
2022年6月

研究奨励賞, 日本進化学会

水内良
2020年9月

最優秀ポスター発表賞, 日本進化学会第22回大会

水内良
2018年3月

Life Travel Award 2018, Life, MDPI

水内良
2017年8月

優秀ポスター発表賞, 日本進化学会第19回大会

水内良
2015年6月

The NASA Astrobiology Program award, Astrobiology Science Conference 2015

水内良
2015年3月

情報科学研究科賞, 大阪大学

水内良
2014年10月

PhD students honorable, CEITEC Annual Conference

水内良
2013年3月

工学賞, 大阪大学

水内良

論文

Constraint on an RNA world on montmorillonite clay.

Ryo Mizuuchi

Biophysical journal 123(4) 421-423 2024年2月査読有り招待有り筆頭著者最終著者責任著者
Cell-free expression of RuBisCO for ATP production in the synthetic cells.

Shugo Sugii, Katsumi Hagino, Ryo Mizuuchi, Norikazu Ichihashi

Synthetic biology 8(1) ysad016 2023年12月
Emergence of linkage between cooperative RNA replicators encoding replication and metabolic enzymes through experimental evolution.

Kensuke Ueda, Ryo Mizuuchi, Norikazu Ichihashi

PLoS genetics 19(8) e1010471 2023年8月4日査読有り責任著者
Minimal RNA self-reproduction discovered from a random pool of oligomers

Ryo Mizuuchi, Norikazu Ichihashi

Chemical Science 14(28) 7656-7664 2023年6月査読有り筆頭著者責任著者
How prebiotic complexity increases through Darwinian evolution

Kohtoh Yukawa, Ryo Mizuuchi, Norikazu Ichihashi

Current Opinion in Systems Biology 34 100456 2023年4月査読有り
Plausible pathway for a host-parasite molecular replication network to increase its complexity through Darwinian evolution.

Rikuto Kamiura, Ryo Mizuuchi, Norikazu Ichihashi

PLoS computational biology 18(12) e1010709 2022年12月査読有り
Experimental evidence for the correlation between RNA structural fluctuations and the frequency of beneficial mutations

Yutaro Maeda, Ryo Mizuuchi, Shuji Shigenobu, Atsushi Shibai, Hazuki Kotani, Chikara Furusawa, Norikazu Ichihashi

RNA 28(12) 1659-1667 2022年10月4日査読有り
Evolutionary transition from a single RNA replicator to a multiple replicator network.

Ryo Mizuuchi, Taro Furubayashi, Norikazu Ichihashi

Nature communications 13(1) 1460-1460 2022年3月18日査読有り筆頭著者責任著者
Relaxed Substrate Specificity in Qβ Replicase through Long-Term In Vitro Evolution

Kohtoh Yukawa, Ryo Mizuuchi, Norikazu Ichihashi

Life 12(1) 32 2022年1月査読有り
原始生命を模した分子複製システムの進化と改良

Ryo Mizuuchi

Viva Origino 49(3) 10 2021年12月査読有り招待有り筆頭著者最終著者責任著者
Primitive Compartmentalization for the Sustainable Replication of Genetic Molecules.

Ryo Mizuuchi, Norikazu Ichihashi

Life (Basel, Switzerland) 11(3) 2021年2月28日査読有り筆頭著者責任著者
PURE mRNA display and cDNA display provide rapid detection of core epitope motif via high-throughput sequencing.

Sabrina Galiñanes Reyes, Yutetsu Kuruma, Mai Fujimi, Masako Yamazaki, Sumie Eto, Shota Nishikawa, Satoshi Tamaki, Asaki Kobayashi, Ryo Mizuuchi, Lynn Rothschild …

Biotechnology and bioengineering 118(4) 1736-1749 2021年1月27日査読有り
Translation-coupled RNA replication and parasitic replicators in membrane-free compartments.

Ryo Mizuuchi, Norikazu Ichihashi

Chemical communications (Cambridge, England) 56(87) 13453-13456 2020年10月12日査読有り筆頭著者責任著者
Emergence and diversification of a host-parasite RNA ecosystem through Darwinian evolution.

Taro Furubayashi, Kensuke Ueda, Yohsuke Bansho, Daisuke Motooka, Shota Nakamura, Ryo Mizuuchi, Norikazu Ichihashi

eLife 9 e56038 2020年7月21日査読有り
In vitro evolution of phi29 DNA polymerases through compartmentalized gene expression and rolling-circle replication.

Yoshihiro Sakatani, Ryo Mizuuchi, Norikazu Ichihashi

Protein engineering, design & selection 32(11) 481-487 2020年6月13日査読有り
Structural transition of replicable RNAs during in vitro evolution with Qβ replicase.

Mizuuchi R, Usui K, Ichihashi N

RNA 26(1) 83-90 2020年1月査読有り筆頭著者
A fusion method to develop an expanded artificial genomic RNA replicable by Qβ replicase

Ueda K, Mizuuchi R, Matsuda F, Ichihashi N

ChemBioChem 20(18) 2331-2335 2019年9月16日査読有り
Spontaneous advent of genetic diversity in RNA populations through multiple recombination mechanisms.

Smail BA, Clifton BE, Mizuuchi R, Lehman N

RNA 25(4) 453-464 2019年3月査読有り責任著者
Limited Sequence Diversity Within a Population Supports Prebiotic RNA Reproduction

Mizuuchi R, Lehman N

Life 9(1) 20 2019年2月査読有り筆頭著者責任著者
Mineral surfaces select for longer RNA molecules

Mizuuchi R, Blokhuis A, Vincent L, Nghe P, Lehman N, Baum D

Chemical Communications 55(14) 2090-2093 2019年1月査読有り筆頭著者責任著者

もっとみる

MISC

アマミホシゾラフグがつくる「ミステリーサークル」の謎を解く

川瀬裕司, 水内良, 進寛史, 北嶋友喜, 細田耕, 清水正宏, 岩井大輔, 近藤滋

計測自動制御学会システム・情報部門学術講演会講演論文集 ROMBUNNO.GS03‐5 2017年査読有り
Evolution and Adaptation of the RNA Coupled with an Artificial Life-Like Self-Replication System to a Severe Translational Environment

Ryo Mizuuchi, Norikazu Ichihashi, Kimihito Usui, Tetsuya Yomo

Proceeding of International Astrobiology Workshop 2013 1006 2013年査読有り

講演・口頭発表等

原始的なRNA 集団と自己複製体の探究

第48回生命の起原および進化学会学術講演会 2024年3月
生命の起源と初期進化の追体験

第10回東京女子医科大学・早稲田大学研究交流セミナー 2024年2月招待有り
生命の起源を追体験する

定量生物学の会第十一回年会 2024年1月招待有り
Experimental evolution of artificial RNA replication systems: for understanding the origins of life

International Workshop for Bridging Synthetic, Computational & Evolutionary Biology 2023年12月招待有り
Minimal RNA self-reproduction discovered from a random pool of oligomers

第61回日本生物物理学会年会 2023年11月招待有り
原始⽣命モデルの実験進化で観測不能な⽣命の起源に迫る

日本進化学会第25回大会 2023年9月招待有り
Emergence and evolution of host-parasite ecosystems in a molecular replication system

Confect Symposium 2023 “Marine Microbial Virus Ecology and Evolution 2023年8月招待有り
Evolution of complexity in an artificial RNA replication system

STATPHYS28 Satellite Meeting, Statistical Physics and Information-Processing in Living Systems 2023年8月招待有り
RNA replication systems and evolution: for understanding the origins of life

SPEED × Bottom-up Biotech × ELSI joint workshop 2023年7月招待有り
分子から生命が生まれる道筋を解き明かすために

生命の分子システムの理解に向けて何を創れば良いか？ 2023年5月招待有り
再構成実験で探る生命の起源：原始生命モデルと実験室内進化

CHEMINAS 47 2023年5月招待有り
Compartmentalization for RNA replication and evolution

第60回日本生物物理学会年会 2022年9月招待有り
Emergence and Darwinian evolution of RNA replicators

Interdisciplinary Origin of Life Meeting for Early Career Researchers (IOoL2022) 2022年8月
Mineral surfaces select for longer RNA molecules: implication for prebiotic evolution

Japan Geoscience Union Meeting 2022 2022年5月招待有り
人工RNA複製体のダーウィン進化による複雑化

第46回生命の起原および進化学会学術講演会 2022年3月
人工RNA複製システムと生命の起源

学術変革領域(A)分子サイバネティクス第10回領域セミナー 2022年1月招待有り
From emergence to Darwinian evolution of RNA replicators

NASA Center for the Origin of Life meeting 2022年1月招待有り
人工RNA複製体の進化と人工細胞と生命の起源

人工細胞モデル＆分子ロボティクス第2回研究会 2021年11月
Evolutionary complexification of an artificial RNA replication system

第59回日本生物物理学会年会 2021年11月
人工RNA自己複製体と寄生体の長期共進化

日本微生物生態学会 (環境ウイルス研究部会集会) 2021年11月招待有り

もっとみる

共同研究・競争的資金等の研究課題

原始RNA集団における自己複製体の創発と進化

JST 創発的研究支援事業 2023年4月 - 2026年3月

水内良
人工多細胞におけるゲノム複製の時空間制御

日本学術振興会学術変革領域研究 (A) (公募研究) 2023年4月 - 2025年3月

水内良
最小自己複製RNAの構築

日本学術振興会若手研究 2023年4月 - 2025年3月

水内良
長鎖DNA合成と自律型人工細胞創出のための人工細胞リアクタシステム

JST CREST 2023年4月 - 2025年3月

野地博行
人工多細胞型ゲノム複製システムの構築

日本学術振興会学術変革領域研究 (A) (公募研究) 2021年10月 - 2023年3月

水内良
原始生命の進化に学ぶゲノム拡張基盤の構築

JST さきがけ研究 2019年10月 - 2023年3月

水内良
原始複製体モデルを用いた複雑化仮説の実験的検証

日本学術振興会研究活動スタート支援 2019年10月 - 2021年3月

水内良
短いランダム配列RNAから自己複製体が創発する可能性の探求

日本学術振興会海外特別研究員 2018年4月 - 2019年3月

水内良
シッポウフグの巣の形成原理の解明

ヒューマンウェアイノベーションプログラム融合研究費 2017年7月 - 2018年3月

近藤滋
実験進化モデルを用いた共働する遺伝子の適応進化

日本学術振興会特別研究員 DC1 2015年4月 - 2018年3月

水内良
Direct observation of co-evolution at the RNA-protein interface

NASA NASA Science Innovation Fund 2015年10月 - 2016年9月

Mark A Ditzler

水内良

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

受賞

論文

MISC

講演・口頭発表等

共同研究・競争的資金等の研究課題

メニュー

共著者の一覧

フォロー一覧