飯塚怜 (Ryo Iizuka) - マイポータル

基本情報

J-GLOBAL ID: 202001009093607760
researchmap会員ID: R000003234

経歴

2020年4月 - 現在

東京大学大学院理学系研究科生物科学専攻助教
2016年2月 - 現在

公益財団法人川崎市産業振興財団ナノ医療イノベーションセンター客員研究員
2012年11月 - 2020年3月

東京大学大学院薬学系研究科助教
2009年3月 - 2012年10月

東京大学大学院薬学系研究科特任助教
2006年4月 - 2009年2月

独立行政法人日本学術振興会特別研究員（PD）
2005年5月 - 2006年3月

東京農工大学大学院工学教育部生命工学専攻特任助手
2004年10月 - 2005年4月

東京農工大学大学院工学教育部生命工学専攻産学官連携研究員

学歴

2002年4月 - 2004年9月

東京農工大学大学院工学教育部博士後期課程生命工学専攻
2001年4月 - 2002年3月

東京農工大学大学院工学研究科博士前期課程生命工学専攻
1997年4月 - 2001年3月

東京農工大学工学部生命工学科

受賞

2019年9月

2019年度奨励賞日本薬学会関東支部

飯塚怜
2018年11月

平成30年度酵素工学奨励賞酵素工学研究会

飯塚怜
2018年9月

オムロン賞 TECH PLANTER 第5回バイオテックグランプリ

酵素探索プロジェクト
2018年9月

2018年度奨励賞日本バイオイメージング学会

飯塚怜
2017年8月

星野賞研究奨励賞第30回バイオメディカル分析科学シンポジウム（BMAS2017）

飯塚怜
2016年12月

2016年度コスモ・バイオ学術論文賞コスモ・バイオ株式会社

飯塚怜
2015年3月

エンバイオ賞第21回リバネス研究費

飯塚怜
2014年4月

オンチップ・バイオテクノロジーズ賞第17回リバネス研究費

飯塚怜
2008年11月

研究奨励極限環境微生物学会

飯塚怜

論文

N-terminal region of Drosophila melanogaster Argonaute2 forms amyloid-like aggregates

Haruka Narita, Tomohiro Shima, Ryo Iizuka, Sotaro Uemura

BMC Biology 21(1) 78 2023年4月19日査読有り
Complete genomic sequences of two agarolytic Vibrio species isolates from the red algae Gracilaria

Mei Ito, Mikihisa Muta, Takashi Funatsu, Yuji Hatada, Ryo Iizuka

Microbiology Resource Announcemets 11(12) e00934-22 2022年12月査読有り最終著者責任著者
Efficient depolymerization of polyethylene terephthalate (PET) and polyethylene furanoate by engineered PET hydrolase Cut190

Fusako Kawai, Yoshitomo Furushima, Norihiro Mochizuki, Naoki Muraki, Mitsuaki Yamashita, Akira Iida, Rie Mamoto, Takehiko Tosha, Ryo Iizuka, Sakihito Kitajima

AMB Express 12(1) 134-134 2022年10月26日査読有り
Zero-mode waveguides and nanopore-based sequencing technologies accelerate single-molecule studies

Ryo Iizuka, Hirohito Yamazaki, Sotaro Uemura

Biophysics and Physicobiology 19 e190032 2022年9月査読有り筆頭著者
Selection of green fluorescent proteins by in vitro compartmentalization using microbead-display libraries

Ryo Iizuka, Kentaro Tahara, Anna Matsueda, Soichiro Tsuda, Dong Hyun Yoon, Tetsushi Sekiguchi, Shuichi Shoji, Takashi Funatsu

Biochemical Engineering Journal 187 108627-108627 2022年9月査読有り筆頭著者責任著者
Heterogeneous dissociation process of truncated RNAs by oligomerized Vasa helicase

Yoshimi Kinoshita, Ryo Murakami, Nao Muto, Shintaroh Kubo, Ryo Iizuka, Sotaro Uemura

Communications Biology 4(1) 1386 2021年12月査読有り
Inside or out? Clonal thiotrophic symbiont populations occupy deep-sea mussel bacteriocytes with pathways connecting to the external environment

Tetsuro Ikuta, Yuka Amari, Akihiro Tame, Yoshihiro Takaki, Miwako Tsuda, Ryo Iizuka, Takashi Funatsu, Takao Yoshida

ISME Communications 1(1) 38 2021年8月査読有り
Photo-reactive oligodeoxynucleotide-embedded nanovesicles (PROsomes) with switchable stability for efficient cellular uptake and gene knockdown

Beob Soo Kim, Mitsuru Naito, Rimpei Kamegawa, Hyun Jin Kim, Ryo Iizuka, Takashi Funatsu, Shingo Ueno, Takanori Ichiki, Akihiro Kishimura, Kanjiro Miyata

Chemical Communications 56(66) 9477-9480 2020年7月査読有り
Nascent SecM chain interacts with outer ribosomal surface to stabilize translation arrest

Mikihisa Muta, Ryo Iizuka, Tatsuya Niwa, Yuanfang Guo, Hideki Taguchi, Takashi Funatsu

Biochemical Journal 477(2) 557-566 2020年1月31日査読有り責任著者
Construction of integrated gene logic-chip.

Takeya Masubuchi, Masayuki Endo, Ryo Iizuka, Ayaka Iguchi, Dong Hyun Yoon, Tetsushi Sekiguchi, Hao Qi, Ryosuke Iinuma, Yuya Miyazono, Shuichi Shoji, Takashi Funatsu, Hiroshi Sugiyama, Yoshie Harada, Takuya Ueda, Hisashi Tadakuma

Nature Nanotechnology 13(10) 933-940 2018年10月査読有り
Detection and quantification of micrornas by ligase-assisted sandwich hybridization on a microarray

Ryo Iizuka, Taro Ueno, Takashi Funatsu

Methods in Molecular Biology 1368 53-65 2016年5月1日査読有り
Culture-independent method for identification of microbial enzyme-encoding genes by activity-based single-cell sequencing using a water-in-oil microdroplet platform

Kazuki Nakamura, Ryo Iizuka, Shinro Nishi, Takao Yoshida, Yuji Hatada, Yoshihiro Takaki, Ayaka Iguchi, Dong Hyun Yoon, Tetsushi Sekiguchi, Shuichi Shoji, Takashi Funatsu

Scientific Report 6 22259 2016年2月査読有り責任著者
Chaperonin GroEL uses asymmetric and symmetric reaction cycles in response to the concentration of non-native substrate proteins.

Ryo Iizuka, Takashi Funatsu

Biophysics and Physicobiology 13 63-69 2016年査読有り筆頭著者責任著者
In situ synthesis and immobilization of enzyme molecules on microreactor array chips

Shingo Ueno, Tatsunori Hirai, Shusuke Sato, Manish Biyani, Hiromi Kuramochi, Ryo Iizuka, Takanori Akagi, Takashi Funatsu, Takanori Ichiki

Journal of Photopolymer Science and Technology 28(5) 719-725 2015年10月20日査読有り
Nascent SecM chain outside the ribosome reinforces translation arrest

Zhuohao Yang, Ryo Iizuka, Takashi Funatsu

PLoS ONE 10(3) 2015年3月25日査読有り
Optical observation of deep bulk damage in amorphous perfluorocarbon films produced by UV photons emitted from low-pressure argon plasma

Takao Ono, Ryo Iizuka, Takanori Akagi, Takashi Funatsu, Takanori Ichiki

Journal of Photopolymer Science and Technology 27(3) 393-398 2014年9月5日査読有り
Single-molecule observation of protein folding in symmetric GroEL-(GroES)2 complexes

Yodai Takei, Ryo Iizuka, Taro Ueno, Takashi Funatsu

Journal of Biological Chemistry 287(49) 41118-41125 2012年11月30日査読有り
Initiation factor 2, tRNA, and 50S subunits cooperatively stabilize mRNAs on the ribosome during initiation

Tomoaki Masuda, Alexey N. Petrov, Ryo Iizuka, Takashi Funatsu, Joseph D. Puglisi, Sotaro Uemura

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 109(13) 4881-4885 2012年3月27日査読有り
Development of Microchamber Array Chip-Based Assay System for beta-Glucosidase Activity

Tahara Kentaro, Iizuka Ryo, Ono Takao, Igarashi Kiyohiko, Samejima Masahiro, Ichiki Takanori, Funatsu Takashi

BIOPHYSICAL JOURNAL 102(3) 186A-187A 2012年1月31日査読有り
Microfluidic active sorting of DNA molecules labeled with single quantum dots using flow switching by a hydrogel sol-gel transition

Mai Haneoka, Yoshitaka Shirasaki, Hirokazu Sugino, Tokihiko Aoki, Takahiro Arakawa, Kazuto Ozaki, Dong Hyun Yoon, Noriyuki Ishii, Ryo Iizuka, Shuichi Shoji, Takashi Funatsu

Sensors and Actuators B: Chemical 159(1) 314-320 2011年11月28日査読有り

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MISC

１分子シーケンス技術の生体機能研究への応用

山崎洋人, 飯塚怜, 上村想太郎

生体分子環境の化学（CSJカレントレビュー: 45） 131-136 2023年2月
Physico- and chemical biology using nanomanipulation and micromanipulation technologies

Akira Kitamura, Ryo Iizuka

Biophysics and Physicobiology 19 e190044 2022年査読有り責任著者
次世代シーケンサー

飯塚怜, 上村想太郎

先端の分析法新訂第2 版 515-520 2022年筆頭著者
ナノ・マイクロデバイスと1分子検出顕微鏡を用いた生体分子の機能解析と新機能創生

飯塚怜

YAKUGAKU ZASSHI 140 1299-1303 2020年11月筆頭著者責任著者
DEFORMABILITY-BASED MICROFLUIDIC MICRODROPLET SORTING AS A SCREENING METHOD FOR SINGLE AGAROLYTIC BACTERIAL CELLS

Mikihisa Muta, Kai Saito, Ryo Iizuka, Wataru Kawakubo, Dong Hyun Yoon, Mei Ito, Yuji Hatada, Tetsushi Sekiguchi, Shuichi Shoji, Takashi Funatsu

Proceedings of the 24th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences 48-49 2020年10月査読有り責任著者
ナノ・マイクロ構造体を利用した蛍光イメージング

飯塚怜

化学工業 70(5) 8-13 2019年5月
固定化リボソームを用いたタンパク質合成の一分子イメージング

飯塚怜, 船津高志

細胞・生体分子の固定化と機能発現 238-246 2018年4月筆頭著者
マイクロ・ナノデバイスを用いた生体分子の機能解析と有用遺伝子の探索・回収

藤井聡一郎, 中村和貴, 飯塚怜, 船津高志

Molecular Electronics and Bioelectronics 28(3) 165-168 2017年
培養を介さないでも、有用な遺伝子を微生物から取得できる新手法の開発

秦田勇二, 飯塚怜, 西真郎, 伊藤芽, 関口哲志, 庄子習一, 船津高志

埼玉工業大学工学部紀要 27(27) 21-26 2017年
IN VITRO SELECTION OF NOVEL PEPTIDE AGONISTS FOR HUMAN SOMATOSTATIN RECEPTOR SUBTYPE-2 USING A WATER-IN-OIL MICRODROPLET PLATFORM

T. Sakurai, R. Iizuka, Y. Nakamura, J. Ishii, A. Kondo, A. Iguchi, D. H. Yoon, T. Sekiguchi, S. Shoji, T. Funatsu

Proceedings of the 20th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences 593-594 2016年査読有り責任著者
CULTURE-INDEPENDENT METHOD FOR SCREENING AND IDENTIFYING MICROBIAL ENZYME-ENCODING GENES USING MICRODROPLET-BASED SINGLE CELL GENOMICS

K. Nakamura, R. Iizuka, T. Yoshida, Y. Hatada, Y. Takaki, S. Nishi, A. Iguchi, D. H. Yoon, T. Sekiguchi, S. Shoji, T. Funatsu

Proceedings of the 19th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences 513-515 2015年査読有り責任著者
SENSITIVE FLUORESCENCE-ACTIVATED SORTING OF MICRODROPLETS CONTAINING SUBCELLUAR STRUCTURES BY THERMOREVERSIBLE GELATION POLYMER

H. Okada, A. Iguchi, R. Iizuka, D. H. Yoon, T. Sekiguchi, S. Shoji, T. Funatsu

Proceedings of the 18th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences 1259-1261 2014年査読有り
PEPTIDE-BASED LIGAND SCREENING SYSTEM FOR G PROTEIN-COUPLED RECEPTORS USING WATER-IN-OIL MICRODROPLETS

T. Sakurai, R. Iizuka, R. Sekine, Y. Nakamura, D. H. Yoon, T. Sekiguchi, J. Ishii, A. Kondo, S. Shoji, T. Funatsu

Proceedings of the 18th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences 965-967 2014年査読有り責任著者
Enzyme-immobilized microwell array for on-chip directed evolution of enzymes

Shingo Ueno, Tatsunori Hirai, Akihisa Tamada, Manish Biyani, Manish Biyani, Ryo Iizuka, Ryo Iizuka, Takashi Funatsu, Takashi Funatsu, Takanori Ichiki, Takanori Ichiki

Proceedings of the 18th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences 1802-1804 2014年1月1日
変性タンパク質濃度に応じて巧みに反応を切り替えるシャペロニンGroEL

飯塚怜, 上野太郎, 船津高志

生物物理 54(4) 189-194 2014年筆頭著者
一分子蛍光イメージング技術

飯塚怜

ぶんせき (461) 267-273 2013年5月5日
ポリマー製ナノホールアレイデバイスを用いた局所照明による1分子イメージング

小野尭生, 飯塚怜, 赤木貴則, 船津高志, 一木隆範

電気学会研究会資料. BMS, バイオ・マイクロシステム研究会 = The papers of Technical Meeting on Bio Micro Systems, IEE Japan 2012(1) 19-24 2012年3月14日
SIMPLFIED MICROFLUIDIC-BASED SYSTEM TO GENERATE DOUBLE EMULSION MICRO DROPLETS FOR BIOMEDICAL APPLICATIONS

R. Sekine, H. Okada, T. Sakurai, D. H. Yoon, R. Iizuka, T. Sekiguchi, T. Funatsu, S. Shoji

Proceedings of 1st International conference on MicroFluidic Handling Systems 127-130 2012年
YEAST-BASED LIGAND ASSAY SYSTEM FOR DETECTING G PROTEIN-COUPLED RECEPTOR ACTIVATION IN WATER-IN-OIL DROPLETS

T. Sakurai, R. Iizuka, Y. Tanigaki, R. Sekine, D. H. Yoon, T. Sekiguchi, J. Ishii, A. Kondo, N. Nemoto, S. Shoji, T. Funatsu

YEAST-BASED LIGAND ASSAY SYSTEM FOR DETECTING G PROTEIN-COUPLED RECEPTOR ACTIVATION IN WATER-IN-OIL DROPLETS 1537-1539 2012年査読有り責任著者
Single-molecule imaging device using localized evanescent illumination in polymeric nanoholes

Takao Ono, Takao Ono, Takao Ono, Ryo Iizuka, Ryo Iizuka, Takanori Akagi, Takanori Akagi, Takashi Funatsu, Takashi Funatsu, Takanori Ichiki, Takanori Ichiki

Proceedings of the 16th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences, MicroTAS 2012 1294-1296 2012年1月1日

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所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

未知・未培養ポリエチレンテレフタレート分解微生物の探索とその酵素の獲得

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2022年4月 - 2025年3月

飯塚怜
ポリエチレンテレフタレート分解微生物・酵素の探索

公益財団法人発酵研究所一般助成 2021年4月 - 2023年3月

飯塚怜
液滴の変形能を利用した微生物スクリーニングによるバイオマス分解酵素遺伝子の取得

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2018年4月 - 2021年3月

飯塚怜
単一エクソソーム内miRNAプロファイリングによるがんの早期診断法の開発

日本医療研究開発機構「革新的医療技術創出拠点プロジェクト」拠点（「知の協創の世界拠点」を目指した TR の戦略的推進と展開） 2018年 - 2020年

船津高志, 飯塚怜
液滴を利用した微生物培養を介さない酵素遺伝子取得法の確立とその実践

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2015年4月 - 2017年3月

飯塚怜
新規Ｇタンパク質共役受容体リガンド探索システムの開発とその応用

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2012年4月 - 2015年3月

飯塚怜
1分子計測技術を用いたシャペロニンおよびリボソームの機能・相互作用解析

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2010年 - 2011年

飯塚怜
光ピンセット法を用いたリボソームによる翻訳素過程の力学解析

日本学術振興会科学研究費助成事業研究活動スタート支援 2009年 - 2010年

飯塚怜
シャペロニン機能の1分子イメージング

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2006年 - 2008年

飯塚怜

産業財産権

特願2019-109092 ＲＮＡの解析方法、核酸の作製方法、核酸、キット、およびＲＮＡ解析システム

上野太郎, 船津高志, 飯塚怜, 鍾興雅
特願2014-147726 核酸の検出方法、捕捉プローブ、検出プローブセット、マイクロアレイ、核酸検出キット、核酸固定化固相、及び流体デバイス

一木隆範, 上野太郎, 船津高志, 飯塚怜, 鈴木久皇

メディア報道

平成30年度酵素工学奨励賞

酵素工学ニュース, 第81号, 3 2019年会誌・広報誌
細胞を精密制御集積型遺伝子回路のナノチップ開発

日刊工業新聞 2018年7月24日新聞・雑誌
ピュアサイエンティストが、社会実装を目指し「ビジネス」の世界へ

incu・be Vol.42, 8–9 2018年会誌・広報誌
miRNAやエクソソームの分析から、がんを超早期に発見する

NanoSky Vol. 3, 2–5 2017年会誌・広報誌
未来の起源

TBS 2016年11月6日テレビ・ラジオ番組
微生物の酵素培養せずに発見

日経産業新聞 2016年8月26日新聞・雑誌