神川龍馬 (Ryoma Kamikawa) - マイポータル

基本情報

J-GLOBAL ID: 201301007910916950
researchmap会員ID: B000233771

外部リンク: http://kaken.nii.ac.jp/d/r/40627634.ja.html

研究分野

ライフサイエンス / 多様性生物学、分類学 /

経歴

2012年

筑波大学, 生命環境科学研究科(系), その他

主要な論文

Genome evolution of a nonparasitic secondary heterotroph, the diatom Nitzschia putrida

Ryoma Kamikawa, Takako Mochizuki, Mika Sakamoto, Yasuhiro Tanizawa, Takuro Nakayama, Ryo Onuma, Ugo Cenci, Daniel Moog, Samuel Speak, Krisztina Sarkozi …

Science Advances 8(17) eabi5075 2022年4月29日査読有り筆頭著者責任著者
An Enigmatic Stramenopile Sheds Light on Early Evolution in Ochrophyta Plastid Organellogenesis

Tomonori Azuma, Tomáš Pánek, Alexander K. Tice, Motoki Kayama, Mayumi Kobayashi, Hideaki Miyashita, Toshinobu Suzaki, Akinori Yabuki, Matthew W. Brown, Ryoma Kamikawa

Molecular Biology and Evolution 39(4) 2022年4月10日査読有り最終著者責任著者
Rappemonads are haptophyte phytoplankton

Masanobu Kawachi, Takuro Nakayama, Motoki Kayama, Mami Nomura, Hideaki Miyashita, Othman Bojo, Lesley Rhodes, Stuart Sym, Richard N. Pienaar, Ian Probert …

Current Biology 31(11) 2395-2403.e4 2021年6月査読有り最終著者責任著者
非光合成性藻類の色素体進化

神川龍馬

光合成研究 31(1) 37-49 2021年4月査読有り招待有り筆頭著者最終著者責任著者
Highly Reduced Plastid Genomes of the Non-photosynthetic Dictyochophyceans Pteridomonas spp. (Ochrophyta, SAR) Are Retained for tRNA-Glu-Based Organellar Heme Biosynthesis

Motoki Kayama, Kacper Maciszewski, Akinori Yabuki, Hideaki Miyashita, Anna Karnkowska, Ryoma Kamikawa

Frontiers in Plant Science 11 602455-602455 2020年11月27日査読有り最終著者責任著者
A non-photosynthetic green alga illuminates the reductive evolution of plastid electron transport systems

Motoki Kayama, Jun-Feng Chen, Takashi Nakada, Yoshiki Nishimura, Toshiharu Shikanai, Tomonori Azuma, Hideaki Miyashita, Shinichi Takaichi, Yuichiro Kashiyama, Ryoma Kamikawa

BMC Biology 18(1) 126-126 2020年9月査読有り最終著者責任著者
Dinoflagellates with relic endosymbiont nuclei as models for elucidating organellogenesis

Chihiro Sarai, Goro Tanifuji, Takuro Nakayama, Ryoma Kamikawa, Kazuya Takahashi, Euki Yazaki, Eriko Matsuo, Hideaki Miyashita, Ken-ichiro Ishida, Mitsunori Iwataki …

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 117 5364-5375 2020年2月査読有り筆頭著者
Substrate specificity of plastid phosphate transporters in a non-photosynthetic diatom and its implication in evolution of red alga-derived complex plastids

Daniel Moog, Akira Nozawa, Yuzuru Tozawa, Ryoma Kamikawa

Scientific Reports 10 1167 2020年1月査読有り最終著者責任著者
Principles of plastid reductive evolution illuminated by nonphotosynthetic chrysophytes.

Dorrell RG, Azuma T, Nomura M, Audren de Kerdrel G, Paoli L, Yang S, Bowler C, Ishii KI, Miyashita H, Gile GH …

Proc Natl Acad Sci U S A 116(14) 6914-6923 2019年4月査読有り最終著者責任著者
The Origin and Diversification of Mitochondria

Andrew J. Roger, Sergio A. Munoz-Gomez, Ryoma Kamikawa

CURRENT BIOLOGY 27(21) R1177-R1192 2017年11月査読有り招待有り最終著者
A Non-photosynthetic Diatom Reveals Early Steps of Reductive Evolution in Plastids

Ryoma Kamikawa, Daniel Moog, Stefan Zauner, Goro Tanifuji, Ken-Ichiro Ishida, Hideaki Miyashita, Shigeki Mayama, Tetsuo Hashimoto, Uwe G. Maier, John M. Archibald …

MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION 34(9) 2355-2366 2017年9月査読有り筆頭著者責任著者
Organelles that illuminate the origins of Trichomonas hydrogenosomes and Giardia mitosomes

Michelle M. Leger, Martin Kolisko, Ryoma Kamikawa, Courtney W. Stairs, Keitaro Kume, Ivan Cepicka, Jeffrey D. Silberman, Jan O. Andersson, Feifei Xu, Akinori Yabuki …

NATURE ECOLOGY & EVOLUTION 1(4) 0092 2017年4月査読有り筆頭著者
The Earliest Stages of Mitochondrial Adaptation to Low Oxygen Revealed in a Novel Rhizarian

Ryan M. R. Gawryluk, Ryoma Kamikawa, Courtney W. Stairs, Jeffrey D. Silberman, Matthew W. Brown, Andrew J. Roger

CURRENT BIOLOGY 26(20) 2729-2738 2016年10月査読有り
光合成能力を失った種と葉緑体の進化・多様性～環境と栄養性の進化関係の解明へ向けて～

神川龍馬

生物の科学遺伝 70(2) 115-120 2016年3月招待有り
Proposal of a Twin Aarginine Translocator System-Mediated Constraint against Loss of ATP Synthase Genes from Nonphotosynthetic Plastid Genomes

Ryoma Kamikawa, Goro Tanifuji, Sohta A. Ishikawa, Ken-Ichiro Ishii, Yusei Matsuno, Naoko T. Onodera, Ken-Ichiro Ishida, Tetsuo Hashimoto, Hideaki Miyashita, Shigeki Mayama …

MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION 32(10) 2598-2604 2015年10月査読有り
Plastid Genome-Based Phylogeny Pinpointed the Origin of the Green-Colored Plastid in the Dinoflagellate Lepidodinium chlorophorum

Ryoma Kamikawa, Goro Tanifuji, Masanobu Kawachi, Hideaki Miyashita, Tetsuo Hashimoto, Yuji Inagaki

GENOME BIOLOGY AND EVOLUTION 7(4) 1133-1140 2015年4月査読有り筆頭著者責任著者
Multiple losses of photosynthesis in Nitzschia (Bacillariophyceae)

Ryoma Kamikawa, Naoji Yubuki, Masaki Yoshida, Misaka Taira, Noriaki Nakamura, Ken-ichiro Ishida, Brian S. Leander, Hideaki Miyashita, Tetsuo Hashimoto, Shigeki Mayama …

PHYCOLOGICAL RESEARCH 63(1) 19-28 2015年1月査読有り筆頭著者責任著者
Complete genome of a nonphotosynthetic cyanobacterium in a diatom reveals recent adaptations to an intracellular lifestyle

Takuro Nakayama, Ryoma Kamikawa, Goro Tanifuji, Yuichiro Kashiyama, Naohiko Ohkouchi, John M. Archibald, Yuji Inagaki

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 111(31) 11407-11412 2014年8月査読有り
Palpitomonas bilix represents a basal cryptist lineage: insight into the character evolution in Cryptista

Akinori Yabuki, Ryoma Kamikawa, Sohta A. Ishikawa, Martin Kolisko, Eunsoo Kim, Akifumi S. Tanabe, Keitaro Kume, Ken-ichiro Ishida, Yuji Inagki

SCIENTIFIC REPORTS 4 4614 2014年4月査読有り筆頭著者
Gene Content Evolution in Discobid Mitochondria Deduced from the Phylogenetic Position and Complete Mitochondrial Genome of Tsukubamonas globosa

Ryoma Kamikawa, Martin Kolisko, Yuki Nishimura, Akinori Yabuki, Matthew W. Brown, Sohta A. Ishikawa, Ken-ichiro Ishida, Andrew J. Roger, Tetsuo Hashimoto, Yuji Inagaki

GENOME BIOLOGY AND EVOLUTION 6(2) 306-315 2014年査読有り筆頭著者責任著者
Split Introns in the Genome of Giardia intestinalis Are Excised by Spliceosome-Mediated trans-Splicing

Ryoma Kamikawa, Yuji Inagaki, Masaharu Tokoro, Andrew J. Roger, Tetsuo Hashimoto

CURRENT BIOLOGY 21(4) 311-315 2011年2月査読有り筆頭著者責任著者
Direct phylogenetic evidence for lateral transfer of elongation factor-like gene

Ryoma Kamikawa, Yuji Inagaki, Yoshihiko Sako

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 105(19) 6965-6969 2008年5月査読有り筆頭著者

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MISC

211

非光合成クリプトモナスは炭素固定能力を維持する

谷藤吾朗, 松田真実, 吉田崇伸, 矢吹彬憲, 伊藤元雄, 石谷佳之, 野牧秀隆, 神川龍馬, 蓮沼誠久, 柏山祐一郎

日本寄生虫学会東日本支部大会プログラム・講演要旨 81st (Web) 2022年
To be algae or not to be algae: losses of photosynthesis in diatoms

Ryoma Kamikawa

The 4th Asian Congress of Protistology 2021年11月招待有り
ゲノム・トランスクリプトームから見た藻類の多様性と進化

神川龍馬

プランクトン学会若手の会 2021年9月招待有り
Loss of photosynthesis in Ochrophyta

Ryoma Kamikawa

2nd AsiaEvo 2021年8月招待有り
アピコンプレクサ類アピコプラストは葉緑体縮退進化の王道か？

神川龍馬

第90回日本寄生虫学会第32回日本臨床寄生虫学会合同大会サテライトミーティング 2021年4月16日招待有り
様々なヘテロ接合度の生物を用いたハプロイドセット構築のためのゲノムアセンブリ手法の評価

望月孝子, 坂本美佳, 谷澤靖洋, 中山卓郎, 谷藤吾朗, 神川龍馬, 中村保一

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 44th 2021年
珪藻のゲノム解析支援:Nitzschia sp.PL1-4株のゲノムアセンブリ

望月孝子, 坂本美佳, 谷澤靖洋, 矢倉勝, 中山卓郎, 谷藤吾朗, 神川龍馬, 中村保一

日本植物生理学会年会(Web) 62nd 2021年
ハマサンゴの骨格から分離した糸状緑藻Phaeophila dendroidesによる遠赤色光の利用

大波千恵子, 西堀洋平, 植野嘉文, 須田彰一郎, 神川龍馬, 秋本誠志, 宮下英明

藻類 69(1) 2021年
縮退オルガネラから見るオルガネラゲノムの存在意義

神川龍馬

日本分子生物学会ワークショップ「ミトコンドリア・葉緑体がもつ核外ゲノムの多彩な複製維持機構と構造」 2020年12月招待有り
微細藻類における光合成能の喪失と葉緑体縮退進化ーNo photosynthesis, no life?

神川龍馬

光合成学会ミニシンポジウム 2020年9月18日招待有り
ハマサンゴの一種Porites sp.の骨格から分離した糸状緑藻

西堀洋平, 大波千恵子, 須田彰一郞, 神川龍馬, 宮下英明

第44回日本藻類学会 2020年3月
非光合成性藻類におけるclpC遺伝子の有無を介した色素体ゲノム喪失に対する機能的制約

加山基, 矢吹彬憲, 宮下英明, 神川龍馬

第44回日本藻類学会 2020年3月
ヤマアカガエル及びニホンアカガエルの卵塊に共生する藻類

武井萌, 西川完途, 神川龍馬, 宮下英明

第44回日本藻類学会 2020年3月
緑藻類における光合成能喪失と葉緑体電子伝達系の縮退進化

加山基, 陳俊峰, 仲田崇志, 西村芳樹, 鹿内利治, 宮下英明, 高市真一, 柏山祐一郎, 神川龍馬

第44回日本藻類学会 2020年3月
不等毛藻類の葉緑体喪失に伴う，葉緑体とミトコンドリアへの二重局在性タンパク質の標的配列の進化

東智範, 加山基, 宮下英明, 神川龍馬

第44回日本藻類学会 2020年3月
琵琶湖から分離された,遠赤色光のみを光源として光合成生育する真核藻類

西堀洋平, 北崎翔, 神川龍馬, 宮下英明

藻類 68(1) 2020年
海洋原核生物も”密集”すればウイルスによる感染を受けるのか?

富永賢人, 山本圭吾, 神川龍馬, 緒方博之, 吉田天士

日本地球化学会年会要旨集(Web) 67th 2020年
ミクロコズム培養系を用いた海洋性優占原核生物遷移過程におけるウイルス動態解析

武部紘明, 富永賢人, 神川龍馬, 山本圭吾, 渡邉哲弘, 吉田天士

日本地球化学会年会要旨集(Web) 67th 2020年
Genome evolution through loss of photosynthesis and adaptation to a heterotrophic lifestyle in a non-photosynthetic diatom.

第42回日本分子生物学会年会【ワークショップ】遺伝子の水平伝播からゲノム進化を考える 2019年12月招待有り筆頭著者最終著者責任著者
葉緑体喪失に伴うオルガネラ DNA polymerase の進化

東智範, 加山基, 宮下英明, 神川龍馬

第3回日本共生生物学会 2019年11月

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書籍等出版物

アメーバのはなし

神川龍馬 (担当:分担執筆, 範囲:ミトコンドリアの起源・進化)

朝倉書店 2018年9月
Monitoring harmful algae by using molecular biological techniques (Chapter 2, pp 15-28), in Food Quality (ed., Kostas Kapiris)

Shiraishi T, Ryoma Kamikawa, Sako Y, Imai I

INTECH 2012年4月20日
貝毒原因プランクトンの分子モニタリング. In: 今井一郎、福代康夫・広石伸互 (編) 「貝毒研究の最先端―現状と展望」

細井(田辺)祥子, 神川龍馬, 左子芳彦

恒星社厚生閣

講演・口頭発表等

Mitohondrial evolution: from genomes to metabolisms

神川龍馬

筑波大学遺伝子実験センター形質転換植物デザイン研究拠点研究セミナー 2012年9月10日招待有り
嫌気環境に生きる：フォルニカータ生物群のエネルギー生産機構とRNA代謝

神川龍馬

国立環境研究所生物系若手セミナー 2012年4月19日招待有り

共同研究・競争的資金等の研究課題

ウイルス駆動の海洋低次生態系の時計仕掛けと海洋への影響解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(S) 2021年7月 - 2026年3月

吉田天士, 長崎慶三, 緒方博之, 神川龍馬, 山本圭吾, 大美博昭
光合成補助色素フコキサンチンの未知なる生合成系の解明とその誕生の謎を紐解く

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2019年4月 - 2024年3月

神川龍馬, 原田二朗, 宮下英明, 谷藤吾朗, 中山卓郎, 高市眞一
フォルニカータ生物群におけるミトコンドリア関連オルガネラの機能進化の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B)) 2019年10月 - 2023年3月

橋本哲男, 久米慶太郎, 千葉洋子, 神川龍馬
クロロフィルcの生化学から顕生代海洋基礎生産の進化を紐解く

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2018年4月 - 2023年3月

柏山祐一郎, 原田二朗, 塚谷祐介, 神川龍馬, 力石嘉人, 木下雄介, 谷藤吾朗, 伊庭靖弘
植物プランクトンの多様な光利用戦略：ロドプシンを用いた新奇な光利用機構の探索

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2018年6月 - 2021年3月

吉澤晋, 神川龍馬
非光合成生物の光適応進化の全容解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2017年4月 - 2021年3月

谷藤吾朗, 柏山祐一郎, 神川龍馬, 稲垣祐司
時空間的探索による一酸化炭素資化菌の包括的研究とその応用基盤の構築

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(S) 2016年5月 - 2021年3月

左子芳彦, 吉田天士, 神川龍馬, 緒方博之, 安田尚登, 奥西将之, 前田広人, 五斗進
光合成能喪失藻類をモデルとした従属栄養性への進化を駆動する因子の提唱

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(A) 2015年4月 - 2019年3月

神川龍馬
好気性真核生物から嫌気性真核生物への進化におけるスナップショットと多様性の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2015年4月 - 2018年3月

神川龍馬
マトリョーシカ型進化原理の展開

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2016年4月 - 2017年3月

野崎智義, 守屋繁春, 山本雅裕, 松崎素道, 石田健一郎, 神川龍馬, 小保方潤一, 稲垣祐司, 木原久美子
ミトコンドリア・色素体以外の共生オルガネラ成立過程の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2011年4月 - 2016年3月

稲垣祐司, 小保方潤一, 神川龍馬
「天狗の麦飯」の多様性と消滅因子の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2012年4月 - 2015年3月

宮下英明, 神川龍馬
連続二次共生に伴う葉緑体ゲノム進化:緑色渦鞭毛藻類を例として

日本学術振興会科学研究費助成事業研究活動スタート支援 2011年 - 2012年

神川龍馬
麻痺性貝毒原因藻シストのミトコンドリア遺伝子の動態解明による発芽予測法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2006年 - 2008年

神川龍馬

神川龍馬

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研究分野

経歴

主要な論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

共同研究・競争的資金等の研究課題

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