福永流也 (Ryuya Fukunaga) - マイポータル

基本情報

所属: ジョンズホプキンス大学 (Johns Hopkins University School of Medicine） Department of Biological Chemistry Associate Professor

学位: 理学博士(東京大学)

J-GLOBAL ID: 200901068215797327
researchmap会員ID: 5000090729

外部リンク: https://sites.google.com/site/fukunagalabjhmi/

研究キーワード

研究分野

経歴

2019年 - 現在

ジョンズホプキンス大学, 生物化学科, アソシエイトプロフェッサー
2013年 - 2018年

ジョンズホプキンス大学, 生物化学科, アシスタントプロフェッサー
2009年 - 2013年

マサチューセッツ大学 (Phillip Zamore研究室)
2010年 - 2012年

Charles A. King Trust Postdoctoral Fellowship
2007年 - 2009年

日本学術振興会海外特別研究員
2007年 - 2009年

カリフォルニア大学バークレー (Jennifer Doudna研究室)
2004年 - 2007年

日本学術振興会特別研究員DC1
2002年 - 2007年

東京大学大学院理学系研究科生物化学専攻 (横山茂之研究室)

学歴

- 2007年

東京大学大学院, 理学系研究科, 生物化学専攻
- 2002年

東京大学, 理学部, 生物化学科

論文

Differences in molecular phenotype in mouse and human hypertrophic cardiomyopathy.

Styliani Vakrou, Yamin Liu, Li Zhu, Gabriela V Greenland, Bahadir Simsek, Virginia B Hebl, Yufan Guan, Kirubel Woldemichael, Conover C Talbot, Miguel A Aon …

Scientific reports 11(1) 13163-13163 2021年6月23日
RNA-binding protein Maca is crucial for gigantic male fertility factor gene expression, spermatogenesis, and male fertility, in Drosophila.

Li Zhu, Ryuya Fukunaga

PLoS genetics 17(6) e1009655 2021年6月
Drosophila Regnase-1 RNase is required for mRNA and miRNA profile remodelling during larva-to-adult metamorphosis.

Li Zhu, Susan E Liao, Ryuya Fukunaga

RNA biology 16(10) 1386-1400 2019年10月査読有り
DEAD-box RNA helicase Belle posttranscriptionally promotes gene expression in an ATPase activity-dependent manner.

Susan E Liao, Suresh K Kandasamy, Li Zhu, Ryuya Fukunaga

RNA (New York, N.Y.) 25(7) 825-839 2019年7月査読有り
Author Correction: LOTUS domain protein MARF1 binds CCR4-NOT deadenylase complex to post-transcriptionally regulate gene expression in oocytes.

Li Zhu, Suresh K Kandasamy, Susan E Liao, Ryuya Fukunaga

Nature communications 10(1) 1074-1074 2019年3月1日査読有り
RNA methyltransferase BCDIN3D is crucial for female fertility and miRNA and mRNA profiles in Drosophila ovaries.

Li Zhu, Susan E Liao, Yiwei Ai, Ryuya Fukunaga

PloS one 14(5) e0217603 2019年
Differences in microRNA-29 and Pro-fibrotic Gene Expression in Mouse and Human Hypertrophic Cardiomyopathy.

Yamin Liu, Junaid Afzal, Styliani Vakrou, Gabriela V Greenland, C Conover Talbot Jr, Virginia B Hebl, Yufan Guan, Rehan Karmali, Jil C Tardiff, Leslie A Leinwand …

Frontiers in cardiovascular medicine 6 170-170 2019年
LOTUS domain protein MARF1 binds CCR4-NOT deadenylase complex to post-transcriptionally regulate gene expression in oocytes.

Li Zhu, Suresh K Kandasamy, Susan E Liao, Ryuya Fukunaga

Nature communications 9(1) 4031-4031 2018年10月2日査読有り
An RNA-binding protein Blanks plays important roles in defining small RNA and mRNA profiles in Drosophila testes.

Susan E Liao, Yiwei Ai, Ryuya Fukunaga

Heliyon 4(7) e00706 2018年7月査読有り
Dicer partner protein tunes the length of miRNAs using base-mismatch in the pre-miRNA stem.

Li Zhu, Suresh K Kandasamy, Ryuya Fukunaga

Nucleic acids research 46(7) 3726-3741 2018年4月20日査読有り
Loquacious-PD removes phosphate inhibition of Dicer-2 processing of hairpin RNAs into siRNAs.

Ryuya Fukunaga

Biochemical and biophysical research communications 498(4) 1022-1027 2018年4月15日査読有り
Allele-specific differences in transcriptome, miRNome, and mitochondrial function in two hypertrophic cardiomyopathy mouse models.

Styliani Vakrou, Ryuya Fukunaga, D Brian Foster, Lars Sorensen, Yamin Liu, Yufan Guan, Kirubel Woldemichael, Roberto Pineda-Reyes, Ting Liu, Jill C Tardiff …

JCI insight 3(6) 2018年3月22日査読有り
Kinetic analysis of small silencing RNA production by human and Drosophila dicer enzymes in vitro

Liao S.E, Fukunaga R

Methods in Molecular Biology 1680 101-121 2018年査読有り
The C-terminal dsRNA-binding domain of Drosophila Dicer-2 is crucial for efficient and high-fidelity production of siRNA and loading of siRNA to Argonaute2.

Suresh K Kandasamy, Li Zhu, Ryuya Fukunaga

RNA (New York, N.Y.) 23(7) 1139-1153 2017年7月査読有り
Phosphate-binding pocket in Dicer-2 PAZ domain for high-fidelity siRNA production.

Suresh K Kandasamy, Ryuya Fukunaga

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 113(49) 14031-14036 2016年12月6日査読有り
Common miR-590 Variant rs6971711 Present Only in African Americans Reduces miR-590 Biogenesis.

Xiaoping Lin, Steven Steinberg, Suresh K Kandasamy, Junaid Afzal, Blaid Mbiyangandu, Susan E Liao, Yufan Guan, Celia P Corona-Villalobos, Scot J Matkovich, Neal Epstein …

PloS one 11(5) e0156065 2016年5月査読有り
A SelB/EF-Tu/aIF2γ-like protein from Methanosarcina mazei in the GTP-bound form binds cysteinyl-tRNACys

Yanagisawa T, Ishii R, Hikida Y, Fukunaga R, Sengoku T, Sekine SI, Yokoyama S

J. Struct. Funct. Genomics 16(1) 25-41 2015年3月査読有り
Inorganic phosphate blocks binding of pre-miRNA to Dicer-2 via its PAZ domain.

Ryuya Fukunaga, Cansu Colpan, Bo W Han, Phillip D Zamore

The EMBO journal 33(4) 371-84 2014年2月18日査読有り
A universal small molecule, inorganic phosphate, restricts the substrate specificity of Dicer-2 in small RNA biogenesis.

Ryuya Fukunaga, Phillip D Zamore

Cell cycle (Georgetown, Tex.) 13(11) 1671-6 2014年6月査読有り
Dicer partner proteins tune the length of mature miRNAs in flies and mammals.

Ryuya Fukunaga, Bo W Han, Jui-Hung Hung, Jia Xu, Zhiping Weng, Phillip D Zamore

Cell 151(3) 533-46 2012年10月26日査読有り

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MISC

Dicer Partner Proteins Tune the Length of Mature miRNAs in Flies and Mammals.

Ryuya Fukunaga, Bo W Han, Jui-Hung Hung, Jia Xu, Zhiping Weng, Phillip D Zamore

Cell 151(4) 912-912 2012年11月9日

共同研究・競争的資金等の研究課題

ノンコーディングRNAによる生体制御システムの解明

産業財産権

特願US patent application 20100323364 MODIFIED tRNA CONTAINING UNNATURAL BASE AND USE THEREOF

Sekine Shun-Ichi, Fukunaga Ryuya, Yokoyama Shigeyuki, Hirao Ichiro, Harada Yoko
特許US patent 8,178,301 Mutant SepRS, and method for site-specific introduction of phosphoserine into protein using the same

Yokoyama Shigeyuki, Fukunaga Ryuya, Sekine Shun-Ichi
変異体SepRS及びこれを用いるタンパク質への部位特異的ホスホセリン導入法 (福永流也, 関根俊一, 横山茂之)

福永流也

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