青砥早希 (Saki Aoto) - マイポータル

基本情報

所属: 北里大学未来工学部講師

学位: 博士（理学）(お茶の水女子大学)

研究者番号: 60775972
ORCID iD: https://orcid.org/0000-0002-9011-9341
J-GLOBAL ID: 201801012476719603
researchmap会員ID: B000303209

研究分野

経歴

2026年4月 - 現在

北里大学, 未来工学部, 講師
2016年4月 - 2026年3月

国立成育医療研究センター, メディカルゲノムセンター, 研究員
2014年4月 - 2016年4月

がん研究会研究所, ゲノムセンター, 特任研究助手

論文

Machine learning approach to analyzing complex care coordination patterns for medically complex children

Saki Aoto, Yoshikazu Ito, Shintaro Morooka, Ai Ito, Akihiro Umezawa, Kohji Okamura, Tomoo Nakamura

BMC Medical Informatics and Decision Making 2026年7月9日
Automated detection of mulberry bodies in urinary sediment for non-invasive Fabry disease screening.

Hiroshi Yamanaka, Tetsumin So, Naoko Sakamoto, Saki Aoto, Xiao-Kang Li, Yi Wang, Qian Shen, Ohsuke Migita, Motomichi Kosuga, Kohji Okamura

Clinical chemistry and laboratory medicine 2026年4月30日
High-Coverage Jomon Genomes Provide Insights into Population Structure and Genetic Traits of Ancient Japanese Hunter-Gatherers

Masahiko Kato, Fuzuki Mizuno, Yasuhiro Taniguchi, Osamu Kondo, Masami Matsushita, Takayuki Matsushita, Aiko Saso, Minoru Yoneda, Kunihiko Kurosaki, Li Wang …

2025年12月16日
Approaches to Evaluate Whole Exome Sequencing Data That Incorporate Genetic Intolerance Scores for Congenital Anomalies, Including Intronic Regions Adjacent to Exons

Kosuke Taniguchi, Fuyuki Hasegawa, Yuka Okazaki, Asuka Hori, Hiroko Ogata‐Kawata, Saki Aoto, Ohsuke Migita, Tomoko Kawai, Kazuhiko Nakabayashi, Kohji Okamura …

Molecular Genetics & Genomic Medicine 13(3) e70092 2025年3月
Applicability of the regression approach for histological multi-class grading in clear cell renal cell carcinoma

Mayu Shibata, Akihiro Umezawa, Saki Aoto, Kohji Okamura, Michiyo Nasu, Ryuichi Mizuno, Mototsugu Oya, Kei Yura, Shuji Mikami

Regenerative Therapy 28 431-437 2025年3月
Maternal vitamin D deficiency is a risk factor for infants’ epigenetic gestational age acceleration at birth in Japan

河合智子, 左勝則, 小川浩平, 田中久子, 青砥早希, 嘉村浩美, 森崎菜穂, 藤原武男, 秦健一郎, 秦健一郎

日本小児科学会雑誌 129(2) 2025年1月20日
Genetic analysis of a Yayoi individual from the Doigahama site provides insights into the origins of immigrants to the Japanese Archipelago

Jonghyun Kim, Fuzuki Mizuno, Takayuki Matsushita, Masami Matsushita, Saki Aoto, Koji Ishiya, Mami Kamio, Izumi Naka, Michiko Hayashi, Kunihiko Kurosaki …

Journal of Human Genetics 70(1) 47-57 2024年10月15日
DNA methylation changes in the genome of patients with hypogonadotropic hypogonadism.

Erina Suzuki, Kazuhiko Nakabayashi, Saki Aoto, Tsutomu Ogata, Yoko Kuroki, Mami Miyado, Maki Fukami, Keiko Matsubara

Heliyon 10(18) e37648 2024年9月30日
Machine learning trial to detect sex differences in simple sticker arts of 1606 preschool children

Matsubara K, Ohgami Y, Okamura K, Aoto S, Fukami M, Shimada Y

76(3) 343-349 2024年6月査読有り
Re-evaluation of whole exome sequencing, including intronic region, in combination with genetic intolerance score for detecting foetal structural anomalies in X-linked disorders

Kosuke Taniguchi, Fuyuki Hasegawa, Yuka Okazaki, Asuka Hori, Hiroko Ogata-Kawata, Saki Aoto, Osuke Migita, Tomoko Kawai, Kazuhiko Nakabayashi, Kohji Okamura …

2023年2月7日
Automated urinary sediment detection for Fabry disease using deep-learning algorithms

Hidetaka Uryu, Ohsuke Migita, Minami Ozawa, Chikako Kamijo, Saki Aoto, Kohji Okamura, Fuyuki Hasegawa, Torayuki Okuyama, Motomichi Kosuga, Kenichiro Hata

Molecular Genetics and Metabolism Reports 33 100921-100921 2022年12月
Collection of 2429 constrained headshots of 277 volunteers for deep learning

12(1) 3730-3730 2022年12月査読有り
Identification of epigenetic memory candidates associated with gestational age at birth through analysis of methylome and transcriptional data

Kohei Kashima, Tomoko Kawai, Riki Nishimura, Yuh Shiwa, Kevin Y. Urayama, Hiromi Kamura, Kazue Takeda, Saki Aoto, Atsushi Ito, Keiko Matsubara …

Scientific Reports 11(1) 3381-3381 2021年12月査読有り
Diversification of CpG-Island Promoters Revealed by Comparative Analysis Between Human and Rhesus Monkey Genomes

Saki Aoto, Mayu Fushimi, Kei Yura, Kohji Okamura

Mammalian Genome 31(7-8) 240-251 2020年7月9日査読有り
Frequent retrotransposition of endogenous genes in ERCC2-deficient cells derived from a patient with xeroderma pigmentosum

Saki Aoto, Saki Katagiri, Yi Wang, Alistair T, Pagnamenta, Rie Sakamoto-Abutani, Masashi Toyoda, Akihiro Umezawa, Kohji Okamura

Stem Cell Research and Therapy 10(1) 273-273 2019年査読有り
Block of CDK1-dependent polyadenosine elongation of Cyclin B mRNA in metaphase-i-arrested starfish oocytes is released by intracellular pH elevation upon spawning

Hiroe Ochi, Saki Aoto, Kazunori Tachibana, Masatoshi Hara, Kazuyoshi Chiba

MOLECULAR REPRODUCTION AND DEVELOPMENT 83(1) 79-87 2016年1月査読有り
Case study on the evolution of hetero-oligomer interfaces based on the differences in paralogous proteins

Saki Aoto, Kei Yura

Biophysics and Physicobiology 12 103-116 2015年査読有り

MISC

妊娠中のVitamin D欠乏と出生児のエピジェネティッククロック加速

河合智子, 左勝則, 小川浩平, 田中久子, 青砥早希, 嘉村浩美, 森崎菜穂, 藤原武男, 堀川玲子, 秦健一郎 …

栄養学雑誌 83(5 Supplement) 2025年
全エクソームシーケンスデータを用いたコピー数バリアント(CNV)参照リストの作出

緒方広子, 青砥早希, 石渡啓介, 嘉村浩美, 河合智子, 秦健一郎, 秦健一郎, 中林一彦

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 47th 2024年
エゾナキウサギゲノムにおけるゲノムインプリンティングを受ける領域の探索

青砥早希, 進導美幸, 山口藍, 押田龍夫, 岡村浩司

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 47th 2024年
エゾナキウサギIMPACTのアレル特異的DNAメチル化

進導美幸, 青砥早希, 山口藍, 押田龍夫, 岡村浩司

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 47th 2024年
絨毛膜羊膜炎に伴う胎盤エピゲノム変動は生後児血のSOCS3メチル化変化と相関する

鹿嶋晃平, 鹿嶋晃平, 河合智子, 池村雅子, 嘉村浩美, 青砥早希, 佐藤泰輔, 本村健一郎, 入山高行, 永松健 …

DOHad研究(Web) 12(3) 2024年
希少未診断疾患エピバリアント解析のための参照データベースとツールキットの開発

青砥早希, 松原圭子, 山澤一樹, 秦健一郎, 鏡雅代, 中林一彦

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 46th 2023年12月8日筆頭著者
動物実験管理システムのオープンソース開発

岡村峻平, 進導美幸, 青砥早希, 黒木陽子, 黒木陽子, 岡村浩司

日本実験動物学会総会講演要旨集(Web) 70th 2023年
低ゴナドトロピン性性腺機能低下症における疾患特異的メチル化変化の探索

鈴木江莉奈, 宮戸真美, 松原圭子, 松原圭子, 松原圭子, 黒木陽子, 黒木陽子, 黒木陽子, 川嶋明香, 原香織 …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 46th 2023年
動物実験管理ウェブアプリケーションのオープンソース開発

進導美幸, 岡村峻平, 青砥早希, 黒木陽子, 黒木陽子, 岡村浩司

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 46th 2023年
エピバリアントを有するプロモータ領域および検体を検出するEpimutation Finderの開発

青砥早希, 秦健一郎, 中林一彦

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 45th 2022年11月30日
健常者集団中のエピバリアントを視覚的に確認できるウェブビューワの構築

青砥早希, 秦健一郎, 秦健一郎, 中林一彦

日本人類遺伝学会大会(CD-ROM) 67th 2022年
少遺伝性疾患ゲノム診断率向上に向けてのDNAメチル化キャプチャーシーケンス法の開発

長谷川慶太, 長谷川慶太, 中林一彦, 河合智子, 青砥早希, 春日義史, 副島英伸, 岡本伸彦, 田中守, 秦健一郎

日本人類遺伝学会大会(CD-ROM) 67th 2022年
ヒトおよびアカゲザルの比較解析によるCpGアイランドプロモータの多様化

青砥早希, 伏見麻由, 由良敬, 岡村浩司

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 43rd 2020年12月4日
色素性乾皮症患者由来ERCC2欠損細胞における内在性遺伝子のレトロトランスポジション

青砥早希, 豊田雅士, 梅澤明弘, 岡村浩司

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 42nd 2019年査読有り
深層学習および線形分類を利用したトランススプライシングに関わる塩基配列の探索

片桐沙弥, 片桐沙紀, 青砥早希, 西野光一郎, 岡村浩司

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 2018年査読有り
Noonan症候群様症状を示す一卵性双生児の全ゲノム解析

青砥早希, 岡村浩司, 右田王介, 高田史男, 中林一彦, 秦健一郎

生命科学系学会合同年次大会 2017年度 [4P2T18-0525)] 2017年12月査読有り
ヒトおよびアカゲザルCpGアイランドプロモータの配列比較解析

青砥早希, 伏見麻由, 由良敬, 岡村浩司

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 2016年査読有り
子宮子宮体がんの病理と診断ゲノム解析からみた2種類の子宮体部類内膜腺癌

杉山裕子, 後藤理, 福井伸行, 土屋裕章, 青砥早希, 荷見勝彦, 加藤一喜, 馬屋原健司, 宇津木久仁子, 竹島信宏 …

日本癌治療学会誌 50(3) 989-989 2015年9月
ヒトデ卵の減数分裂進行時におけるmRNAポリA鎖伸長調節

越智洋絵, 原昌稔, 立花和則, 青砥早希, 千葉和義

日本動物学会大会予稿集 85th 2014年
mRNA切断ポリアデニル化特異因子複合体構成サブユニットの構造推定

青砥早希, 由良敬

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 13th 2013年

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講演・口頭発表等

エゾナキウサギゲノムにおけるゲノムインプリンティングを受ける領域の探索

青砥早希, 進導美幸, 山口藍, 押田龍夫, 岡村浩司

第47回日本分子生物学会年会 2024年11月28日
オリゴヌクレオチドの位置関係と畳み込みニューラルネットワークを利用したプロモーター配列の解析

青砥早希, 岡村浩司

日本分子生物学会第41回日本分子生物学会年会 2018年11月28日
Noonan症候群様症状を示す一卵性双生児の全ゲノム解析

青砥早希

日本分子生物学会第40回日本分子生物学会年会 2017年12月9日

所属学協会

日本分子生物学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

定住社会のフロンティア：骨考古学の技術革新による先史血縁社会と葬制の研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(S) 2026年4月 - 2031年3月

谷口康浩, 植田信太郎, 近藤修, 三宅裕, 那須浩郎, 萩原康雄, 水野文月, 大橋順, 青砥早希
ERCC2欠損iPS細胞を利用したレトロコピー挿入ゲノム部位の配列的・空間的特徴解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2025年4月 - 2028年3月

青砥早希
ゲノム解析による遺伝子診断の円滑化を目指した双方向進捗管理システムの構築

国立成育医療研究センター成育医療研究開発費 2025年4月 - 2026年3月

青砥早希
小児がん及びヒト多能性幹細胞に対する畳込ニューラルネットワークによる分類器の創成

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2024年4月 - 2025年3月

梅澤明弘, 三上修治, 青砥早希, 菅原亨, 岡村浩司
ヒト集団におけるレトロトランスポジションの発生頻度とその発生機序の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2021年4月 - 2025年3月

青砥早希
ヒトゲノムインプリンティング研究におけるマウスの代替動物としてのウサギゲノムの検証

国立成育医療研究センターダイバーシティ実現推進室若手女性研究者活動支援費 2024年11月 - 2025年3月

青砥早希
ウルトラ低カバレッジシーケンシングによる低DNA量検体・検査時間短縮を実現するコピー数多型検出パイプラインの構築

国立成育医療研究センター成育医療研究開発費 2024年4月 - 2025年3月

青砥早希
インプリンティング疾患診断補助のためのエピバリアント検出ツールの開発

国立成育医療研究センター成育医療研究開発費 2023年4月 - 2024年3月

青砥早希
全ゲノムシーケンスデータ解析における生殖・周産期疾患の健常コントロールとなる構造多型データベースの開発

国立成育医療研究センター成育医療研究開発費 2022年4月 - 2023年3月

青砥早希
既存検体の再解析による日本人の遺伝子発現制御領域多型の収集とWEBデータベース化

国立成育医療研究センター成育医療研究開発費 2021年4月 - 2022年3月

青砥早希
エクソームデータを用いた大規模レトロトランスポジション検出法の開発

成育医療研究開発費 2019年4月 - 2020年3月

青砥早希
成育ゲノム医療の推進に向けたデータベース開発

成育医療研究開発費 2017年4月 - 2018年3月

青砥早希

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講演・口頭発表等

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