Shirou Manabe

Profile Information

Affiliation: Endowed Chair Associate Professor, Graduate School of Medicine Graduate School of Medicine, Osaka University

Degree: Doctor of Medical Science(Osaka University)
Master of Engineering(Osaka Institute of Technology)

J-GLOBAL ID: 201801020279747495
researchmap Member ID: B000324957

Major Research Interests

Major Research Areas

Research History

Jul, 2022 - Present

Endowed Chair Associate Professor, Graduate School of Medicine Graduate School of Medicine, Osaka University
Apr, 2017 - Jun, 2022

特任助教, 情報統合医学講座医療情報学, 大阪大学大学院医学系研究科
Oct, 2011 - Mar, 2017

特任研究員, 情報統合医学講座医療情報学, 大阪大学大学院医学系研究科

Committee Memberships

Jun, 2013 - Present

評議員, 日本医療情報学会
Apr, 2013 - Present

開催幹事, 関西医療情報処理懇談会
Apr, 2013 - Present

医療情報技師育成部会上級医療情報技師育成指導者, 日本医療情報学会
Apr, 2012 - Present

EBLM委員会, 日本臨床検査医学会
Apr, 2012 - Present

検査項目コード委員会, 日本臨床検査医学会

Papers

Effect of the RNF213 p.R4810K Variant on the Progression of Intracranial Artery Stenosis

Shuhei Okazaki, Takeshi Yoshimoto, Mariko Ohara, Masatoshi Takagaki, Hajime Nakamura, Kotaro Watanabe, Yasufumi Gon, Kenichi Todo, Tsutomu Sasaki, Hiroyuki Araki, Tomomi Yamada, Shirou Manabe, Haruhiko Kishima, Masafumi Ihara, Hideki Mochizuki

Neurology Genetics, 8(5) e200029-e200029, Oct, 2022 Peer-reviewed
Identification of mild cognitive impairment subtypes predicting conversion to Alzheimer’s disease using multimodal data

Masataka Kikuchi, Kaori Kobayashi, Sakiko Itoh, Kensaku Kasuga, Akinori Miyashita, Takeshi Ikeuchi, Eiji Yumoto, Yuki Kosaka, Yasuto Fushimi, Toshihiro Takeda, Shirou Manabe, Satoshi Hattori, Akihiro Nakaya, Kenichi Kamijo, Yasushi Matsumura

Computational and Structural Biotechnology Journal, 20 5296-5308, 2022 Peer-reviewed
Detecting Adverse Drug Events Through the Chronological Relationship Between the Medication Period and the Presence of Adverse Reactions From Electronic Medical Record Systems: Observational Study

Kei Teramoto, Toshihiro Takeda, Naoki Mihara, Yoshie Shimai, Shirou Manabe, Shigeki Kuwata, Hiroshi Kondoh, Yasushi Matsumura

JMIR Medical Informatics, 9(11) e28763-e28763, Nov 1, 2021 Peer-reviewed
Practical use of a multicenter clinical research support system connected to electronic medical records.

Shirou Manabe, Toshihiro Takeda, Atsushi Hattori, Masashi Yamamoto, Yoshie Shimai, Yoshiki Namiuchi, Junji Yamaguchi, Tomomi Yamada, Shozo Konishi, Yasushi Matsumura

Computer methods and programs in biomedicine, 210 106362-106362, Oct, 2021 Peer-reviewedLead author
Automatic creation of annotations for chest radiographs based on the positional information extracted from radiographic image reports.

Bowen Wang, Toshihiro Takeda, Kento Sugimoto, Jiahao Zhang, Shoya Wada, Shozo Konishi, Shirou Manabe, Katsuki Okada, Yasushi Matsumura

Computer methods and programs in biomedicine, 209 106331-106331, Aug 4, 2021 Peer-reviewed
Extracting clinical terms from radiology reports with deep learning

Kento Sugimoto, Toshihiro Takeda, Jong-Hoon Oh, Shoya Wada, Shozo Konishi, Asuka Yamahata, Shiro Manabe, Noriyuki Tomiyama, Takashi Matsunaga, Katsuyuki Nakanishi, Yasushi Matsumura

Journal of Biomedical Informatics, 116 103729-103729, Apr, 2021 Peer-reviewed
医療情報銀行を中心とするPersonal Health Recordのアーキテクチャとその試行

松村泰志, 武田理宏, 真鍋史朗, 小西正三, 宮内恒, 坂田健太郎, 杉下滉紀, 東博暢, 五味健太郎, 片岡宏輔, 高石友博, 高木かなえ, 山内玲

医療情報学, 41(1) 17-28, Apr, 2021 Peer-reviewed
The practice of active patient involvement in rare disease research using ICT: experiences and lessons from the RUDY JAPAN project.

Nao Hamakawa, Atsushi Kogetsu, Moeko Isono, Chisato Yamasaki, Shirou Manabe, Toshihiro Takeda, Kazumasa Iwamoto, Tomoya Kubota, Joe Barrett, Nathanael Gray, Alison Turner, Harriet Teare, Yukie Imamura, Beverley Anne Yamamoto, Jane Kaye, Michihiro Hide, Masanori P Takahashi, Yasushi Matsumura, Muhammad Kassim Javaid, Kazuto Kato

Research involvement and engagement, 7(1) 9-9, Feb 1, 2021 Peer-reviewed
【電子カルテからのReal World Dataの収集】OCRネットにおける多施設臨床研究支援システム

武田理宏, 真鍋史朗, 松村泰志

Precision Medicine, 3(9) 796-799, Aug, 2020
End-to-End Approach for Structuring Radiology Reports.

Kento Sugimoto, Toshihiro Takeda, Shoya Wada, Asuka Yamahata, Shozo Konishi, Shiro Manabe, Yasushi Matsumura

Studies in health technology and informatics, 270 203-207, Jun 16, 2020 Peer-reviewed
An Automatic Image Collection System for Multicenter Clinical Studies.

Toshihiro Takeda, Shirou Manabe, Atsushi Hattori, Junji Yamaguchi, Shozo Konishi, Yuichiro Yamamoto, Daiyo Takahashi, Yasushi Matsumura

Studies in health technology and informatics, 270 23-27, Jun 16, 2020 Peer-reviewed
ICTを利用した患者参画型の医学研究における交流の場の構築

磯野萌子, 濱川菜桜, 古結敦士, 山崎千里, 久保田智哉, 岩本和真, 真鍋史朗, 武田理宏, 松村泰志, 山本ベバリー・アン, 秀道広, 高橋正紀, 加藤和人

日本難病医療ネットワーク学会機関誌, 7(1) 136-136, Nov, 2019
Extracting Symptom Names and Disease-Symptom Relationships from Web Texts Using a Multi-Column Convolutional Neural Network.

Shoya Wada, Ryu Iida, Kentaro Torisawa, Toshihiro Takeda, Shiro Manabe, Yasushi Matsumura

Studies in health technology and informatics, 264 423-427, Aug 21, 2019 Peer-reviewed
The Acquisition of Structured Clinical Data from a Document-Based Electronic Medical Record System.

Toshihiro Takeda, Dongyao Zhang, Shoya Wada, Akito Nakagawa, Kento Sugimoto, Shirou Manabe, Yasushi Matsumura

Studies in health technology and informatics, 264 1600-1601, Aug 21, 2019 Peer-reviewed
Screening of anticancer drugs to detect drug-induced interstitial pneumonia using the accumulated data in the electronic medical record.

Yoshie Shimai, Toshihiro Takeda, Katsuki Okada, Shirou Manabe, Kei Teramoto, Naoki Mihara, Yasushi Matsumura

Pharmacology research & perspectives, 6(4) e00421, Jul, 2018 Peer-reviewed
抽出データ解析時のピットフォール～骨粗鬆症治療薬に関する後向き解析～

中川彰人, 村田泰三, 真鍋史朗, 武田理宏, 松村泰志

第22回日本医療情報学会春季学術大会プログラム・抄録集, 132, Jun, 2018 Peer-reviewed
電子カルテとデータ連携したCDISC標準準拠の電子症例報告システムの構築と循環器領域での活用

武田理宏, 真鍋史朗, 中川彰人, 服部睦, 高橋大曜, 砂真一郎, 彦惣俊吾, 中谷大作, 坂田泰史, 松村泰志

医療情報学, Nov, 2017 Peer-reviewed
【医療ビッグデータの可能性と現状の取り組み】電子カルテデータ二次利用の現状と課題

武田理宏, 真鍋史朗, 松村泰志

生体医工学, 55(4) 151-158, Aug, 2017 Peer-reviewed
【狙われる病院情報システムとその対策】安全対策はどこまで可能か臨床研究で用いる患者データをどう守るか大阪大学医学部附属病院の取り組みと現状

武田理宏, 真鍋史朗, 松村泰志

新医療, 44(6) 107-110, Jun, 2017 Peer-reviewed
Design of Japan Laboratory Code Version 11 (JLAC11)

Shirou MANABE, Katsunori SHIMIZU, Osamu YAMADA, Taeko HOTTA, Kazunori MIYAKE, Hiromi KATAOKA, Atsushi ISHIGURO, Masato YAMAZAKI, Hironobu MIYASHITA, Osamu KOSUDA, Etsuji YAMADA, Dongchon KAN

The OFFICIAL JOURNAL OF JAPANESE SOCIETY OF LABORATORY MEDICINE, 65(4) 482-488, Apr, 2017 Lead author

Misc.

112

ペースメーカ診療を対象とした電子カルテにおける診療課題データの医療情報銀行への連携

小西正三, 武田理宏, 真鍋史朗, 岡田佳築, 和田聖哉, 松村泰志

医療情報学連合大会論文集, 41回 498-500, Nov, 2021 Peer-reviewed
電子問診票システムの患者報告アウトカムへの応用

真鍋史朗, 武田理宏, 小西正三, 島井良重, 山本征司, 坂井亜紀子, 岡田佳築, 和田聖哉, 山口純司, 波内良樹, 松村泰志

医療情報学連合大会論文集, 41回 525-527, Nov, 2021 Peer-reviewed
顔認証技術を用いた小児科病棟入室管理システムの有用性の評価

小玉伽那, 武田理宏, 圓見千代, 中継希江, 和田聖哉, 真鍋史朗, 小西正三, 岡田佳築, 鍋谷佳子, 川崎良, 松村泰志

医療情報学連合大会論文集, 41回 592-596, Nov, 2021 Peer-reviewed
臨床研究画像収集システムを用いた多施設共同臨床研究における臨床画像データ収集の効率化

岡田佳築, 真鍋史朗, 武田理宏, 松村泰志

医療情報学連合大会論文集, 41回 689-691, Nov, 2021
心臓CT画像を用いた左心房セグメンテーションに関する研究

薛飛, 小西正三, 和田聖哉, 真鍋史朗, 岡田佳築, 武田理宏, 松村泰志

医療情報学連合大会論文集, 41回 692-695, Nov, 2021
二次元画像分類モデルによる間質性肺炎代表断面像抽出手法の開発

張家豪, 和田聖哉, 杉本賢人, 武田理宏, 岡田佳築, 真鍋史朗, 小西正三, 松村泰志

医療情報学連合大会論文集, 41回 696-699, Nov, 2021
医学文書を対象とした疾患症状関係抽出におけるゼロ照応の評価

和田聖哉, 武田理宏, 岡田佳築, 真鍋史朗, 小西正三, 松村泰志

医療情報学連合大会論文集, 41回 730-732, Nov, 2021
放射線レポートの二次利用に向けた構造化システムの開発に関する取り組み

杉本賢人, 和田聖哉, 小西正三, 岡田佳築, 真鍋史朗, 武田理宏, 山本征司, 松村泰志

医療情報学連合大会論文集, 41回 911-913, Nov, 2021
PDF形式で保存される検査レポートからデータの抽出と構造化を実現するプログラムの開発

区駿業, 和田聖哉, 武田理宏, 岡田佳築, 真鍋史朗, 小西正三, 杉本賢人, 松村泰志

医療情報学連合大会論文集, 41回 914-917, Nov, 2021
遺伝性血管性浮腫の患者参加型臨床研究(RUDY Japan)の構築

森桶聡, 田中暁生, 齋藤怜, 松原大樹, 秀道広, 加藤和人, 山崎千里, 古結敦士, 濱川菜桜, 磯野萌子, 相京辰樹, 山本ベバリーアン, 山本ベバリーアン, 松村泰志, 武田理宏, 真鍋史朗

アレルギー, 70(6/7), 2021
大阪臨床研究ネットワーク(OCR-net)を活用した脳卒中領域の臨床研究支援

岩本穂珠美, 岡崎周平, 真鍋史朗, 武田理宏, 高垣匡寿, 平山龍一, 平山龍一, 貴島晴彦, 望月秀樹, 名井陽

CRCと臨床試験のあり方を考える会議プログラム・抄録集, 21st, 2021
Providing new medical care based on patient-centered sharing of medical information

武田理宏, 小西正三, 真鍋史朗, 岡田佳築, 松村泰志, 松村泰志

日本生体医工学会大会プログラム・抄録集(Web), 60th, 2021
Classification of Certainty Scale of Radiology Reports

杉本賢人, 和田聖哉, 小西正三, 岡田佳築, 真鍋史朗, 武田理宏, 松村泰志

日本医療情報学会春季学術大会プログラム・抄録集, 25th, 2021
Unsupervised Named Entity Recognition for Disease Symptom Expression with Language Model

和田聖哉, 武田理宏, 真鍋史朗, 小西正三, 岡田佳築, 松村泰志

日本医療情報学会春季学術大会プログラム・抄録集, 25th, 2021
臨床研究における臨床画像データ収集自動化の試み

岡田佳築, 真鍋史朗, 武田理宏, 松村泰志

医療情報学連合大会論文集, 40回 477-479, Nov, 2020
臨床研究支援システムを用いたNCD登録システムの開発

真鍋史朗, 服部睦, 山口純司, 波内良樹, 島井良重, 坂井亜紀子, 山本征司, 武田理宏, 小西正三, 松村泰志

医療情報学連合大会論文集, 40回 531-535, Nov, 2020
形態素解析が日本語医学BERTモデルに与える影響

和田聖哉, 武田理宏, 真鍋史朗, 小西正三, 松村泰志

医療情報学連合大会論文集, 40回 738-743, Nov, 2020
放射線レポートのエンティティ抽出モデルの一般化可能性の評価

杉本賢人, 和田聖哉, 小西正三, 武田理宏, 真鍋史朗, 松永隆, 松村泰志

医療情報学連合大会論文集, 40回 750-753, Nov, 2020
スマートフォンおよびウェアラブルデバイスを用いた身体活動量収集の取組みと課題

小西正三, 中谷大作, 山崎慶太, 加藤大志, 執行真旗, 西村公伸, 勝正範, 真鍋史朗, 武田理宏, 大久保厚志, 坂田泰史, 松村泰志

医療情報学連合大会論文集, 40回 949-951, Nov, 2020
自身の健康状態を短時間で把握することを目的とした健康診断Personal Health Recordサービスの構築とその利用結果

武田理宏, 島井良重, 山本陵平, 清水政彦, 真鍋史朗, 三嶋正芳, 瀧原圭子, 松村泰志

医療情報学連合大会論文集, 40回 425-430, Nov, 2020

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