山本哲史 (Satoshi Yamamoto) - マイポータル

基本情報

所属: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構農業環境研究部門主任研究員

学位: 博士（理学）(京都大学)

ORCID iD: https://orcid.org/0000-0003-0123-9112
J-GLOBAL ID: 201501011921860020
researchmap会員ID: 7000012368

外部リンク: https://sites.google.com/view/satoshiyamamoto/top

研究分野

ライフサイエンス / 生態学、環境学 /

経歴

2024年4月 - 現在

国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構農業環境研究部門, 主任研究員
2020年4月 - 2024年3月

国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構農業環境研究部門, 研究員
2017年11月 - 2020年3月

京都大学大学院理学研究科, 助教
2014年4月 - 2017年10月

神戸大学大学院人間発達環境学研究科人間環境学専攻, 研究員
2011年4月 - 2014年3月

京都大学大学院人間環境学研究科, 特定研究員
2010年4月 - 2011年3月

京都大学大学院理学研究科, 博士研究員
2008年4月 - 2010年3月

日本学術振興会特別研究員（DC2）

学歴

2006年4月 - 2009年3月

京都大学大学院理学研究科生物科学専攻博士後期課程
2004年4月 - 2006年3月

京都大学大学院理学研究科生物科学専攻修士課程
2000年4月 - 2004年3月

信州大学理学部生物科学科

論文

OdoCocktail-Japan: Primer sets to enrich environmental DNA of Japanese Odonata species

Satoshi Yamamoto, Naoki Katayama, Junsuke Yamasako, Kenji Ito, Yuki G. Baba

2026年5月12日
Landscape factors influencing the distribution of rare submerged plant species: an environmental DNA (eDNA) study

Ayaka Fujiwara, Kei Uchida, Satoshi Yamamoto, Hirotoshi Sato, Ryohei Nakao, Masayuki K. Sakata, Norio Hayashi, Hiroki Yamanaka, Atushi Ushimaru, Toshifumi Minamoto

PeerJ 14 e21096-e21096 2026年4月21日
Large-scale environmental DNA survey reveals niche axes of a regional coastal fish community

Yutaka Osada, Masaki Miya, Hitoshi Araki, Hideyuki Doi, Akihide Kasai, Reiji Masuda, Toshifumi Minamoto, Satoquo Seino, Teruhiko Takahara, Satoshi Yamamoto …

Scientific Reports 16(1) 2026年2月16日
Optimal Environmental DNA Sampling Strategy for Comprehensively Assessing Biodiversity in Rice Paddy Fields

Satoshi Yamamoto, Naoki Katayama, Junsuke Yamasako, Kenji Ito, Satoru Okubo, Yuki G. Baba

Environmental DNA 2025年11月
Cryptic invasion by non-native reed canary grass, Phalaris arundinacea, in Japan endangers native conspecific populations through displacement and hybridization

Satoshi Yamamoto, Chika Egawa, Yasuyuki Yoshimura, Natsumi Ueda, Hiroyuki Shibaike

2025年9月12日
When and how do 17-year periodical cicada nymphs decide to emerge? A field test of the 4-year-gate hypothesis

Namiho Saito, Satoshi Yamamoto, Satoshi Kakishima, Yutaka Okuzaki, Andrew Rasmussen, Diler Haji, Shota Nomura, Hiroyuki Tanaka, Takehiko Itoh, Jin Yoshimura …

Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences 2025年8月査読有り
Complementary role of environmental DNA for line-transect bird surveys: A field test in a Japanese rice landscape

Naoki Katayama, Satoshi Yamamoto, Yuki G. Baba, Kenji Ito, Junsuke Yamasako

Ecological Indicators 166 112442-112442 2024年9月査読有り筆頭著者
Sensitive and efficient surveillance of Japanese giant salamander (Andrias japonicus) distribution in western Japan using multi-copy nuclear DNA marker

Shunsuke Hidaka, Toshiaki S. Jo, Satoshi Yamamoto, Koki R. Katsuhara, Sei Tomita, Masaki Miya, Makihiko Ikegami, Atushi Ushimaru, Toshifumi Minamoto

Limnology 2024年4月査読有り
Species traits and ecosystem characteristics affect species detection by <scp>eDNA</scp> metabarcoding in lake fish communities

Hideyuki Doi, Shunsuke Matsuoka, Shin‐ichiro S. Matsuzaki, Mariko Nagano, Hirotoshi Sato, Hiroki Yamanaka, Saeko Matsuhashi, Satoshi Yamamoto, Toshifumi Minamoto, Hitoshi Araki …

Freshwater Biology 68 1346-1358 2023年7月査読有り
Environmental DNA emission by two carangid fishes in single and mixed-species tanks

Hiroaki Murakami, Reiji Masuda, Satoshi Yamamoto, Toshifumi Minamoto, Yoh Yamashita

Fisheries Science 88(1) 55-62 2022年1月査読有り
Estimating fish population abundance by integrating quantitative data on environmental DNA and hydrodynamic modelling

Keiichi Fukaya, Hiroaki Murakami, Seokjin Yoon, Kenji Minami, Yutaka Osada, Satoshi Yamamoto, Reiji Masuda, Akihide Kasai, Kazushi Miyashita, Toshifumi Minamoto …

Molecular Ecology 30(13) 3057-3067 2021年7月査読有り
Compilation of real‐time PCR conditions toward the standardization of environmental DNA methods

Hideyuki Doi, Toshifumi Minamoto, Teruhiko Takahara, Satsuki Tsuji, Kimiko Uchii, Satoshi Yamamoto, Izumi Katano, Hiroki Yamanaka

Ecological Research 36(3) 379-388 2021年5月査読有り
eDNA as a tool for non-invasive monitoring of the fauna of a turbid, well-mixed system, the Elbe estuary in Germany

Martin Schwentner, Reza Zahiri, Satoshi Yamamoto, Martin Husemann, Björn Kullmann, Ralf Thiel

PLOS ONE 16(4) 2021年4月16日査読有り
Aboveground herbivores drive stronger plant species-specific feedback than belowground fungi to regulate tree community assembly

Kohmei Kadowaki, Satoshi Yamamoto, Hirotoshi Sato, Akifumi S. Tanabe, Hirokazu Toju

Oecologia 195 773-784 2021年2月18日査読有り
An illustrated manual for environmental DNA research: Water sampling guidelines and experimental protocols

Toshifumi Minamoto, Masaki Miya, Tetsuya Sado, Satoquo Seino, Hideyuki Doi, Michio Kondoh, Keigo Nakamura, Teruhiko Takahara, Satoshi Yamamoto, Hiroki Yamanaka …

Environmental DNA 3(1) 8-13 2021年1月10日
Detection of herbivory: eDNA detection from feeding marks on leaves

Aoi Kudoh, Toshifumi Minamoto, Satoshi Yamamoto

Environmental DNA 2(4) 627-634 2020年10月1日査読有り責任著者
Characterizing the spatial and temporal occurrence patterns of the endangered botiid loach Parabotia curtus by environmental DNA analysis using a newly developed species-specific primer set

Ko Sugiura, Sei Tomita, Toshifumi Minamoto, Tappei Mishina, Akihisa Iwata, Tsukasa Abe, Satoshi Yamamoto, Katsutoshi Watanabe

Ichthyological Research 68(1) 152-157 2020年6月3日査読有り
Estimations of riverine distribution, abundance and biomass of anguillid eels in Japan and Taiwan using environmental DNA analysis

Hikaru Itakura, Ryoshiro Wakiya, Masayuki K. Sakata, Hsiang-Yi Hsu, Shih-Chong Chen, Chih-shao Yang, Satoshi Yamamoto, Toshifiumi Minamoto

Zoological Studies (in press) 2020年4月査読有り
Sedimentary eDNA provides different information on timescale and fish species composition compared with aqueous eDNA

SAKATA Masayuki K., YAMAMOTO Satoshi, GOTOH Ryo O., MIYA Masaki, YAMANAKA Hiroki, MINAMOTO Toshifumi

Environmental DNA (in press) 2020年2月査読有り
Population abundance gradient of Inurois punctigera along altitude

Satoshi Yamamoto, Seiko Matsuhisa

Entomological Science 23(1) 23-27 2019年12月13日査読有り筆頭著者責任著者

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MISC

昆虫調査における環境DNA分析

山本哲史

2022年9月招待有り筆頭著者
環境DNA分析を用いた水田の昆虫多様性評価

馬場友希, 片山直樹, 山迫淳介, 山本哲史, 池田浩明, 伊藤健二

昆虫と自然 2022年9月招待有り
Dispersion and degradation of environmental DNA from caged fish in a marine environment (vol 85, pg 327, 2019)

Hiroaki Murakami, Seokjin Yoon, Akihide Kasai, Toshifumi Minamoto, Satoshi Yamamoto, Masayuki K. Sakata, Tomoya Horiuchi, Hideki Sawada, Michio Kondoh, Yoh Yamashita …

FISHERIES SCIENCE 85(6) 1109-1109 2019年11月
環境DNA分析による個体数の推定

深谷肇一, 村上弘章, 尹錫鎭, 南憲吏, 長田穣, 山本哲史, 益田玲爾, 笠井亮秀, 宮下和志, 源利文 …

日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web) 21st 2019年
舞鶴湾におけるマアジとカタクチイワシの環境DNAの水平・鉛直分布

村上弘章, 山本哲史, 源利文, 南憲吏, 宮下和士, 深谷肇一, 尹錫鎭, 笠井亮秀, 澤田英樹, 益田玲爾 …

日本水産学会大会講演要旨集 2018 28 2018年3月26日
沿岸海域における環境DNAの分散過程に関する生簀を用いた検証実験

村上弘章, 尹錫鎭, 笠井亮秀, 源利文, 山本哲史, 坂田雅之, 堀内智矢, 澤田英樹, 益田玲爾

日本水産学会大会講演要旨集 2016 35 2016年3月26日
MiFish, a set of universal primers for metabarcoding environmental DNA from fishes: detection of > 230 species from aquarium tanks and coral reefs in the subtropical western North Pacific

Masaki Miya, Yukuto Sato, Tsukasa Fukunaga, Tetsuya Sado, Keiichi Sato, Toshifumi Minamoto, Satoshi Yamamoto, Hiroaki Yamanaka, Hitoshi Araki, Michio Kondoh …

GENOME 58(5) 257-257 2015年5月
生態系規模生物多様性モニタリングに向けて:同一の水サンプル由来の細菌DNAと環境DNAのメタバーコーディング

IWASAKI Wataru, MIYA Masaki, SATO Yukuto, FUKUNAGA Tsukasa, SADO Tetsuya, SATO Keiichi, MINAMOTO Toshifumi, YAMAMOTO Satoshi, YAMANAKA Hiroki, ARAKI Hitoshi …

日本微生物生態学会大会(Web) 30th 2015年

担当経験のある科目(授業)

共同研究・競争的資金等の研究課題

フユシャク類にみられる平行種分化とゲノムの構造不安定性

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2021年4月 - 2025年3月

山本哲史, 池田紘士, 曽田貞滋
環境DNA解析に基づく包括的な水田の生物多様性・生態系サービス評価手法の確立

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2021年4月 - 2025年3月

馬場友希, 伊藤健二, 片山直樹, 山本哲史, 山迫淳介, 大久保悟, 池田浩明
フユシャク類にみられる平行種分化とゲノムの構造不安定性

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2021年4月 - 2025年3月

山本哲史, 曽田貞滋, 池田紘士
環境DNA解析に基づく包括的な水田の生物多様性・生態系サービス評価手法の確立

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2021年4月 - 2025年3月

馬場友希, 伊藤健二, 片山直樹, 山本哲史, 山迫淳介, 大久保悟, 池田浩明
ゲノム編集による昆虫の生活史制御遺伝子の同定

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2021年7月 - 2024年3月

山本哲史, 曽田貞滋
周期ゼミの羽化年決定機構と周期分化のゲノム基盤

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(開拓) 2020年4月 - 2023年3月

曽田貞滋, 山本哲史, 藤澤知親
画像解析と群集メタバーコーディングによる統合的生物多様性モニタリング法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2020年4月 - 2023年3月

藤澤知親, 山本哲史
冬尺蛾における平行進化現象の理解に向けた生活史調節機構とその遺伝的基盤の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2018年4月 - 2021年3月

山本哲史
植物における菌根共生による環境適応の検証

学術研究助成基金助成金／若手研究(B) 2014年4月 - 2016年3月

山本哲史

山本哲史

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学歴

論文

MISC

担当経験のある科目(授業)

共同研究・競争的資金等の研究課題

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