井元清哉 (Seiya Imoto) - マイポータル

基本情報

所属: 東京大学医科学研究所附属ヒトゲノム解析センター教授 (センター長)

研究者番号: 10345027
J-GLOBAL ID: 202001014118417957
researchmap会員ID: R000014294

外部リンク: https://www.hm-intelligence.com/

研究分野

経歴

2020年4月 - 現在

東京大学, 医科学研究所附属ヒトゲノム解析センター, 教授 (センター長)
2015年5月 - 2020年3月

東京大学, 医科学研究所ヘルスインテリジェンスセンター, 教授 (センター長)
2007年2月 - 2015年4月

東京大学, 医科学研究所附属ヒトゲノム解析センター, 准教授
2001年12月 - 2007年2月

東京大学, 医科学研究所附属ヒトゲノム解析センター, 助手
2001年4月 - 2001年11月

東京大学, 医科学研究所附属ヒトゲノム解析センター, 博士研究員
1999年1月 - 2001年3月

独立行政法人日本学術振興会, 特別研究員

論文

205

Case Report: Mixed ductal–lobular carcinoma consisting of invasive lobular carcinoma with a glycogen-rich clear cell pattern and elevated tumor mutation burden

Kae Kawachi, Xiaoyan Tang, Rika Kasajima, Kotoe Katayama, Rui Yamaguchi, Kiyoshi Yamaguchi, Yoichi Furukawa, Seiya Imoto, Satoru Miyano, Emi Yoshioka …

Frontiers in Oncology 16 2026年1月26日
Disruption of Human Papillomavirus 16 E6/E7 Genes Using All-in-One Adenovirus Vectors Expressing Eight Double-Nicking Guide RNAs

Megumi Yamaji, Tomomi Nakahara, Tomoko Nakanishi, Satomi Aoyama-Kikawa, Kiyoshi Yamaguchi, Yoichi Furukawa, Mariko Nakamura, Tadashi Okada, Hirotaka Tabata, Ryoko Fuse …

International Journal of Molecular Sciences 26(17) 8685-8685 2025年9月5日
Multihit Somatic Mosaicism of TP53 Pathogenic Variants in a Patient Mimicking Li-Fraumeni Syndrome.

Kazuaki Yokoyama, Nozomi Yokoyama, Aya Shinozaki-Ushiku, Mika Ito, Hiroyuki Takamori, Satoshi Takahashi, Eigo Shimizu, Seiya Imoto, Tomoki Todo, Yasuhito Nannya

JCO precision oncology 9 e2500392 2025年9月
Identification and replication of sex-dimorphic protein quantitative trait loci across multiple ancestries and their associations with diseases.

Youngjune Bhak, Vasilis Raptis, Yunye He, Tomoko Nakanishi, Erin Macdonald-Dunlop, Yoji Sagiya, Takayuki Morisaki, Koichi Matsuda, Akinori Kanai, Yutaka Suzuki …

Scientific reports 15(1) 31721-31721 2025年8月28日
JOB: Japan Omics Browser provides integrative visualization of multi-omics data.

Yugo Takahashi, Qingbo S Wang, Takanori Hasegawa, Ho Namkoong, Fumitaka Inoue, Koichi Fukunaga, Seiya Imoto, Satoru Miyano, Yukinori Okada

BMC genomics 26(1) 451-451 2025年5月7日
Unraveling the COVID-19 Severity Hubs and Interplays in Inflammatory-Related RNA-Protein Networks.

Heewon Park, Qingbo S Wang, Takanori Hasegawa, Ho Namkoong, Hiroko Tanaka, Ryuji Koike, Yuko Kitagawa, Akinori Kimura, Seiya Imoto, Takanori Kanai …

International journal of molecular sciences 26(9) 2025年5月6日
Comprehensive analysis of prognosis markers with molecular features derived from pan-cancer whole-genome sequences.

Mamoru Kato, Jo Nishino, Momoko Nagai, Hirofumi Rokutan, Daichi Narushima, Hanako Ono, Takanori Hasegawa, Seiya Imoto, Shigeyuki Matsui, Tatsuhiko Tsunoda …

Human genomics 19(1) 39-39 2025年4月12日査読有り
Predicting coronavirus disease 2019 severity using explainable artificial intelligence techniques.

Takuya Ozawa, Shotaro Chubachi, Ho Namkoong, Shota Nemoto, Ryo Ikegami, Takanori Asakura, Hiromu Tanaka, Ho Lee, Takahiro Fukushima, Shuhei Azekawa …

Scientific reports 15(1) 9459-9459 2025年3月19日
stana: an R package for metagenotyping analysis and interactive application based on clinical data.

Noriaki Sato, Kotoe Katayama, Daichi Miyaoka, Miho Uematsu, Ayumu Saito, Kosuke Fujimoto, Satoshi Uematsu, Seiya Imoto

NAR genomics and bioinformatics 7(1) lqae191 2025年3月
Cell of origin and expression profiles of pseudomyxoma peritonei derived from the appendix.

Rei Noguchi, Kiyoshi Yamaguchi, Hideaki Yano, Yoshimasa Gohda, Tomomichi Kiyomatsu, Yasunori Ota, Toru Igari, Norihiko Takahashi, Tomoyuki Ohsugi, Kiyoko Takane …

Pathology, research and practice 266 155776-155776 2025年2月
Comparative analysis of the B cell receptor repertoire during relapse and remission in patients with multiple sclerosis

Miriam Pérez-Saldívar, Yusuke Nakamura, Kazuma Kiyotani, Seiya Imoto, Kotoe Katayama, Rui Yamaguchi, Satoru Miyano, Jesús Martínez-Barnetche, Elizabeth Ernestina Godoy-Lozano, Graciela Ordoñez …

Clinical Immunology 269 110398-110398 2024年12月
Publisher Correction: Statistically and functionally fine-mapped blood eQTLs and pQTLs from 1,405 humans reveal distinct regulation patterns and disease relevance

Qingbo S. Wang, Takanori Hasegawa, Ho Namkoong, Ryunosuke Saiki, Ryuya Edahiro, Kyuto Sonehara, Hiromu Tanaka, Shuhei Azekawa, Shotaro Chubachi, Yugo Takahashi …

Nature Genetics 56(10) 2281-2281 2024年9月27日
Pathogenicity Prediction of Gene Fusion in Structural Variations: A Knowledge Graph-Infused Explainable Artificial Intelligence (XAI) Framework.

Katsuhiko Murakami, Shin-Ichiro Tago, Sho Takishita, Hiroaki Morikawa, Rikuhiro Kojima, Kazuaki Yokoyama, Miho Ogawa, Hidehito Fukushima, Hiroyuki Takamori, Yasuhito Nannya …

Cancers 16(10) 2024年5月17日
Gastrointestinal symptoms in COVID-19 and disease severity: a Japanese registry-based retrospective cohort study.

Yuta Matsubara, Hiroki Kiyohara, Yohei Mikami, Kosaku Nanki, Ho Namkoong, Shotaro Chubachi, Hiromu Tanaka, Shuhei Azekawa, Shinya Sugimoto, Yusuke Yoshimatsu …

Journal of gastroenterology 59(3) 195-208 2024年3月
Estimating gene-level false discovery probability improves eQTL statistical fine-mapping precision.

Qingbo S Wang, Ryuya Edahiro, Ho Namkoong, Takanori Hasegawa, Yuya Shirai, Kyuto Sonehara, Atsushi Kumanogoh, Makoto Ishii, Ryuji Koike, Akinori Kimura …

NAR genomics and bioinformatics 5(4) lqad090 2023年12月
Prognostic significance of hypertension history and blood pressure on admission in Japanese patients with coronavirus disease 2019: integrative analysis from the Japan COVID-19 Task Force.

Kaori Sakurai, Shotaro Chubachi, Takanori Asakura, Ho Namkoong, Hiromu Tanaka, Shuhei Azekawa, Takashi Shimada, Shiro Otake, Kensuke Nakagawara, Takahiro Fukushima …

Hypertension research : official journal of the Japanese Society of Hypertension 47(3) 639-648 2023年11月2日
成人組織球症における遺伝子変異解析

佐藤亜紀, 遊佐希, 小川弥穂, 高森弘之, 清水英悟, 神保光児, 横山和明, 大田泰徳, 井元清哉, 南谷泰仁 …

日本血液学会学術集会 85回 407-407 2023年10月
Genetic analysis of low-grade adenosquamous carcinoma of the breast progressing to high-grade metaplastic carcinoma.

Kae Kawachi, Xiaoyan Tang, Rika Kasajima, Takashi Yamanaka, Eigo Shimizu, Kotoe Katayama, Rui Yamaguchi, Kazuaki Yokoyama, Kiyoshi Yamaguchi, Yoichi Furukawa …

Breast cancer research and treatment 202(3) 563-573 2023年8月31日
P1342: THE IMPACT OF CLONAL HEMATOPOIESIS ON THE RISK OF SEVERE COVID-19 INFECTION

Ryunosuke Saiki, Ho Namkoong, Qingbo Wang, Ryuya Edahiro, Kyuto Sonehara, Takanori Hasegawa, Hideki Makishima, Yasuhito Nannya, Nobuyuki Kakiuchi, Yuichi Shiraishi …

HemaSphere 7(S3) e928591b-e928591b 2023年8月8日
Clinical characteristics of patients with COVID-19 harboring detectable intracellular SARS-CoV-2 RNA in peripheral blood cells.

Hiromu Tanaka, Ho Namkoong, Shotaro Chubachi, Shinji Irie, Yoshifumi Uwamino, Ho Lee, Shuhei Azekawa, Shiro Otake, Kensuke Nakagawara, Takahiro Fukushima …

International journal of infectious diseases : IJID : official publication of the International Society for Infectious Diseases 135 41-44 2023年8月2日

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MISC

The impact of clonal hematopoiesis on the risk of severe COVID-19

Ryunosuke Saiki, Ryuya Edahiro, Kyuto Sonehara, Qingbo Wang, Ho Namkoong, Takanori Hasegawa, Yasuhito Nannya, Yuichi Shiraishi, Akinori Kimura, Seiya Imoto …

CANCER SCIENCE 115 1760-1760 2024年3月
ゲノム医療を促進するAI開発:説明可能AI(XAI)と生成AIを融合した統合アプローチ

多湖真一郎, 村上勝彦, 瀧下祥, 森川裕章, 小嶋陸大, 阿部修也, 横山和明, 小川弥穂, 小川弥穂, 福島英人 …

日本癌学会学術総会抄録集(Web) 83rd 2024年
遺伝子ネットワーク解析による高悪性度胎児性肺腺癌のパスウェイ予測・検討

笠島理加, 笠島理加, 鈴木理樹, 鈴木理樹, 清水英悟, 玉田嘉紀, 新井田厚司, 廣島幸彦, 片山琴絵, 山口類 …

日本癌学会学術総会抄録集(Web) 81st 2022年
Classification of Primary Liver Cancer with Immunosuppression Mechanisms and Correlation with Genomic Alterations (vol 52, 102, 2021)

Masashi Fujita, Rui Yamaguchi, Takanori Hasegawa, Shu Shimada, Koji Arihiro, Shuto Hayashi, Kazuhiro Maejima, Kaoru Nakano, Akihiro Fujimoto, Atsushi Ono …

EBIOMEDICINE 66 2021年4月
胎児性肺癌における遺伝子ネットワーク解析

笠島理加, 鈴木理樹, 清水英悟, 玉田嘉紀, 新井田厚司, 山口類, 井元清哉, 古川洋一, 宮野悟, 横瀬智之 …

日本癌学会総会記事 79回 PJ14-1 2020年10月
イムノゲノミクスの進歩と精密医療への応用肝臓がん免疫抑制機構の免疫ゲノム解析(Advances in immunogenomics and application to precision medicine Immunogenomic analysis of immune suppression mechanisms in primary liver cancer)

藤田征志, 山口類, 有廣光司, 島田周, 宮野悟, 山上裕機, 茶山一彰, 垣見和宏, 田中真二, 井元清哉 …

日本癌学会総会記事 78回 IS9-5 2019年9月
Comprehensive Search for Prognostic Biomarkers using PCAWG Data

Mamoru Kato, Momoko Nagai, Takanori Hasegawa, Seiya Imoto, Shigeyuki Matsui, Tatsuhiko Tsunoda, Tatsuhiro Shibata

CANCER SCIENCE 109 291-291 2018年12月
Genomic insights into immune suppression in liver cancer

Masashi Fujita, Seiya Imoto, Rui Yamaguchi, Takanori Hasegawa, Shuto Hayashi, Kazuhiro Kakimi, Satoru Miyano, Hiroki Yamaue, Kazuaki Chayama, Hidewaki Nakagawa

CANCER SCIENCE 109 640-640 2018年12月
Prognostic Impact of Circulating Tumor DNA Status Post-Allogeneic Hematopoietic Stem Cell Transplantation in Acute Myeloid Leukemia and Myelodysplastic Syndrome

Sousuke Nakamura, Kazuaki Yokoyama, Eigo Shimizu, Nozomi Yusa, Miho Ogawa, Tomomi Takei, Asako Kobayashi, Mika Ito, Masamichi Isobe, Takaaki Konuma …

BLOOD 132 2018年11月29日
Artificial Intelligence Guided Precision Medicine Approach to Hematological Disease

Tomomi Takei, Kazuaki Yokoyama, Nozomi Yusa, Sousuke Nakamura, Miho Ogawa, Kanya Kondoh, Masayuki Kobayashi, Asako Kobayashi, Mika Ito, Eigo Shimizu …

BLOOD 132 2018年11月
ポリメラーゼ校正関連ポリポーシス患者由来の大腸腫瘍の遺伝子およびエピゲノム解析(Genetic and epigenetic analyses of colorectal tumors in a patient with the loss of polymerase proofreading)

山口貴世志, 清水英悟, 池上恒雄, 高根希世子, 山口類, 井元清哉, 宮野悟, 古川洋一

日本癌学会総会記事 77回 1798-1798 2018年9月
腫瘍由来循環DNAを用いたAMLおよびMDSの移植後微小残存病変の検出に関する後方視的解析(Circulating tumor DNA predicts relapse after allo-SCT in AML and MDS)

中村聡介, 横山和明, 遊佐希, 近藤幹也, 小川弥穂, 武井智美, 小林麻子, 伊藤美香, 神保光児, 田上晋 …

臨床血液 59(9) 1554-1554 2018年9月
RHOA遺伝子変異の検出が診断および病勢評価に有用であった血管免疫芽球性T細胞リンパ腫(Successful application of RHOA p.G17V status for diagnosis and disease monitoring in a case of AITL)

水澤舞, 小川弥穂, 横山和明, 川俣豊隆, 安藤匠平, 近藤幹也, 武井智美, 中村聡介, 伊藤美香, 遊佐希 …

臨床血液 59(9) 1550-1550 2018年9月
肝臓がんおよび大腸がんのゲノム・トランスクリプトーム解析による腫瘍免疫微小環境の特性評価

藤田征志, 井元清哉, 山口類, 長谷川嵩矩, 林周斗, 宮野悟, 松原長秀, 冨田尚裕, 山上裕機, 茶山一彰 …

日本がん免疫学会総会プログラム・抄録集 22回 152-152 2018年7月
Immuno-genomic subtype of liver cancer correlates with mechanisms of immune suppression and prognosis

Masashi Fujita, Seiya Imoto, Rui Yamaguchi, Takanori Hasegawa, Shuto Hayashi, Satoru Miyano, Hiroki Yamaue, Kazuaki Chayama, Hidewaki Nakagawa

HUMAN GENOMICS 12 2018年3月
LPLからの形質転換が示唆されたMYD88変異陽性DLBCLの1例

越智清純, 横山和明, 神保光児, 平野光人, 湯佐希, 小川弥穂, 竹田玲奈, 武井智美, 川俣豊隆, 福山朋房 …

臨床血液 58(8) 1080-1080 2017年8月
社会課題を解く視点からの提言 : 人に尊重される健康と医療のデザイン—Humanity-based Design of Health and Medical Services—特別小特集電子情報通信学会の今後100年に向けて : 未来をひらく新しい科学研究への期待と展望

友池仁暢, 塚田信吾, 江崎禎英, 山口類, 井元清哉, 宮野悟

電子情報通信学会誌 = The journal of the Institute of Electronics, Information and Communication Engineers 100(1) 3-12 2017年1月
Exploratory Introduction of Cognitive Computing to Clinical Sequencing in Hematological Malignancies

Kazuaki Yokoyama, Nozomi Yusa, Mika Itoh, Asako Suzuki, Sosuke Nakamura, Miho Ogawa, Koji Jimbo, Masayuki Kobayashi, Toyotaka Kawamata, Takaaki Konuma …

BLOOD 128(22) 2016年12月2日
日本人における前立腺癌の遺伝子変異解析と癌化経路の予測

笠島理加, 山口類, 清水英悟, 玉田嘉紀, 新井田厚司, 岸田健, 青木一郎, 井元清哉, 宮野悟, 上村博司 …

日本癌学会総会記事 75回 P-2242 2016年10月
プロモーター1Bの欠失によるAPC-1B転写産物の減少は大腸腺腫の発生に寄与する

山口貴世志, 長山聡, 清水英悟, 上村光弘, 山口類, 渋谷哲朗, 新井正美, 池上恒雄, 宮野悟, 井元清哉 …

日本癌学会総会記事 75回 P-1051 2016年10月

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共同研究・競争的資金等の研究課題

HFLACの有用な分子を抽出するためのネットワーク解析法の確立

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2024年4月 - 2027年3月

笠島理加, 宮城洋平, 鈴木理樹, 井元清哉, 山口貴世志, 山口類
腸内pathobiontを標的としたファージ療法開発のための基盤研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2022年4月 - 2026年3月

植松智, 井元清哉
時空間内包型数理的解析手法によるがん細胞のクロナリティの新たな理解

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2022年6月 - 2025年3月

植村元秀, 井元清哉, 片山琴絵, 山口類
疾患メタゲノム解析による腸内微生物叢の臓器機能評価のための情報基盤技術の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2021年4月 - 2024年3月

井元清哉, 植松智, 湯上伸弘
全ゲノム-マルチオミクス情報に基づく日本型有毛白血病の分子病態解明と標的治療開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2021年4月 - 2024年3月

横山和明, 井元清哉, 木村晋也, 石井敬人
がん微小環境情報を考慮したがんゲノム解析モデルの開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2020年4月 - 2023年3月

笠島理加, 井元清哉, 廣島幸彦, 山口類
先端ゲノム解析と人工知能によるコロナ制圧研究

科学技術振興機構戦略的な研究開発の推進/戦略的創造研究推進事業/CREST 2020年 - 2023年

井元清哉
エネルギー代謝ネットワーク異常による疾患の分子基盤解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2018年7月 - 2022年3月

田中廣壽, 井元清哉
肝胆膵がんの多元的オミックス解析による分子機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2018年4月 - 2021年3月

中川英刀, 井元清哉, 山上裕機, 相方浩, 中村透, 二階堂愛
ベイズモデルによるがんと免疫のシステム的統合理解と免疫逃避機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2018年4月 - 2021年3月

井元清哉, 中川英刀
スーパーコンピューティングと革新的情報技術によるがんシステムの新次元探索

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2015年6月 - 2020年3月

宮野悟, 島村徹平, 白石友一, PARK HEEWON, 山口類, 新井田厚司, 片山琴絵, 張耀中, 井元清哉, 玉田嘉紀
大規模複雑データの理論と方法論の総合的研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2015年4月 - 2020年3月

青嶋誠, 宇野力, 金森敬文, 蛭川潤一, 矢田和善, 廣瀬慧, 星野伸明, 柳原宏和, 小森理, 竹之内高志, 松井秀俊, 植木優夫, 井元清哉, 鈴木大慈
階層ベイズによる高多様性領域HLAゲノムシークエンス解析法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2015年4月 - 2018年3月

井元清哉, 水野晋一
パーソナルゲノム医療に向けたメディカルインフォマティクスの情報基盤研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2013年4月 - 2016年3月

宮野悟, 東條有伸, 古川洋一, 山口類, 井元清哉
オミックス解析とシステム数理科学による漢方薬効の統合理解

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2012年4月 - 2015年3月

井元清哉, 渡辺賢治
計算とシミュレーションによるがんシステム学の創成

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2010年4月 - 2015年3月

宮野悟, 井元清哉, 山口類, 白石友一, 玉田嘉紀, 島村徹平, 長崎正朗, 樋口知之, 茅野光範, 後藤典子
統計数理モデリングに基づく感染症拡大予測と科学的政策決定

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2011年 - 2013年

井元清哉
ネットワーク解析による薬剤応答パスウェイの解析法の研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2010年 - 2012年

宮野悟, 井元清哉, 山口類, 長崎正朗, 渡賢治, 後藤典子
生体内分子ネットワークに基づく大規模がんゲノムデータ解析の方法論の研究

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2010年 - 2012年

井元清哉, SHARMA Alokanand
超高次元複雑ヘテロデータ解析に基づく柔軟かつ頑健な非線形統計的モデリングの研究

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(A) 2008年 - 2010年

井元清哉

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