島村繁 (Shigeru Shimamura) - マイポータル

基本情報

ORCID iD: https://orcid.org/0000-0002-5580-962X
J-GLOBAL ID: 202401016924515014
researchmap会員ID: R000063205

論文

Ultrasensitive quantification and comprehensive evaluation of nicking endonuclease efficiency.

Yi Zhang, Chieko Ishiwata, Noriko Kudo, Shigeru Shimamura, Kanako Kurosawa, Daisuke Nishiura, Taichi Yokokawa

Analytical biochemistry 116114-116114 2026年3月14日
Exploring protein N-glycosylation in ammonia-oxidizing Nitrososphaerota archaea through glycoproteomic analysis.

Satoshi Nakagawa, Hirokazu Yagi, Tomoki Suyama, Shigeru Shimamura, Saeko Yanaka, Maho Yagi-Utsumi, Shingo Kato, Moriya Ohkuma, Koichi Kato, Ken Takai

mBio e0385924 2025年5月19日
Uncommon N-Glycan Structures in Anhydrobiotic Tardigrades.

Hirokazu Yagi, Taiki Saito, Shih-Yun Guu, Nao Yamakawa, Shigeru Shimamura, Sachiko Kondo, Maho Yagi-Utsumi, Ken Takai, Jun-Ichi Furukawa, Yann Guerardel …

Molecular & cellular proteomics : MCP 100979-100979 2025年4月28日
Isolation and cultivation of a novel freshwater magnetotactic coccus FCR-1 containing unchained magnetosomes

Hirokazu Shimoshige, Keiichi Yanagisawa, Masayuki Miyazaki, Yoshihiro Takaki, Shigeru Shimamura, Hidetaka Nomaki, Mizuki Fukui, Hiroki Shirakawa, Hideki Kobayashi, Azuma Taoka …

Communications Biology 2025年3月27日
TK2268 encodes the major aminotransferase involved in the conversion from oxaloacetic acid to aspartic acid in Thermococcus kodakarensis.

Yu Su, Yuta Michimori, Yuto Fukuyama, Shigeru Shimamura, Takuro Nunoura, Haruyuki Atomi

Applied and environmental microbiology e0201724 2025年2月24日
Impact of acetate on CO2 fixation pathways in thermophilic and hydrogenotrophic bacteria.

Yoko Chiba, Tomomi Sumida, Masafumi Kameya, Yuto Fukuyama, Tomoyuki Wakashima, Shigeru Shimamura, Ryoma Kamikawa, Yoshito Chikaraishi, Takuro Nunoura

ISME communications 5(1) ycaf227 2025年1月
N-linked protein glycosylation in Nanobdellati (formerly DPANN) archaea and their hosts.

Satoshi Nakagawa, Hiroyuki D Sakai, Shigeru Shimamura, Yoshiki Takamatsu, Shingo Kato, Hirokazu Yagi, Saeko Yanaka, Maho Yagi-Utsumi, Norio Kurosawa, Moriya Ohkuma …

Journal of bacteriology e0020524 2024年8月28日
Correction: A single-molecule counting approach for convenient and ultrasensitive measurement of restriction digest efficiencies

Yi Zhang, Takuro Nunoura, Daisuke Nishiura, Miho Hirai, Shigeru Shimamura, Kanako Kurosawa, Chieko Ishiwata, Shigeru Deguchi

PLOS ONE 19(8) e0308550-e0308550 2024年8月5日
Genes for the type-I reaction center and galactolipid synthesis are required for chlorophyll a accumulation in a purple photosynthetic bacterium.

Yusuke Tsukatani, Chihiro Azai, Tomoyasu Noji, Shigeru Kawai, Saori Sugimoto, Shigeru Shimamura, Yasuhiro Shimane, Jiro Harada, Tadashi Mizoguchi, Hitoshi Tamiaki …

Plant & cell physiology 2024年7月20日
Removal of phosphoglycolate in hyperthermophilic archaea

Yuta Michimori, Rikihisa Izaki, Yu Su, Yuto Fukuyama, Shigeru Shimamura, Karin Nishimura, Yuya Miwa, Sotaro Hamakita, Takahiro Shimosaka, Yuki Makino …

Proceedings of the National Academy of Sciences 121(16) 2024年4月9日
Palaeoproteomic investigation of an ancient human skeleton with abnormal deposition of dental calculus.

Yoko Uchida-Fukuhara, Shigeru Shimamura, Rikai Sawafuji, Takumi Nishiuchi, Minoru Yoneda, Hajime Ishida, Hirofumi Matsumura, Takumi Tsutaya

Scientific reports 14(1) 5938-5938 2024年3月11日
Characterization of protein glycosylation in an Asgard archaeon.

Satoshi Nakagawa, Hiroyuki Imachi, Shigeru Shimamura, Saeko Yanaka, Hirokazu Yagi, Maho Yagi-Utsumi, Hiroyuki Sakai, Shingo Kato, Moriya Ohkuma, Koichi Kato …

BBA advances 6 100118-100118 2024年
Development of a rapid and highly accurate method for 13C tracer-based metabolomics and its application on a hydrogenotrophic methanogen.

Yuto Fukuyama, Shigeru Shimamura, Sanae Sakai, Yuta Michimori, Tomomi Sumida, Yoshito Chikaraishi, Haruyuki Atomi, Takuro Nunoura

ISME communications 4(1) ycad006 2024年1月
Elemental sulfur, hydrogen sulfide, and carbon monoxide-driven dimerization of glycine at sub-millimolar concentrations: Implications for the origin of life

Norio Kitadai, Shigeru Shimamura, Wataru Takahagi, Masayuki Miyazaki, Eiji Tasumi, Satoshi Okada

Geochimica et Cosmochimica Acta 349 55-63 2023年5月15日
Sequestration and efflux largely account for cadmium and copper resistance in the deep-sea Nitratiruptor sp. SB155-2 (phylum Campylobacterota).

Ángela Ares, Sanae Sakai, Toshio Sasaki, Shigeru Shimamura, Satoshi Mitarai, Takuro Nunoura

Environmental microbiology 24(12) 6144-6163 2022年12月
Fundidesulfovibrio magnetotacticus sp. nov., a sulphate-reducing magnetotactic bacterium, isolated from sediments and freshwater of a pond.

Hirokazu Shimoshige, Hideki Kobayashi, Shigeru Shimamura, Masayuki Miyazaki, Toru Maekawa

International journal of systematic and evolutionary microbiology 72(9) 2022年9月
Proteomic Time-Course Analysis of the Filamentous Anoxygenic Phototrophic Bacterium, Chloroflexus aurantiacus, during the Transition from Respiration to Phototrophy.

Shigeru Kawai, Shigeru Shimamura, Yasuhiro Shimane, Yusuke Tsukatani

Microorganisms 10(7) 2022年6月25日
Physiological and comparative proteomic characterization of Desulfolithobacter dissulfuricans gen. nov., sp. nov., a novel mesophilic, sulfur-disproportionating chemolithoautotroph from a deep-sea hydrothermal vent.

Yurina Hashimoto, Shigeru Shimamura, Akihiro Tame, Shigeki Sawayama, Junichi Miyazaki, Ken Takai, Satoshi Nakagawa

Frontiers in microbiology 13 1042116-1042116 2022年
Chloroplast acquisition without the gene transfer in kleptoplastic sea slugs, Plakobranchus ocellatus.

Taro Maeda, Shunichi Takahashi, Takao Yoshida, Shigeru Shimamura, Yoshihiro Takaki, Yukiko Nagai, Atsushi Toyoda, Yutaka Suzuki, Asuka Arimoto, Hisaki Ishii …

eLife 10 2021年4月27日
Isolation and cultivation of a novel sulfate-reducing magnetotactic bacterium belonging to the genus Desulfovibrio.

Hirokazu Shimoshige, Hideki Kobayashi, Shigeru Shimamura, Toru Mizuki, Akira Inoue, Toru Maekawa

PloS one 16(3) e0248313 2021年

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MISC

オービトラップ質量分析計を用いたアミノ酸解析の可能性

島村繁, 澄田智美, 布浦拓郎

低温科学 79 37-42 2021年3月20日査読有り
Orbitrap Fusionを用いたCE-MSと四重極GC-MSでのアミノ酸分析の比較

澄田智美, 島村繁, 布浦拓郎

低温科学 79 43-49 2021年3月20日査読有り
新奇硫黄酸化細菌の性状とゲノム解析

布浦拓郎, 風間宏美, 角太淳吾, 島村繁, 高木善弘, 高井研

日本微生物生態学会講演要旨集 27th 2011年
地殼内生物圏におけるメタゲノム解析(遺伝子解析,口頭発表)

布浦拓郎, 高見英人, 笈田花子, 平山仙子, 西真郎, 島村繁, 鈴木庸平, 稲垣史生, 高井研, 山下敦士 …

日本微生物生態学会講演要旨集 (21) 2005年
菱刈金山地下熱水環境に優占する未知なる好熱性Archaeaゲノムの探索

布浦拓郎, 笈田花子, 平山仙子, 鈴木庸平, 稲垣史生, 西真郎, 島村繁, 高見英人, 高井研, KENNETH H. Nealson …

日本微生物生態学会講演要旨集 (20) 2004年
菱刈金山地下熱水環境に存在する未培養好熱性Archaeaのrrn遺伝子オペロンを含むFosmidクローンの解析

笈田花子, 布浦拓郎, 平山仙子, 鈴木庸平, 稲垣史生, 西真郎, 島村繁, 高見英人, 高井研, KENNETH H. Nealson …

日本微生物生態学会講演要旨集 (20) 2004年

書籍等出版物

キャピラリー電気泳動法・イオンクロマトグラフィーの分析テクニック

技術情報協会

技術情報協会 2023年12月
ゲノム解析を中心とした最前線と将来展望

大熊, 盛也, 工藤, 俊章

シーエムシー出版 2015年11月 (ISBN: 9784781310381)

講演・口頭発表等

166

非直鎖状マグネトソームを有する新規父島淡水性球状磁性細菌FCR-1株の分離培養

下重裕一, 柳澤圭一, 宮崎征行, 高木善弘, 島村繁, 野牧秀隆, 福井深月, 白川拓輝, 小林英城, 田岡東, 前川透

日本農芸化学会大会 2025年度 2025年3月7日
Nanobdellati・宿主・ウイルス共培養系における三者の相互作用の解析

酒井博之, 酒井博之, 中川聡, 中川聡, 中川聡, 島村繁, 高井研, 布浦拓郎, 黒沢則夫, 大熊盛也

日本微生物生態学会大会(Web) 2025年
Glycobiological interactions between DPANN and host Archaea

中川聡, 酒井博之, 島村繁, 武藤久, 高井研

第6回 ExCELLSシンポジウム 2024年1月22日
酸性温泉に由来する新規Nanobdellati(DPANNアーキア)及び宿主アーキアのグライコプロテオミクス

森田祥空, 酒井博之, 島村繁, 武藤久, 澤山茂樹, 高井研, 高井研, 中川聡, 中川聡, 中川聡

日本Archaea研究会講演会要旨集 2024年
独立栄養性細菌Thermodesulfatator indicusが有する未知のセリン生合成経路の探索

若島朋幸, 若島朋幸, 福山宥斗, 島村繁, 常松奈緒, 布浦拓郎, 千葉洋子, 千葉洋子

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2024年
新規CO資化性微生物の探索-好熱性水素細菌Hydrogenobacter thermophilusのCO耐性および資化性の検証

千葉洋子, 千葉洋子, 常松奈緒, 亀谷将史, 亀谷将史, 若島朋幸, 若島朋幸, 島村繁, 福山宥斗, 布浦拓郎

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2024年
珪藻の葉緑体に蓄積する新奇環状一本鎖DNAウイルス

外丸裕司, 山田和正, 本郷悠貴, 島村繁, 高尾祥丈, 一見和彦

日本微生物生態学会大会(Web) 2024年
Proteomic analysis of the sulfate-reducing magnetotactic bacterium, Fundidesulfovibrio magnetotacticus, grown in the presence of tryptophan.

下重裕一, 島村繁, 前川透

The 20th International Symposium on Bioscience and Nanotechnology 2023年12月8日
Assimilation of CO2 in hyperthermophilic and heterotrophic bacteria revealed by 13C tracer-based metabolomics using CE-MS

福山宥斗, 島村繁, 澄田智美, 千葉洋子, 力石嘉人, 跡見晴幸, 布浦拓郎

The 36th JSME & The 13th ASME 2023年11月28日
Exploring a novel glycine biosynthesis pathway in Thermodesulfatator indicus , a thermophilic sulfate-reducing bacterium using isotopomer analysis.

若島朋幸, 福山宥斗, 島村繁, 常松奈緒, 布浦拓郎, 千葉洋子

第36回日本微生物生態学会 2023年11月28日
Orbitrap Fusion MSを活用した高感度且つ高精度なトレーサー解析

福山宥斗, 島村繁, 酒井早苗, 道盛裕太, 澄田智美, 力石嘉人, 跡見晴幸, 布浦拓郎

第17回メタボロームシンポジウム 2023年10月19日
A novel CE-MS-based tracer metabolomics: a promising tool to verify real amino acid biosynthetic pathways and central carbon metabolic pathways in any kinds of archaeal isolates

福山宥斗, 島村繁, 酒井早苗, 道盛裕太, 澄田智美, 力石嘉人, 跡見晴幸, 布浦拓郎

The 2023 Gordon Research Conference 2023年7月26日
A novel CE-MS based tracer metabolomics: a promising tool to verify real amino acid biosynthetic pathways and central carbon metabolic pathway in any kinds of microbial isolates.

福山宥斗, 島村繁, 酒井早苗, 道盛裕太, 澄田智美, 力石嘉人, 跡見晴幸, 布浦拓郎

The 2023 Gordon Research Conference 2023年7月25日
糸状性光合成細菌Chloroflexus aurantiacusの呼吸から光合成モードへの移行過程における経時的プロテオーム解析

河合繁, 島村繁, 嶋根康弘, 塚谷祐介

第64回日本植物生理学会 2023年3月17日
CE-MSを用いた¹³Cトレーサーに基づくメタボロミクスにより明らかになった超好熱性細菌と従属栄養細菌におけるCO₂の同化

FUKUYAMA Yuto, SHIMAMURA Shigeru, SUMIDA Tomomi, CHIBA Yoko, CHIKARAISHI Yoshito, ATOMI Haruyuki, NUNOURA Takuro

日本微生物生態学会大会(Web) 2023年
ナノアーキアおよび宿主アーキアのグライコプロテオーム

高松芳基, 島村繁, 加藤真悟, 矢木宏和, 矢木宏和, 矢木真穂, 矢木真穂, 谷中冴子, 加藤晃一, 加藤晃一, 澤山茂樹, 大熊盛也, 井町寛之, 高井研, 高井研, 中川聡, 中川聡, 中川聡

日本Archaea研究会講演会要旨集 2023年
微量メタボローム解析法を用いたMethanothermobacter thermautotrophicusにおけるアミノ酸生合成系の代謝ギャップの探索

福山宥斗, 島村繁, 澄田智美, 酒井早苗, 跡見晴幸, 布浦拓郎

日本Archaea研究会講演会要旨集 2023年
DPANNおよび宿主アーキアの経時的グライコプロテオミクス

中川聡, 中川聡, 中川聡, 島村繁, 高松芳基, 酒井博之, 加藤真悟, 澤山茂樹, 矢木宏和, 矢木宏和, 矢木真穂, 矢木真穂, 谷中冴子, 谷中冴子, 加藤晃一, 加藤晃一, 高井研, 高井研

日本微生物生態学会大会(Web) 2023年
アイソトポマー分析を用いた好熱性硫酸還元菌Thermodesulfatator indicusの新規グリシン生合成経路の探索

若島朋幸, 若島朋幸, 福山宥斗, 島村繁, 常松奈緒, 布浦拓郎, 千葉洋子, 千葉洋子

日本微生物生態学会大会(Web) 2023年
糸状性光合成細菌Chloroflexus aurantiacusの光合成タンパク質の発現機序

河合繁, 島村繁, 嶋根康弘, 塚谷祐介

第13回藍藻の分子生物学 2022年12月10日

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共同研究・競争的資金等の研究課題

深海性二枚貝シロウリガイ類の共生系の進化

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2012年4月 - 2015年3月

吉田尊雄, 高木善弘, 島村繁

産業財産権

特許第4997420号変異微生物

影山泰, 高木善弘, 島村繁, 西真郎, 小林徹, 伊藤進, 掘越弘毅
特許第4736085号宿主微生物

高木善弘, 島村繁, 西真郎, 小林徹, 伊藤進, 掘越弘毅, 遠藤圭二, 影山泰, 荒勝俊, 尾崎克也
特許第4616660号好熱性菌及びそれと類縁性の高い非好熱性菌のアミノ酸組成に基づいた非好熱性菌からの耐熱性蛋白質の予測方法

高見英人, 掘越弘毅, 高木善弘, 池甲珠, 西真朗, 島村繁, 鈴木洋子, 内山郁夫, 李志軍
特開2007-259725 変異微生物

影山泰, 高木善弘, 島村繁, 西真郎, 小林徹, 伊藤進, 掘越弘毅
特開2006-296242 宿主微生物

高木善弘, 島村繁, 西真郎, 小林徹, 伊藤進, 掘越弘毅, 遠藤圭二, 影山泰, 荒勝俊, 尾崎克也
特開2006-067907 有用タンパク質およびその製造方法

高木善弘, 島村繁, 西真郎, 鈴木洋子, 伊藤進, 掘越弘毅, 小林徹, 影山泰, 川合修次
特開2005-270097 好熱性菌及びそれと類縁性の高い非好熱性菌のアミノ酸組成に基づいた非好熱性菌からの耐熱性蛋白質の予測方法

高見英人, 掘越弘毅, 高木善弘, 池甲珠, 西真朗, 島村繁, 鈴木洋子, 内山郁夫, 李志軍

島村繁

基本情報

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

共同研究・競争的資金等の研究課題

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