Shigeyuki Oba

J-GLOBAL         Last updated: Dec 19, 2017 at 12:41
 
Avatar
Name
Shigeyuki Oba
Nickname
shigepong
E-mail
obai.kyoto-u.ac.jp
URL
http://ishiilab.jp/member/oba/
Affiliation
Kyoto University
Section
Graduate School of Informatics Department of Systems Science
Job title
Senior Lecturer
Degree
PhD Technology(Nara Institute of Science Technology)
Research funding number
80362838
Twitter ID
shigepong

Research Areas

 
 

Academic & Professional Experience

 
Apr 2008
 - 
Today
Senior lecturer, Kyoto university, graduate school of informatics
 
Oct 2008
 - 
Mar 2014
PRESTO researcher, Japan Science and Technology agency
 
Apr 2007
 - 
Mar 2008
Assistant professor, Nara institute of science and technology, graduate school of information science
 
Apr 2003
 - 
Mar 2007
Assistant professor, Nara institute of science and technology, graduate school of information science
 

Published Papers

 
Meshgi, K., Maeda, S., Oba, S. and Ishii, S.
Neural Networks   87 132-148   Mar 2017   [Refereed]
Murakami, Y., Koyama, M., Oba, S., Kuroda, S. and Ishii, S.
Biophysics and Physicobiology   to appear    2017   [Refereed]
Kato, K., Uchida, J., Kukita, Y., Kumagai, T., Nishino, K., Inoue, T., Kimura, M., Oba, S., Imamura, F.
Scientific Report   6(29093)    Jul 2016   [Refereed]
S. Oba; K. Nakae; Y. Ikegaya; S. Aki; J. Yoshimoto; and S. Ishii
BMC neuroscience   17(1) 1   May 2016   [Refereed]
Imamura, F., Uchida, J., Kukita, Y., Kumagai, K., Nishino, K., Inoue, T., Kumura, M., Oba, S., and Kato, K.
Lung Cancer   94 68-73   Apr 2016   [Refereed]
Uchida, J., Imamura, F., Kukita, Y., Oba, S., Kumagai, T., Nishino, K., Inoue, T., Kimura, M., Kato, K.
Cancer Science   107(3) 353-358   Mar 2016   [Refereed]
J. Uchida; K. Kato; Y. Kukita; T. Kumagai; K. Nishio; H. Daga; I. Nagatomo; T. Inoue; M. Kimura; S. Oba; Y. Ito; K. Takeda; F. Imamura
Clinical Chemistry   61(9) 1191-1196   Jul 2015   [Refereed]
H. Skibbe; M. Reisert; S. Maeda; M. Koyama; S. Oba; K. Ito; S. Ishii
IEEE Transactions on Medical Imaging   34(2) 628-643   Feb 2015   [Refereed]
K. Nakae; Y. Ikegaya; T. Ishikawa; S. Oba; H, Urakubo; M. Koyama; & S. Ishii
PLoS Computational Biology,   10(11)    Nov 2014   [Refereed]
H. Morioka; A. Kanemura; S. Morimoto; T. Yoshioka; S. Oba; M. Kawanabe; S. Ishii
NeuroImage   90 128-139   2014   [Refereed]
Y. Kukita; J. Uchida; S. Oba; K. Nishino; T. Kumagai; K. Taniguchi; T. Okuyama; F. Imamura; K. Kato
PLoS ONE   8(11)    Nov 2013   [Refereed]
M. Kouno; K. Nakae; S. Oba; S. Ishii
Artificial Life and Robotics   17(3-4) 417-425   2013   [Refereed]
W. Kim; T. Matsui; M. Yamao; M. Ishibashi; K. Tamada; T. Takumi; K. Kohno; S. Oba; S. Ishii; Y. Sakumura; Y. Bessho
Molecular Biology of the Cell   22(18) 3541-3549   Sep 2011   [Refereed]
N. Takahashi; S. Oba; N. Yukinawa; S. Ujita; M. Mizunuma; N. Matsuki; S. Ishii; Y. Ikegaya
Current protocols in neuroscience / editorial board, Jacqueline N. Crawley ... [et al.]   Chapter 2 Unit 2.14   2011   [Refereed]
E. Isogai; M. Ohira; T. Ozaki; S. Oba; Y. Nakamura; A. Nakagawara
PLoS ONE   6(5)    2011   [Refereed]
N. Takahashi; S. Oba; N. Yukinawa; S. Ujita; M. Mizunuma; N. Matsuki; S. Ishii; Y. Ikegaya
Current Protocols in Neuroscience   (SUPPL.57)    2011   [Refereed]
S. Hotta; S. Oba; S. Ishii
Artificial Life and Robotics   15(2) 129-132   2010   [Refereed]
N. Yukinawa; S. Oba; K. Kato; S. Ishii
IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics   6(2) 333-343   Apr 2009   [Refereed]
M. Yu; M. Ohira; Y. Li; H. Niizuma; M.L. Oo; Y. Zhu; T. Ozaki; E. Isogai; Y. Nakamura; T. Koda; S. Oba; B. Yu; A. Nakagawara
International Journal of Oncology   34(4) 931-938   Apr 2009   [Refereed]
M. Shirahata; S. Oba; K. Iwao-Koizumi; S. Saito; N. Ueno; M. Oda; N. Hashimoto; S. Ishii; J.A. Takahashi; K. Kato
Cancer Science   100(1) 165-172   Jan 2009   [Refereed]
Robust model selection for classification of microarrays
I. Suzuki; T. Takenouchi; M. Ohira; S. Oba; S. Ishii
Cancer Informatics   7 141-157   2009   [Refereed]
S. Oba; S. Ishii
International Journal of Biostatistics   5(1)    2009   [Refereed]
N. Tomioka; S. Oba; M. Ohira; A. Misra; J. Fridlyand; S. Ishii; Y. Nakamura; E. Isogai; T. Hirata; Y. Yoshida; S. Todo; Y. Kaneko; D.G. Albertson; D. Pinkel; B.G. Feuerstein; A. Nakagawara
Oncogene   27(4) 441-449   Jan 2008   [Refereed]
A. Tanabe; K. Fukumizu; S. Oba; T. Takenouchi; S. Ishii
Computational Statistics   22(1) 145-157   2007   [Refereed]
M. Motoori; I. Takemasa; Y. Doki; S. Saito; H. Miyata; S. Takiguchi; Y. Fujiwara; T. Yasuda; M. Yano; Y. Kurokawa; T. Komori; M. Yamasaki; N. Ueno; S. Oba; S. Ishii; M. Monden; K. Kato
European Journal of Cancer   42(12) 1897-1903   Aug 2006   [Refereed]
S. Oba; S. Ishii
BMC Bioinformatics   7    2006   [Refereed]
N. Yukinawa; S. Oba; K. Kato; K. Taniguchi; K. Iwao-Koizumi; Y. Tamaki; S. Noguchi; S. Ishii
BMC Genomics   7    2006   [Refereed]
M. Motoori; I. Takemasa; M. Yano; S. Saito; H. Miyata; S. Takiguchi; Y. Fujiwara; T. Yasuda; Y. Doki; Y. Kurokawa; N. Ueno; S. Oba; S. Ishii; M. Monden; K. Kato
International Journal of Cancer   114(6) 963-968   May 2005   [Refereed]
H. Kita-Matsuo; N. Yukinawa; R. Matoba; S. Saito; S. Oba; S. Ishii; K. Kato
Analytical Biochemistry   339(1) 15-28   Apr 2005   [Refereed]
M. Ohira; S. Oba; Y. Nakamura; E. Isogai; S. Kaneko; A. Nakagawa; T. Hirata; H. Kubo; T. Goto; S. Yamada; Y. Yoshida; M. Fuchioka; S. Ishii; A. Nakagawara
Cancer Cell   7(4) 337-350   Apr 2005   [Refereed]
Multi-class pattern classification based on a probabilistic model of combining binary classifiers
N. Yukinawa; S. Oba; K. Kato; S. Ishii
Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics)   3697 LNCS 337-342   2005   [Refereed]
M. Ohira; S. Oba; Y. Nakamura; T. Hirata; S. Ishii; A. Nakagawara
Cancer Letters   228(1-2) 5-11   2005   [Refereed]
Y. Kurokawa; R. Matoba; I. Takemasa; H. Nagano; K. Dono; S. Nakamori; K. Umeshita; M. Sakon; N. Ueno; S. Oba; S. Ishii; K. Kato; M. Monden
Journal of Hepatology   41(2) 284-291   Aug 2004   [Refereed]
Y. Kurokawa; R. Matoba; I. Takemasa; S. Nakamori; M. Tsujie; H. Nagano; K. Dono; K. Umeshita; M. Sakon; N. Ueno; H. Kita; S. Oba; S. Ishii; K. Kato; M. Monden
Journal of Hepatology   39(6) 1004-1012   Dec 2003   [Refereed]
S. Oba; M.-A. Sato; I. Takemasa; M. Monden; K.-I. Matsubara; S. Ishii
Bioinformatics   19(16) 2088-2096   Nov 2003   [Refereed]
On-line learning methods for Gaussian processes
S. Oba; M.-A. Sato; S. Ishii
IEICE Transactions on Information and Systems   E86D(3) 650-654   Mar 2003   [Refereed]
Identification of expressed genes linked to malignancy of human colorectal carcinoma by parametric clustering of quantitative expression data.
S. Muro; I. Takemasa; S. Oba; R. Matoba; N. Ueno; C. Maruyama; R. Yamashita; M. Sekimoto; H. Yamamoto; S. Nakamori; M. Monden; S. Ishii; K. Kato
Genome biology   4(3) R21   2003   [Refereed]
Prior hyperparameters in Bayesian PCA
S. Oba; M.-A. Sato; S. Ishii
Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics)   2714 271-279   2003   [Refereed]
S. Oba; M.-A. Sato; S. Ishii
Systems and Computers in Japan   34(11) 55-66   2003   [Refereed]
Meshgi, K., Maeda, S.i., Oba, S., Skibbe, H., Li, Y.z. , and Ishii. S.
Journal of Computer Vision and Image Understanding   150 81-94   Sep 2016   [Refereed]

Misc

 
S. Oba; K. Kato; S. Ishii
Proceedings - BIBE 2005: 5th IEEE Symposium on Bioinformatics and Bioengineering   2005 210-217   2005   [Refereed]
N. Yukinawa; T. Takenouchi; S. Oba; S. Ishii
Journal of Physics: Conference Series   95(1)    2008   [Refereed]
Re-weighted ODP for differential gene expression analysis
H. Nomura; S. Oba; S. Ishii
Proceedings of the 13th International Symposium on Artificial Life and Robotics, AROB 13th\\'08   67-70   2008   [Refereed]
Two-way factor analysis for missing value estimation of matrix data
K. Sodebayashi; S. Oba; S. Ishii
Proceedings of the 13th International Symposium on Artificial Life and Robotics, AROB 13th\\'08   85-88   2008   [Refereed]
Detection of multiple overlapping string-shaped objects using spectral clustering
C. Maeda; S. Oba; N. Yukinawa; S. Ishii
Proceedings of the 13th International Symposium on Artificial Life and Robotics, AROB 13th\\'08   240-243   2008   [Refereed]