井深章子 (Ibuka Akiko) - マイポータル

基本情報

所属: 神奈川大学理学部生物科学科教授

学位: 学士（農学）(1992年3月東京大学)
修士（農学）(1994年3月東京大学大学院)
博士（農学）(1999年3月東京大学大学院)

通称等の別名: SHIMIZU-IBUKA, Akiko
研究者番号: 60301420
J-GLOBAL ID: 201401041344127804
researchmap会員ID: B000242492

研究キーワード

研究分野

経歴

2022年4月 - 現在

神奈川大学理学部生物科学科教授
2014年9月 - 2022年3月

新潟薬科大学応用生命科学部応用生命科学科教授
2011年4月 - 2014年8月

山形大学理学部物質生命化学科准教授
2009年4月 - 2011年3月

東京大学大学院農学生命科学研究科応用生命化学専攻特任助教
2007年4月 - 2009年3月

東京農業大学応用生物科学部栄養科学科専任講師
2004年10月 - 2007年3月

東京農業大学応用生物科学部栄養科学科助手
2003年6月 - 2005年3月

静岡県立大学大学院生活健康科学研究科客員研究員
1997年10月 - 2003年6月

静岡県立大学大学院生活健康科学研究科助手

学歴

1995年4月 - 1997年9月

東京大学大学院農学生命科学研究科応用生命工学
1993年4月 - 1995年3月

東京大学大学院農学研究科応用生命工学
1989年4月 - 1993年3月

東京大学農学部農芸化学科

論文

Insights into the inhibition of MOX-1 β-lactamase by S02030, a boronic acid transition state inhibitor

Front. Microbiol. 12 2021年12月査読有り
メタロβ-ラクタマーゼIMP-1のRNA分解活性

Yoshiki Kato, Masayuki Takahashi, Mineaki Seki, Masayuki Nashimoto, Akiko Shimizu-Ibuka

PLOS One 15(10) e0241557 2020年10月査読有り
ブドウ由来ミラクリン類似タンパク質の構造機能解析

Biochim. Biophys. Acta Proteins Proteom. 1866(11) 1125-1130 2018年8月査読有り
Structural and Mutagenic Analysis of Metallo-β-Lactamase IMP-18.

Furuyama Takamitsu, Nonomura Haruka, Ishii Yoshikazu, Hanson Nancy D, Shimizu-Ibuka Akiko

Antimicrobial agents and chemotherapy 60(9) 5521-5526 2016年9月1日査読有り
Long-Chain Fatty Acids Elicit a Bitterness-Masking Effect on Quinine and Other Nitrogenous Bitter Substances by Formation of Insoluble Binary Complexes

Kayako Ogi, Haruyuki Yamashita, Tohru Terada, Ryousuke Homma, Akiko Shimizu-Ibuka, Etsuro Yoshimura, Yoshiro Ishimaru, Keiko Abe, Tomiko Asakura

Journal of Agricultural and Food Chemistry 63(38) 8493-8500 2015年9月30日査読有り
Identification of key neoculin residues responsible for the binding and activation of the sweet taste receptor

Taichi Koizumi, Tohru Terada, Ken-ichiro Nakajima, Masaki Kojima, Seizo Koshiba, Yoshitaka Matsumura, Kohei Kaneda, Tomiko Asakura, Akiko Shimizu-Ibuka, Keiko Abe, Takumi Misaka

SCIENTIFIC REPORTS 5 12947 2015年8月査読有り
Conformational Change Observed in the Active Site of Class C β-Lactamase MOX-1 upon Binding to Aztreonam.

Oguri, T, Ishii, Y, Shimizu-Ibuka, A

Antimicrob. Agents Chemother. 59(8) 5069-5072 2015年8月査読有り
Crystal structure of Mox-1, a unique plasmid-mediated class C β-lactamase with hydrolytic activity towards moxalactam.

Oguri, T, Furuyama, T, Okuno, T, Ishii, Y, Tateda, K, Bonomo, R. A, Shimizu-Ibuka, A

Antimicrob. Agents Chemother. 58(7) 3914-3920 2014年7月査読有り
Purification, crystallization and preliminary X-ray analysis of IMP-18, a class B carbapenemase from Pseudomonas aeruginosa

Takamitsu Furuyama, Yoshikazu Ishii, Norimasa Ohya, Kazuhiro Tateda, Nancy D. Hanson, Akiko Shimizu-Ibuka

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY AND CRYSTALLIZATION COMMUNICATIONS 69 1397-1400 2013年12月査読有り
Peanut-Skin Polyphenols, Procyanidin A1 and Epicatechin-(4 beta -> 6)-epicatechin-(2 beta -> O -> 7, 4 beta -> 8)-catechin, Exert Cholesterol Micelle-Degrading Activity in Vitro

Tomoko Tamura, Naoko Inoue, Megumi Ozawa, Akiko Shimizu-Ibuka, Soichi Arai, Naoki Abe, Hiroyuki Koshino, Kiyoshi Mura

BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY 77(6) 1306-1309 2013年6月査読有り
Extended-spectrum β-lactamase，構造生物学的見地からみた基質特異性拡張戦略

井深章子

Jpn. J. Chemother 61(3) 287-291 2013年査読有り招待有り
Novel Angiotensin I-Converting Enzyme Inhibitory Peptides Found in a Thermolysin-Treated Elastin with Antihypertensive Activity

Yuko Sato, Tsudoi Toyoda, Akiko Shimizu-Ibuka, Tomoko Tamura, Kazuo Kobayashi-Hattori, Takemichi Nakamura, Soichi Arai, Kiyoshi Mura

BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY 76(7) 1329-1333 2012年7月査読有り
Serum Cholesterol Reduction by Feeding a High-Cholesterol Diet Containing a Lower-Molecular-Weight Polyphenol Fraction from Peanut Skin

Tomoko Tamura, Naoko Inoue, Akiko Shimizu-Ibuka, Miki Tadaishi, Toshichika Takita, Soichi Arai, Kiyoshi Mura

BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY 76(4) 834-837 2012年4月査読有り
ヒト甘味受容体は酸によって誘導されたミラクリンの甘味を伝える。

Koizumi, A., Tsuchiya, A., Nakajima, K., Ito, K., Terada, T., Shimizu-Ibuka, A., Briand, L., Asakura, T., Misaka, T., and Abe, K.

Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108 16819-16824 2011年9月査読有り
Effects of Peanut-Skin Procyanidin A1 on Degranulation of RBL-2H3 Cells

Keisuke Tomochika, Akiko Shimizu-Ibuka, Tomoko Tamura, Kiyoshi Mura, Naoki Abe, Jun-ichi Onose, Soichi Arai

BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY 75(9) 1644-1648 2011年9月査読有り
Non-Acidic Compounds Induce the Intense Sweet Taste of Neoculin, a Taste-Modifying Protein

Ken-ichiro Nakajima, Ayako Koizumi, Kisho Iizuka, Keisuke Ito, Yuji Morita, Taichi Koizumi, Tomiko Asakura, Akiko Shimizu-Ibuka, Takumi Misaka, Keiko Abe

BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY 75(8) 1600-1602 2011年8月査読有り
Identification and modulation of the key amino acid residue responsible for the ph sensitivity of neoculin, a taste-modifying protein

Ken-ichiro Nakajima, Kanako Yokoyama, Taichi Koizumi, Ayako Koizumi, Tomiko Asakura, Tohru Terada, Katsuyoshi Masuda, Keisuke Ito, Akiko Shimizu-Ibuka, Takumi Misaka, Keiko Abe

PLoS ONE 6(4) e19448 2011年査読有り
Cysteine-to-serine shuffling using a Saccharomyces cerevisiae expression system improves protein secretion: Case of a nonglycosylated mutant of miraculin, a taste-modifying protein

Keisuke Ito, Taishi Sugawara, Ayako Koizumi, Ken-Ichiro Nakajima, Akiko Shimizu-Ibuka, Mitsunori Shiroishi, Hidetsugu Asada, Takami Yurugi-Kobayashi, Tatsuro Shimamura, Tomiko Asakura, Takumi Misaka, So Iwata, Takuya Kobayashi, Keiko Abe

Biotechnology Letters 33(1) 103-107 2011年査読有り
Roles of Residues Cys69, Asn104, Phe160, Gly232, Ser237, and Asp240 in Extended-Spectrum beta-Lactamase Toho-1

Akiko Shimizu-Ibuka, Mika Oishi, Shoko Yamada, Yoshikazu Ishii, Kiyoshi Mura, Hiroshi Sakai, Hiroshi Matsuzawa

ANTIMICROBIAL AGENTS AND CHEMOTHERAPY 55(1) 284-290 2011年1月査読有り
Bulky high-mannose-type N-glycan blocks the taste-modifying activity of miraculin

Keisuke Ito, Taishi Sugawara, Ayako Koizumi, Ken-ichiro Nakajima, Akiko Shimizu-Ibuka, Mitsunori Shiroishi, Hidetsugu Asada, Takami Yurugi-Kobayashi, Tatsuro Shimamura, Tomiko Asakura, Katsuyoshi Masuda, Masaji Ishiguro, Takumi Misaka, So Iwata, Takuya Kobayashi, Keiko Abe

Biochimica et Biophysica Acta - General Subjects 1800(9) 986-992 2010年9月査読有り

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講演・口頭発表等

メタロβ-ラクタマーゼIMP-1のRNA加水分解活性

加藤善輝, 高橋昌幸, 関峰秋, 梨本正之, 井深章子

日本生化学会2020年度大会 2020年9月14日
メタロ-β-ラクタマーゼIMP-1における亜鉛結合解析

加藤善輝, 野澤裕介, 古川那由太, 井深章子

日本農芸化学会2019年大会 2019年3月26日
Lactobacillus sakeiUonuma株由来アラニンラセマーゼ(AlaR)の解析

中山栞, 大越正貴, 吉井郁弥, 市村光, 平賀晴菜, 古川那由太, 西脇俊和, 井深章子

日本農芸化学会2019年大会 2019年3月24日
Lactobacillus sakei Uonuma株由来アラニンラセマーゼ(AlaR)の解析

中山栞, 大越正貴, 吉井郁弥, 市村光, 平賀晴菜, 古川那由太, 西脇俊和, 井深章子

日本農芸化学会2019年大会 2019年3月24日
Overcoming Extended spectrum AmpC β-lactamases with boronic acid transition state inhibitors; crystal structure of MOX-1 complexed with S02030.

A. Shimizu-Ibuka, T. Ishikawa, N. Furukawa, E. Caselli, F. Prati, M. A. Taracila, R. A. Bonomo, Y. Ishii

ASM microbe 2018 2018年6月8日 American Society for Microbiology
ブドウ由来ミラクリン類似タンパク質の構造解析

大倉宗一郎, 堀実佐穂, 古川那由太, 井深章子

日本農芸化学会2017年大会 2017年3月18日日本農芸化学会

所属学協会

2014年 - 現在

American Society for Microbiology
2007年 - 現在

American Chemical Society
1997年 - 現在

日本生化学会
1995年 - 現在

日本農芸化学会

Works(作品等)

Neoculin as a new sweet protein with taste-modifying activity: purification, characterization, and X-ray crystallography

Shimizu-Ibuka,A, Morita,Y, Nakajima,K, Asakura,T, Terada,T, Misaka,T, Abe,K

2008年その他

共同研究・競争的資金等の研究課題

メタロβ-ラクタマーゼの未知酵素活性の検証と新規アプローチによる阻害剤探索

基盤研究(C) 2019年3月 - 2022年3月
呈味性に優れた塩味増強物質の開発に向けた塩味センシング技術の創出と検証

JST 2019年8月

井深章子

基本情報

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研究分野

経歴

学歴

論文

講演・口頭発表等

所属学協会

Works(作品等)

共同研究・競争的資金等の研究課題

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