下村拓史 (Takushi Shimomura) - マイポータル

基本情報

所属: 生理学研究所神経機能素子研究部門助教

学位: 博士（理学）(京都大学)

ORCID ID: https://orcid.org/0000-0002-8109-535X
J-GLOBAL ID: 201901020117428482
researchmap会員ID: B000359305

研究キーワード

研究分野

経歴

2012年4月 - 現在

生理学研究所, 分子細胞生理研究領域神経機能素子研究部門, 助教
2012年4月 - 2016年3月

名古屋大学, 細胞生理学研究センター, 特定研究員
2011年4月 - 2012年3月

京都大学, 特定研究員

学歴

2008年4月 - 2011年3月

京都大学, 大学院理学研究科, 生物科学専攻博士後期課程
2006年4月 - 2008年3月

京都大学, 大学院理学研究科, 生物科学専攻博士前期課程
2002年4月 - 2006年3月

京都大学, 理学部

受賞

論文

Conformational rearrangements in the second voltage sensor domain switch PIP2- and voltage-gating modes in two-pore channels.

Takushi Shimomura, Kiichi Hirazawa, Yoshihiro Kubo

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 120(6) e2209569120 2023年2月7日査読有り筆頭著者責任著者
Dopamine drives neuronal excitability via KCNQ channel phosphorylation for reward behavior.

Daisuke Tsuboi, Takeshi Otsuka, Takushi Shimomura, Md Omar Faruk, Yukie Yamahashi, Mutsuki Amano, Yasuhiro Funahashi, Keisuke Kuroda, Tomoki Nishioka, Kenta Kobayashi …

Cell reports 40(10) 111309-111309 2022年9月6日査読有り
Closed-state inactivation of cardiac, skeletal, and neuronal sodium channels is isoform specific.

Niklas Brake, Adamo S Mancino, Yuhao Yan, Takushi Shimomura, Yoshihiro Kubo, Anmar Khadra, Derek Bowie

The Journal of general physiology 154(7) 2022年7月4日査読有り
Phosphoinositide regulates dynamic movement of the S4 voltage sensor in the second repeat in two-pore channel 3.

Kiichi Hirazawa, Michihiro Tateyama, Yoshihiro Kubo, Takushi Shimomura

The Journal of biological chemistry 297(6) 101425-101425 2021年12月査読有り責任著者
Mechanism of hERG inhibition by gating-modifier toxin, APETx1, deduced by functional characterization.

Kazuki Matsumura, Takushi Shimomura, Yoshihiro Kubo, Takayuki Oka, Naohiro Kobayashi, Shunsuke Imai, Naomi Yanase, Madoka Akimoto, Masahiro Fukuda, Mariko Yokogawa …

BMC molecular and cell biology 22(1) 3-3 2021年1月7日査読有り
A native prokaryotic voltage-dependent calcium channel with a novel selectivity filter sequence

Takushi Shimomura, Yoshiki Yonekawa, Hitoshi Nagura, Michihiro Tateyama, Yoshinori Fujiyoshi, Katsumasa Irie

eLife 2020年2月25日査読有り筆頭著者
Phosphoinositides modulate the voltage dependence of two-pore channel 3.

Takushi Shimomura, Yoshihiro Kubo

The Journal of general physiology 151(8) 986-1006 2019年8月5日査読有り
Two mutations at different positions in the CNBH domain of the hERG channel accelerate deactivation and impair the interaction with the EAG domain

Kume Shinichiro, Shimomura Takushi, Tateyama Michihiro, Kubo Yoshihiro

JOURNAL OF PHYSIOLOGY-LONDON 596(19) 4629-4650 2018年10月1日査読有り
Optimized expression and purification of NavAb provide the structural insight into the voltage dependence

Irie Katsumasa, Haga Yukari, Shimomura Takushi, Fujiyoshi Yoshinori

FEBS LETTERS 592(2) 274-283 2018年1月査読有り
SLO potassium channels antagonize premature decision making in C. elegans

Aoki Ichiro, Tateyama Michihiro, Shimomura Takushi, Ihara Kunio, Kubo Yoshihiro, Nakano Shunji, Mori Ikue

COMMUNICATIONS BIOLOGY 1 123-123 2018年査読有り
Molecular determinants of prokaryotic voltage-gated sodium channels for recognition of local anesthetics

Takushi Shimomura, Katsumasa Irie, Yoshinori Fujiyoshi

FEBS JOURNAL 283(15) 2881-2895 2016年8月査読有り筆頭著者
Control of Spontaneous Ca2+ Transients Is Critical for Neuronal Maturation in the Developing Neocortex

Yuki Bando, Katsumasa Irie, Takushi Shimomura, Hiroki Umeshima, Yuki Kushida, Mineko Kengaku, Yoshinori Fujiyoshi, Tomoo Hirano, Yoshiaki Tagawa

CEREBRAL CORTEX 26(1) 106-117 2016年1月査読有り
Two alternative conformations of a voltage-gated sodium channel

Ching-Ju Tsai, Kazutoshi Tani, Katsumasa Irie, Yoko Hiroaki, Takushi Shimomura, Duncan G. McMillan, Gregory M. Cook, Gebhard F.X. Schertler, Yoshinori Fujiyoshi, Xiao-Dan Li

Journal of Molecular Biology 425(22) 4074-4088 2013年11月15日査読有り
The C-terminal helical bundle of the tetrameric prokaryotic sodium channel accelerates the inactivation rate

Katsumasa Irie, Takushi Shimomura, Yoshinori Fujiyoshi

NATURE COMMUNICATIONS 3 2012年4月査読有り
The Acceleration of the Inactivation of Prokaryotic Sodium Channel by the Formation of C-Terminal 4-Helix Bundle

Irie Katsumasa, Shimomura Takushi, Fujiyoshi Yoshinori

BIOPHYSICAL JOURNAL 102(3) 132A 2012年1月31日査読有り
Arrangement and Mobility of the Voltage Sensor Domain in Prokaryotic Voltage-gated Sodium Channels

Shimomura Takushi, Irie Katsumasa, Nagura Hitoshi, Imai Tomoya, Fujiyoshi Yoshinori

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 286(9) 7409-7417-7417 2011年3月4日査読有り筆頭著者
Regulation of cellular excitability is critical for neuronal migration

Bando Yuki, Irie Katsumasa, Kushida Yuki, Shimomura Takushi, Fujiyoshi Yoshinori, Hirano Tomoo, Tagawa Yoshiaki

NEUROSCIENCE RESEARCH 71 E229 2011年査読有り
Evidence for lateral mobility of voltage sensors in prokaryotic voltage-gated sodium channels

Hitoshi Nagura, Katsumasa Irie, Tomoya Imai, Takushi Shimomura, Toshihide Hige, Yoshinori Fujiyoshi

BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS 399(3) 341-346 2010年8月査読有り
Comparative Study of the Gating Motif and C-type Inactivation in Prokaryotic Voltage-gated Sodium Channels

Katsumasa Irie, Kazuya Kitagawa, Hitoshi Nagura, Tomoya Imai, Takushi Shimomura, Yoshinori Fujiyoshi

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 285(6) 3685-3694 2010年2月査読有り

MISC

細菌の祖先型イオンチャネルから探る,普遍的なカルシウム選択機構

下村拓史, 入江克雅, 入江克雅

生物物理(Web) 61(4) 2021年
サソリ毒の持つ精巧なNa⁺チャネル調節メカニズム

下村拓史

ファルマシア 55(9) 888-888 2019年査読有り
膜電位感受性Na⁺チャネルの電位感受性変異体に見られるセンサードメインの位置変化

下村拓史, 今井友也, 名倉仁, 入江克雅, 藤吉好則

生化学 2009年
RIGIDITY OF S6 HELIX CONTROLS C-TYPE INACTIVATION RATE OF PROKARYOTIC VOLTAGE-GATED SODIUM CHANNELS

Katsumasa Irie, Kazuya Kitagawa, Hitoshi Nagura, Tomoya Imai, Takushi Shimomura, Yoshinori Fujiyoshi

JOURNAL OF PHYSIOLOGICAL SCIENCES 59 250-250 2009年
2P289 システインスキャン実験に見られる電圧感受性イオンチャネルのS4ヘリックスの大きな動き(生体膜・人工膜,口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)

下村拓史, 名倉仁, 髭俊秀, 今井友也, 入江克雄, 三尾和弘, 佐藤主税, 藤吉好則

生物物理 47(1) S185 2007年11月20日
Lateral mobility of voltage sensor domain of bacterial sodium channels

Hitoshi Nagura, Katsumasa Irie, Tomoya Imai, Takushi Shimomura, Toshihide Hige, Yoshinori Fujiyoshi

NEUROSCIENCE RESEARCH 58 S41-S41 2007年

書籍等出版物

脳神経化学: 脳はいま化学の言葉でどこまで語れるか (DOJIN BIOSCIENCE SERIES)

森, 泰生, 尾藤, 晴彦 (担当:分担執筆)

化学同人 2018年4月4日 (ISBN: 4759817263)

講演・口頭発表等

Contribution of the 2nd S4 helix for switching PIP2- and voltage-gating modes in two-pore channels

Ion Channel Modulation Symposium 2023 2023年招待有り
膜電位下蛍光電流同時測定法により明らかになった、Two-pore Channelにおけるリガンド依存性と電位依存性ゲーティングの切り替え・統合の分子基盤

第95回⽇本⽣化学会⼤会 2022年招待有り

所属学協会

日本生理学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

光生理学的手法を用いたTwo pore channelにおけるイオン選択性制御の分子基盤の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2023年4月 - 2026年3月

下村拓史
非天然アミノ酸を用いた汎用かつ簡便なタンパク質光感受化法

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2022年4月 - 2024年3月

下村拓史
非天然アミノ酸を利用した、イオンチャネルの特定状態を指向した解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2020年4月 - 2023年3月

下村拓史
光異性化アミノ酸導入による、リガンド依存性イオンチャネルの光制御化法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2020年4月 - 2022年3月

下村拓史
受精時の多精拒否におけるTPC3チャネルの役割の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2018年4月 - 2020年3月

下村拓史
定説を覆す電位依存的制御メカニズムを有するNa+チャネルの光生理学的解析

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2016年4月 - 2018年3月

下村拓史

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研究分野

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論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

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共同研究・競争的資金等の研究課題

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