shinichi nakagawa

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Name
shinichi nakagawa
E-mail
nakagawaspharm.hokudai.ac.jp
Affiliation
Hokkaido University
Section
Faculty of Pharmaceutical Sciences Division of Molecular Pharmceutical Sciences
Research funding number
50324679

Research Areas

 
 

Academic & Professional Experience

 
May 2016
 - 
Today
Professor, Faculty of Pharmaceutical Sciences, Hokkaido University
 
Apr 2010
 - 
Apr 2016
Associate Chief Scientist, RIKEN
 
Apr 2005
 - 
Mar 2010
Initiative Researcher, RIKEN
 
Apr 2002
 - 
Mar 2005
Researcher, RIKEN CDB
 
Apr 2000
 - 
Mar 2002
Assistant Professor, University of Kyoto
 

Published Papers

 
Gurumurthy CB, Sato M, Nakamura A, Inui M, Kawano N, Islam MA, Ogiwara S, Takabayashi S, Matsuyama M, Nakagawa S, Miura H, Ohtsuka M
Nature protocols   14(8) 2452-2482   Aug 2019   [Refereed]
Shinoda S, Kitagawa S, Nakagawa S, Wei FY, Tomizawa K, Araki K, Araki M, Suzuki T, Suzuki T
Nucleic acids research      Jul 2019   [Refereed]
Hirose T, Yamazaki T, Nakagawa S
Wiley interdisciplinary reviews. RNA   e1545   May 2019   [Refereed]
Gast M, Rauch B, Haghikia A, Nakagawa S, Haas J, Stroux A, Schmidt D, Schumann P, Weiss S, Jensen L, Kratzer A, Kraenkel N, Müller C, Börnigen D, Hirose T, Blankenberg S, Escher F, Kühl A, Kuss A, Meder B, Landmesser U, Zeller T, Poller W
Cardiovascular research      Mar 2019   [Refereed]
Mito M, Kadota M, Nakagawa S, Iwasaki S
Journal of visualized experiments : JoVE   (143)    Jan 2019   [Refereed]
Kim J, Piao HL, Kim BJ, Yao F, Han Z, Wang Y, Xiao Z, Siverly AN, Lawhon SE, Ton BN, Lee H, Zhou Z, Gan B, Nakagawa S, Ellis MJ, Liang H, Hung MC, You MJ, Sun Y, Ma L
Nature genetics   50(12) 1705-1715   Dec 2018   [Refereed]
Nakagawa S, Yamazaki T, Hirose T
Open biology   8(10)    Oct 2018   [Refereed]
Taiwa K, Yokoi S, Mito M, Fujii K, Kimura Y, Iwasaki S, Nakagawa S
RNA (New York, N.Y.)      Sep 2018   [Refereed]
Ahmed ASI, Dong K, Liu J, Wen T, Yu L, Xu F, Kang X, Osman I, Hu G, Bunting KM, Crethers D, Gao H, Zhang W, Liu Y, Wen K, Agarwal G, Hirose T, Nakagawa S, Vazdarjanova A, Zhou J
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America   115(37) E8660-E8667   Sep 2018   [Refereed]
Gast M, Rauch BH, Nakagawa S, Haghikia A, Jasina A, Haas J, Nath N, Jensen L, Stroux A, Böhm A, Friebel J, Rauch U, Skurk C, Blankenberg S, Zeller T, Prasanth KV, Meder B, Kuss A, Landmesser U, Poller W
Cardiovascular research      Aug 2018   [Refereed]
Yamazaki T, Souquere S, Chujo T, Kobelke S, Chong YS, Fox AH, Bond CS, Nakagawa S, Pierron G, Hirose T
Molecular cell   70(6) 1038-1053.e7   Jun 2018   [Refereed]
Lin H, Miyauchi K, Harada T, Okita R, Takeshita E, Komaki H, Fujioka K, Yagasaki H, Goto YI, Yanaka K, Nakagawa S, Sakaguchi Y, Suzuki T
Nature communications   9(1) 1875   May 2018   [Refereed]
Fox AH, Nakagawa S, Hirose T, Bond CS
Trends in biochemical sciences   43(2) 124-135   Feb 2018   [Refereed]
Mito M, Kadota M, Tanaka K, Furuta Y, Abe K, Iwasaki S, Nakagawa S
Scientific reports   8(1) 1143   Jan 2018   [Refereed]
Mello SS, Sinow C, Raj N, Mazur PK, Bieging-Rolett K, Broz DK, Imam JFC, Vogel H, Wood LD, Sage J, Hirose T, Nakagawa S, Rinn J, Attardi LD
Genes & development   31(11) 1095-1108   Jun 2017   [Refereed]
Chujo T, Yamazaki T, Kawaguchi T, Kurosaka S, Takumi T, Nakagawa S, Hirose T
The EMBO journal   36(10) 1447-1462   May 2017   [Refereed]
Poller W, Dimmeler S, Heymans S, Zeller T, Haas J, Karakas M, Leistner DM, Jakob P, Nakagawa S, Blankenberg S, Engelhardt S, Thum T, Weber C, Meder B, Hajjar R, Landmesser U
European heart journal      Apr 2017   [Refereed]
Chen X, He L, Zhao Y, Li Y, Zhang S, Sun K, So K, Chen F, Zhou L, Lu L, Wang L, Zhu X, Bao X, Esteban MA, Nakagawa S, Prasanth KV, Wu Z, Sun H, Wang H
Cell discovery   3 17002   2017   [Refereed]
Quesnel-Vallières M, Dargaei Z, Irimia M, Gonatopoulos-Pournatzis T, Ip JY, Wu M, Sterne-Weiler T, Nakagawa S, Woodin MA, Blencowe BJ, Cordes SP
Molecular cell   64(6) 1023-1034   Dec 2016   [Refereed]
Sakaguchi T, Hasegawa Y, Brockdorff N, Tsutsui K, Tsutsui KM, Sado T, Nakagawa S
Developmental cell   39(1) 11-12   Oct 2016   [Refereed]
Ishida K, Miyauchi K, Kimura Y, Mito M, Okada S, Suzuki T, Nakagawa S
Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms   20(11) 887-901   Sep 2015   [Refereed]
West JA, Mito M, Kurosaka S, Takumi T, Tanegashima C, Chujo T, Yanaka K, Kingston RE, Hirose T, Bond C, Fox A, Nakagawa S
The Journal of cell biology   214(7) 817-830   Sep 2016   [Refereed]
Yamada N, Hasegawa Y, Yue M, Hamada T, Nakagawa S, Ogawa Y
PLoS genetics   11(8) e1005430   Aug 2015   [Refereed]
Anantharaman A, Jadaliha M, Tripathi V, Nakagawa S, Hirose T, Jantsch MF, Prasanth SG, Prasanth KV
Scientific reports   6 34043   Sep 2016   [Refereed]
Nakagawa S
Biochimica et biophysica acta   1859(1) 177-183   Jun 2015   [Refereed]
Adriaens C, Standaert L, Barra J, Latil M, Verfaillie A, Kalev P, Boeckx B, Wijnhoven PW, Radaelli E, Vermi W, Leucci E, Lapouge G, Beck B, van den Oord J, Nakagawa S, Hirose T, Sablina AA, Lambrechts D, Aerts S, Blanpain C, Marine JC
Nature medicine   22(8) 861-868   Aug 2016   [Refereed]
Peters T, Hermans-Beijnsberger S, Beqqali A, Bitsch N, Nakagawa S, Prasanth KV, de Windt LJ, van Oort RJ, Heymans S, Schroen B
PloS one   11(2) e0150236   Feb 2016   [Refereed]
Ip JY, Sone M, Nashiki C, Pan Q, Kitaichi K, Yanaka K, Abe T, Takao K, Miyakawa T, Blencowe BJ, Nakagawa S
Scientific reports   6 27204   Jun 2016   [Refereed]
Yoshimoto R, Mayeda A, Yoshida M, Nakagawa S
Biochimica et biophysica acta   1859(1) 192-199   Oct 2015   [Refereed]
Mito M, Kawaguchi T, Hirose T, Nakagawa S
Methods (San Diego, Calif.)   98 158-165   Apr 2016   [Refereed]
Zong X, Nakagawa S, Freier SM, Fei J, Ha T, Prasanth SG, Prasanth KV
Nucleic acids research   44(6) 2898-2908   Apr 2016   [Refereed]
Hirose T, Nakagawa S
Biochimica et biophysica acta   1859(1) 1-2   Jan 2016   [Refereed]
Gast M, Schroen B, Voigt A, Haas J, Kuehl U, Lassner D, Skurk C, Escher F, Wang X, Kratzer A, Michalik K, Papageorgiou A, Peters T, Loebel M, Wilk S, Althof N, Prasanth KV, Katus H, Meder B, Nakagawa S, Scheibenbogen C, Schultheiss HP, Landmesser U, Dimmeler S, Heymans S, Poller W
Journal of molecular cell biology   8(2) 178-181   Jan 2016   [Refereed]
Nakagawa S
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)   1206 107-122   2015   [Refereed]
Okada Y, Nakagawa S
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)   1262 21-35   2015   [Refereed]
Standaert L, Adriaens C, Radaelli E, Van Keymeulen A, Blanpain C, Hirose T, Nakagawa S, Marine JC
RNA (New York, N.Y.)   20(12) 1844-1849   Dec 2014   [Refereed]
Hasegawa Y, Nakagawa S
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)   1262 333-348   2015   [Refereed]
Ishizuka A, Hasegawa Y, Ishida K, Yanaka K, Nakagawa S
Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms   19(9) 704-721   Sep 2014   [Refereed]
Nakagawa S, Shimada M, Yanaka K, Mito M, Arai T, Takahashi E, Fujita Y, Fujimori T, Standaert L, Marine JC, Hirose T
Development (Cambridge, England)   141(23) 4618-4627   Dec 2014   [Refereed]
Nakagawa S, Kageyama Y
Biochimica et biophysica acta   1839(3) 215-222   Mar 2014   [Refereed]
Nakagawa S, Hirano T
Nature structural & molecular biology   21(3) 207-208   Mar 2014   [Refereed]
Hirose T, Virnicchi G, Tanigawa A, Naganuma T, Li R, Kimura H, Yokoi T, Nakagawa S, Bénard M, Fox AH, Pierron G
Molecular biology of the cell   25(1) 169-183   Jan 2014   [Refereed]
Naganuma T, Nakagawa S, Tanigawa A, Sasaki YF, Goshima N, Hirose T
The EMBO journal   31(20) 4020-4034   Oct 2012   [Refereed]
Murota Y, Ishizu H, Nakagawa S, Iwasaki YW, Shibata S, Kamatani MK, Saito K, Okano H, Siomi H, Siomi MC
Cell reports   8(1) 103-113   Jul 2014   [Refereed]
Hirose T, Nakagawa S
Biomolecular concepts   3(5) 415-428   Oct 2012   [Refereed]
Nakagawa S, Hirose T
Cellular and molecular life sciences : CMLS   69(18) 3027-3036   Sep 2012   [Refereed]
Nakagawa S, Ip JY, Shioi G, Tripathi V, Zong X, Hirose T, Prasanth KV
RNA (New York, N.Y.)   18(8) 1487-1499   Aug 2012   [Refereed]
Ip JY, Nakagawa S
Development, growth & differentiation      Nov 2011   [Refereed]
Hasegawa Y, Nakagawa S
RNA biology   8 735-739   Sep 2011   [Refereed]
Nakagawa S, Prasanth KV
Trends in cell biology   21(6) 321-327   Jun 2011   [Refereed]
Tsuiji H, Yoshimoto R, Hasegawa Y, Furuno M, Yoshida M, Nakagawa S
Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms   16(5) 479-490   May 2011   [Refereed]
Nakagawa S, Naganuma T, Shioi G, Hirose T
The Journal of cell biology   193(1) 31-39   Apr 2011   [Refereed]
Hasegawa Y, Brockdorff N, Kawano S, Tsutui K, Tsutui K, Nakagawa S
Developmental cell   19(3) 469-476   Sep 2010   [Refereed]
Kubo F, Nakagawa S
Development (Cambridge, England)   136(11) 1823-1833   Jun 2009   [Refereed]
Suga A, Taira M, Nakagawa S
Developmental biology   330(2) 318-328   Jun 2009   [Refereed]
T. Naganuma, S. Nakagawa, A. Tanigawa, Y.F. Sasaki, N. Goshima, T. Hirose
EMBO J   31 4020-4034   Jul 2013   [Refereed]
Kubo F, Nakagawa S
Development, growth & differentiation   50 245-251   May 2008   [Refereed]
Takahashi Y, Watanabe T, Nakagawa S, Kawakami K, Sato Y
Methods in cell biology   87 271-280   2008   [Refereed]
Chida D, Nakagawa S, Nagai S, Sagara H, Katsumata H, Imaki T, Suzuki H, Mitani F, Ogishima T, Shimizu C, Kotaki H, Kakuta S, Sudo K, Koike T, Kubo M, Iwakura Y
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America   104(46) 18205-18210   Nov 2007   [Refereed]
Sone M, Hayashi T, Tarui H, Agata K, Takeichi M, Nakagawa S
Journal of cell science   120(15) 2498-2506   Aug 2007   [Refereed]
Watanabe T, Saito D, Tanabe K, Suetsugu R, Nakaya Y, Nakagawa S, Takahashi Y
Developmental biology   305(2) 625-636   May 2007   [Refereed]
Sato Y, Kasai T, Nakagawa S, Tanabe K, Watanabe T, Kawakami K, Takahashi Y
Developmental biology   305(2) 616-624   May 2007   [Refereed]
Tanabe K, Takahashi Y, Sato Y, Kawakami K, Takeichi M, Nakagawa S
Development (Cambridge, England)   133(20) 4085-4096   Oct 2006   [Refereed]
Aoki H, Hara A, Nakagawa S, Motohashi T, Hirano M, Takahashi Y, Kunisada T
Experimental eye research   82 265-274   Feb 2006   [Refereed]
Kubo F, Takeichi M, Nakagawa S
Development (Cambridge, England)   132(12) 2759-2770   Jun 2005   [Refereed]
Tanabe K, Takeichi M, Nakagawa S
Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists   229(4) 899-906   Apr 2004   [Refereed]
Nakagawa S, Takada S, Takada R, Takeichi M
Developmental biology   260(2) 414-425   Aug 2003   [Refereed]
Kubo F, Takeichi M, Nakagawa S
Development (Cambridge, England)   130(3) 587-598   Feb 2003   [Refereed]
Takeichi M, Nakagawa S
Current protocols in cell biology   Chapter 9 Unit 9.3   May 2001   [Refereed]
Takeichi M, Nakagawa S, Aono S, Usui T, Uemura T
Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences   355(1399) 885-890   Jul 2000   [Refereed]
Redies C, Ast M, Nakagawa S, Takeichi M, Martínez-de-la-Torre M, Puelles L
The Journal of comparative neurology   421(4) 481-514   Jun 2000   [Refereed]
Honjo Y, Nakagawa S, Takeichi M
Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms   5(4) 309-318   Apr 2000   [Refereed]
Ephrin-B regulates the Ipsilateral routing of retinal axons at the optic chiasm.
Nakagawa S, Brennan C, Johnson KG, Shewan D, Harris WA, Holt CE
Neuron   25(3) 599-610   Mar 2000   [Refereed]
Aono S, Nakagawa S, Reynolds AB, Takeichi M
The Journal of cell biology   145(3) 551-562   May 1999   [Refereed]
Wöhrn JC, Nakagawa S, Ast M, Takeichi M, Redies C
Neuroscience   90(3) 985-1000   Mar 1999   [Refereed]
Neural crest emigration from the neural tube depends on regulated cadherin expression.
Nakagawa S, Takeichi M
Development (Cambridge, England)   125(15) 2963-2971   Aug 1998   [Refereed]
Wöhrn JC, Puelles L, Nakagawa S, Takeichi M, Redies C
The Journal of comparative neurology   396(1) 20-38   Jun 1998   [Refereed]
Arndt K, Nakagawa S, Takeichi M, Redies C
Molecular and cellular neurosciences   10(5/6) 211-228   Apr 1998   [Refereed]
Arndt K, Nakagawa S, Takeichi M, Redies C
Molecular and cellular neurosciences   10(5-6) 211-228   Apr 1998   [Refereed]
Nakagawa S, Takeichi M
Development, growth & differentiation   39(4) 451-455   Aug 1997   [Refereed]
Neural crest cell-cell adhesion controlled by sequential and subpopulation-specific expression of novel cadherins.
Nakagawa S, Takeichi M
Development (Cambridge, England)   121(5) 1321-1332   May 1995   [Refereed]

Misc

 
若井道仁, 中川真一
実験医学   33(20) 3296-3297   Dec 2015
水戸麻理, 中川真一
実験医学   33(20) 3402-3406   Dec 2015
中條岳志, 中川真一, 川口哲哉, 内匠透, 廣瀬哲郎
日本生化学会大会(Web)   88th 2T25P-08(2P0765) (WEB ONLY)-08(2P0765)]   Dec 2015
RNA制御のケミカルバイオロジー スプライシング阻害剤Spliceostatin Aの感受性を決定づけるイントロンの特徴とは?
芳本 玲, 甲斐田 大輔, 古野 正朗, 鈴木 治和, 林崎 良英, 前田 明, 中川 真一, 吉田 稔
日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集   88回・38回 [4W10-p   Dec 2015
川口哲哉, 廣瀬哲郎, 中川真一
実験医学   33(14) 2283-2289   Sep 2015
【ノンコーディングRNAテキストブック 最新の医学・創薬研究、方法論とマイルストーン論文200報】 (第2章)長鎖ノンコーディングRNAのマイルストーン研究 総論 長鎖ncRNA研究の歴史と現状
中川 真一
実験医学   33(20) 3266-3269   Dec 2015
芳本玲, 芳本玲, 甲斐田大輔, 甲斐田大輔, 古野正朗, 鈴木治和, 林崎良英, 前田明, 中川真一, 吉田稔
日本生化学会大会(Web)   88th 4W10-P-4 (WEB ONLY)   2015
【ノンコーディングRNAテキストブック 最新の医学・創薬研究、方法論とマイルストーン論文200報】 (第2章)長鎖ノンコーディングRNAのマイルストーン研究 核内構造体IncRNA 染色体機能とIncRNA
若井 道仁, 中川 真一
実験医学   33(20) 3296-3297   Dec 2015
【ノンコーディングRNAテキストブック 最新の医学・創薬研究、方法論とマイルストーン論文200報】 (第2章)長鎖ノンコーディングRNAのマイルストーン研究 その他のIncRNA関連トピック IncRNA複合体解析法の登場
中川 真一
実験医学   33(20) 3304-3305   Dec 2015
室田友紀子, 石津大嗣, 中川真一, 岩崎由香, 芝田晋介, 鎌谷太陽, 齋藤都暁, 岡野栄之, 塩見春彦, 塩見美喜子
日本RNA学会年会要旨集   16th 122   Jul 2014
芳本玲, 古野正明, 鈴木治和, 林崎良英, 中川真一, 吉田稔
日本RNA学会年会要旨集   16th 229   Jul 2014
【ノンコーディングRNAテキストブック 最新の医学・創薬研究、方法論とマイルストーン論文200報】 (第2章)長鎖ノンコーディングRNAのマイルストーン研究 その他のIncRNA関連トピック IncRNA解析の問題点と遺伝学的解析
中川 真一
実験医学   33(20) 3308-3309   Dec 2015
【ノンコーディングRNAテキストブック 最新の医学・創薬研究、方法論とマイルストーン論文200報】 (第4章)ncRNA研究をはじめよう RNA細胞内局在の高解像度解析
水戸 麻理, 中川 真一
実験医学   33(20) 3402-3406   Dec 2015
RNAの局在を可視化する手法として最も古くから使われている手法が、in situハイブリダイゼーションである。その原理は、固定した細胞に対してラベルしたプローブを高特異性条件下でハイブリダイズさせ、ラベルを検出することで細胞内局在を調べるというきわめてシンプルなものであるが、感度、特異性、ともにいまだこれを上回る技術は開発されていない。本稿ではin situハイブリダイゼーションを行う際の留意点、および、RNA局在を超解像顕微鏡を用いて観察する手法を解説する。(著者抄録)
廣瀬哲郎, 谷川明恵, VIRNICCHI Giorgio, BENARD Marianne, 長沼孝雄, 佐々木保典, 中川真一, FOX Archa, PIRRON Gerard
日本RNA学会年会要旨集   14th 52   Jul 2012
室田友紀子, 石津大嗣, 芝田晋介, 鎌谷太陽, 齋藤都暁, 中川真一, 岡野栄之, 塩見春彦, 塩見美喜子
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)   35th 2P-0287 (WEB ONLY)   2012
石塚 明, 中川 真一
生体の科学   62(5) 502-503   Oct 2011
【長鎖ノンコーディングRNA:遺伝子発現制御メカニズム別・機能リファレンス】 【メカニズム mRNAと相互作用するIncRNA】 レトロトランスポゾン配列を介して形成される二本鎖RNAによる遺伝子発現制御
石田 賢太郎, 中川 真一
細胞工学   34(1) 38-42   Dec 2014
長谷川優子, 中川真一
日本RNA学会年会要旨集   16th 114   Jul 2014
中川真一, 石田賢太郎
日本遺伝学会大会プログラム・予稿集   85th 75   Aug 2013
WEST Jason, 工樂樹洋, KINGSTON Robert, 廣瀬哲郎, 中川真一
日本RNA学会年会要旨集   15th 100   Jul 2013
中川真一, 廣瀬哲郎
日本RNA学会年会要旨集   14th 48   Jul 2012
石田賢太郎, 中川真一
日本RNA学会年会要旨集   14th 140   Jul 2012
中川真一
生化学   82(1) 42-46   Jan 2010
これまでに知られている機能性核内高分子ノンコーティングRNAの主な機能について、転移座からみてcisに働いて転写サイト付近の転写を制御するもの、transに働いて核内構造体を形成するものの二つに分けて概説した。パラスペックルの構造維持に必要なMENε/β、核スペックルに局在するMalat1、および著者等によって同定された、神経系に特異的に発現する新規核内構造物を形成するGomafuなどの発現、構造、機能などについて述べた。
【ゲノムの"ダークマター"長鎖ncRNAが制御する多彩な生命現象】 概論 長鎖ncRNA研究のはじまりの終わり
中川 真一, 影山 裕二
実験医学   29(11) 1702-1708   Jul 2011
ヒトやマウスのゲノムからタンパク質をコードしないノンコーディングRNA(ncRNA)が大量に転写されているということが明らかとなってから、かれこれ10年近くが経とうとしている。ncRNAのなかでも長鎖のncRNAの生理機能は長らく不明であったが、近年になってようやく個々の遺伝子について詳細な解析がなされるようになり、これらの分子が制御する生命機能の全体像がおぼろげながら見えるようになってきた。この概論では、現時点における長鎖ncRNA研究の現状と問題点を解説したい。(著者抄録)
長谷川優子, 筒井公子, 筒井研, 鈴木勉, 中川真一
生化学   84回 ROMBUNNO.1S1P-4-4   Sep 2011
【生命分子を統合するRNA-その秘められた役割と制御機構 分子進化・サイレンシング・non-coding RNAからRNA修飾・編集・RNA-タンパク質間相互作用まで】 (第2章)転移因子・ウイルスと宿主の"せめぎ合い"と遺伝子サイレンシング 概論 転移因子・ウイルスと宿主のせめぎ合いによりもたらされるゲノム進化
中川 真一
実験医学   31(7) 1047-1054   May 2013
日常生活のタイムスケールにおいてゲノムDNAは不変であり、その安定性が生命現象の基盤となっているのは周知の事実である。ところが、数億年という単位で物事が進む進化的なタイムスケールでみるとこの常識は必ずしも真ではなく、むしろ、ゲノムDNAが変化していくことこそ生命の本質であるという見方もできよう。前者のタイムスケールにおいては、情報はDNAからRNAを経てタンパク質へとほぼ一方向に流れていくが、後者のタイムスケールにおいては逆転写反応を介したRNAからDNAへの情報の流れも端倪すべからざる大...
長沼孝雄, 中川真一, 青木一真, 五島直樹, 佐々木保典, 廣瀬哲郎
生化学   83回・33回 ROMBUNNO.3P-0795-0795   Dec 2010
[Emerging world of nuclear long noncoding RNAs]
Nakagawa S
Seikagaku. The Journal of Japanese Biochemical Society   82 42-46   Jan 2010   [Refereed]
長沼孝雄, 佐々木保典, 中川真一, 廣瀬哲郎
日本分子生物学会年会講演要旨集   32nd(Vol.1) 24   2009
中川真一, 石田賢太郎
蛋白質 核酸 酵素   53(15) 1932-1939   Dec 2008
近年のトランスクリプトーム解析によって,ゲノムの大部分が転写されていること,その多くがmRNAとしての特徴をもちながら蛋白質をコードしていないmRNA型ノンコーディングRNAであることが明らかとなり,特定のものについてはその機能もわかりつつある.本稿では,とくに最近,あいついで報告された,核内に大量に蓄積するmRNA型ノンコーディングRNAに焦点をあて,その研究の現状を解説したい.また,ノンコーディングRNA全般について,洪水のように発表されつづけている論文から少し距離をおいた議論をしてみ...
【拡大・進展を続けるRNA研究の最先端 長鎖noncoding RNA・small RNAからRNA修飾・編集・品質管理まで】 noncoding RNAの分子機構と生命現象、疾患との関わり 進化的に「新しい」バイオマテリアル 核内mRNA型noncoding RNAに何ができるのか
中川 真一
実験医学   28(10) 1496-1501   Jun 2010
さまざまな生物のゲノムが解読されて明らかとなったのは、多細胞生物間でタンパク質をコードしている遺伝子の数がそれほど変わらないという事実であった。一方、高等真核生物では大量のnoncoding RNAがゲノムから読み出されている。これらのRNAの働きで高等な生物に見られる複雑さを説明できるのか?本稿ではnoncoding RNAの中でも、特に哺乳類に特異的に存在する4種類の核内mRNA型noncoding RNAに焦点を当て、進化的に「新しい」それらの遺伝子が制御する核内プロセスや生命現象を...
中川真一
脳の神経回路の機能解明 平成16-21年度 No.16069101   118-119   2010
中川真一
生化学   ROMBUNNO.2S12A-1   Sep 2009
石田賢太郎, 中川真一
日本RNA学会年会要旨集   11th 42   Jul 2009
[Lessons from abundant nuclear mRNA-like noncoding RNAs]
Nakagawa S, Ishida K
Tanpakushitsu kakusan koso. Protein, nucleic acid, enzyme   53 1932-1939   Dec 2008   [Refereed]
長岡真, 大原智也, 中川真一, 加藤敬行, 五島直樹, 野村信夫, 鈴木健夫, 坂口裕理子, 鈴木勉
日本RNA学会年会要旨集   9th 22   Jul 2007
中川真一
生化学   76(12) 1573-1576   Dec 2004
中川真一
実験医学   26(10) 1552-1556,HYOSHI,1474(2)   Jun 2008
曽根正光, 築地仁美, 甲斐田大輔, 吉田稔, 中川真一
日本RNA学会年会要旨集   10th 4   Jul 2008
石田賢太郎, 中川真一
生化学   1P-0918   2008
長谷川優子, 河野真二, 筒井公子, 筒井研, 中川真一
生化学   2T5-2   2008
【命名から20年を超えて Wnt研究の新機軸】 概論 Wnt研究の現在 基礎研究の広がりと臨床応用への予兆
中川 真一
実験医学   26(3) 356-360   Feb 2008
【RNAの機能解明と医療応用 最新の解析戦略と機能性RNAの知見から、RNA異常と疾患の関わり、RNA医薬・診断への応用まで】 機能性RNAの生理学 核内mRNA型non-coding RNA
中川 真一
実験医学   26(10) 1552-1556   Jun 2008
一般にタンパク質をコードしているmRNAは細胞質に局在するが、mRNA型non-coding RNAの中には細胞質へと運ばれず核内に局在するものがある。これら核内mRNA型non-coding RNAの既知の生理的機能として染色体レベルでの発現調節や刷り込みの制御等が知られているが、核内で特定の「足場」を作っていると思われる新たな分子群が同定されつつある。これら新規mRNA型non-coding RNAの機能解析を通じて全く新たな研究領域が発掘される可能性がある。(著者抄録)
中川真一, 竹市雅俊, 久保郁, 久保郁
日本眼科学会雑誌   111 101   Mar 2007
千田大, 中川真一, 相良洋, 鈴木春巳, 久保光正, 岩倉洋一郎
生化学   3P-1139   2007
網膜細胞分化の分子メカニズム 網膜幹細胞の未分化性を制御する分子メカニズム
中川 真一, 竹市 雅俊, 久保 郁
日本眼科学会雑誌   111(臨増) 101-101   Mar 2007
中川真一
再生医療   4(2) 277-282,200   May 2005
【視聴覚の再生】 Wntシグナルによる培養条件下での層形成の誘導と幹細胞の維持活性
中川 真一
再生医療   4(2) 277-282   May 2005
[Role of Wnt signaling in eye organogenesis]
Nakagawa S
Seikagaku. The Journal of Japanese Biochemical Society   76 1573-1576   Dec 2004   [Refereed]
中川真一
細胞工学   23(6) 651-654   Jun 2004
青野真也, 中川真一, 竹市雅俊
日本細胞生物学会大会講演要旨集   52nd 36   1999
【Wntシグナルとその多彩な機能 細胞極性・細胞運動・幹細胞の自己複製・発癌】 網膜の組織形成とWntの活性
中川 真一
細胞工学   23(6) 651-654   May 2004
発生期の網膜の細胞はいったんばらばらにしても再集合して組織塊を形成することができるが,そこでは特徴的な網膜の層構造は決して再生されず,内腔面に細胞が同心円状に並んだロゼットと呼ばれる異常な構造体ができてしまう.最近になって,Wntがこのロゼット形成を阻害し,正しい層構造を持った組織の再生を誘導することが明らかになった.この層形成誘導因子研究の歴史的背景と網膜の辺縁部の特殊性に焦点を当てて解説した

Conference Activities & Talks

 
Preferential association of prion-like-domain-containing RNA binding proteins to functional lncRNA candidates [Invited]
shinichi nakagawa
30 Nov 2018   
Prediction of functional lncRNAs using UPA-seq
shinichi nakagawa
CSHL Asia   31 Oct 2018   
中川真一, 小松太和, 水戸麻理, 竹本愛菜, 藤居光一, 岩崎信太郎
日本RNA学会年会要旨集   9 Jul 2018   
Attempts towards identification of novel functional lncRNAs
shinichi nakagawa
EMBO workshop   11 Apr 2018   
Towards Identification of Novel Functional Long noncoding RNAs
Shinichi Nakagawa
Kumamoto Key Forum   12 Jan 2018   
中川真一
日本神経学会学術大会プログラム・抄録集   2018   
Identification ofnovel functional lncRNA candidates using differential sensitivities to UV-irradiation [Invited]
shinichi nakagawa
ConBio 2017   9 Dec 2017   
Analyses of physiological function of lncRNAs [Invited]
shinichi nakagawa
IIBMP2017   29 Sep 2017   
小松太和, 小松太和, 中川真一
日本RNA学会年会要旨集   19 Jul 2017   
Observation of sub-micron size nuclear bodies using super-resolution microscopy [Invited]
shinichi nakagawa
The 43th Naito Conference「Noncoding RNA: Biology, Chemistry, & Diseases」   29 Jun 2017   
Fine structural analyses of nuclear body paraspeckle using SIM
Shinichi Nakagawa
50th JSDB meeting   10 May 2017   
中川真一
千里ライフサイエンスセミナー講演要旨集   2017   
RNAと生命現象 長鎖ノンコーディングRNAによる妊孕性の制御
中川 真一
日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会   Dec 2015   
中川真一
日本核酸医薬学会年会講演要旨集   15 Nov 2015   
中川真一, 水戸麻理, 廣瀬哲郎
日本RNA学会年会要旨集   15 Jul 2015   
長谷川優子, 中川真一
日本RNA学会年会要旨集   23 Jul 2014   
中川真一, 石田賢太郎
日本遺伝学会大会プログラム・予稿集   31 Aug 2013   
WEST Jason, 工樂樹洋, KINGSTON Robert, 廣瀬哲郎, 中川真一
日本RNA学会年会要旨集   24 Jul 2013   
長谷川優子, 中川真一
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)   2013   
中川真一, 廣瀬哲郎
日本RNA学会年会要旨集   18 Jul 2012   
石田賢太郎, 中川真一
日本RNA学会年会要旨集   18 Jul 2012   
石塚明, 長谷川優子, 中川真一
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)   2012   
室田友紀子, 石津大嗣, 齋藤都暁, 小谷葉月, 中川真一, 塩見春彦, 塩見美喜子
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)   2011   
非コードRNA作用マシナリー 動作原理の分子基盤と生理機能 大量に蓄積する核内ノンコーディングRNAの機能解析 Gomafuを例にとって
中川 真一
日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集   Dec 2010   
90塩基の低分子ノンコーディングRNAによる核内繋留を介した新規遺伝子発現制御(A novel gene expression regulatory mechanism controlled by 90nt nuclear non-coding RNA through the nuclear retention)
石田 賢太郎, 中川 真一
日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集   Dec 2010   
長谷川優子, BROCKDORFF Neil, 筒井公子, 筒井研, 中川真一
日本RNA学会年会要旨集   27 Jul 2010   
長沼孝雄, 中川真一, 青木一真, 五島直樹, 佐々木保典, 廣瀬哲郎
日本RNA学会年会要旨集   27 Jul 2010   
曽根正光, 築地仁美, 芳本玲, 吉田稔, 北市清幸, 山本経之, 阿部高也, 高雄啓三, 宮川剛, 中川真一
日本RNA学会年会要旨集   27 Jul 2010   
ノンコーディングRNAが制御する多様な機能 新規核内高分子ノンコーディングRNA Gomafuの機能解析
中川 真一
日本生化学会大会プログラム・講演要旨集   Sep 2009   
長谷川優子, 河野真二, 筒井公子, 筒井研, 鈴木勉, 中川真一
日本RNA学会年会要旨集   27 Jul 2009   
築地仁美, 芳本玲, 吉田稔, 中川真一
日本分子生物学会年会講演要旨集   2009   
非コードRNA研究の新領域 新規mRNA様非コードRNA Gomafuの機能解析(Functional analysis of a novel mRNA-like noncoding RNA Gomafu)
中川 真一
日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集   Nov 2008   
曽根正光, 稲垣智子, 竹市雅俊, 中川真一
日本RNA学会年会要旨集   28 Jul 2007   
築地仁美, 曽根正光, 中川真一
日本RNA学会年会要旨集   28 Jul 2007   
石田賢太郎, 中川真一
日本RNA学会年会要旨集   28 Jul 2007   
Wntシグナル伝達の新たな展望 Wntシグナル伝達下流における網膜幹細胞維持の毛様体境界帯でのNotchシグナル伝達とは独立したC-hairy1による制御(New horizon of Wnt signaling c-hairy1 controls retinal stem cell maintenance downstream of Wnt signaling, independently of Notch singnaling at the ciliary marginal zone)
久保 郁, 竹市 雅俊, 中川 真一
日本発生生物学会・日本細胞生物学会合同大会要旨集   May 2007   
曽根正光, 竹市雅俊, 中川真一
日本RNA学会年会要旨集   18 Jul 2006   
石田賢太郎, 中川真一
日本RNA学会年会要旨集   18 Jul 2006   
曽根正光, 竹市雅俊, 中川真一
日本分子生物学会年会講演要旨集   25 Nov 2005   
田辺光志, 竹市雅俊, 中川真一
日本分子生物学会年会講演要旨集   25 Nov 2005   
田辺光志, 竹市雅俊, 中川真一
日本発生生物学会大会発表要旨集   May 2005   
中川真一
日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集   25 Nov 2004   
曽根正光, 竹市雅俊, 中川真一
日本発生生物学会大会発表要旨集   10 May 2004   
中川真一
日本発生生物学会大会発表要旨集   10 May 2004   
久保郁, 竹市雅俊, 中川真一
日本発生生物学会大会発表要旨集   2002   
中川真一, 森吉弘毅, 中西重忠, 竹市雅俊
日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集   Jul 1996   
中川真一, 竹市雅俊
日本発生生物学会大会発表要旨集   1996   
中川真一, 竹市雅俊
日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集   Nov 1994   
中川真一, 竹市雅俊
日本発生生物学会大会発表要旨集   1994   

Research Grants & Projects

 
Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology: Grants-in-Aid for Scientific Research(基盤研究(C))
Project Year: 2007 - 2009    Investigator(s): Shinichi NAKAGAWA
The marginal region of the retina contains retinal stem cells that continue to proliferate and remain undifferentiated for a long period. We have previously identified a signaling molecule Wnt2b as a retinal stem cell factor that maintains undiffe...
Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology: Grants-in-Aid for Scientific Research(基盤研究(C))
Project Year: 2004 - 2006    Investigator(s): Shinichi NAKAGAWA
During the histogenesis of the central nervous system, an enormous number of processes must be precisely executed according to the genetic program controlled by both cell-intrinsic and extrinsic factors. We have investigated the molecular mechanis...
Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology: Grants-in-Aid for Scientific Research(基盤研究(C))
Project Year: 2001 - 2003    Investigator(s): Sinichi NAKAGAWA
To study cortical neuron patterning, we utilized reaggregation cultures of dissociated retinal cells prepared from chicken embryos. Singly dissociated retinal cells can reaggregate and undergo a certain level of histogenesis, including cell type-s...