中川真一 (shinichi nakagawa) - マイポータル

基本情報

所属: 北海道大学大学院薬学研究院創薬科学部門教授

学位: 理学博士(京都大学)

研究者番号: 50324679
J-GLOBAL ID: 200901032447755154
researchmap会員ID: 6000012171

外部リンク: https://sites.google.com/rnabiol.com/home

研究分野

経歴

2016年5月 - 現在

北海道大学大学院, 薬学研究院, 教授
2010年4月 - 2016年4月

理化学研究所, 准主任研究員
2005年4月 - 2010年3月

理化学研究所, 独立主幹研究員
2002年4月 - 2005年3月

理化学研究所発生再生科学総合研究センター, 研究員
2000年4月 - 2002年3月

京都大学大学院・生命科学研究科, 助手
1998年4月 - 2000年3月

ケンブリッジ大学, ポスドク
1995年4月 - 1998年3月

京都大学, 大学院理学研究科生物物理学専攻, 博士課程

主要な論文

123

SINE-derived short noncoding RNAs: their evolutionary origins, molecular mechanisms, and physiological significance

Rei Yoshimoto, Shinichi Nakagawa

Frontiers in RNA Research 1 2023年8月10日
Nondomain biopolymers: Flexible molecular strategies to acquire biological functions.

Kazuharu Arakawa, Tetsuro Hirose, Toshifumi Inada, Takuhiro Ito, Toshie Kai, Masaaki Oyama, Yukihide Tomari, Takao Yoda, Shinichi Nakagawa

Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms 2023年5月30日
Species-specific formation of paraspeckles in intestinal epithelium revealed by characterization of NEAT1 in naked mole-rat.

Akihiro Yamada, Hikaru Toya, Mayuko Tanahashi, Misuzu Kurihara, Mari Mito, Shintaro Iwasaki, Satoshi Kurosaka, Toru Takumi, Archa Fox, Yoshimi Kawamura …

RNA (New York, N.Y.) 28(8) 1128-1143 2022年8月査読有り最終著者責任著者
The cell type-specific ER membrane protein UGS148 is not essential in mice.

Osamu Takahashi, Mayuko Tanahashi, Saori Yokoi, Mari Kaneko, Kaori Yanaka, Shinichi Nakagawa, Hiroshi Maita

Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms 27(1) 43-60 2022年1月査読有り責任著者
ArcRNAs and the formation of nuclear bodies.

Shinichi Nakagawa, Tomohiro Yamazaki, Taro Mannen, Tetsuro Hirose

Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society 33(2) 382-401 2021年6月3日査読有り筆頭著者責任著者
Forced isoform switching of Neat1_1 to Neat1_2 leads to the loss of Neat1_1 and the hyperformation of paraspeckles but does not affect the development and growth of mice.

Isobe M, Toya H, Mito M, Chiba T, Asahara H, Hirose T, Nakagawa S

RNA (New York, N.Y.) 26(3) 251-264 2020年3月査読有り最終著者責任著者
UPA-seq: prediction of functional lncRNAs using differential sensitivity to UV crosslinking.

Taiwa Komatsu, Saori Yokoi, Koichi Fujii, Mari Mito, Yusuke Kimura, Shintaro Iwasaki, Shinichi Nakagawa

RNA (New York, N.Y.) 24(12) 1785-1802 2018年12月査読有り最終著者責任著者
Molecular dissection of nuclear paraspeckles: towards understanding the emerging world of the RNP milieu.

Nakagawa S, Yamazaki T, Hirose T

Open biology 8(10) 2018年10月査読有り筆頭著者責任著者
Cell Type-Specific Survey of Epigenetic Modifications by Tandem Chromatin Immunoprecipitation Sequencing.

Mari Mito, Mitsutaka Kadota, Kaori Tanaka, Yasuhide Furuta, Kuniya Abe, Shintaro Iwasaki, Shinichi Nakagawa

Scientific reports 8(1) 1143-1143 2018年1月18日査読有り筆頭著者責任著者
Control of Chromosomal Localization of Xist by hnRNP U Family Molecules

Takehisa Sakaguchi, Yuko Hasegawa, Neil Brockdorff, Ken Tsutsui, Kimiko M. Tsutsui, Takashi Sado, Shinichi Nakagawa

DEVELOPMENTAL CELL 39(1) 11-12 2016年10月査読有り
Structural, super-resolution microscopy analysis of paraspeckle nuclear body organization

Jason A. West, Mari Mito, Satoshi Kurosaka, Toru Takumi, Chiharu Tanegashima, Takeshi Chujo, Kaori Yanaka, Robert E. Kingston, Tetsuro Hirose, Charles Bond …

JOURNAL OF CELL BIOLOGY 214(7) 817-830 2016年9月査読有り
Gomafu IncRNA knockout mice exhibit mild hyperactivity with enhanced responsiveness to the psychostimulant methamphetamine

Joanna Y. Ip, Masamitsu Sone, Chieko Nashiki, Qun Pan, Kiyoyuki Kitaichi, Kaori Yanaka, Takaya Abe, Keizo Takao, Tsuyoshi Miyakawa, Benjamin J. Blencowe …

SCIENTIFIC REPORTS 6 27204 2016年6月査読有り
Simultaneous multicolor detection of RNA and proteins using super-resolution microscopy

Mari Mito, Tetsuya Kawaguchi, Tetsuro Hirose, Shinichi Nakagawa

METHODS 98 158-165 2016年4月査読有り
Regulation of gene expression via retrotransposon insertions and the noncoding RNA 4.5S RNA(H)

Kentaro Ishida, Kenjyo Miyauchi, Yuko Kimura, Mari Mito, Shunpei Okada, Tsutomu Suzuki, Shinichi Nakagawa

GENES TO CELLS 20(11) 887-901 2015年11月査読有り
Lessons from reverse-genetic studies of lncRNAs.

Nakagawa S

Biochimica et biophysica acta 1859(1) 177-183 2015年6月査読有り
Formation of nuclear bodies by the lncRNA Gomafu-associating proteins Celf3 and SF1

Akira Ishizuka, Yuko Hasegawa, Kentaro Ishida, Kaori Yanaka, Shinichi Nakagawa

GENES TO CELLS 19(9) 704-721 2014年9月査読有り
Paraspeckle nuclear bodies-useful uselessness?

Shinichi Nakagawa, Tetsuro Hirose

CELLULAR AND MOLECULAR LIFE SCIENCES 69(18) 3027-3036 2012年9月査読有り
Malat1 is not an essential component of nuclear speckles in mice

Shinichi Nakagawa, Joanna Y. Ip, Go Shioi, Vidisha Tripathi, Xinying Zong, Tetsuro Hirose, Kannanganattu V. Prasanth

RNA-A PUBLICATION OF THE RNA SOCIETY 18(8) 1487-1499 2012年8月査読有り
eXIST with matrix-associated proteins

Shinichi Nakagawa, Kannanganattu V. Prasanth

TRENDS IN CELL BIOLOGY 21(6) 321-327 2011年6月査読有り
Competition between a noncoding exon and introns: Gomafu contains tandem UACUAAC repeats and associates with splicing factor-1

Hitomi Tsuiji, Rei Yoshimoto, Yuko Hasegawa, Masaaki Furuno, Minoru Yoshida, Shinichi Nakagawa

GENES TO CELLS 16(5) 479-490 2011年5月査読有り
Paraspeckles are subpopulation-specific nuclear bodies that are not essential in mice

Shinichi Nakagawa, Takao Naganuma, Go Shioi, Tetsuro Hirose

JOURNAL OF CELL BIOLOGY 193(1) 31-39 2011年4月査読有り
The Matrix Protein hnRNP U Is Required for Chromosomal Localization of Xist RNA

Yuko Hasegawa, Neil Brockdorff, Shinji Kawano, Kimiko Tsutui, Ken Tsutui, Shinichi Nakagawa

DEVELOPMENTAL CELL 19(3) 469-476 2010年9月査読有り

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MISC

104

メダカを用いたmalat1の機能解析

横井佐織, 水戸麻里, 岩崎信太郎, 中川真一

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 45th 2022年
メダカをモデルとした行動に関わる性格の分子神経基盤解析

田中豪, 成瀬清, 郷康広, 辰本将司, 豊田敦, 勝村啓史, 中川真一, 横井佐織

日本神経化学会大会抄録集(Web) 65th 2022年
【相分離メカニズムと疾患"膜のないオルガネラ"はいかに機能するか?神経変性疾患・ウイルス感染とどう関わるか?】(第2章)相分離と細胞内構造核内の非膜オルガネラ Cajal bodyの多機能性と柔軟性の包括的理解

大峽咲希, 中川真一, 米田宏

実験医学 39(10) 1509-1514 2021年6月
細胞内ティール組織化:マルチバレント相互作用と相分離が織りなす細胞内プロセスの理解ティール相互作用によって作られる核内非膜オルガネラの形成機構

中川真一, 大峽咲希, 米田宏

日本細胞生物学会大会講演要旨集 72回 W2-4 2020年6月
【イメージング時代の構造生命科学細胞の動態、膜のないオルガネラ、分子の構造変化をトランススケールに観る】(第2章)構造生命科学からトランススケール・イメージングによる細胞動態学へトランススケールな解析が待たれる生命科学の未解決課題 RNAを含む非膜構造体の内部微細構造観察と天然変性領域の役割

中川真一

実験医学 38(5) 762-768 2020年3月
配偶者選択におけるオキシトシンの役割の性的二形性

横井佐織, 成瀬清, 亀井保博, 安齋賢, 木下政人, 水戸麻理, 岩崎信太郎, 井ノ上俊太郎, 奥山輝大, 中川真一 …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 43rd 2020年
パラスペックル:RNAを骨格として形成されるミクロ相分離構造体

山崎智弘, 山本哲也, 吉野彪羅, 高桑央, 高桑央, SOUQUERE Sylvie, 中川真一, PIERRON Gerard, 廣瀬哲郎

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 43rd 2020年
長鎖ノンコーディングRNAであるGomafuの核内繋留機構におけるSF3b2の寄与の解明

上原理加, 梅本銀河, 中川真一, 吉田稔, 服部光治, 築地仁美

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 92回 [2P-242] 2019年9月
核内構造体パラスペックルの生理機能

中川真一

臨床神経学 58(Suppl.) S56-S56 2018年12月
UPA‐Seq:UVへの感受性を利用した機能性lncRNAの同定

中川真一, 小松太和, 水戸麻理, 竹本愛菜, 藤居光一, 岩崎信太郎

日本RNA学会年会要旨集 20th 40 2018年7月9日
核内構造体パラスペックルはNEAT1 IncRNAの複数の機能ドメインにより構築される

山崎智弘, Souquere Sylvie, 木立尚孝, Fox Archa, 中川真一, Gerard Pierron, 廣瀬哲郎

生命科学系学会合同年次大会 2017年度 [1P-0764] 2017年12月
分子共生-RNAタンパク質相互作用による機能創発 UV照射に対する異なる感受性を利用した新規機能的lncRNA候補の同定(Identification of novel functional IncRNA candidates using differential sensitivities to UV-irradiation)

中川真一

生命科学系学会合同年次大会 2017年度 [4AW09-7] 2017年12月
DISTURBED EXPRESSION OF IMMUNOREGULATORY LONG NONCODING RNAS IN CIRCULATING IMMUNE CELLS FROM PATIENTS WITH EARLY MYOCARDIAL INFARCTION

Wolfgang Poller, Martina Gast, Shinichi Nakagawa, Jan Haas, Andrea Stroux, Christian Mueller, Daniela Boernigen, Dirk Westermann, Carsten Skurk, Ursula Rauch-Kroehnert …

JOURNAL OF THE AMERICAN COLLEGE OF CARDIOLOGY 69(11) 2036-2036 2017年3月
DEFICIENCY OF LONG NONCODING RNA MALAT1 CAUSES IMMUNE SYSTEM DEREGULATION AND ACCELERATED ATHEROSCLEROSIS IN APO E-/- MICE

Wolfgang Poller, Martina Gast, Bernhard Rauch, Shinichi Nakagawa, Kannanganattu Prasanth, Andrea Stroux, Jan Haas, Benjamin Meder, Carsten Skurk, Ursula Rauch-Kroehnert …

JOURNAL OF THE AMERICAN COLLEGE OF CARDIOLOGY 69(11) 2031-2031 2017年3月
Lessons from reverse-genetic studies of lncRNAs

Shinichi Nakagawa

Biochimica et Biophysica Acta - Gene Regulatory Mechanisms 1859(1) 177-183 2016年1月1日
Clues to long noncoding RNA taxonomy

Tetsuro Hirose, Shinichi Nakagawa

BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENE REGULATORY MECHANISMS 1859(1) 1-2 2016年1月
ncRNA研究をはじめよう 6.RNA細胞内局在の高解像度解析

水戸麻理, 中川真一

実験医学 33(20) 3402-3406 2015年12月10日
長鎖ノンコーディングRNAのマイルストーン研究核内構造体lncRNA 13.染色体機能とlncRNA

若井道仁, 中川真一

実験医学 33(20) 3296-3297 2015年12月10日
長鎖ノンコーディングRNAのマイルストーン研究その他のlncRNA関連トピック 17.lncRNA複合体解析法の登場

中川真一

実験医学 33(20) 3304-3305 2015年12月10日
長鎖ノンコーディングRNAのマイルストーン研究その他のlncRNA関連トピック 19.lncRNA解析の問題点と遺伝学的解析

中川真一

実験医学 33(20) 3308-3309 2015年12月10日

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書籍等出版物

ノンコーディングRNAテキストブック : 最新の医学・創薬研究、方法論とマイルストーン論文200報

塩見美喜子, 中川真一, 浅原弘嗣

羊土社 2015年 (ISBN: 9784758103510)

講演・口頭発表等

Preferential association of prion-like-domain-containing RNA binding proteins to functional lncRNA candidates

中川真一

2018年11月30日招待有り
Prediction of functional lncRNAs using UPA-seq

中川真一

CSHL Asia 2018年10月31日
UPA‐Seq:UVへの感受性を利用した機能性lncRNAの同定

中川真一, 小松太和, 水戸麻理, 竹本愛菜, 藤居光一, 岩崎信太郎

日本RNA学会年会要旨集 2018年7月9日
Attempts towards identification of novel functional lncRNAs

中川真一

EMBO workshop 2018年4月11日
Towards Identification of Novel Functional Long noncoding RNAs

中川真一

Kumamoto Key Forum 2018年1月12日
核内構造体パラスペックルの生理機能

中川真一

日本神経学会学術大会プログラム・抄録集 2018年
Identification of novel functional lncRNA candidates using differential sensitivities to UV-irradiation

中川真一

ConBio 2017 2017年12月9日招待有り
長鎖ノンコーディングRNAの個体レベルでの機能解析

中川真一

第6回生命医薬情報学連合大会 2017年9月29日招待有り
UV‐Phenol RNA‐seqによる機能性長鎖非コードRNAの同定

小松太和, 小松太和, 中川真一

日本RNA学会年会要旨集 2017年7月19日
Observation of sub-micron size nuclear bodies using super-resolution microscopy

中川真一

The 43th 内藤コンファレンス「Noncoding RNA: Biology, Chemistry, & Diseases」 2017年6月29日招待有り
Fine structural analyses of nuclear body paraspeckle using SIM

中川真一

第50回日本発生生物学会年会 2017年5月10日
「長鎖ノンコーディングRNAにできること~マウスからのメッセージ」

中川真一

千里ライフサイエンスセミナー講演要旨集 2017年
Observation of nuclear bodies using super-resolution microscopy

Shinichi Nakagawa

第39回日本分子生物学会年会 2016年12月1日招待有り
核内構造体パラスペックルの生理機能と微細構造解析

中川真一

第53回日本生化学会北海道支部例会 2016年7月8日
RNAと生命現象長鎖ノンコーディングRNAによる妊孕性の制御

中川真一

日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会 2015年12月
核内構造体を形成する長鎖ノンコーディングRNAの生理機能解析

中川真一

日本核酸医薬学会年会講演要旨集 2015年11月15日
超解像顕微鏡による核内構造体パラスペックルの微細構造観察

中川真一, 水戸麻理, 廣瀬哲郎

日本RNA学会年会要旨集 2015年7月15日
hnRNP Uにより制御される新規インプリンティング遺伝子の同定

長谷川優子, 中川真一

日本RNA学会年会要旨集 2014年7月23日
レトロトランスポゾンSINE B1と相同配列を持つ核内ノンコーディングRNAによるグローバルな遺伝子発現制御

中川真一, 石田賢太郎

日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 2013年8月31日
核内構造体パラスペックルはGAリッチな配列を含むイントロンを繋留している

WEST Jason, 工樂樹洋, KINGSTON Robert, 廣瀬哲郎, 中川真一

日本RNA学会年会要旨集 2013年7月24日

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担当経験のある科目(授業)

共同研究・競争的資金等の研究課題

マウス変異体を用いた非ドメイン型RNAの生理機能解析

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2021年9月 - 2026年3月

中川真一, 荒木喜美
非ドメイン型バイオポリマー領域の組織運営

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2021年9月 - 2026年3月

中川真一, 廣瀬哲郎, 尾山大明, 稲田利文, 荒川和晴, 甲斐歳恵, 依田隆夫, 伊藤拓宏, 泊幸秀
非ドメイン型バイオポリマーの生物学：生物の柔軟な機能獲得戦略

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2021年9月 - 2026年3月

中川真一
超天然変性タンパク質の個体レベルでの生理機能解析

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2021年7月 - 2024年3月

中川真一, 泊幸秀
反応場に着目したpiRNA経路の生化学的解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(S) 2018年6月 - 2023年3月

泊幸秀, 中川真一
逆遺伝学スクリーニングを用いた新規長鎖ノンコーディングRNAの生理機能解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2017年4月 - 2022年3月

中川真一, 横井佐織
ノンコーディングRNAネオタクソノミの実現を加速する国際活動支援

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2015年11月 - 2019年3月

廣瀬哲郎, 中川真一, 淺原弘嗣, 泊幸秀, 鈴木勉, 塩見美喜子, 影山裕二
ネオタクソノミに応じたncRNAの生理機能の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2014年7月 - 2019年3月

中川真一
非コードRNA作用マシナリー

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2009年7月 - 2014年3月

泊幸秀, 影山裕二, 鈴木健夫, 程久美子, 中澤敬信, 和田猛, 佐渡敬, 塩見美喜子, 宮川さとみ, 中川真一, 竹下文隆, 小田健昭, 山下暁朗, 西村教子
レトロトランスポゾン挿入配列によるmRNAの局在・代謝制御機構の解析

文部科学省科学研究費補助金(挑戦的萌芽研究) 挑戦的萌芽研究 2012年 - 2012年

中川真一
核マトリクス・ノンコーディングRNA複合体によるエピジェネティックな発現制御解析

文部科学省科学研究費補助金(基盤研究(B)) 基盤研究(B) 2011年 - 2012年

中川真一
スプライシング因子の新機能に関する化学遺伝学研究

文部科学省科学研究費補助金(基盤研究(S)) 基盤研究(S) 2009年 - 2012年

吉田稔, 中川真一
遺伝学的アプローチによる高分子非コードRNAマシナリーの生理機能解析

文部科学省科学研究費補助金(新学術領域研究(研究領域提案型)) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2009年 - 2012年

影山裕二, 中川真一
網膜の幹細胞を維持する分子メカニズムの解明

文部科学省科学研究費補助金(基盤研究(C)) 基盤研究(C) 2007年 - 2009年

中川真一
網膜の予定神経節細胞の核に局在するノンコーディングRNAの機能解析

文部科学省科学研究費補助金(特定領域研究) 特定領域研究 2005年 - 2006年

中川真一
中枢神経系の層形成を制御する分子メカニズムの研究

文部科学省科学研究費補助金(基盤研究(C)) 基盤研究(C) 2004年 - 2006年

中川真一
中枢神経系の層形成時に細胞タイプ特異的に発現する新規遺伝子の機能解析

文部科学省科学研究費補助金(特定領域研究) 特定領域研究 2005年 - 2005年

中川真一
中枢神経系の層形成過程においてニューロンが特定の層を認識する分子メカニズムの研究

文部科学省科学研究費補助金(特定領域研究) 特定領域研究 2003年 - 2004年

中川真一
中枢神経系に見られる層構造の形成機構の解析

文部科学省科学研究費補助金(基盤研究(C)) 基盤研究(C) 2001年 - 2003年

中川真一

中川真一

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研究キーワード

研究分野

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主要な論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

共同研究・競争的資金等の研究課題

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