白水美香子 (Mikako Shirouzu) - マイポータル

基本情報

所属: 国立研究開発法人理化学研究所生命機能科学研究センターチームリーダー

J-GLOBAL ID: 201801012321580480
researchmap会員ID: B000306707

研究分野

ライフサイエンス / 構造生物化学 /

論文

450

Structural insights into promoter-proximal pausing of RNA polymerase II at +1 nucleosome.

Masahiro Naganuma, Tomoya Kujirai, Haruhiko Ehara, Tamami Uejima, Tomoko Ito, Mie Goto, Mari Aoki, Masami Henmi, Sayako Miyamoto-Kohno, Mikako Shirouzu …

Science advances 11(10) eadu0577 2025年3月7日
Identification of benzimidazole-6-carboxamide based inhibitors of secretory glutaminyl cyclase for the treatment of Alzheimer's disease

K.V. Dileep, Naoki Sakai, Kentaro Ihara, Akiko Nakata, Akihiro Ito, Divya M. Sivaraman, Chi Wai Yip, Jay W. Shin, Minoru Yoshida, Mikako Shirouzu …

International Journal of Biological Macromolecules 293 139320-139320 2025年3月
Heme regulates protein interactions and phosphorylation of BACH2 intrinsically disordered region in humoral response

Miki Watanabe-Matsui, Shun Kadoya, Kei Segawa, Hiroki Shima, Tadashi Nakagawa, Yuko Nagasawa, Shuichiro Hayashi, Mitsuyo Matsumoto, Mariko Ikeda, Akihiko Muto …

iScience 28(1) 111529-111529 2025年1月
Carotenoid pigments enhance rhodopsin-mediated phototrophy by light-harvesting and photocycle-accelerating

Takayoshi Fujiwara, Toshiaki Hosaka, Masumi Hasegawa-Takano, Yosuke Nishimura, Kento Tominaga, Kaho Mori, Satoshi Nishino, Yuno Takahashi, Tomomi Uchikubo-Kamo, Kazuharu Hanada …

2024年11月9日
Structural basis for the effects of Ser387 phosphorylation of MgcRacGAP on its GTPase-activating activities for CDC42 and RHOA.

Kazutaka Murayama, Miyuki Kato-Murayama, Toshiaki Hosaka, Toshio Kitamura, Shigeyuki Yokoyama, Mikako Shirouzu

Journal of structural biology 108151-108151 2024年11月8日
A tRNA modification with aminovaleramide facilitates AUA decoding in protein synthesis

Kenjyo Miyauchi, Satoshi Kimura, Naho Akiyama, Kazuki Inoue, Kensuke Ishiguro, Thien-Son Vu, Veerasak Srisuknimit, Kenta Koyama, Gosuke Hayashi, Akiko Soma …

Nature Chemical Biology 2024年9月19日
Structure-based development of novel substrate-type G9a inhibitors as epigenetic modulators for sickle cell disease treatment.

Yosuke Nishigaya, Shohei Takase, Tatsunobu Sumiya, Tomohiro Sato, Hideaki Niwa, Shin Sato, Akiko Nakata, Seiji Matsuoka, Yuki Maemoto, Noriaki Hashimoto …

Bioorganic & medicinal chemistry letters 110 129856-129856 2024年9月15日
E22G Aβ40 fibril structure and kinetics illuminate how Aβ40 rather than Aβ42 triggers familial Alzheimer's.

Mohammad Jafar Tehrani, Isamu Matsuda, Atsushi Yamagata, Yu Kodama, Tatsuya Matsunaga, Mayuko Sato, Kiminori Toyooka, Dan McElheny, Naohiro Kobayashi, Mikako Shirouzu …

Nature communications 15(1) 7045-7045 2024年8月15日
Structure of a phosphodiesterase from Streptomyces sanglieri with a novel C-terminal domain.

Kazutaka Murayama, Toshiaki Hosaka, Mikako Shirouzu, Daisuke Sugimori

Biochemical and biophysical research communications 708 149784-149784 2024年5月14日
Structural analyses of the GI.4 norovirus by cryo-electron microscopy and X-ray crystallography revealing binding sites for human monoclonal antibodies.

Tomomi Kimura-Someya, Kazushige Katsura, Miyuki Kato-Murayama, Toshiaki Hosaka, Tomomi Uchikubo-Kamo, Kentaro Ihara, Kazuharu Hanada, Shin Sato, Kazutaka Murayama, Michiyo Kataoka …

Journal of virology 98(5) e0019724 2024年5月14日
The luciferase-based in vivo protein–protein interaction assay revealed that CHK1 promotes PP2A and PME-1 interaction

Sana Ando, Keiko Tanaka, Maharu Matsumoto, Yuki Oyama, Yuri Tomabechi, Atsushi Yamagata, Mikako Shirouzu, Reiko Nakagawa, Noriaki Okimoto, Makoto Taiji …

Journal of Biological Chemistry 300(5) 107277-107277 2024年5月
Structural basis for antiepileptic drugs and botulinum neurotoxin recognition of SV2A

Atsushi Yamagata, Kaori Ito, Takehiro Suzuki, Naoshi Dohmae, Tohru Terada, Mikako Shirouzu

Nature Communications 15(1) 2024年4月18日
1H, 13C, and 15N resonance assignments and solution structure of the N-terminal divergent calponin homology (NN-CH) domain of human intraflagellar transport protein 54

Kanako Kuwasako, Weirong Dang, Fahu He, Mari Takahashi, Kengo Tsuda, Takashi Nagata, Akiko Tanaka, Naohiro Kobayashi, Takanori Kigawa, Peter Güntert …

Biomolecular NMR Assignments 18(1) 71-78 2024年3月29日
Structural insights into the decoding capability of isoleucine tRNAs with lysidine and agmatidine

Naho Akiyama, Kensuke Ishiguro, Takeshi Yokoyama, Kenjyo Miyauchi, Asuteka Nagao, Mikako Shirouzu, Tsutomu Suzuki

Nature Structural & Molecular Biology 2024年3月27日
Molecular basis of ligand recognition specificity of flavone glucosyltransferases in Nemophila menziesii.

Kazutaka Murayama, Miyuki Kato-Murayama, Toshiaki Hosaka, Naoko Okitsu, Yoshikazu Tanaka, Mikako Shirouzu

Archives of biochemistry and biophysics 753 109926-109926 2024年3月
A macrocyclic kinase inhibitor overcomes triple resistant mutations in EGFR-positive lung cancer

Mai Suzuki, Ken Uchibori, Tomoko Oh-hara, Yumi Nomura, Ryusei Suzuki, Ai Takemoto, Mitsugu Araki, Shigeyuki Matsumoto, Yukari Sagae, Mutsuko Kukimoto-Niino …

npj Precision Oncology 8(1) 46-46 2024年2月23日
Efficiency of transcription and translation of cell-free protein synthesis systems in cell-sized lipid vesicles with changing lipid composition determined by fluorescence measurements.

Akari Miwa, Masatoshi Wakamori, Tetsuro Ariyoshi, Yasushi Okada, Mikako Shirouzu, Takashi Umehara, Koki Kamiya

Scientific reports 14(1) 2852-2852 2024年2月3日
Boric acid intercepts 80S ribosome migration from AUG-stop by stabilizing eRF1

Mayuki Tanaka, Takeshi Yokoyama, Hironori Saito, Madoka Nishimoto, Kengo Tsuda, Naoyuki Sotta, Hideki Shigematsu, Mikako Shirouzu, Shintaro Iwasaki, Takuhiro Ito …

Nature Chemical Biology 2024年1月24日
Cyanorhodopsin-II represents a yellow-absorbing proton-pumping rhodopsin clade within cyanobacteria

Masumi Hasegawa-Takano, Toshiaki Hosaka, Keiichi Kojima, Yosuke Nishimura, Marie Kurihara, Yu Nakajima, Yoshiko Ishizuka-Katsura, Tomomi Kimura-Someya, Mikako Shirouzu, Yuki Sudo …

The ISME Journal 18(1) 2024年1月8日
A small molecule iCDM-34 identified by in silico screening suppresses HBV DNA through activation of aryl hydrocarbon receptor.

Yutaka Furutani, Yoshinori Hirano, Mariko Toguchi, Shoko Higuchi, Xian-Yang Qin, Kaori Yanaka, Yumi Sato-Shiozaki, Nobuaki Takahashi, Marina Sakai, Pornparn Kongpracha …

Cell death discovery 9(1) 467-467 2023年12月22日

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MISC

141

ノロウイルス構造解析から明らかになった抗ヒトノロウイルス抗体結合部位

染谷友美, 染谷友美, 桂一茂, 加藤(村山)美幸, 保坂俊彰, 内窪(加茂)友美, 伊原健太郎, 花田和晴, 村山和隆, 白水美香子 …

日本ウイルス学会学術集会プログラム・予稿集(Web) 70th 2023年
Structural insights into the small GTPase specificity of the DOCK guanine nucleotide exchange factors

Mutsuko Kukimoto-Niino, Kentaro Ihara, Kazutaka Murayama, Mikako Shirouzu

Current Opinion in Structural Biology 71 249-258 2021年12月1日
孔形成特性を変化させるための黄色ブドウ球菌の2成分孔形成毒素の設計

GHANEM Nouran, GHANEM Nouran, MATSUI Takashi, MATSUI Takashi, KANEKO Jun, UCHIKUBO-KAMO Tomomi, SHIROUZU Mikako, HASHIMOTO Tsubasa, OGAWA Tomohisa, OGAWA Tomohisa …

生物物理(Web) 61(Supplement 1-2) 2021年
高度好熱菌の16S rRNAシュードウリジン合成酵素遺伝子の探索

桑名祐輔, 上崎晃輔, 荒川静花, 白水美香子, 竹本千重, 横川隆志, 堀弘幸

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 44th 2021年
Targeting all transforming growth factor-b isoforms with an Fc chimeric receptor impairs tumor growth and angiogenesis of oral squamous cell cancer

Kazuki Takahashi, Yuichi Akatsu, Katarzyna A. Podyma-Inoue, Takehisa Matsumoto, Hitomi Takahashi, Yasuhiro Yoshimatsu, Daizo Koinuma, Mikako Shirouzu, Kohei Miyazono, Tetsuro Watabe

Journal of Biological Chemistry 295(36) 12559-12572 2020年9月4日
高度好熱菌シュードウリジン合成酵素遺伝子二重破壊株の作成方法の開発

桑名祐輔, 上崎晃輔, 荒川靜花, 白水美香子, 竹本千重, 横川隆志, 堀弘幸

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 43rd 2020年
C型肝炎ウイルス侵入を阻害する抗OCLN低分子抗体の創出

清水芳実, 清水芳実, 篠田雄大, 白砂圭崇, 近藤昌夫, 新屋直子, 花田賢太郎, 八木清仁, 鈴木哲朗, 脇田隆字 …

日本生化学会大会(Web) 93rd 2020年
部位特異的クロスリンクによるBRAPとリニアユビキチンの複合体化とユビキチン鎖認識部位の解析

庄司志咲子, 米持まゆ美, 井上みお, 花田和晴, 桂一茂, 白水美香子

第42回日本分子生物学会年会 3LBA-008 (web only) 2019年12月
高度好熱菌16S rRNAのアンチ・シャイン・ダルガーノ配列領域に存在する2つのシュードウリジンの合成酵素の探索

上崎晃輔, 荒川静花, 桑名祐輔, 白水美香子, 竹本千重, 堀弘幸

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 42nd 2019年
可変領域が最も長いtRNA^SerのX線結晶構造解析

竹本千重, 川添将仁, 小西史一, 横川隆志, 直枝智恵子, 苫米地由里, 板垣貴, 白水美香子, 横山茂之

日本RNA学会年会要旨集 21st 2019年
無細胞タンパク質合成系により産生したプロテインキナーゼドメインの性状評価

苫米地由里, 桂一茂, 津曲千恵美, 三國順子, 米持まゆ美, 新野睦子, 竹本千重, 白水美香子

日本生化学会大会(Web) 92nd 2019年
大腸菌無細胞タンパク質合成技術を利用した密着結合タンパク質クローディンファミリー分子の網羅的な大量調製手法

新屋直子, 篠田雄大, 桂一茂, 竹本千重, 花田和晴, 井上みお, 染谷友美, 白水美香子

日本生化学会大会(Web) 92nd 2019年
ヒトクローディン-11の立体構造解析に向けたモノクローナル抗体作製

篠田雄大, 新屋直子, 染谷友美, 白水美香子

日本生化学会大会(Web) 92nd 2019年
タンキラーゼ阻害剤の創薬研究(3):新規ジヒドロキナゾリノン誘導体の創出

鷲塚健一, 白井文幸, 八代田陽子, 幸瞳, 丹羽英明, 佐藤心, 安倍昌子, 大貫哲男, 眞崎唯, 平間千津子 …

メディシナルケミストリーシンポジウム講演要旨集 37th 2019年
タンキラーゼ阻害剤の創薬研究(1):細胞増殖阻害活性改善を指向した誘導体合成

甲田泰子, 白井文幸, 水谷アンナ, 八代田陽子, 津村武史, 狩野ゆうこ, 近田翼, 村松由起子, 幸瞳, 丹羽英明 …

メディシナルケミストリーシンポジウム講演要旨集 37th 2019年
タンキラーゼ阻害剤の創薬研究(2):経口投与で抗腫瘍効果を示すスピロインドリノン誘導体RK582の創製

白井文幸, 水谷アンナ, 八代田陽子, 津村武史, 狩野ゆうこ, 近田翼, 村松由起子, 幸瞳, 丹羽英明, 佐藤心 …

メディシナルケミストリーシンポジウム講演要旨集 37th 2019年
FMO計算によるH‐PGDS阻害剤及び結晶水の相互作用解析

高谷大輔, 伊中浩治, 大村明史, 竹貫健二, 河西真史, 矢吹有香子, 中川ゆかり, 津金沢恵子, 小川直子, 渡邉千鶴 …

構造活性相関シンポジウム講演要旨集 46th 61‐62 2018年12月
IkB-betaはIKK2との分子間相互作用性がIkB-alphaとは明確に異なる

庄司志咲子, 花田和晴, 米持まゆ美, 白水美香子

第91回日本生化学会大会 1P-382(WEB only) 2018年9月
ユビキチンリガーゼBRAPのRNF52ドメインによるオリゴユビキチン化反応

庄司志咲子, 花田和晴, 大沢登, 白水美香子

日本ケミカルバイオロジー学会第13回年会 PB-71 2018年6月
ヒト由来ミトコンドリア外膜タンパク質Voltage-dependent anion channel 1(VDAC1)の結晶構造解析とオリゴマー形成

保坂俊彰, 岡崎正晃, 岡崎正晃, 染谷友美, 桂芳子, 伊東夏織, 横山茂之, どど孝介, どど孝介, 袖岡幹子 …

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 18th 2018年

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共同研究・競争的資金等の研究課題

クライオ電顕によるDOCKシグナロソームの動的構造の解明

科学技術振興機構戦略的な研究開発の推進戦略的創造研究推進事業 CREST 2022年 - 2027年

白水美香子
リボソームRNA複合体による無機栄養感知機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2014年4月 - 2017年3月

田中真幸, 白水美香子, 横山武司
LAMP2を標的としたリソソーム細胞内輸送のブロッキングによる顎骨吸収の抑制

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2013年4月 - 2017年3月

横山三紀, 坂本健作, 白水美香子, 寺澤和恵, KA 井上
ＨＬＡクラスＩ／ＩＩ分子の高次構造解析

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2010年4月 - 2015年3月

横山茂之, 白水美香子, 本間光貴
RasによるRafの活性化機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業奨励研究(A) 1998年 - 1999年

白水美香子
Ras蛋白質によるターゲット活性化のメカニズム

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究(A) 1998年 - 1998年

横山茂之, 白水美香子
Rasタンパク質によるターゲット活性化のメカニズム

日本学術振興会科学研究費助成事業重点領域研究 1997年 - 1997年

横山茂之, 白水美香子
阻害因子の設計をめざした細胞内情報伝達の制御ネットワークの解析

日本学術振興会科学研究費助成事業奨励研究(A) 1996年 - 1996年

白水美香子
発癌型Rasに特徴的な細胞内情報伝達機構の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業重点領域研究 1996年 - 1996年

横山茂之, 白水美香子

産業財産権

特開2021-017413 ヒトTGF-βのLAP断片に対する抗体及びその利用

井上育代, 小嶋聡一, 白水美香子, 津曲千恵美, 松本武久, 齊藤隆, 竹森利忠, 松浦知和, 政木隆博, 三浦雅央, 須藤浩三
特開2018-050536 芳香族アシル基転移酵素遺伝子及びその使用

興津奈央子, 田中良和, 白水美香子, 村山和隆, 横山茂之
WO2017-022696 膜タンパク質の製造方法およびその利用

横山茂之, 篠田雄大, 伊東夏織, 野村直子, 桂芳子, 染谷友美, 白水美香子, 堀哲哉, 中村祥浩, 田辺弘明
特許第6749589号抗Eva1タンパク質抗体

竹森利忠, 白水美香子, 田中実穂, 上島珠美, 近藤亨
特許第5704677号膜タンパク質の製造方法

横山茂之, 下野和実, 白水美香子, 五島美絵
特許第4838957号無細胞タンパク質合成系を用いたタンパク質の製造方法

田島夏織, 木川隆則, 白水美香子, 矢吹孝, 石原豪史, 横山茂之
特許第4477923号無細胞タンパク質合成用抽出液の製造方法及びその方法により製造される細胞抽出液

松田夏子, 木川隆則, ナムチップ, チュンポルクルウォン, 竹本千重, 白水美香子, 田仲昭子, 横山茂之
特許第4467435号非天然型チロシン誘導体組み込みタンパク質の発現方法

横山茂之, 白水美香子, 坂本恵香, 坂本健作
特許第4441170号 S12リボソームタンパク質に変異を有する大腸菌細胞抽出液及びそれを用いる無細胞系によるタンパク質の製造方法

ナムチップ, チュンポルクルウォン, 堀千重, 横山茂之, 白水美香子, 木川隆則, 越智幸三, 保坂毅
特許第4359707号チオレドキシン融合タンパク質発現ベクターを用いた無細胞タンパク質合成系によるタンパク質の製造方法

白水美香子, 石原豪史, 佐伯美帆呂, 五島美絵, 田島夏織, 木川隆則, 横山茂之
WO2009-060857 膜タンパク質の製造方法

横山茂之, 下野和実, 白水美香子, 五島美絵
特開2008-167738 2型ヒスタミン受容体タンパク質に結合し2型ヒスタミン受容体とヒスタミンとの結合を阻止し得るモノクローナル抗体

渡邊武, 横山茂之, 白水美香子, 寺田貴帆, 下野和実
特開2007-223916 抗菌剤

横山茂之, 安室憲一, 大貫裕之, 山崎瑞枝, 佐藤万仁, 小野寺賢司, 白水美香子, 廣田洋
特開2005-341803 非対称な塩基配列を認識して切断する酵素I−CsmI及びその製造方法

別所義隆, 柴田理恵, 白水美香子, 横山茂之, 大濱武, 黒川さゆり
特開2005-229874 BAG3ドメインポリペプチド及びその用途

林文晶, 白水美香子, 新井亮一, 廣田洋, 佐藤万仁, 横山茂之, 林崎良英
特開2005-229876 BAG5ドメインポリペプチド及びその用途

林文晶, 白水美香子, 高木哲雄, 廣田洋, 佐藤万仁, 横山茂之, 林崎良英
特許第3668942号アフリカツメガエル卵母細胞抽出液を用いるタンパク質合成システム

白水美香子, アレクサンダー, トクマコフ, 横山茂之
特開2005-006646 無細胞タンパク質合成用抽出液の製造方法及びその方法により製造される細胞抽出液

松田夏子, 木川隆則, ナムチップ, チュンポルクルウォン, 竹本千重, 白水美香子, 田仲昭子, 横山茂之
特開2004-173627 S12リボソームタンパク質に変異を有する大腸菌細胞抽出液及びそれを用いる無細胞系によるタンパク質の製造方法

ナムチップ, チュンポルクルウォン, 堀千重, 横山茂之, 白水美香子, 木川隆則, 越智幸三, 保坂毅
WO2004-039989 非天然型アミノ酸組み込みタンパク質の発現方法

横山茂之, 白水美香子, 坂本恵香, 坂本健作

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