谷口昇志 (Shoji Taniguchi) - マイポータル

基本情報

所属: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構作物研究部門, 作物デザイン研究領域, スマート育種システムグループ研究員

学位: 博士（農学）(2021年4月東京大学大学院農学生命科学研究科)

研究者番号: 30914915
J-GLOBAL ID: 202101018967964948
researchmap会員ID: R000031865

学部での専門は農村開発 (Rural development)と国際協力。

大学院では生物測定学を専攻し、日本列島の淡水域に生息する魚類個体群の遺伝的空間構造や漁獲量の解析に取り組む。

博士号取得とともに農研機構に入構、現在はイネなど作物育種を対象にゲノミック予測やリモセン時系列データ分析などを行っている。

研究キーワード

研究分野

経歴

2026年4月 - 現在

国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 作物研究部門, 作物デザイン研究領域, スマート育種システムグループ, 研究員
2025年11月 - 2026年3月

国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 作物研究部門, ゲノム育種支援室
2021年9月 - 2025年10月

国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 基盤技術研究本部農業情報研究センター多変量解析ユニット, 研究員
2021年4月 - 2021年9月

国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 作物研究部門スマート育種基盤研究領域育種ビッグデータ整備利用グループ, 研究員
2019年7月 - 2020年3月

長野大学, 研究員
2018年8月 - 2018年10月

国立研究開発法人水産研究・教育機構, 研究等支援職員
2016年2月 - 2016年3月

Johannes Kepler University Linz, 短期研究滞在

学歴

2016年4月 - 2021年3月

東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 生産・環境生物学専攻
2014年4月 - 2016年3月

東京大学, 農学部, 国際開発農学専修
2012年4月 - 2014年3月

東京大学, 教養学部, 理科二類

受賞

2016年3月

学部長賞, 東京大学農学部
2015年6月

統計検定2級最優秀成績賞, 一般財団法人統計質保証推進協会

論文

Identifying where Japanese agriculture is most at risk: A longitudinal analytical framework based on municipal boundaries as of 1950 for workforce decline and aging (2005–2020)

Kazuho Funakawa, Toshihiro Sakamoto, Kohei Imamura, Mizuki Morishita, Shoji Taniguchi, Nobusuke Iwasaki, Gen Sakurai

PLOS One 21(4) e0334403-e0334403 2026年4月1日
Modelling and Using Spatial Effects in Nationwide Historical Data Improve Genomic Prediction of Rice Heading Date in Japan

Shoji Taniguchi, Takeshi Hayashi, Hiroshi Nakagawa, Kei Matsushita, Hiromi Kajiya-Kanegae, Jun-Ichi Yonemaru, Akitoshi Goto

Rice 18(1) 2025年4月11日査読有り筆頭著者
Selection of chromosome segment substitution lines with reduced grain chalkiness without yield penalty in rice

Hirofumi Fukuda, Akari Fukuda, Yasunori Nonoue, Di Guan, Noriko Kanno, Shoji Taniguchi, Ryoji Imase, Kei Matsushita, Sota Kitasaki, Yuzo Komaki …

Breeding Science 2025年3月
Phenology analysis for trait prediction using UAVs in a MAGIC rice population with different transplanting protocols

Shoji Taniguchi, Toshihiro Sakamoto, Haruki Nakamura, Yasunori Nonoue、Di Guan, Akari Fukuda, Hirofumi Fukuda, Kaede C. Wada, Takuro Ishii, Jun-Ichi Yonemaru, Daisuke Ogawa

Frontiers in Artificial Intelligence 7 2025年1月査読有り筆頭著者責任著者
Prediction of heading date, culm length, and biomass from canopy-height-related parameters derived from time-series UAV observations of rice

Shoji Taniguchi, Toshihiro Sakamoto, Ryoji Imase, Yasunori Nonoue, Hiroshi Tsunematsu, Akitoshi Goto, Kei Matsushita, Sinnosuke Ohmori, Hideo Maeda, Yoshinobu Takeuchi …

Frontiers in Plant Science 13 998803 2022年12月査読有り筆頭著者
Inferring the demographic history of Japanese eel (Anguilla japonica) from genomic data: Insights for conservation and fisheries management

Leanne Faulks, Prashant Kaushik, Shoji Taniguchi, Masashi Sekino, Reiichiro Nakamichi, Yuki Yamamoto, Hiroka Fujimori, Chiaki Okamoto, Sakie Kodama, Ayu Daryani …

Aquatic Conservation: Marine and Freshwater Ecosystems 2022年4月2日査読有り
Waves Out of the Korean Peninsula and Inter- and Intra-Species Replacements in Freshwater Fishes in Japan

Shoji Taniguchi, Johanna Bertl, Andreas Futschik, Hirohisa Kishino, Toshio Okazaki

GENES 12(2) 2021年2月査読有り筆頭著者

MISC

オンライン予測を深堀る

齋藤正博, 清水勝基, 武次広夢, 谷口昇志, 山下優樹

MIRU2025若手プログラム 2025年7月
ゲノム情報と登熟期間の気温に基づく水稲玄米品質予測モデルの開発

鈴木信裕, 谷口昇志, 林武司, 松下景, 鐘ヶ江弘美, 鐘ヶ江弘美, 中川博視, 後藤明俊, 後藤明俊

育種学研究 27 2025年
ゲノム情報,気象および空間効果に基づく交配後代集団における到穂日数,収量予測モデルの開発

後藤明俊, 後藤明俊, 谷口昇志, 林武司, 矢部志央理, 松下景, 鐘ヶ江弘美, 矢野昌裕, 米丸淳一

育種学研究 26 2024年
近年日本で育成された品種を含む水稲30品種のUAVを活用したフェノロジー特性解析

谷口昇志, 坂本利弘, 今瀬諒司, 野々上慈徳, 常松浩史, 後藤明俊, 松下景, 大森伸之介, 前田英郎, 竹内善信 …

育種学研究 24 2022年
ニホンウナギ

箱山洋, 阿部貴晃, 谷口昇志, Prashant Kaushik, 児玉紗希江, 藤森宏佳, 岡本千晶, Ayu Daryani, Angel Faye Manwong, Ishmerai Galang …

令和元年度国際漁業資源の現況 2020年3月

講演・口頭発表等

「あきだわら」と「たちはるか」のイネ単交配集団を用いた農業形質の遺伝解析

押山幸嗣, 坂本利弘, 谷口洋二郎, 山内歌子, 谷口昇志, 福田寛史, 西村泰介, 小川大輔

日本育種学会第149回講演会 2026年3月22日
米粉用品種候補系統における出穂期遺伝子の網羅的解析と東北地方北部での栽培に好適な遺伝子型組合せの検討

大森伸之介, 神田伸一郎, 須永若菜, 北澤則之, 谷口昇志, 谷口洋二郎, 田中淳一

日本育種学会第149回講演会 2026年3月22日
水稲交配後代の選抜に活用するためのゲノミック予測モデルの開発と検証

鈴木信裕, 山本英司, 谷口昇志, 松下景, 池ヶ谷智仁, 黒木慎, 鐘ヶ江弘美, 後藤明俊

日本育種学会第149回講演会 2026年3月21日
遺伝子ピラミッディングを最適化するRパッケージgpyramidの開発

谷口昇志, 清水浩晶, 田中剛, 石川吾郎, 小林史典

日本育種学会第148回講演会 2025年9月10日
ゲノム情報と登熟期間の気温に基づく水稲玄米品質予測モデルの開発

鈴木信裕, 谷口昇志, 林武司, 松下景, 鐘ヶ江弘美, 中川博視, 後藤明俊

日本育種学会第147回講演会 2025年3月20日
RパッケージphenolocropによるUAV時系列データ解析

谷口昇志, 坂本利弘, 小川大輔

日本育種学会第146回講演会 2024年9月20日
収量を落とさずに玄米品質を高めるCSSLの選抜

Hirofumi Fukuda, Akari Fukuda, Yasunori Nonoue, Di Guan, Noriko Kanno, Shoji Taniguchi, Ryoji Imase, Toshihiro Sakamoto, Shuichi Fukuoka, Jun-ichi Yonemaru, Daisuke Ogawa

イネ遺伝学・分子生物学ワークショップ2024 2024年7月
ゲノム情報、気象および空間効果に基づく交配後代集団における到穂日数、収量予測モデルの開発

後藤明俊, 谷口昇志, 林武司, 矢部志央理, 松下景, 鐘ヶ江弘美, 矢野昌裕, 米丸淳一

日本育種学会第145回講演会 2024年3月16日
Comparison of Genomic Prediction Models Using Various Training Datasets from the Country-Wide Wheat Breeding Database in Japan

Shoji Taniguchi, Yuki Nakano, Haruki Nakamura, Hiroaki Shimizu, Goro Ishikawa

Plant and Animal Genome 31 2024年1月15日
イネ全国データを対象に空間効果を考慮したゲノミック予測モデルの開発

谷口昇志, 林武司, 中川博視, 松下景, 鐘ヶ江弘美, 矢野昌裕, 米丸淳一, 後藤明俊

日本育種学会第144回講演会 2023年9月16日
ドローンリモートセンシングを活用した遺伝育種学研究

坂本利弘, 小川大輔, 米丸淳一, 常松浩史, 野々上慈徳, 菅野徳子, 谷口昇志, 中村春貴, 福田あかり

日本リモートセンシング学会第74回（令和5年度春季）学術講演会 2023年6月
水稲育種ビックデータを活用した品種ゲノム情報と気象環境情報双方による出穂期予測モデル開発

後藤明俊, 谷口昇志, 林武司, 中川博視, 松下景, 鐘ヶ江弘美, 矢野昌裕, 米丸淳一

日本育種学会第143回講演会 2023年3月18日
系譜情報グラフデータベース「Pedigree Finder」の紹介

鐘ケ江弘美, 谷口昇志, 米丸淳一

日本育種学会第142回講演会 2022年9月23日
形質値のシミュレーションによるイネ交配後代集団のゲノミック予測手法の検証

谷口昇志, 林武司, 鐘ヶ江弘美, 松下景, 矢野昌裕, 米丸淳一, 後藤明俊

日本育種学会第142回講演会 2022年9月23日
水稲ヒストリカルデータを用いた交配シミュレーターの作成と実測値をもちいた検証

後藤明俊, 林武司, 谷口昇志, 鐘ヶ江弘美, 松下景, 菊井玄一郎, 矢野昌裕, 米丸淳一

日本育種学会第141回講演会 2022年3月21日
近年日本で育成された品種を含む水稲30品種のUAVを活用したフェノロジー特性解析

谷口昇志, 坂本利弘, 今瀬諒司, 野々上慈徳, 常松浩史, 後藤明俊, 松下景, 大森伸之介, 前田英郎, 竹内善信, 石井卓朗, 鐘ヶ江弘美, 米丸淳一, 小川大輔

日本育種学会第141回講演会 2022年3月20日
Impacts of Kuroshio on the annual fluctuation of the glass eel recruitment to Japan

谷口昇志, 岡本千晶, 藤森宏佳, 児玉紗希江, 清水学, 箱山洋

第66日本生態学会全国大会 2019年3月17日
Island biogeography of Candidia temminckii, a freshwater fish, suggests intraspecific replacements

Shoji Taniguchi, Johanna Bertl, Andreas Futschik, Hirohisa Kishino, Toshio Okazaki

SMBE2018 2018年6月11日
同一種内の淡水魚の個体群間の置き換わりで生じる地理的分断の検出

谷口昇志, 岡崎登志夫, Johanna Bertl, Andreas Futschik, 岸野洋久

日本進化学会第19回大会 2017年8月24日
大陸からの侵入淡水魚による置き換りの推定: 分子系統地理的前向きシミュレーションによるアプローチ

谷口昇志, 指田昌樹, 岡崎登志夫, 田祥麟, Johanna Bertl, Andreas Futschik, 岸野洋久

日本生態学会第64回全国大会 2017年3月16日

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所属学協会

Works(作品等)

Rパッケージgpyramid

谷口昇志

2025年7月24日コンピュータソフト
Rパッケージphenolocrop

谷口昇志

2023年3月28日コンピュータソフト

共同研究・競争的資金等の研究課題

気候変動適応の社会実装に向けた総合的研究（S24）

環境再生保全機構環境研究総合推進費気候変動に対する地域単位の包括的な適応戦略の解析・創出（S24テーマ2） 2025年4月
みどりの品種開発加速化プロジェクト

農林水産省委託プロジェクト研究 2023年4月 - 2025年3月
水産資源調査・評価推進事業（ウナギユニット）

水産庁 2019年7月 - 2020年3月