阪口翔太 (Shota Sakaguchi) - マイポータル

基本情報

所属: 京都大学大学院人間・環境学研究科助教

学位: 博士（農学）(京都大学)

J-GLOBAL ID: 201301041797877840
researchmap会員ID: B000232840

外部リンク: https://sites.google.com/site/shota0060/

研究キーワード

研究分野

経歴

2015年11月 - 現在

京都大学大学院, 人間・環境学研究科, 助教
2013年4月 - 現在

日本学術振興会特別研究員PD （東京大学）
2010年4月 - 2013年3月

日本学術振興会特別研究員DC1 （京都大学）
2008年4月 - 2013年3月

京都大学大学院農学研究科
2004年4月 - 2008年3月

京都大学農学部
京都大学大学院人間・環境学研究科, 助教

学歴

2013年4月 - 現在

日本学術振興会 PD
2008年4月 - 2013年3月

京都大学大学院, 農学研究科, 森林科学専攻
2004年4月 - 2008年3月

京都大学, 農学研究科

受賞

2022年8月

クリタ・水環境科学研究優秀賞, ダムに沈んだ絶滅危惧植物（新種ヤンバルアオヤギバナ）の保全個体群の遺伝的評価, （公財）クリタ・水環境科学振興財団

阪口翔太
2022年3月

日本植物分類学会論文賞, Functional Traits Divergence in Parallelly Evolved Rheophytic Populations of Solidago virgaurea L. Complex (Asteraceae) in Japan, 日本植物分類学会

Shota Sakaguchi, Atsushi Abe, Koki Nagasawa, Daiki Takahashi, Hiroaki Setoguchi, Masayuki Maki, Ryuta Kyan, Takako Nishino, Naoko Ishikawa, Shun K. Hirota, Yoshihisa Suyama, Motomi Ito
2018年3月

奨励賞, 日本植物分類学会

阪口翔太
2013年3月

2013年度学生奨励賞, 日本森林学会

阪口翔太
2012年3月

2012 Best Poster Award, Ecological Society of Japan / EAFES

阪口翔太
2011年3月

第11回Ecological Research論文賞, 日本生態学会

阪口翔太
2009年3月

第56回大会・最優秀ポスター賞, 日本生態学会

阪口翔太
2008年3月

2008 優秀ポスター賞, 日本生態学会

阪口翔太

論文

130

Unraveling enigmatic disjunctions: Population genetic analysis points to independent origins of rare rhododendrons in the Rhododendron keiskei complex (Ericaceae)

Shota Sakaguchi, Hee‐Joo Choi, Watanabe Yoichi, Daiki Takahashi, Shun K. Hirota, Masayuki Maki, Shoki Murakami, Taichi Harada, Nobuo Kobayashi, Yuji Kurashige …

TAXON 2025年2月査読有り
Surviving at the Southern Edge: The Rear-Edge Population of Viola brevistipulata var. acuminata Persisting in Disturbance-Mediated Refugium

Shota Sakaguchi, Shigeru Fukumoto, Taro Fujimura, Shun K. Hirota, Kazuki Yamamoto, Masae I. Ishihara

Acta Phytotaxonomica et Geobotanica 76(1) 1-11 2025年2月査読有り
Phylogenetic origin of dioecious Callicarpa (Lamiaceae) species endemic to the Ogasawara Islands revealed by chloroplast and nuclear whole genome analyses

Kazutoshi Masuda, Hiroaki Setoguchi, Koki Nagasawa, Suzuki Setsuko, Shosei Kubota, Shin S. Satoh, Shota Sakaguchi

Molecular Phylogenetics and Evolution 203 108234-108234 2025年2月
High‐intensity light promotes adaptive divergence of photosynthetic traits between sun‐exposed and shaded populations in Saxifraga fortunei

Kana Magota, Eiji Gotoh, Shota Sakaguchi, Hajime Ikeda, Hiroaki Setoguchi

American Journal of Botany 111(7) 2024年7月12日
Recent advances in the study of serpentine plants and ecosystems: Perspectives from the 10th International Conference on Serpentine Ecology, France

Antony van der Ent, Shota Sakaguchi, Robert S. Boyd, Nishanta Rajakaruna, A. Joseph Pollard, Takafumi Mizuno, Sandrine Isnard, Cristina Gonnelli, Guillaume Echevarria

Ecological Research 39(4) 411-415 2024年7月
Gamblea innovans f. simplicifolia (Araliaceae), a new form discovered in Honshu, Japan

Sakaguchi, S, Fukumoto, S, Yamasaki, M

Acta Phytotaxonomica et Geobotanica 75 113-115 2024年7月査読有り筆頭著者
Deer grazing drove an assemblage‐level evolution of plant dwarfism in an insular system

Daiki Takahashi, Yoshihisa Suyama, Keitaro Fukushima, Hiroaki Setoguchi, Shota Sakaguchi

Journal of Ecology 2024年5月8日査読有り
Phylogeographic incongruence between two related <scp>Geranium</scp> species with divergent habitat preferences in East Asia

Seikan Kurata, Shota Sakaguchi, Shun K. Hirota, Osamu Kurashima, Yoshihisa Suyama, Motomi Ito

Ecological Research 2024年3月7日
Genetic consequences of Last Glacial–Holocene changes in snowfall regime in Arnica mallotopus populations: A plant confined to heavy‐snow areas of Japan

Kazutoshi Masuda, Hiroaki Setoguchi, Koki Nagasawa, Shun K. Hirota, Yoshihisa Suyama, Kazuhiro Sawa, Shigeru Fukumoto, Masae I. Ishihara, Harue Abe, Hayato Tsuboi …

American Journal of Botany 2024年2月2日
Refugia within refugium of Geranium yesoense varieties: a follow-up study using chloroplast genome sequencing data of specimens from Mt. Asama, Japan

Seikan Kurata, Shota Sakaguchi, Osamu Kurashima, Risa Ogawa, Yoshihisa Suyama, Sachiko Nishida, Motomi Ito

Biological Journal of the Linnean Society 2024年1月2日
Evaluating the potential of interpopulation outbreeding to rescue plant populations facing reproductive failures

Shota Sakaguchi, Shigeru Fukumoto, Kazutoshi Masuda, Hiroaki Setoguchi, Shun K. Hirota, Yoshihisa Suyama, Daisuke Fujiki, Reiichi Miura, Kazuki Yamamoto, Misyo Ota …

Ecological Research 2024年
e<scp>DNA</scp> metabarcoding analysis reveals the consequence of creating ecosystem‐scale refugia from deer grazing for the soil microbial communities

Kohmei Kadowaki, Mie N. Honjo, Naoto Nakamura, Yoichiro Kitagawa, Masae I. Ishihara, Shunsuke Matsuoka, Yuuya Tachiki, Keitaro Fukushima, Shota Sakaguchi, Inoue Mizuki …

Environmental DNA 2023年11月28日
Extreme low <scp>pH</scp>, not Al³⁺, is a key abiotic stressor for the extremophyte Carex angustisquama (Cyperaceae) in highly acidic solfatara fields

K. Nagasawa, K. Fukushima, H. Setoguchi, M. Katsuyama, S. Sakaguchi

Plant Biology 25(4) 551-562 2023年3月21日
The contrary conservation situations of two local critically endangered species, Vaccinium emarginatum (Ericaceae) and Elatostema platyphyllum (Urticaceae), growing on the eastern edge of the distribution

Mayu Shibabayashi, Taiga Shimizu, Chinatsu Tokuhiro, Yoshihisa Suyama, Shota Sakaguchi, Takuro Ito, Chih-Chieh Yu, Kuo-Fang Chung, Jun’ichi Nagasawa, Toshiaki Shiuchi …

Frontiers in Ecology and Evolution 11 2023年1月26日
Rear‐edge daylily populations show legacies of habitat fragmentation due to the Holocene climate warming

Kazutoshi Masuda, Hiroaki Setoguchi, Koki Nagasawa, Masae Iwamoto Ishihara, Kazuhiro Sawa, Kenji Horie, Hayato Tsuboi, Shigeru Fukumoto, Tsuguoki Tango, Shota Sakaguchi

Journal of Biogeography 50(3) 551-563 2022年12月23日査読有り最終著者
Comparative reproductive ecology of two sister Asarum species (Aristolochiaceae) in relation to the evolution of elongated floral appendage

D. Takahashi, S. Sakaguchi, T. Teramine, H. Setoguchi

Plant Biology 24(6) 987-997 2022年10月
A new color variant of Hemerocallis middendorffii Trautv. et C.A.Mey. var. esculenta (Koidz.) Ohwi (Asphodelaceae)

Kazutoshi Masuda, Hiroaki Setoguchi, Shigeru Fukumoto, Masae Iwamoto Ishihara, Shota Sakaguchi

Acta Phytotaxonomica et Geobotanica 74 33-37 2022年9月査読有り最終著者
From East Asia to Beringia: reconstructed range dynamics of Geranium erianthum (Geraniaceae) during the last glacial period in the northern Pacific region

Seikan Kurata, Shota Sakaguchi, Hajime Ikeda, Shun K. Hirota, Osamu Kurashima, Yoshihisa Suyama, Motomi Ito

Plant Systematics and Evolution 308(4) 2022年8月
Genetic purity of a rear-edge population of Carex podogyna Franch. et Sav. (Cyperaceae) maintained under interspecific hybridization.

Koki Nagasawa, Shigeru Fukumoto, Hiroaki Setoguchi, Masae Ishihara, Ken-Ichi Hiratsuka, Kazutoshi Masuda, Shota Sakaguchi

Genes & genetic systems 97(2) 93-99 2022年5月12日
芦生研究林で再発見された絶滅寸前種マルバスミレ（スミレ科）

于佳欣, 増田和俊, 阪口翔太

森林研究 81 17-18 2022年5月査読有り最終著者責任著者

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MISC

165

多雪植物群集の遺伝的分化:25種の比較系統地理解析で探る地理隔離と種特性の影響

阪口翔太, 長澤耕樹, 増田和俊, 渡辺洋一, 廣田峻, 陶山佳久, 高橋大樹, 沢和浩, 堀江健二, 坂田ゆず …

日本植物分類学会大会研究発表要旨集 23rd 2024年
多雪植物群集の遺伝的分化を探る:25種を対象とした比較系統地理解析

阪口翔太, 長澤耕樹, 増田和俊, 渡辺洋一, 廣田峻, 陶山佳久, 高橋大樹, 沢和浩, 堀江健二, 坂田ゆず …

日本生態学会大会講演要旨(Web) 71st 2024年
全ゲノム解析による屋久島産矮小植物の進化過程の解明

高橋大樹, 陶山佳久, 長澤耕樹, 石川直子, 瀬戸口浩彰, 阪口翔太

日本生態学会大会講演要旨(Web) 71st 2024年
昨日の敵は今日の友-内生菌の作用によるサワシロギクの蛇紋岩適応-

堀文乃, 林雅貴, 福島慶太郎, 阪口翔太, 石川直子, 伊藤元己, 西野貴子

日本生態学会大会講演要旨(Web) 71st 2024年
多雪植物群集の遺伝的分化を探る:25種を対象とした比較系統地理解析

阪口翔太, 長澤耕樹, 増田和俊, 渡辺洋一, 廣田峻, 陶山佳久, 高橋大樹, 沢和浩, 堀江健二, 坂田ゆず …

森林遺伝育種学会大会講演要旨集(Web) 12th 2023年
MIG-seq法を用いたスミレ科オオバキスミレ群の系統解析

渡辺蕗, 瀬戸口浩彰, いがりまさし, 堀江健二, 内藤健, 坪井勇人, 長澤耕樹, 増田和俊, 渡辺洋一, 藤井紀行 …

日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM) 87th 2023年
日本列島における超塩基性岩型アキノキリンソウの進化過程の解明

高添清登, 瀬戸口浩彰, 永野惇, 永野惇, 石川直子, 堀江健二, 伊藤元己, 阪口翔太

日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM) 87th 2023年
渓流沿い植物の種分化ゲノミクス:沖縄産Solidago属での狭葉化・交配前隔離の遺伝的基盤を探る

阪口翔太, 石川直子, 阿部篤志, 瀬戸口浩彰, 高橋大樹, 永野惇, 永野惇, 牧雅之, 喜屋武隆太, 伊藤元己

日本植物分類学会大会研究発表要旨集 22nd 2023年
日本列島における超塩基性岩型アキノキリンソウの平行進化の検証

高添清登, 瀬戸口浩彰, 永野惇, 永野惇, 石川直子, 堀江健二, 伊藤元己, 阪口翔太

日本植物分類学会大会研究発表要旨集 22nd 2023年
全ゲノム解析で紐解くスミレ科オオバキスミレ群の適応放散史

渡辺蕗, 瀬戸口浩彰, いがりまさし, 堀江健二, 内藤健, 坪井勇人, 長澤耕樹, 増田和俊, 渡辺洋一, 藤井紀行 …

日本植物分類学会大会研究発表要旨集 22nd 2023年
網羅的発現解析と全ゲノム比較に基づく極限植物ヤマタヌキランの低pH耐性遺伝子の探索

長澤耕樹, 瀬戸口浩彰, 内藤健, 永野惇, 永野惇, 石川直子, 阪口翔太

日本植物分類学会大会研究発表要旨集 22nd 2023年
サワシロギクの蛇紋岩適応と微生物作用~植物炭疽病菌は敵か,味方か~

林雅貴, 仲野慶大, 阪口翔太, 福島慶太郎, 石川直子, 井鷺裕司, 陶山佳久, 伊藤元己, 西野貴子

日本植物分類学会大会研究発表要旨集 22nd 2023年
芦生冷温帯林における3種類の断片的シカ情報を利用した個体群変動パタンの解析

井上みずき, 伊東宏樹, 山崎理正, 福本繁, 岡本勇貴, 甲木勝也, 福島慶太郎, 境優, 阪口翔太, 藤木大介 …

個体群生態学会大会プログラム・講演要旨集(Web) 39th 2023年
海洋島で雌雄異株化したムラサキシキブ属における性決定ゲノム領域の特定

増田和俊, 瀬戸口浩彰, 長澤耕樹, 鈴木節子, 久保田渉誠, 佐藤真, 阪口翔太

日本生態学会大会講演要旨(Web) 70th 2023年
海洋島における雌雄異株化のゲノム基盤:小笠原産ムラサキシキブ属での検証

増田和俊, 瀬戸口浩彰, 長澤耕樹, 鈴木節子, 久保田渉誠, 佐藤真, 阪口翔太

日本植物分類学会大会研究発表要旨集 22nd 2023年
機械学習LightGBMによるシカの目撃頻度予測

大塚裕斗, 井上みずき, 山崎理正, 高柳敦, 福島慶太郎, 阪口翔太, 藤木大介, 境優, 高橋大樹, 長澤耕樹 …

日本生態学会大会講演要旨(Web) 70th 2023年
シカによる過採食が土壌微生物群集に与える影響:広域シカ柵設置サイトにおける解析例

門脇浩明, 本庄三恵, 中村直人, 北川陽一郎, 石原正恵, 松岡俊将, 立木佑弥, 福島慶太郎, 阪口翔太, 井上みずき …

日本生態学会大会講演要旨(Web) 70th 2023年
サワシロギク蛇紋岩型の複数集団はどのように成立したか

林雅貴, 阪口翔太, 福島慶太郎, 石川直子, 井鷺裕司, 陶山佳久, 伊藤元己, 西野貴子

日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM) 86th 2022年
ゼンテイカの分布末端集団における保全遺伝学的研究

増田和俊, 瀬戸口浩彰, 長澤耕樹, 沢和浩, 丹後亜興, 坪井勇人, 福本繁, 堀江健二, 平塚健一, 石原正恵 …

日本植物分類学会大会研究発表要旨集 21st (CD-ROM) 2022年
絶滅危惧植物カンランの域外保全に向けた遺伝解析

西原美佳, 阪口翔太, 長澤淳一, 市河三英, 廣田峻, 陶山佳久, 遊川知久, 平塚健一, 山下幸司, 橋本季正 …

日本植物分類学会大会研究発表要旨集 21st (CD-ROM) 2022年

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書籍等出版物

芦生原生林を歩きつくす：フィールドワーク20年の調査と発見

福本繁 (担当:分担執筆, 範囲:希少植物の域外保全プロジェクト，大規模シカ柵で生態系を回復させる)

ナカニシヤ出版 2021年12月 (ISBN: 9784779516108)
日本における森林樹木の遺伝的多様性と地理的遺伝構造

戸丸信弘, 内山憲太郎, 玉木一郎, 阪口翔太 (担当:共編者(共編著者))

2021年4月 (ISBN: 9784944005321)
「中尾佐助照葉樹林文化論」の展開 ― 多角的視座からの位置づけ

山口裕文, 金子務, 大形徹, 大野朋子 (担当:分担執筆, 範囲:第七章東アジア温帯林構成植物の歴史生物地理)

北海道大学出版会 2016年6月 (ISBN: 9784832968202)
地図でわかる樹木の種苗移動ガイドライン

津村義彦, 陶山佳久 (担当:分担執筆, 範囲:生態ニッチモデルと遺伝的地域性，カツラ・ヒロハカツラ，ハリギリ)

2015年 (ISBN: 9784829965245)
系統地理学 DNAで解き明かす生きものの自然史

阪口翔太 (担当:共著, 範囲:第4章，コラム1，コラム2)

文一総合出版 2013年

講演・口頭発表等

後氷期に起きた系統混合が北方地域におけるハリギリ集団の高い遺伝的多様性を説明する

阪口翔太

日本森林学会大会学術講演集(CD-ROM) 2013年3月25日
針葉樹の集団デモグラフィから探るオーストラリアの最終間氷期最盛期以降の景観変化

阪口翔太, 阪口翔太, PRIOR Lynda, BOWMAN David, CRISP Michael, 津村義彦, 井鷺裕司

日本森林学会大会学術講演集(CD-ROM) 2013年3月25日
系統進化に伴うニッチの変化は日本におけるツツジ属ミツバツツジ節の多様化を促進したのか?

渡辺洋一, 阪口翔太, 戸丸信弘

日本生態学会大会講演要旨集 2013年3月5日
豪州ヒノキにおける集団デモグラフィの地理的変異はどのように形成されたのか?

阪口翔太, PRIOR Lynda, CRISP Michael, BOWMAN David, 津村義彦, 井鷺裕司

日本生態学会大会講演要旨集 2013年3月5日

担当経験のある科目(授業)

生物学特講II (横浜国立大学教育人間科学部)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

日本列島の森林生態系の形成過程の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(S) 2024年4月 - 2029年3月

津村義彦, 東城幸治, 竹中將起, 内山憲太郎, 森英樹, 戸丸信弘, 阪口翔太, 百原新, 陶山佳久, 松井哲哉, 石濱史子, 後藤晋
人為選択実験と全ゲノム分析による植物の適応進化過程の復元

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2024年4月 - 2027年3月

阪口翔太, 孫田佳奈, 渡辺洋一, 福島慶太郎
矮化オオバコの適応進化ーエピジェネティックな変化による進化の検証

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2024年4月 - 2027年3月

石川直子, 阪口翔太
生態ゲノミクスによる野生植物の平行進化機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2021年4月 - 2024年3月

阪口翔太
シカがもたらす葉サイズの進化と可塑性の変化ー葉サイズ制御の分子機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2019年4月 - 2024年3月

石川直子, 阪口翔太
キク科植物の交配前隔離に関わるゲノム領域の特定

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究若手研究 2018年4月 - 2021年3月

阪口翔太
オーストラリアの乾燥環境勾配に沿った染色体数減数現象の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2016年4月 - 2020年3月

伊藤元己, 阪口翔太, 土松隆志, Worth James
植物の生態型分化機構研究：アキノキリンソウ群多様化の比較ゲノム解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2016年4月 - 2019年3月

伊藤元己, 久保田渉誠, 阪口翔太, 牧雅之, 石川直子, 西野貴子
ニューカレドニアにおけるヒノキ科2属の平行的な生態的種分化の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 若手研究(B) 2014年4月 - 2017年3月

阪口翔太
植物の超塩基性土壌への適応進化：シュンジュギクの比較ゲノム解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2013年4月 - 2017年3月

伊藤元己, 阪口翔太, 土松隆志, 青木誠志郎, 森長真一, 石川直子
生態ゲノミクスで豪州ヒノキにおける環境適応プロセスを復元する

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2013年4月 - 2016年3月

阪口翔太
種内・属内レベルの集団ゲノミクスによる樹木の適応進化・種分化プロセスの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 基盤研究(A) 2012年4月 - 2015年3月

井鷺裕司, 津村義彦, 上野真義, 瀬戸口浩彰, 阪口翔太
ヒノキ科樹木における環境適応プロセスの遺伝的解明

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2010年 - 2012年

阪口翔太

阪口翔太

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研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

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