共同研究・競争的資金等の研究課題

2016年4月 - 2020年3月

オーストラリアの乾燥環境勾配に沿った染色体数減数現象の解析

日本学術振興会  科学研究費助成事業 基盤研究(B)  基盤研究(B)

課題番号
16H05762
体系的課題番号
JP16H05762
配分額
(総額)
17,030,000円
(直接経費)
13,100,000円
(間接経費)
3,930,000円

平成28年度から30年度までに行った、オーストラリアの南オーストラリア州、ニューサウスウェルズ州、クイーンスランド州フィールド調査において収集したキク科ブラキコーム属植物の種子から発芽させた植物に対し、全ゲノムを対象にしたMIGseq (Multiplexed ISSR Genotyping by sequencing) 解析用DNAと、発現遺伝子調査のためのRNAseq解析用RNAの抽出を行った。
上記の核酸抽出サンプルに対し、詳細な系統解析のためのMIGseqとゲノム内の重複遺伝子数を調査のためのRNAseq解析を実行したが、実験途中の10月に、研究代表者が不測の病気で入院することになり、MIGseq解析とRNAseq解析の一部については実験が終了しなかった。そのため、追加の実験と解析を、次年度に計画延長して行う事になった。
これまですでにMIGseq解析が終了した種について、2n=18の染色体数を持つブラキコーム・リジデュラを外群として用いて、予備的に全ゲノム領域を用いた系統解析を行った。その結果、リニアリローバ複合体に属する種は系統樹の基部で分岐し、他の種と姉妹群を形成した。この結果は、核DNAのInternal transcribed spacer (nrITS) 領域による系統解析結果と同様であり、染色体数2n=4のブラキコーム・ダイクロモゾーマティカを含むリニアリローバ複合体は、本属の成立の早い時期に分化した植物群から生じたものであり、他の同属植物とは近縁ではないこという、昨年度までの結果を支持するものである。

リンク情報
KAKEN
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-16H05762
ID情報
  • 課題番号 : 16H05762
  • 体系的課題番号 : JP16H05762