磯部祥子 (Sachiko Isobe) - マイポータル

基本情報

所属: （公財）かずさDNA研究所先端研究開発部・シーズ開拓研究室　情報解析システム開発チームチーム長

J-GLOBAL ID: 202001013146056211
researchmap会員ID: B000382639

研究分野

論文

171

Assessing the potential for genome-assisted breeding in red perilla using quantitative trait locus analysis and genomic prediction

Sei Kinoshita, Kengo Sakurai, Kosuke Hamazaki, Takahiro Tsusaka, Miki Sakurai, Terue Kurosawa, Youichi Aoki, Kenta Shirasawa, Sachiko Isobe, Hiroyoshi Iwata

2023年10月17日
Establishing a comprehensive web-based analysis platform forNicotiana benthamianagenome and transcriptome

Ken-ichi Kurotani, Hideki Hirakawa, Kenta Shirasawa, Koya Tagiri, Moe Mori, Yasunori Ichihashi, Takamasa Suzuki, Yasuhiro Tanizawa, Yasukazu Nakamura, Sachiko Isobe …

2023年9月5日
Transcriptome analysis of tomato plants following salicylic acid-induced immunity against Clavibacter michiganensis ssp. michiganensis

Naoki Yokotani, Yoshinori Hasegawa, Yusuke Kouzai, Hideki Hirakawa, Sachiko Isobe

Plant Biotechnology 2023年9月査読有り
Plant GARDEN: a portal website for cross-searching between different types of genomic and genetic resources in a wide variety of plant species.

Hisako Ichihara, Manabu Yamada, Mitsuyo Kohara, Hideki Hirakawa, Andrea Ghelfi, Takuro Tamura, Akihiro Nakaya, Yasukazu Nakamura, Sachiko Shirasawa, Samatchaya Yamashita …

BMC plant biology 23(1) 391-391 2023年8月12日
A Novel Method for Quantifying Plant Morphological Characteristics Using Normal Vectors and Local Curvature Data via 3D Modelling—A Case Study in Leaf Lettuce

Kaede C. Wada, Atsushi Hayashi, Unseok Lee, Takanari Tanabata, Sachiko Isobe, Hironori Itoh, Hideki Maeda, Satoshi Fujisako, Nobuo Kochi

Sensors 23(15) 6825-6825 2023年7月31日
Propagation path of a flowering cherry (Cerasus×yedoensis) cultivar ‘Somei-Yoshino’ traced by somatic mutations

Kenta Shirasawa, Tomoya Esumi, Akihiro Itai, Katsunori Hatakeyama, Tadashi Takashina, Takuji Yakuwa, Katsuhiko Sumitomo, Takeshi Kurokura, Eigo Fukai, Keiichi Sato …

2023年7月12日
Polyploid GWAS reveals the basis of molecular marker development for complex breeding traits including starch content in the storage roots of sweet potato

Emdadul Haque, Kenta Shirasawa, Keisuke Suematsu, Hiroaki Tabuchi, Sachiko Isobe, Masaru Tanaka

Frontiers in Plant Science 14 1181909-1181909 2023年6月5日
Haploid-resolved and chromosome-scale genome assembly in Citrus unshiu and its parental species, C. nobilis and C. kinokuni

Sachiko Isobe, Hiroyoshi Fujii, Kenta Shirasawa, Yoshihiro Kawahara, Tomoko Endo, Takehiko Shimada

2023年6月5日
Telomere-to-telomere genome assembly of an allotetraploid pernicious weed,Echinochloa phyllopogon

Mitsuhiko P Sato, Satoshi Iwakami, Kanade Fukunishi, Kai Sugiura, Kentaro Yasuda, Sachiko Isobe, Kenta Shirasawa

2023年5月24日
Power Up Plant Genetic Research with Genomic Data.

Man-Wah Li, Sachiko Isobe, Hon-Ming Lam

International journal of molecular sciences 24(8) 2023年4月7日
Identification of major quantitative trait loci for parthenocarpic ability in East Asian melon

Yosuke Yoshioka, Akito Nashiki, Ahmad Zaelani, Sachiko Isobe, Kenta Shirasawa, Koichiro Shimomura, Akio Ohyama

2023年2月19日
Chromosome-scale genome assembly of Eustoma grandiflorum, the first complete genome sequence in the genus Eustoma

Kenta Shirasawa, Ryohei Arimoto, Hideki Hirakawa, Motoyuki Ishimori, Andrea Ghelfi, Masami Miyasaka, Makoto Endo, Saneyuki Kawabata, Sachiko N Isobe

G3 Genes|Genomes|Genetics 13(2) 2023年2月9日
Genome Sequence and Analysis of Nicotiana benthamiana, the Model Plant for Interactions between Organisms.

Ken-Ichi Kurotani, Hideki Hirakawa, Kenta Shirasawa, Yasuhiro Tanizawa, Yasukazu Nakamura, Sachiko Isobe, Michitaka Notaguchi

Plant & cell physiology 64(2) 248-257 2023年2月9日
Identification of novel sex determination loci in Japanese weedy melon

Akito Nashiki, Hiroki Matsuo, Kota Takano, Fauziatul Fitriyah, Sachiko Isobe, Kenta Shirasawa, Yosuke Yoshioka

TAG. Theoretical and applied genetics. Theoretische und angewandte Genetik 136(6) 136-136 2023年1月21日
Development of a digital phenotyping system using 3D model reconstruction for zoysiagrass

Sorawich Pongpiyapaiboon, Hidenori Tanaka, Masatsugu Hashiguchi, Takuyu Hashiguchi, Atsushi Hayashi, Takanari Tanabata, Sachiko Isobe, Ryo Akashi

The Plant Phenome Journal 6(1) 2023年1月
An improved reference genome for Trifolium subterraneum L. provides insight into molecular diversity and intra-specific phylogeny.

Kenta Shirasawa, Roger Moraga, Andrea Ghelfi, Hideki Hirakawa, Hideki Nagasaki, Kioumars Ghamkhar, Brent A Barrett, Andrew G Griffiths, Sachiko N Isobe

Frontiers in plant science 14 1103857-1103857 2023年
Genetic diversity analysis and core collection construction for Amaranthus tricolor germplasm based on genome-wide single-nucleotide polymorphisms

Ken Hoshikawa, Ya-Ping Lin, Roland Schafleitner, Kenta Shirasawa, Sachiko Isobe, Duc Chinh Nguyen, Ryo Ohsawa, Yosuke Yoshioka

SCIENTIA HORTICULTURAE 307 2023年1月
ハプロタイプ毎に識別した6倍体サツマイモ(Ipomoea batatas(L.)Lam)の染色体スケールゲノムアセンブル

磯部祥子, YOON U., 平川英樹, 白澤健太, CAO Q., 田中勝, KWAK S., LIU Q.

育種学研究 25 2022年12月25日
Chromosome-scale genome assembly of Glycyrrhiza uralensis revealed metabolic gene cluster centred specialized metabolites biosynthesis.

Amit Rai, Hideki Hirakawa, Megha Rai, Yohei Shimizu, Kenta Shirasawa, Shinji Kikuchi, Hikaru Seki, Mami Yamazaki, Atsushi Toyoda, Sachiko Isobe …

DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes 29(6) 2022年12月1日
De novo whole-genome assembly in an interspecific hybrid table grape, 'Shine Muscat'.

Kenta Shirasawa, Hideki Hirakawa, Akifumi Azuma, Fumiya Taniguchi, Toshiya Yamamoto, Akihiko Sato, Andrea Ghelfi, Sachiko N Isobe

DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes 29(6) 2022年12月1日

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MISC

387

ゲノムと新技術により輝きを増す遺伝資源と育種学の未来—The future of genetic resources and breeding science brightened by genomics and new technologies—2022年第63回シンポジウム(シンポジウム・ワークショップ)報告

佐藤豊, 草場信, 内藤健, 磯部祥子, 有泉亨, 佐藤修正, 佐藤和広, 新倉聡, 赤木剛士

育種学研究 = Breeding research : 日本育種学会和文誌 / 日本育種学会編 25(1) 33-40 2023年6月
合成生物学の手法を用いた窒素固定共生リコンストラクションの試み

花野滋, 花野滋, 戸松創, 瀧田英司, 大竹興一郎, 梅月まり華, 平川秀樹, 磯部祥子, 征矢野敬, 壽崎拓哉 …

日本植物生理学会年会(Web) 64th 2023年
農学・植物科学を対象とした形質評価技術の開発

七夕高也, 磯部祥子

計測自動制御学会制御部門マルチシンポジウム(CD-ROM) 10th 2023年
植物の成長情報を大量に取得するための技術開発

七夕高也, 磯部祥子

電気学会全国大会講演論文集(CD-ROM) 2023 2023年
イチゴの収量性と乾物生産量の関係解析

龍勝利, 森山貴仁, 石橋正文, 濱野恵, 磯部祥子, 黒倉健

園芸学研究別冊 22(1) 2023年
タイヌビエの高精度ゲノム解読からわかる日本国内の遺伝的多様性

佐藤光彦, 岩上哲史, 福西詩奏, 杉浦快, 保田謙太郎, 磯部祥子, 白澤健太

日本雑草学会大会講演要旨集 62nd 2023年
ロングリード技術による針葉樹4種の全ゲノム解読

白澤健太, 三嶋賢太郎, 平川英樹, 平尾知士, 坪村美代子, 永野聡一郎, 井城泰一, 磯部祥子, 高橋誠

日本森林学会大会学術講演集 134th 2023年
DNA分析によるサツマイモ加工品の品種識別の試み

田中勝, HAQUE Emdadul, 田口和憲, 進藤彰子, 門田有希, 峯岸恭孝, 竹内朋幸, 高崎一人, 内藤嘉磯, 磯部祥子

DNA多型 31(1) 2023年
後代の予測育種価に基づく交配組合せの選択:アカジソ複数F₃集団を用いた交配計画への応用

木下青, 櫻井建吾, 濱崎甲資, CHEN T., 津坂宜宏, 櫻井美希, 黒沢輝枝, 白澤健太, 磯部祥子, 岩田洋佳

育種学研究 25 2023年
小石川植物園のソメイヨシノ老木の全ゲノム解析

白澤健太, 磯部祥子

育種学研究 25 2023年
イチゴの夏期果実品質におけるゲノミックセレクションの選抜効果の検証

本城正憲, 濱野恵, 木村鉄也, 塚崎光, 山本英司, 磯部祥子

園芸学研究別冊 22(1) 2023年
カーネーションにおける日持ち性QTL近傍DNAマーカーの有効性の検証

八木雅史, 松野純子, 松野純子, 白澤健太, 磯部祥子, 棚瀬幸司, 山口博康

園芸学研究別冊 22(1) 2023年
ホソバオケラのゲノム育種を目指した技術開発:ゲノムワイド関連解析・ゲノミック予測モデルの構築

津坂宜宏, 白澤健太, 磯部祥子

日本生薬学会年会講演要旨集 69th 2023年
‘シャインマスカット‘の両親系統の交配に由来するブドウF₁集団を用いたデータ駆動型育種の可能性評価

南川舞, 南川舞, 稲森稔, 谷口郁也, 東暁史, 清水健雄, 磯部祥子, 白澤健太, 岩田洋佳

園芸学研究別冊 22(1) 2023年
日本品種のイチゴのパンゲノム解析

磯部祥子, 白澤健太, 平川英樹, 濱野恵, 龍勝利, 黒倉健

園芸学研究別冊 22(1) 2023年
リンゴFYPr606系統が示す自家摘果性の作動機構の解析

柘植美希奈, 金丸京平, 山口維尚, 白澤健太, 磯部祥子, 白武勝裕, 松本省吾, 太田垣駿吾, 太田垣駿吾

園芸学研究別冊 22(1) 2023年
アジサイの花房型に特異的な発現を示すSEP相同遺伝子の特定

上町達也, 奈島賢児, 清水顕史, 竹内俊輝, 谷川奈津実, 白澤健太, 磯部祥子, 東未来, 阿久津翠, 中澤佳子 …

園芸学研究別冊 22(1) 2023年
ラージindelマーカーを作成するプログラムLINDA(Large INDel Analyzer)の開発

根津巽, 渡邊知輝, 堀池徳祐, 白澤健太, 磯部祥子, 島田武彦, 藤井浩

園芸学研究別冊 22(1) 2023年
ゲノム編集トマト‘シシリアンルージュハイギャバ’の全ゲノム解析

白澤健太, 磯部祥子

園芸学研究別冊 22(1) 2023年
植物ゲノム情報ポータルサイト「Plant GARDEN」の改訂(2022年度・第4四半期版)

市原寿子, 平川英樹, 山田学, 小原光代, 山下サマッチャヤー, 白澤沙知子, 戸田陽介, 清水武彦, 中村保一, 中村保一 …

育種学研究 25 2023年

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講演・口頭発表等

日本品種のイチゴのパンゲノム解析

磯部祥子, 白澤健太, 平川英樹, 濱野恵, 龍勝利, 黒倉健

園芸学会令和5年度春季大会 2023年3月19日
ハプロタイプ毎に識別した６倍体サツマイモ(Ipomoea batatas (L.) Lam)の染色体スケールゲノムアセンブル

磯部祥子, Yoon Ung-Han, 平川英樹, 白澤健太, 曹清河, 田中勝, 郭尚洙, 刘庆昌

日本育種学会大143回講演会 2023年3月18日
Data-Driven Breeding of Strawberries at Five Breeding Stations in Japan

Sachiko Isobe

PAG 30 2023年3月16日招待有り
dd-RAD-Seq法によるキャベツ品種の識別性

磯部祥子, 白澤健太

日本DNA多型学会・第31回学術集会 2022年11月17日
イチゴゲノム解析とGS育種の365歩のマーチ

磯部祥子

第9回アジア植物遺伝資源 (PGRAsia) シンポジウム 2022年11月16日招待有り
For whom the plant genome has been sequenced

2022年10月15日
植物の参照ゲノム配列とユーザーのゲノム配列データを比較するプラットホーム「Mi-GARDEN」の開発

磯部祥子, 堀口晃一郎, 山田学, 三澤拓真, 中村保一, 市原寿子, 小原光代, 平川英樹

日本育種学会・第142回講演会 2022年9月24日
植物の多様性の理解のためにゲノム解析が明らかにできていること

磯部祥子

日本育種学会・第142回講演会・シンポジウム「ゲノムと新技術により輝きを増す遺伝資源と育種学の未来」 2022年9月23日招待有り
Whole genome assembly in hexaploid sweetpotato and comparison with diploid wild species

2022年9月22日招待有り
Plant GARDEN からMi-GARDENへ～公開ゲノム情報とユーザーデータをつなぐ～

磯部祥子, 市原寿子, 山田学, 中村保一, 戸田陽介, 小原光代, 山下サマッチャヤー, 七夕高也, 平川英樹, 田畑哲之

日本植物学会第86回大会シンポジウム「使おう！植物学を支える研究プラットフォーム」 2022年9月17日招待有り
シャインマスカット’全ゲノム解読とブドウ品種ゲノムのリシーケンスによるSNPパネルの構築

磯部祥子, 白澤健太, 谷口郁也, 平川英樹, 山本俊哉, 佐藤明彦, 東暁史

園芸学会令和４年度秋季大会 2022年9月11日
Pan genome of strawberry varieties in Japan

Sachiko Isobe, Kenta Shirasawa, Hideki Hirakawa, Megumi Hamano, Katsutoshi Ryu, Takeshi Kurokura

IHC 2022 2022年8月15日
Large Scale Genotyping in Strawberry Genomic Selection

Sachiko Isobe

PAG Asia 2022 2022年6月22日招待有り
Contribution of Omni-C technology to the de novo assembly of plant genomes and future challenges

Sachiko Isobe

GAP Asia 2022年4月13日招待有り
イチゴの染色体特異的SNPマーカーの開発

磯部祥子, 白澤健太, 片岡園, 末吉孝行, 野口裕司, 門田日陽里, 和田卓也

日本育種学会・第141回講演会 2022年3月22日
「作物の形質予測モデルを作ってみる」

磯部祥子

アグリゲノム産業研究会第12回例会 2022年3月14日招待有り
植物ゲノム解読の現状と展望

磯部祥子

技術交流財団研究会「ゲノム科学が拓く新産業創出」 2022年3月4日招待有り
植物ゲノム情報統合ポータルサイトPlant GARDENの構築

磯部祥子

第43回日本分子生物学会年会生命科学のデータベース活用法2020 2020年12月2日招待有り
Genome sequencing of cultivated strawberry and its application to Breeding in Japan

Sachiko Isobe

The 6th Asia Pacfic Agrobiological Genom Symposium 2020年12月招待有り
ゲノム解析から植物の多様性を考える

磯部祥子

バーチャル研究会生物多様性のDNA情報学~自然の計測と生命の理解のために 2020年12月招待有り

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共同研究・競争的資金等の研究課題

eGWAS解析によって栽培種イチゴの四季成り性の原因と花成経路を解明する

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2023年4月 - 2026年3月

黒倉健, 磯部祥子, 濱野恵, 本城正憲
無花粉変異体の解析による超日持ち性ガーベラの作出

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2022年4月 - 2025年3月

富永晃好, 磯部祥子, 中塚貴司
大果系イチゴの果実はなぜ大きいのか？

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2020年4月 - 2023年3月

黒倉健, 龍勝利, 磯部祥子, 濱野恵
孤児作物在来品種の機能性向上を目指した高効率育種システムの確立

日本学術振興会科学研究費助成事業国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B)) 国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B)) 2019年10月 - 2022年3月

大澤良, 磯部祥子, 吉岡洋輔, 白澤健太, 星川健
栽培イチゴの多元交雑集団を用いた果実着色遺伝的制御機構の網羅的解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2018年4月 - 2021年3月

和田卓也, 磯部祥子
LD係数を利用した連鎖地図作成法の開発と高次倍数性種への応用

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2015年4月 - 2018年3月

磯部祥子, 中谷明弘, 田中勝
キュウリ属作物の果実品質改良に寄与するゲノムデザイン育種基盤の構築

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(A) 若手研究(A) 2014年4月 - 2018年3月

吉岡洋輔, 下村晃一郎, 磯部祥子, 白澤健太, 西典子, 松村啓子, 森山佳世, 陳蕤坤, アーマドザエラニ, 岩谷拓郎, フィトリヤファウジアトゥル, 松尾宏樹, 内藤千陽
24時間日長で花芽分化するイチゴ系統の収量特性の解明とそれに関与する遺伝子の同定

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2013年4月 - 2016年3月

柳智博, 磯部祥子
種子繁殖型イチゴ育種に向けた種子発芽制御因子のマッピングとマーカー開発

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究挑戦的萌芽研究 2013年4月 - 2015年3月

掛田克行, 磯部祥子, 橋本和紀, 丹羽弘光, 橋爪不二夫, 北村八祥, 森利樹
多系交雑集団を用いたゲノミックセレクション法の開発と実証

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2010年 - 2012年

磯部祥子, 中谷明弘, 白澤健太, 白澤健太, 田畑哲之
落花生の連鎖地図の作成とオレイン酸含有量に関わる選抜マーカーの同定

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2008年 - 2010年

磯部祥子, KOILKONDA Padmalatha
落花生のQTL解析によるオレイン酸含有量の遺伝様式の解明とDNAマーカーの開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2008年 - 2010年

田畑哲之, 磯部祥子, 青木考

産業財産権

特許第7242431号三次元計測装置、三次元計測方法および三次元計測用プログラム

林篤司, 高地伸夫, 七夕高也, 磯部祥子
特許第7229102号画像を用いた三次元計測装置、画像を用いた三次元計測方法および画像を用いた三次元計測用プログラム

林篤司, 高地伸夫, 七夕高也, 磯部祥子
特開2022-046403 キク白さび病抵抗性を判定する方法、製造方法、分子マーカー、キク白さび病抵抗性関連遺伝子、キク白さび病抵抗性のキク属植物

住友克彦, 中野善公, 磯部祥子, 白澤健太, 平川英樹
特開2022-046306 キク白さび病抵抗性を判定する方法、製造方法、分子マーカー、キク白さび病抵抗性関連遺伝子、キク白さび病抵抗性のキク属植物

住友克彦, 磯部祥子, 白澤健太, 平川英樹
特開2021-163007 計測システム、計測方法および計測用プログラム

七夕高也, 兒玉晋洋, 磯部祥子
特許第6898776号三次元計測装置

高地伸夫, 七夕高也, 林篤司, 磯部祥子
特開2020-197493 画像を用いた三次元計測装置、画像を用いた三次元計測方法および画像を用いた三次元計測用プログラム

林篤司, 高地伸夫, 七夕高也, 磯部祥子
特開2020-197407 三次元計測装置、三次元計測方法および三次元計測用プログラム

林篤司, 高地伸夫, 七夕高也, 磯部祥子
特開2018-197685 三次元計測装置

高地伸夫, 七夕高也, 林篤司, 磯部祥子
特開2016-002005 イチゴ種子のDNA粗抽出液を用いたイチゴF1種子の純度検定法

磯部祥子, 宮村佳典, 笹本茂美

学術貢献活動

アグリゲノム産業研究会第13回例会

企画立案・運営等, パネル司会・セッションチェア等

アグリゲノム産業研究会 2022年10月25日 - 2022年10月25日
公開シンポジウム「地球の未来を切り拓く育種学の役割」第３回

企画立案・運営等, パネル司会・セッションチェア等

日本学術会議農学委員会育種学分科会 2022年9月1日 - 2022年9月1日
公開シンポジウム「地球の未来を切り拓く―育種学の役割―」第２回

企画立案・運営等, パネル司会・セッションチェア等

日本学術会議農学委員会育種学分科会 2022年8月5日 - 2022年8月5日
公開シンポジウム「地球の未来を切り拓く育種学の役割」第１回

企画立案・運営等

日本学術会議農学委員会育種学分科会 2022年7月7日 - 2022年7月7日
令和４年度千葉県バイオ・ライフサイエンス・ネットワーク会議事例報告会

企画立案・運営等, パネル司会・セッションチェア等

千葉県バイオ・ライフサイエンス・ネットワーク 2022年6月8日 - 2022年6月8日
アグリゲノム産業研究会第12回例会

企画立案・運営等, パネル司会・セッションチェア等

2022年3月22日 - 2022年3月22日

磯部祥子

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論文

MISC

講演・口頭発表等

共同研究・競争的資金等の研究課題

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