朴聖俊 (Sung-Joon Park) - マイポータル

基本情報

所属: 東京大学医科学研究所附属ヒトゲノム解析センター准教授

researchmap会員ID: 1000325861

研究分野

論文

Single-cell transcriptomics reveals the molecular basis of human iPS cell differentiation into ectodermal ocular lineages

Laura Howard, Yuki Ishikawa, Tomohiko Katayama, Sung-Joon Park, Matthew Hill, Derek Blake, Kohji Nishida, Ryuhei Hayashi, Andrew J. Quantock

Communications Biology 2024年11月12日
TF-EPI: an interpretable enhancer-promoter interaction detection method based on Transformer

Bowen Liu, Weihang Zhang, Xin Zeng, Martin Loza, Sung-Joon Park, Kenta Nakai

Frontiers in Genetics 2024年8月9日
Integrative analysis of cancer multimodality data identifying COPS5 as a novel biomarker of diffuse large B-cell lymphoma

Sung-Joon Park

Frontiers in Genetics 2024年
A computational approach for deciphering the interactions between proximal and distal gene regulators in GC B-cell response

Sung-Joon Park

NAR Genomics and Bioinformatics 2024年
HyGAnno: hybrid graph neural network-based cell type annotation for single-cell ATAC sequencing data

Sung-Joon Park

Briefings in Bioinformatics 2024年
Genome-wide ATAC-see screening identifies TFDP1 as a modulator of global chromatin accessibility

Sung-Joon Park

Nature Genetics 2024年
A computational approach for deciphering the interactions between proximal and distal regulators in B cell differentiation

Sung-Joon Park, Kenta Nakai

2023年11月4日
Multi-omics computational analysis unveils the involvement of AP-1 and CTCF in hysteresis of chromatin states during macrophage polarization

Sung-Joon Park

Frontiers in Immunology 2023年
Signaling Pathway of Taurine-Induced Upregulation of TXNIP

Hideo Satsu, Yusuke Gondo, Hana Shimanaka, Masato Imae, Shigeru Murakami, Kenji Watari, Shunichi Wakabayashi, Sung-Joon Park, Kenta Nakai, Makoto Shimizu

Metabolites 2022年7月
Generation of 3D lacrimal gland organoids from human pluripotent stem cells

Sung-Joon Park

Nature 2022年
Characterizing Promoter and Enhancer Sequences by a Deep Learning Method

Sung-Joon Park

Frontiers in Genetics 2021年
OpenContami: a web-based application for detecting microbial contaminants in next-generation sequencing data

Sung-Joon Park

Bioinformatics 2021年
A semi-supervised deep learning approach for predicting the functional effects of genomic non-coding variations

Sung-Joon Park

BMC Bioinformatics 2021年
Existence and possible roles of independent non-CpG methylation in the mammalian brain

Jong-Hun Lee, Yutaka Saito, Sung-Joon Park, Kenta Nakai

DNA Research 27(4) 2020年8月1日
HHEX promotes myeloid transformation in cooperation with mutant ASXL1

Sung-Joon Park

Blood 2020年
RNA-sequencing reveals positional memory of multipotent mesenchymal stromal cells from oral and maxillofacial tissue transcriptomes

Sung-Joon Park

BMC Genomics 2020年
Broad Heterochromatic Domains Open in Gonocyte Development Prior to De Novo DNA Methylation

Sung-Joon Park

Developmental Cell 2019年
A systematic sequencing-based approach for microbial contaminant detection and functional inference

Sung-Joon Park

BMC Biology 2019年
Analyzing the 3D chromatin organization coordinating with gene expression regulation in B-cell lymphoma

Sung-Joon Park

BMC Medical Genomics 2019年
Multidisciplinary insight into clonal expansion of HTLV-1-infected cells in adult T-cell leukemia via modeling by deterministic finite automata coupled with high-throughput sequencing

Sung-Joon Park

BMC Medical Genomics 2017年

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共同研究・競争的資金等の研究課題

間葉系幹細胞エクソソームによる創傷治癒・抗炎症作用メカニズムの解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2022年4月 - 2026年3月

岩田隆紀, 丸川恵理子, 朴聖俊, 水谷幸嗣
発生・分化のゲノムモダリティと疾患

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2020年11月 - 2025年3月

白髭克彦, 泉幸佑, 朴聖俊
遺伝子転写制御領域の空間構造を定量的に解析する計算手法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2020年4月 - 2023年3月

朴聖俊
染色体構造データベースを利用した転写制御のモデリング

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2018年4月 - 2020年3月

朴聖俊
網羅的塩基配列解読データを用いたコンタミネーションの検出と影響解析手法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2017年4月 - 2020年3月

朴聖俊
受精卵のゲノムアダプテーションの理解

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2010年4月 - 2015年3月

岡田由紀, 白髭克彦, 伊藤武彦, 牧野吉倫, 朴聖俊, 青島圭佑, 羽田政司