加藤真悟 (Shingo Kato) - マイポータル

基本情報

所属: 特定国立研究開発法人理化学研究所バイオリソース研究センター・微生物材料開発室上級研究員

研究者番号: 40554548
ORCID iD: https://orcid.org/0000-0002-4175-0532
J-GLOBAL ID: 201801006696355874
researchmap会員ID: B000298727

外部リンク: http://www.jcm.riken.jp/JCM/staff/skato/index.html

twitterアカウント名：　skato_jcm

https://twitter.com/skato_jcm

研究キーワード

研究分野

経歴

2022年4月 - 現在

特定国立研究開発法人理化学研究所, バイオリソース研究センター, 上級研究員
2018年4月 - 2022年3月

特定国立研究開発法人理化学研究所, バイオリソース研究センター, 開発研究員
2015年9月 - 2018年3月

海洋研究開発機構, 特任研究員
2014年4月 - 2015年8月

デラウェア大学, 海外特別研究員
2011年4月 - 2014年3月

理化学研究所, 基礎科学特別研究員
2009年4月 - 2011年3月

東京薬科大学, 嘱託研究員

学歴

- 2009年3月

東京薬科大学

委員歴

受賞

2025年9月

第11回日本微生物生態学会奨励賞
2022年11月

ANRRC 2022 Poster Award

Shingo Kato
2021年6月

日本微生物資源学会第27回大会優秀発表賞

加藤真悟
2019年11月

極限環境生物学会研究奨励賞

加藤真悟
2019年6月

日本微生物資源学会第26回大会ベストプレゼンテーション賞

加藤真悟
2013年10月

極限環境微生物学会2013年度（第14回）年会優秀ポスター賞

加藤真悟

論文

Whole-genome sequencing of diverse 351 cultured prokaryotes including as-yet-unsequenced type strains.

Shingo Kato, Sachiko Masuda, Arisa Shibata, Takashi Itoh, Mitsuo Sakamoto, Ken Shirasu, Moriya Ohkuma

Genome research 36(4) 875-884 2026年4月7日
Domain-Level Classification of Archaea and Bacteria Using AI-Assisted Single-Cell Raman Spectroscopy

Nanako Kanno, Tatsuya Ohtani, Nodoka Oda, Shingo Kato, Moriya Ohkuma, Shinsuke Shigeto

ACS Omega 11(10) 16913-16921 2026年3月3日
Co-enrichment of Ce and organics in microbe-like structures at the deep-sea ferromanganese crust surface

Ayaka Tokumaru, Mariko Kouduka, Hiroki Suga, Akari Fukuda, Shingo Kato, Yoshio Takahashi, Katsuhiko Suzuki, Akira Usui, Hiroki Mukai, Naotaka Tomioka …

Philosophical Transactions of the Royal Society A: Mathematical, Physical and Engineering Sciences 384(2314) 2026年2月12日
Exploring the Diversity and Metabolic Potential of CO2 fixation Mediated by RubisCO in Prokaryotes in the Japan Collection of Microorganisms.

Arisa Nishihara, Shingo Kato, Moriya Ohkuma

Microbes and environments 41(1) 2026年
Percent-Level Copper Mineralisation Promoted by Copper-Tolerant Iron-Oxidising Bacteria in Circumneutral Mine Drainage.

Kazuya Tanimoto, Shingo Kato, Kohei Tokunaga, Natsuko Hamamura, Moriya Ohkuma, Satoshi Mitsunobu

Environmental microbiology 27(12) e70212 2025年12月
Structural analysis of a symbiotic system involving a Nanobdellati archaeon by cryo-electron tomography.

Sakurako Goto-Ito, Shingo Kato, Mari Takahashi, Ayako Sakamoto, Atsushi Yamagata, Yongchan Lee, Haruhiko Ehara, Mayuko Sato, Kiminori Toyooka, Moriya Ohkuma …

Journal of biochemistry 179(1) 21-30 2025年8月26日査読有り
Microcaldus

Hiroyuki D. Sakai, Takashi Itoh, Shingo Kato, Matthew D. Johnson, Doulin C. Shepherd, Naswandi Nur, Antonius Suwanto, Debnath Ghosal, Moriya Ohkuma, Norio Kurosawa

Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria 1-9 2025年6月30日
Exploring protein N -glycosylation in ammonia-oxidizing Nitrososphaerota archaea through glycoproteomic analysis

Satoshi Nakagawa, Hirokazu Yagi, Tomoki Suyama, Shigeru Shimamura, Saeko Yanaka, Maho Yagi-Utsumi, Shingo Kato, Moriya Ohkuma, Koichi Kato, Ken Takai

mBio 16(6) e0385924 2025年6月11日査読有り
Improving Machine Learning-Based Bacterial Discrimination by Learning Single-Cell Raman Data From Multiple Growth Phases

Nodoka Oda, Nanako Kanno, Shingo Kato, Moriya Ohkuma, Shinsuke Shigeto

JOURNAL OF RAMAN SPECTROSCOPY 56(6) 481-490 2025年6月
Custom-made medium approach for effective enrichment and isolation of chemolithotrophic iron-oxidizing bacteria.

Tomoki Uchijima, Shingo Kato, Kazuya Tanimoto, Fumito Shiraishi, Natsuko Hamamura, Kohei Tokunaga, Hiroko Makita, Momoko Kondo, Moriya Ohkuma, Satoshi Mitsunobu

FEMS microbiology ecology 101(6) 2025年5月20日査読有り
Genome-resolved metaproteogenomic and nanosolid characterization of an inactive vent chimney densely colonized by enigmatic DPANN archaea.

Hinako Takamiya, Mariko Kouduka, Shingo Kato, Hiroki Suga, Masaki Oura, Tadashi Yokoyama, Michio Suzuki, Masaru Mori, Akio Kanai, Yohey Suzuki

The ISME journal 18(1) 2024年11月6日査読有り
Metagenomic Insights into Ecophysiology of Zetaproteobacteria and Gammaproteobacteria in Shallow Zones within Deep-sea Massive Sulfide Deposits.

Nao Masuda, Shingo Kato, Moriya Ohkuma, Kazuyoshi Endo

Microbes and environments 39(3) 2024年9月29日査読有り責任著者
Paracraurococcus lichenis sp. nov., isolated from lichen in Thailand.

Engkarat Kingkaew, Shingo Kato, Takao Iino, Takashi Itoh, Moriya Ohkuma, Wongsakorn Phongsopitanun, Somboon Tanasupawat

Archives of microbiology 206(10) 413-413 2024年9月24日査読有り
N -linked protein glycosylation in Nanobdellati (formerly DPANN) archaea and their hosts

Satoshi Nakagawa, Hiroyuki D. Sakai, Shigeru Shimamura, Yoshiki Takamatsu, Shingo Kato, Hirokazu Yagi, Saeko Yanaka, Maho Yagi-Utsumi, Norio Kurosawa, Moriya Ohkuma …

Journal of Bacteriology 206(9) e0020524 2024年8月28日査読有り
Characterization of protein glycosylation in an Asgard archaeon

Satoshi Nakagawa, Hiroyuki Imachi, Shigeru Shimamura, Saeko Yanaka, Hirokazu Yagi, Maho Yagi-Utsumi, Hiroyuki Sakai, Shingo Kato, Moriya Ohkuma, Koichi Kato …

BBA Advances 6 100118-100118 2024年7月査読有り
Promethearchaeum syntrophicum gen. nov., sp. nov., an anaerobic, obligately syntrophic archaeon, the first isolate of the lineage 'Asgard' archaea, and proposal of the new archaeal phylum Promethearchaeota phyl. nov. and kingdom Promethearchaeati regn. nov.

Hiroyuki Imachi, Masaru K Nobu, Shingo Kato, Yoshihiro Takaki, Masayuki Miyazaki, Makoto Miyata, Miyuki Ogawara, Yumi Saito, Sanae Sakai, Yuhei O Tahara …

International journal of systematic and evolutionary microbiology 74(7) 2024年7月査読有り
Draft genome sequence of an ubiquinone-10 producing Methylobacterium durans LRY1-08 isolated from lichen in Thailand.

Sirilak Namwong, Shingo Kato, Takao Iino, Takashi Itoh, Moriya Ohkuma, Pawina Kanchanasin, Wongsakorn Phongsopitanun, Somboon Tanasupawat

Data in brief 54 110485-110485 2024年6月査読有り
Rhodoferax lithotrophicus sp. nov., a neutrophilic iron-oxidizing and -reducing bacterium isolated from iron-rich freshwater sediments.

Shingo Kato, Takashi Itoh, Takao Iino, Mitsuo Sakamoto, Moriya Ohkuma

International journal of systematic and evolutionary microbiology 74(6) 2024年6月査読有り筆頭著者責任著者
Cell surface architecture of the cultivated DPANN archaeon Nanobdella aerobiophila

Shingo Kato, Yuhei O. Tahara, Yuki Nishimura, Katsuyuki Uematsu, Takahiro Arai, Daisuke Nakane, Ayaka Ihara, Takayuki Nishizaka, Wataru Iwasaki, Takashi Itoh …

Journal of Bacteriology 206(2) e00351-23 2024年1月30日査読有り筆頭著者責任著者
Nanobdellota phyl. nov .

Shingo Kato, Takashi Itoh, Moriya Ohkuma

Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria 1-3 2023年10月30日査読有り筆頭著者責任著者

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MISC

自己合成鉱物をエネルギー獲得に利用する多機能性鉄酸化細菌の発見,分離,生態解明

谷本和也, 加藤真悟, 濱村奈津子, 光延聖

日本微生物生態学会大会(Web) 38th 2025年
Nanobdellatiアーキアから探る初期生物の姿

加藤真悟

Viva Origino 52(4) ID 7 2025年1月査読有り招待有り筆頭著者最終著者責任著者
新規好熱好酸性硫酸還元アーキアの発見とその意義

加藤真悟, 伊藤隆, 大熊盛也

日本Archaea研究会講演会要旨集 36th 2024年
培養だけじゃない!微生物材料拠点の構築とゲノム情報の活用

西原亜理沙, 加藤真悟, 大熊盛也

日本微生物生態学会大会(Web) 37th 2024年
環境優占種の分離を目的とした新しい鉄酸化菌培養法「カスタマイズ培地法」の確立

内島智貴, 加藤真悟, 濱村奈津子, 光延聖

日本微生物生態学会大会(Web) 37th 2024年
シングルセルソーティングによる新規温泉アーキアの網羅的分離培養およびリソース化

加藤真悟

発酵研究所助成研究報告集 38 136 2024年
バクテリア/アーキアドメインをラマン顕微鏡による非破壊・非染色分析法で見分けられるか?:アーキア細胞に見られるラマン分光学的特徴

菅野菜々子, 加藤真悟, 伊藤隆, 大熊盛也, 小田和佳, 大谷竜哉, 高橋愛香音, 重藤真介

日本Archaea研究会講演会要旨集 35th 2023年
好気条件下で増殖するナノアーキアMJ1株およびMJ2株の性状・ゲノム

加藤真悟, 伊藤隆, 小笠原綾香, 高品知典, 大熊盛也

日本Archaea研究会講演会要旨集 35th 2023年
原核生物のドメインをラマン顕微鏡によって非破壊・非染色的に細胞レベルで識別する試み

菅野菜々子, 加藤真悟, 伊藤隆, 大熊盛也, 小田和佳, 大谷竜哉, 重藤真介, 重藤真介

日本微生物生態学会大会(Web) 36th 2023年
独立栄養性ヒ素鉄酸化菌の分離

大政勝喜, 加藤真悟, 濱村奈津子, 光延聖

日本微生物生態学会大会(Web) 36th 2023年
高温温泉に潜む未培養DPANNアーキアOYS group

柳川勝紀, 加藤真悟

日本微生物生態学会大会(Web) 36th 2023年
DPANNアーキアの共生機構に迫る

加藤真悟

日本微生物生態学会大会(Web) 36th 2023年
従属栄養性ヒ素鉄酸化菌の分離

植田健太郎, 大政勝喜, 加藤真悟, 濱村奈津子, 光延聖

日本微生物生態学会大会(Web) 36th 2023年
ナノアーキアの初の学名承認に至るまでの障壁と予想外の結末

加藤真悟

日本微生物生態学会大会(Web) 36th 2023年
アーキアに寄生して好気条件でも増殖可能な新規ナノアーキア

加藤真悟

バイオサイエンスとインダストリー 81(2) 118-119 2023年
ナノアーキアおよび宿主アーキアのグライコプロテオーム

高松芳基, 島村繁, 加藤真悟, 矢木宏和, 矢木宏和, 矢木真穂, 矢木真穂, 谷中冴子, 加藤晃一, 加藤晃一 …

日本Archaea研究会講演会要旨集 35th 2023年
DPANNおよび宿主アーキアの経時的グライコプロテオミクス

中川聡, 中川聡, 中川聡, 島村繁, 高松芳基, 酒井博之, 加藤真悟, 澤山茂樹, 矢木宏和, 矢木宏和 …

日本微生物生態学会大会(Web) 36th 2023年
ナノアーキア研究の現状と展望

加藤真悟

日本微生物生態学会誌 37(2) 63-69 2022年9月筆頭著者最終著者責任著者
網羅的ゲノム解析によるアーキアの未検証代謝機能の探索

加藤真悟, 伊藤隆, 大熊盛也

極限環境生物学会誌(Web) 21 2022年
奥塩原温泉における新規鉄代謝アーキアの探索

逆井青空, 加藤真悟, 伊藤隆, 大熊盛也, 高品知典

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2022 2022年

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書籍等出版物

Deep Sea: Biodiversity, Human Dimension and Ecological Significance

Shingo Kato (担当:分担執筆, 範囲:Prokaryotes In Metal Deposits On The Deep Seafloor)

Nova Science Publishers 2014年
Changing Diversity in Changing Environment

Shingo Kato (担当:分担執筆, 範囲:Microbial Biodiversity and Biogeography on the Deep Seafloor)

InTech 2011年

講演・口頭発表等

Release of online lists of JCM strains with various information

Shingo Kato, Kouji Suzu, Moriya Ohkuma

The 13th ANRRC International Meeting (ANRRC 2022) 2022年11月8日
DPANNアーキア研究の最前線

加藤真悟

日本微生物生態学会第35回大会 2022年11月2日招待有り
提供可能な JCM 株の一覧表のオンライン公開

加藤真悟, 鈴幸二, 大熊盛也

日本微生物資源学会第28回大会 2022年7月2日
Novel bacterial players driving iron cycle in freshwater sediments

Shingo Kato, Moriya Ohkuma

JpGU2022 2022年6月1日
ロングリードメタゲノミクスによる未培養性温泉微生物の完全ゲノム再構築

加藤真悟, 増田幸子, 柴田ありさ, 白須賢, 大熊盛也

日本微生物生態学会第34回大会 2021年11月1日
Research and Resource Development of Diverse Microorganisms in RIKEN-JCM

Shingo Kato

Tsukuba Conference 2021年9月24日招待有り
シングルセルソーティングの威力〜鉄サイクルを駆動する微生物生態の新展開〜

加藤真悟

新学術領域「ポストコッホ生態」シンポジウム 2021年7月6日招待有り
淡水性環境中の鉄サイクルを駆動する新規鉄酸化・還元細菌の探索

加藤真悟, 大熊盛也

日本微生物資源学会第27回大会 2021年6月23日
Oxidation and reduction of iron by a single Rhodoferax isolate at circumneutral pH

Shingo Kato, Takashi Itoh, Moriya Ohkuma

JpGU2021 2021年6月3日
Research and development of archaea/extremophilies in RIKEN-JCM

生物工学Webシンポジウム2020 2020年9月3日招待有り
Microbial ecology of hydrothermally-inactive sulfide deposits in deep-sea hydrothermal fields

Shingo Kato

4th InterRidge Theoretical Institute 2019年11月招待有り
極限環境下の「鉄」にまつわる微生物生態学

加藤真悟

極限環境生物学会2019年度 (第20回) 年会 2019年11月
深海底の熱水性硫化鉱物を「食べる」化学合成生態系

加藤真悟

日本地球化学会第66回年会 2019年9月招待有り
好熱好酸性ナノアーキアの共培養系から探るアーキア間相互作用

加藤真悟, 小笠原綾香, 伊藤隆, 酒井博之, 雪真弘, 高品知典, 大熊盛也

日本微生物生態学会第33回大会 2019年9月
鉄および硫黄を還元する好熱性タウムアーキア

加藤真悟, 伊藤隆, 雪真弘, 大西真史, 長森麻衣, 植松勝之, 鈴木勝彦, 高品知典, 大熊盛也

日本微生物生態学会第33回大会 2019年9月
Isolation of a sulfur- and iron-reducing thermoacidophilic thaumarchaeote

Shingo Kato, Takashi Itoh, Masahiro Yuki, Masafumi Ohnishi, Nagamori Mai, Tomonori Takashina, Moriya Ohkuma

15th International Congress on Thermophiles 2019年9月
新規好熱好酸性ナノアーキアの性状およびゲノム解析

加藤真悟, 小笠原綾香, 伊藤隆, 酒井博之, 雪真弘, 高品知典, 大熊盛也

日本Archaea研究会第32回講演会 2019年7月
好気条件下で増殖する好熱好酸性ナノアーキア

加藤真悟, 小笠原綾香, 伊藤隆, 雪真弘, 高品知典, 大熊盛也

日本微生物資源学会第26回大会 2019年6月
メタゲノム解析から探る未培養アーキア系統群Marine Benthic Group Eの生態

加藤真悟, 鈴木庸平, 伊藤隆, 大熊盛也, 鈴木勝彦

極限環境生物学会2018年度 (第19回) 年会 2018年12月
マンガンクラストの微生物学的研究の総括と展望

加藤真悟

海底マンガン鉱床の地球科学II -環境･開発･地球史- 2018年9月28日

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所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

好酸性硫酸還元菌から紐解く始原的微生物の代謝と生息場

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2024年4月 - 2028年3月

加藤真悟, 伊藤隆, 上野雄一郎
水田土壌表層へのヒ素異常濃集を支配する複合要因の解明と自然模倣型土壌浄化への応用

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2023年4月 - 2027年3月

光延聖, 白石史人, 濱村奈津子, 加藤真悟, 徳永紘平
絶対共生性「CPRバクテリア群/DPANNアーキア群」を標的にした革新的培養戦略

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 挑戦的研究(萌芽) 2022年6月 - 2025年3月

加藤真悟
細菌由来磁鉄鉱の定向配列の検出：細菌活動および古地球磁場研究の新展開

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2022年6月 - 2024年3月

臼井洋一, 加藤真悟
深海底での現場吸着・培養実験で明らかにする鉄マンガンクラストの成長・元素濃集過程

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2020年4月 - 2024年3月

柏原輝彦, 臼井朗, 加藤真悟, 菊池早希子
ナノ地球微生物学：酸化鉄ナノ鉱物の生成・溶解を駆動する微生物から紐解く元素循環

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2019年4月 - 2024年3月

加藤真悟, 鈴木庸平, 伊藤隆
局所ゲノム・鉱物解析による深部岩石環境に生息する極小原核生物の生態解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2020年4月 - 2023年3月

鈴木庸平, 加藤真悟, 石村豊穂
最先端X線分光法を駆使した水田土壌表層へのヒ素濃集機構の解明と土壌修復への応用

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2019年4月 - 2022年3月

光延聖, 松本真悟, 白石史人, 加藤真悟, 濱村奈津子, SHUKLA ELVIS.ANUP
ナノ地球微生物学：微生物が作り出す酸化鉄ナノ粒子から探る真の元素循環プロセス

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(A) 若手研究(A) 2016年4月 - 2019年3月

加藤真悟, 柏原輝彦, 齋藤誠史
狭間条件を好む難培養微生物を網羅的に分離する３D勾配培養法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究挑戦的萌芽研究 2016年4月 - 2018年3月

加藤真悟
鉄酸化独立栄養細菌が優先する微生物群集は深海底下に存在するか？

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 若手研究(B) 2012年4月 - 2014年3月

加藤真悟
室内熱水実験による大河の生物地球化学作用の検証

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2008年 - 2012年

鈴木勝彦, 山岸明彦, 中屋晴恵, 浦辺徹郎, 小林憲正, 大森聡一, 廣瀬丈洋, 加藤真悟, 正木裕香

加藤真悟

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

委員歴

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

所属学協会

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