岡田俊平 (Shunpei Okada) - マイポータル

基本情報

所属: 島根大学学術研究院医学・看護学系微生物学講座講師

学位: 博士(工学)(2015年3月東京大学)

J-GLOBAL ID: 202001013642947932
researchmap会員ID: R000000894

研究分野

経歴

2024年4月 - 現在

島根大学, 学術研究院医学・看護学系微生物学講座, 講師
2022年3月 - 2024年3月

島根大学, 学術研究院医学・看護学系微生物学講座, 助教
2019年4月 - 2022年2月

東京理科大学, 研究推進機構生命医科学研究所, 嘱託助教
2015年4月 - 2019年3月

東京大学, 大学院工学系研究科, 特任研究員

学歴

- 2015年3月

東京大学, 大学院工学系研究科, 化学生命工学専攻博士過程
- 2010年3月

東京大学, 大学院工学系研究科, 化学生命工学専攻修士過程
- 2008年3月

東京大学, 工学部, 化学生命工学科

受賞

2013年7月

第15回日本RNA学会年会優秀賞, 日本RNA学会

論文

MicroRNA-3145 as a potential therapeutic target for hepatitis B virus: inhibition of viral replication via downregulation of HBS and HBX

Amrizal Muchtar, Daichi Onomura, Dan Ding, Hironori Nishitsuji, Kunitada Shimotohno, Shunpei Okada, Keiji Ueda, Koichi Watashi, Takaji Wakita, Kei Iida …

Frontiers in Microbiology 15 2025年1月6日
Persistent Epstein–Barr Virus Infection of Epithelial Cells Leads to APOBEC3C Expression and Induces Mitochondrial DNA Mutations

Aung Phyo Wai, Richardo Timmy, Kousho Wakae, Shunpei Okada, Masamichi Muramatsu, Hironori Yoshiyama, Hisashi Iizasa

Microbiology and Immunology 2024年12月20日
Exploring the anti-EBV potential of suberoylanilide hydroxamic acid: induction of apoptosis in infected cells through suppressing BART gene expression and inducing lytic infection

Yuxin Liu, Aung Phyo Wai, Tumurgan Zolzaya, Yuichi Iida, Shunpei Okada, Hisashi Iizasa, Hironori Yoshiyama

Virology 110161-110161 2024年7月
ICLAMP: a novel technique to explore adenosine deamination via inosine chemical labeling and affinity molecular purification

Yuxi Yang, Koki Nakayama, Shunpei Okada, Kazuki Sato, Takeshi Wada, Yuriko Sakaguchi, Ayaka Murayama, Tsutomu Suzuki, Masayuki Sakurai

FEBS Letters 598(9) 1080-1093 2024年5月
Effects of Strain Differences, Humidity Changes, and Saliva Contamination on the Inactivation of SARS-CoV-2 by Ion Irradiation

Afifah Fatimah Azzahra Ahmad Wadi, Daichi Onomura, Hirokazu Funamori, Mst Mahmuda Khatun, Shunpei Okada, Hisashi Iizasa, Hironori Yoshiyama

Viruses 16(4) 520-520 2024年3月28日
Development of Epstein-Barr virus-associated gastric cancer: infection, inflammation, and oncogenesis

Hisashi Iizasa, Andi Visi Kartika, Syntayehu Fekadu, Shunpei Okada, Daichi Onomura, Afifah Fatimah Azzahra Ahmad Wadi, Mosammat Mahmuda Khatun, Thin Myat Moe, Jun Nishikawa, Hironori Yoshiyama

World Journal of Gastroenterology 28(44) 6249-6257 2022年11月査読有り
Regulation of A-to-I RNA editing and stop codon recoding to control selenoprotein expression during skeletal myogenesis

Yuta Noda, Shunpei Okada, Tsutomu Suzuki

Nature Communications 13(1) 2022年5月6日査読有り
Discovering A-to-I RNA editing through chemical methodology “ICE-seq”

Masayuki Sakurai, Shunpei Okada, Hiroki Ueda, Yuxi Yang

Methods in Molecular Biology 2181 113-148 2022年
Adenosine-to-inosine RNA editing in neurological development and disease

Yuxi Yang, Shunpei Okada, Masayuki Sakurai

RNA Biology 1-15 2021年1月6日査読有り
Complete chemical structures of human mitochondrial tRNAs.

Takeo Suzuki, Yuka Yashiro, Ittoku Kikuchi, Yuma Ishigami, Hironori Saito, Ikuya Matsuzawa, Shunpei Okada, Mari Mito, Shintaro Iwasaki, Ding Ma …

Nature communications 11(1) 2020年8月28日査読有り
The RNA-binding protein QKI-7 recruits the poly(A) polymerase GLD-2 for 3' adenylation and selective stabilization of microRNA-122.

Hiroaki Hojo, Yuka Yashiro, Yuta Noda, Koichi Ogami, Ryota Yamagishi, Shunpei Okada, Shin-Ichi Hoshino, Tsutomu Suzuki

The Journal of biological chemistry 295(2) 390-402 2020年1月10日査読有り
Transcriptome-wide identification of A-to-I RNA editing sites using ICE-seq.

Shunpei Okada, Hiroki Ueda, Yuta Noda, Tsutomu Suzuki

Methods (San Diego, Calif.) 156 66-78 2019年3月1日査読有り
RNA editing enzyme ADAR2 is a mediator of neuropathic pain after peripheral nerve injury.

Hitoshi Uchida, Shinji Matsumura, Shunpei Okada, Tsutomu Suzuki, Toshiaki Minami, Seiji Ito

FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology 31(5) 1847-1855 2017年5月査読有り
Regulation of gene expression via retrotransposon insertions and the noncoding RNA 4.5S RNAH.

Kentaro Ishida, Kenjyo Miyauchi, Yuko Kimura, Mari Mito, Shunpei Okada, Tsutomu Suzuki, Shinichi Nakagawa

Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms 20(11) 887-901 2015年11月査読有り
Transcriptome-wide identification of adenosine-to-inosine editing using the ICE-seq method.

Tsutomu Suzuki, Hiroki Ueda, Shunpei Okada, Masayuki Sakurai

Nature protocols 10(5) 715-32 2015年5月査読有り
Biochemical and Transcriptome-Wide Identification of A-to-I RNA Editing Sites by ICE-Seq.

Shunpei Okada, Masayuki Sakurai, Hiroki Ueda, Tsutomu Suzuki

Methods in enzymology 560 331-53 2015年査読有り
A biochemical landscape of A-to-I RNA editing in the human brain transcriptome.

Masayuki Sakurai, Hiroki Ueda, Takanori Yano, Shunpei Okada, Hideki Terajima, Toutai Mitsuyama, Atsushi Toyoda, Asao Fujiyama, Hitomi Kawabata, Tsutomu Suzuki

Genome research 24(3) 522-34 2014年3月査読有り

MISC

チロシンキナーゼ阻害剤ダサチニブはEpstein-Barrウイルス感染胃上皮細胞により強いアポトーシスを誘導する

LIU Yuxin, IIZASA Hisashi, PHYO Wai Aung, AFIFAH Fatimah, KHATUN Mst. Mahmuda, MYAT Moe Thin, TUMURGAN Zolzaya, OKADA Shunpei, YOSHIYAMA Hironori

日本ウイルス学会学術集会プログラム・予稿集(Web) 70th 2023年

書籍等出版物

新型コロナウイルス感染症の現況

岡田俊平, 飯笹久, Afifah Fatimah, Mst. Mahmuda, Khatun, Thin, Myat Moe, 吉山裕規

島根医学 43(1) 1-10 2023年4月
A-to-I RNA塩基編集による疾患と対策技術

櫻井雅之、久保田真依、中野美世子、岡田俊平

BIO Clinica 36: 504 2021年
A-to-I RNAエディティングの基礎と最新知見特集「エピトランスクリプトミクス」

櫻井雅之, 岡田俊平

月刊細胞53 : 884 2021年
A-to-I RNA塩基編集による疾患と対策技術

櫻井雅之, 岡田俊平

MSDメディカル・サイエンス・ダイジェスト（ニューサイエンス）46: 592 2020年
mRNAの塩基修飾･編集と遺伝子発現制御機構

櫻井雅之, 矢野孝紀, 岡田俊平, 竹内裕樹, 鈴木勉

蛋白質核酸酵素 54: 2086-2091 2009年

講演・口頭発表等

SARS-CoV-2複製におけるRNAポリメラーゼ–ヘリケース相互作用の重要性

岡田俊平, Mosammat Mahmuda Khatun, 東浦彰史, Moushumi Akter, 宇田川愛美, 松岡茂, 上村尚人, 吉山裕規, 坂口剛正, 飯笹久

第71回日本ウイルス学会学術集会コロナウイルス6 2024年11月6日
異なるサイズのサブゲノムRNAの合成に働くSARS-CoV-2不連続転写機構の研究

岡田俊平, Mosammat Mahmuda Khatun, 飯笹久, 宇田川愛美, 吉山裕規

第70回日本ウイルス学会学術集会ワークショップ1「ウイルス遺伝子発現・複製制御1」 2023年9月26日
Can subgenomic RNA synthesis of SARS-CoV-2 be a novel therapeutic target ?

Hisashi Iizasa, Mst. Mahmada Khatun, Tumurgan Zolzaya, Shunpei Okada, Hironori Yoshiyama

ICPAC Bali 2023 2023年9月15日招待有り
SARS-CoV-2の異なるサイズのサブゲノムRNA転写機構の研究

Mst Mahmuda Khatun, 岡田俊平, 宇田川愛美, 飯笹久, 吉山裕規

第37回中国四国ウイルス研究会 2023年9月
異なるサイズのサブゲノムRNA合成に必要なSARS-CoV-2不連続転写の分子機構

岡田俊平, Mosamma, Mahmuda Khatun, 飯笹久, 宇田川愛美, 吉山裕規

第1回新型コロナウイルス研究集会 2023年6月9日
SARS-CoV-2の異なるサイズのサブゲノムRNA合成機構の研究

Mst Mahmuda Khatun, 岡田俊平, 飯笹久, 宇田川愛美, 吉山裕規

第36回インフルエンザ研究者交流の会シンポジウム 2023年6月
SARS-CoV-2固有のRNAメチル化酵素阻害剤の開発

前田麗, 穐近慎一郎, 今村理世, 平出秀人, 宇田川愛美, 岡田俊平, KULSAYUMPORN Naphatsorn, 飯笹久, 吉山裕規, 岡部隆義, 小島宏建, 鈴木勉

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 2023年12月8日
SARS-CoV-2サブゲノムRNA合成に必須な不連続転写の分子機構

岡田俊平, 飯笹久, 宇田川愛美, 吉山裕規

第36回中四国ウイルス研究会 2022年10月29日
アデノシン脱アミノ化RNA編集による新型コロナウイルスの遺伝子配列改変機構

岡田俊平 et al.

東京理科大学研究推進機構核酸創薬研究部門第4回シンポジウム 2021年9月
Single molecule analysis and profiling of tRNAs by direct nanopore sequencing

Maeda, M., Okada, S., Furuta, M., Yamamoto, R., Nishi, R., Dasgupta, B., Noguchi, R., Nagao, A., Sakaguchi, Y., Miyauchi, K., Ueda, H., Suzuki, T.

第22回日本RNA学会 2021年7月
ヒト骨格筋形成に必須なSEPN1のAlu配列エキソン化の制御におけるA-to-I RNAエディティングの機能と生理的意義

野田悠太, 岡田俊平, 鈴木勉

第21回日本RNA学会年会 2019年7月
A-to-I RNA editing regulates skeletal muscle specific exonization of Alu element

Noda Y., Okada S., Suzuki T.

The 23rd annual meeting of the RNA society (RNA2018) 2018年
ヒト骨格筋特異的なAlu配列エキソン化の制御におけるA-to-I RNAエディティングの機能と生理的意義

野田悠太, 岡田俊平, 矢野孝紀, 鈴木勉

生命科学系学会合同年次大会 2017年12月
RNAヘリケースによるA-toI RNAエディティングのエピトランスクリプトーム制御

岡田俊平, 野口英樹, 光山統泰, 矢野孝紀, 櫻井雅之, 豊田敦, 藤山秋佐夫, 鈴木勉

第19回日本RNA学会年会 2017年7月
mRNAの動的二次構造変化によるA-to-I RNAエディティングの形成機構

岡田俊平, 野口英樹, 光山統泰, 矢野孝紀, 櫻井雅之, 豊田敦, 藤山秋佐夫, 鈴木勉

第五回NGS現場の会 2017年5月招待有り
ADAR1 prevents aberrant exonization of Alu elements in human transcriptome

Okada S., Noguchi H., Toyoda, A., Guo C. T., Noda Y., Mitsuyama T., Fujiyama A., Suzuki T.

The 21st annual meeting of the RNA society (RNA2016) 2016年
核内RNAヘリケースUpf1によるA-to-I RNAエディティングの制御

岡田俊平, 矢野孝紀, 櫻井雅之, 鈴木勉

第15回日本RNA学会年会 2013年7月
Dynamic rearrangement of mRNA secondary structure in the cell.

Okada S., Yano T., Sakurai M., Kawabata H., Ueda H., Suzuki T.

Gordon Research Conferences “RNA editing” 2011年
細胞内におけるmRNAの動的な二次構造変化

岡田俊平, 矢野孝紀, 櫻井雅之, 川畑瞳, 上田宏生, 鈴木勉

第12回日本RNA学会年会 2010年7月
A-to-I RNA EditingによるmiRNA依存的翻訳制御の調節

岡田俊平, 櫻井雅之, 矢野孝紀, 川畑瞳, 光山統泰, 上田宏生, 鈴木勉

第11回日本RNA学会 2009年7月

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

SARS-CoV-2サブゲノムRNA合成機構の解明に基づく治療薬開発

大分大学大分大学グローカル感染症研究センター共同研究 2022年7月 - 2024年3月
ゲノム構造Rループ形成のエピトランスクリプトミクス制御

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究若手研究 2019年4月 - 2022年3月

岡田俊平
A-to-I RNA編集を活用した新型コロナウイルスの治療法開発

東京理科大学若手・女性研究者助成金 2020年 - 2022年

その他

METHODS OF THE YEAR 2016, Nature Methods

A-to-I RNAエディティング部位を検出するICE-seqがNature Methods誌のMETHODS OF THE YEAR 2016に選出 “Epitranscriptome sequencing technologies: decoding RNA modifications” Li, X., Xiong, X., and Yi, C. Nature Methods 14: 23-31