相馬亜希子 (Akiko Soma) - マイポータル

基本情報

学位: 農学(岩手大学)

J-GLOBAL ID: 200901000969439180
researchmap会員ID: 5000023126

研究キーワード

Translation, tRNA, Gene structure, RNA processing, Microbiology

研究分野

ライフサイエンス / 分子生物学 / 遺伝子発現、機能性RNA、RNAプロセシング、微生物

受賞

2023年

長瀬研究振興賞, 「枯草菌におけるtRNA大規模欠失株の構築」, 長瀬科学技術振興財団

相馬亜希子
2008年11月

研究奨励賞, 「始原紅藻Cyanidioschyzon merolaeのpermuted tRNA geneの発見」, 極限環境微生物学会

相馬亜希子
2008年6月

第１９回学術研究奨励賞, 「逆転tRNA遺伝子からみつかった新しい遺伝情報の加工方法～輪をつくって切って、ひっくり返す～」, 山下太郎記念財団

相馬亜希子

論文

A tRNA modification with aminovaleramide facilitates AUA decoding in protein synthesis

Kenjyo Miyauchi, Satoshi Kimura, Naho Akiyama, Kazuki Inoue, Kensuke Ishiguro, Thien-Son Vu, Veerasak Srisuknimit, Kenta Koyama, Gosuke Hayashi, Akiko Soma …

Nature Chemical Biology 2024年9月19日査読有り
yaaJ, the tRNA-Specific Adenosine Deaminase, Is Dispensable in Bacillus subtilis

Akiko Soma, Atsushi Kubota, Daisuke Tomoe, Yoshiho Ikeuchi, Fujio Kawamura, Hijiri Arimoto, Yuh Shiwa, Yu Kanesaki, Hideaki Nanamiya, Hirofumi Yoshikawa …

Genes 14(8) 1515 2023年7月25日査読有り筆頭著者責任著者
Intron-Dependent or Independent Pseudouridylation of Precursor tRNA Containing Atypical Introns in Cyanidioschyzon merolae.

Yasuha Nagato, Chie Tomikawa, Hideyuki Yamaji, Akiko Soma, Kazuyuki Takai

International journal of molecular sciences 23(20) 2022年10月11日査読有り
A leaderless mRNA including tRNA-like sequence encodes a small peptide that regulates the expression of GcvB small RNA in Escherichia coli.

Akira Muto, Simon Goto, Daisuke Kurita, Chisato Ushida, Akiko Soma, Hyota Himeno

Journal of biochemistry 2022年1月27日査読有り
Evolution of Ribosomal Protein S14 Demonstrated by the Reconstruction of Chimeric Ribosomes in Bacillus subtilis

Genki Akanuma, Fujio Kawamura, Satoru Watanabe, Masaki Watanabe, Fumiya Okawa, Yousuke Natori, Hideaki Nanamiya, Kei Asai, Taku Chibazakura, Hirofumi Yoshikawa …

Journal of Bacteriology 203(10) 2021年4月21日査読有り
Acetate-dependent tRNA acetylation required for decoding fidelity in protein synthesis.

Takaaki Taniguchi, Kenjyo Miyauchi, Yuriko Sakaguchi, Seisuke Yamashita, Akiko Soma, Kozo Tomita, Tsutomu Suzuki

Nature chemical biology 14(11) 1010-1020 2018年11月査読有り
Small RNA Esr41 inversely regulates expression of LEE and flagellar genes in enterohaemorrhagic Escherichia coli.

Naoki Sudo, Akiko Soma, Sunao Iyoda, Taku Oshima, Yui Ohto, Kenta Saito, Yasuhiko Sekine

Microbiology (Reading, England) 164(5) 821-834 2018年5月査読有り
Processing pathway of disrupted tRNAs in a primitive red alga Cyanidioschyzon merolae.

Saori Hiromoto, Akiko Soma

Viva Origino 45 1-7 2017年査読有り責任著者
A novel small regulatory RNA enhances cell motility in enterohemorrhagic Escherichia coli.

Naoki Sudo, Akiko Soma, Akira Muto, Sunao Iyoda, Mayumi Suh, Nanako Kurihara, Hiroyuki Abe, Toru Tobe, Yoshitoshi Ogura, Tetsuya Hayashi …

The Journal of general and applied microbiology 60(1) 44-50 2014年査読有り
Circularly permuted tRNA genes: their expression and implications for their physiological relevance and development.

Akiko Soma

Frontiers in genetics 5 63-63 2014年査読有り筆頭著者責任著者
Identification of highly-disrupted tRNA genes in nuclear genome of the red alga, Cyanidioschyzon merolae 10D.

Akiko Soma, Junichi Sugahara, Akinori Onodera, Nozomu Yachie, Akio Kanai, Satoru Watanabe, Hirofumi Yoshikawa, Mio Ohnuma, Haruko Kuroiwa, Tsuneyoshi Kuroiwa …

Scientific reports 3 2321-2321 2013年査読有り筆頭著者責任著者
Identification and functional analysis of non-coding RNA from hemorrhagic Escherichia coli O157:H7 sakai.

Akiko Soma

Inst. Ferment. Res. Comm. (25) 93-105 2011年査読有り筆頭著者責任著者
始原紅藻Cyanidioschyzon merolaeの新しいtRNA遺伝子とRNAプロセシング経路の発見

相馬亜希子

Journal of Japanese Society for Extremophiles 8(1) 11-14 2009年査読有り筆頭著者責任著者
Permuted tRNA genes expressed via a circular RNA intermediate in Cyanidioschyzon merolae.

Akiko Soma, Akinori Onodera, Junichi Sugahara, Akio Kanai, Nozomu Yachie, Masaru Tomita, Fujio Kawamura, Yasuhiko Sekine

Science (New York, N.Y.) 318(5849) 450-3 2007年10月19日査読有り筆頭著者
SPLITS: a new program for predicting split and intron-containing tRNA genes at the genome level.

Junichi Sugahara, Nozomu Yachie, Yasuhiko Sekine, Akiko Soma, Motomu Matsui, Masaru Tomita, Akio Kanai

In silico biology 6(5) 411-8 2006年査読有り
Molecular mechanism of lysidine synthesis that determines tRNA identity and codon recognition.

Yoshiho Ikeuchi, Akiko Soma, Tomotake Ote, Jun-ichi Kato, Yasuhiko Sekine, Tsutomu Suzuki

Molecular cell 19(2) 235-46 2005年7月22日査読有り筆頭著者
Structural basis for lysidine formation by ATP pyrophosphatase accompanied by a lysine-specific loop and a tRNA-recognition domain.

Kotaro Nakanishi, Shuya Fukai, Yoshiho Ikeuchi, Akiko Soma, Yasuhiko Sekine, Tsutomu Suzuki, Osamu Nureki

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 102(21) 7487-92 2005年5月24日査読有り
An RNA-modifying enzyme that governs both the codon and amino acid specificities of isoleucine tRNA.

Akiko Soma, Yoshiho Ikeuchi, Satoru Kanemasa, Kazuo Kobayashi, Naotake Ogasawara, Tomotake Ote, Jun-ichi Kato, Kimitsuna Watanabe, Yasuhiko Sekine, Tsutomu Suzuki

Molecular cell 12(3) 689-98 2003年9月査読有り筆頭著者
Site-specific incorporation of an unnatural amino acid into proteins in mammalian cells.

Kensaku Sakamoto, Akiko Hayashi, Ayako Sakamoto, Daisuke Kiga, Hiroshi Nakayama, Akiko Soma, Takatsugu Kobayashi, Makoto Kitabatake, Koji Takio, Kazuki Saito …

Nucleic acids research 30(21) 4692-9 2002年11月1日査読有り
Unique recognition style of tRNA Leu by Haloferax volcanii Leucyl-tRNA synthetase 1 1Edited by D. E. Draper

Akiko Soma, Kiyoto Uchiyama, Teruyuki Sakamoto, Miho Maeda, Hyouta Himeno

Journal of Molecular Biology 293(5) 1029-1038 1999年11月査読有り筆頭著者

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MISC

始原紅藻Cyanidioschyzon merolaeの逆転tRNA遺伝子と新しいRNAプロセシング経路の発見

相馬亜希子、関根靖彦

化学と生物 48(4) 249-254 2010年12月
A. aeolicus tRNAIle2 リシジン合成酵素の結晶構造とその反応触媒機構(蛋白質 A) 構造)

中西孝太郎, 深井周也, 池内与志穂, 相馬亜希子, 鈴木勉, 濡木理

生物物理 44 S124 2004年11月
Class II tRNAの認識・識別機構

相馬亜希子, 内山清人, 坂本輝路, 前田美帆, 吉田淑子, 熊谷律子, 姫野俵太

日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 21 440-440 1998年12月1日
classII tRNAの認識・識別機構における進化的考察

相馬亜希子, 吉田淑子, 姫野俵太

日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 19 470-470 1996年8月1日

Works(作品等)

女子高生夏の学校

2006年 - 2008年

共同研究・競争的資金等の研究課題

オルガネラ由来NUPT/NUMT-tRNAによる新規の遺伝暗号解読戦略の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2022年4月 - 2025年3月

相馬亜希子
植物オルガネラの限定的なtRNA-アミノアシル化酵素セットによる翻訳機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2019年4月 - 2022年3月

相馬亜希子
逆転および分断化ｔＲＮＡ遺伝子の成立におけるイントロンスプライシング機構の役割

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2013年4月 - 2016年3月

相馬亜希子
逆転または高度に分断されたtRNA遺伝子の成り立ちと進化の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2011年 - 2012年

相馬亜希子
病原性大腸菌O157株特異的な非翻訳型RNAの同定と病原性発現における機能の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2006年 - 2007年

相馬亜希子
バクテリアtRNAの修飾機構と病原性発現への関与の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2005年 - 2006年

相馬亜希子
修飾塩基ライシジンの生合成とそれを有する大腸菌O157株特異的tRNAの機能解析

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2004年 - 2004年

相馬亜希子
class2tRNAにおける認識機構の進化

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 1998年 - 1999年

相馬亜希子
tRNAおよびsmall RNAの研究
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メディア報道

「病原性細菌と植物に共通、新規tRNA修飾の発見」

科学新聞 2024年9月新聞・雑誌
「病原性細菌と植物に共通の新規tRNA修飾―タンパク質合成の隠れた調整役」

日本経済新聞 2024年9月インターネットメディア
「逆転tRNA遺伝子と新しいRNA加工法の発見」

琉球新聞 2007年新聞・雑誌
「逆転tRNA遺伝子と新しいRNA加工法の発見」

山陽新聞 2007年新聞・雑誌
「逆転tRNA遺伝子と新しいRNA加工法の発見」

日経新聞 2007年新聞・雑誌
「逆転tRNA遺伝子と新しいRNA加工法の発見」

朝日新聞 2007年新聞・雑誌

相馬亜希子

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研究キーワード

研究分野

受賞

論文

MISC

Works(作品等)

共同研究・競争的資金等の研究課題

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