菊池壮太郎 (Sotaro Kikuchi) - マイポータル

基本情報

所属: 奈良県立医科大学未来基礎医学教室助教

学位: 博士(理学)

研究者番号: 90866386
J-GLOBAL ID: 201901004739228485
researchmap会員ID: B000355287

研究キーワード

構造生物学

研究分野

ライフサイエンス / 構造生物化学 /

経歴

2019年9月 - 現在

奈良県立医科大学医学部, 未来基礎医学教室, 助教
2014年6月 - 2019年8月

University of Texas Southwestern Medical Center, 博士研究員

論文

C9orf72-Derived Proline:Arginine Poly-Dipeptides Modulate Cytoskeleton and Mechanical Stress Response

Tomo Shiota, Riko Nagata, Sotaro Kikuchi, Hitoki Nanaura, Masaya Matsubayashi, Mari Nakanishi, Shinko Kobashigawa, Noriyoshi Isozumi, Takao Kiriyama, Kazuaki Nagayama …

Frontiers in Cell and Developmental Biology 10 2022年3月23日
C9orf72-derived arginine-rich poly-dipeptides impede phase modifiers.

Hitoki Nanaura, Honoka Kawamukai, Ayano Fujiwara, Takeru Uehara, Yuichiro Aiba, Mari Nakanishi, Tomo Shiota, Masaki Hibino, Pattama Wiriyasermkul, Sotaro Kikuchi …

Nature communications 12(1) 5301-5301 2021年9月6日
Gene Expression Profiles of Human Cerebral Organoids Identify PPAR Pathway and PKM2 as Key Markers for Oxygen-Glucose Deprivation and Reoxygenation

Naoki Iwasa, Takeshi K. Matsui, Naohiko Iguchi, Kaoru Kinugawa, Naritaka Morikawa, Yoshihiko M. Sakaguchi, Tomo Shiota, Shinko Kobashigawa, Mari Nakanishi, Masaya Matsubayashi …

Frontiers in Cellular Neuroscience 15 2021年6月8日
27-Hydroxycholesterol regulates human SLC22A12 gene expression through estrogen receptor action.

Masaya Matsubayashi, Yoshihiko M Sakaguchi, Yoshiki Sahara, Hitoki Nanaura, Sotaro Kikuchi, Arvand Asghari, Linh Bui, Shinko Kobashigawa, Mari Nakanishi, Riko Nagata …

FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology 35(1) e21262 2021年1月
Inhibition of the ATR kinase enhances 5-FU sensitivity independently of nonhomologous end-joining and homologous recombination repair pathways.

Soichiro S Ito, Yosuke Nakagawa, Masaya Matsubayashi, Yoshihiko M Sakaguchi, Shinko Kobashigawa, Takeshi K Matsui, Hitoki Nanaura, Mari Nakanishi, Fumika Kitayoshi, Sotaro Kikuchi …

The Journal of biological chemistry 295(37) 12946-12961 2020年9月11日
Human URAT1/SLC22A12 gene promoter is regulated by 27-hydroxycholesterol through estrogen response elements

Masaya Matsubayashi, Yoshihiko M. Sakaguchi, Yoshiki Sahara, Hitoki Nanaura, Sotaro Kikuchi, Arvand Ashari, Linh Bui, Shinko Kobashigawa, Mari Nakanishi, Riko Nagata …

2019年11月6日
Toxic PR poly-dipeptides encoded by the C9orf72 repeat expansion target Kapβ2 and dysregulate phase separation of low-complexity domains

Hitoki Nanaura, Honoka Kawamukai, Ayano Fujiwara, Takeru Uehara, Mari Nakanishi, Tomo Shiota, Masaki Hibino, Yuichiro Aiba, Pattama Wiriyasermkul, Sotaro Kikuchi …

2019年10月21日
Mitotic regulators and the SHP2-MAPK pathway promote IR endocytosis and feedback regulation of insulin signaling.

Eunhee Choi, Sotaro Kikuchi, Haishan Gao, Karolina Brodzik, Ibrahim Nassour, Adam Yopp, Amit G Singal, Hao Zhu, Hongtao Yu

Nature communications 10(1) 1473-1473 2019年4月1日査読有り
Scc2 Is a Potent Activator of Cohesin's ATPase that Promotes Loading by Binding Scc1 without Pds5.

Naomi J Petela, Thomas G Gligoris, Jean Metson, Byung-Gil Lee, Menelaos Voulgaris, Bin Hu, Sotaro Kikuchi, Christophe Chapard, Wentao Chen, Eeson Rajendra …

Molecular cell 70(6) 1134-1148 2018年6月21日査読有り
Dynamic feature of mitotic arrest deficient 2-like protein 2 (MAD2L2) and structural basis for its interaction with chromosome alignment-maintaining phosphoprotein (CAMP).

Kodai Hara, Shota Taharazako, Masanori Ikeda, Hiroki Fujita, Yoshiko Mikami, Sotaro Kikuchi, Asami Hishiki, Hideshi Yokoyama, Yoshinobu Ishikawa, Shin-Ichiro Kanno …

The Journal of biological chemistry 292(43) 17658-17667 2017年10月27日査読有り
Structural basis for the molecular interactions in DNA damage tolerances.

Hiroshi Hashimoto, Asami Hishiki, Kodai Hara, Sotaro Kikuchi

Biophysics and physicobiology 14 199-205 2017年査読有り
Crystal structure of the cohesin loader Scc2 and insight into cohesinopathy.

Sotaro Kikuchi, Dominika M Borek, Zbyszek Otwinowski, Diana R Tomchick, Hongtao Yu

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 113(44) 12444-12449 2016年11月1日査読有り
Identification of the first small-molecule inhibitor of the REV7 DNA repair protein interaction.

Marcelo L Actis, Nigus D Ambaye, Benjamin J Evison, Youming Shao, Murugendra Vanarotti, Akira Inoue, Ezelle T McDonald, Sotaro Kikuchi, Richard Heath, Kodai Hara …

Bioorganic & medicinal chemistry 24(18) 4339-4346 2016年9月15日査読有り
A small molecule inhibitor of monoubiquitinated Proliferating Cell Nuclear Antigen (PCNA) inhibits repair of interstrand DNA cross-link, enhances DNA double strand break, and sensitizes cancer cells to cisplatin.

Akira Inoue, Sotaro Kikuchi, Asami Hishiki, Youming Shao, Richard Heath, Benjamin J Evison, Marcelo Actis, Christine E Canman, Hiroshi Hashimoto, Naoaki Fujii

The Journal of biological chemistry 289(10) 7109-20 2014年3月7日査読有り
A missense mutation in Rev7 disrupts formation of Polζ, impairing mouse development and repair of genotoxic agent-induced DNA lesions.

Khalaj M, Abbasi A, Yamanishi H, Akiyama K, Wakitani S, Kikuchi S, Hirose M, Yuzuriha M, Magari M, Degheidy HA …

The Journal of biological chemistry 289(6) 3811-24 2014年2月7日査読有り
Structural basis of recruitment of DNA polymerase ζ by interaction between REV1 and REV7 proteins.

Kikuchi S, Hara K, Shimizu T, Sato M, Hashimoto H

The Journal of biological chemistry 287(40) 33847-52 2012年9月28日査読有り
Crystallization and X-ray diffraction analysis of the ternary complex of the C-terminal domain of human REV1 in complex with REV7 bound to a REV3 fragment involved in translesion DNA synthesis.

Sotaro Kikuchi, Kodai Hara, Toshiyuki Shimizu, Mamoru Sato, Hiroshi Hashimoto

Acta crystallographica. Section F, Structural biology and crystallization communications 68(Pt 8) 962-4 2012年8月1日査読有り

MISC

コヒーシンローダーScc2のX線結晶構造解析

菊池壮太郎, YU Hongtao

日本結晶学会誌 59(2-3) 121‐126(J‐STAGE)-126 2017年
DNAに傷があっても複製を続けるための分子メカニズム

橋本博, 菱木麻美, 原幸大, 菊池壮太郎

生物物理(Web) 57(1) 015‐019(J‐STAGE)-19 2017年

共同研究・競争的資金等の研究課題

減数分裂期の染色体軸形成を担うコヒーシンとHORMAD1の構造機能解析

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2021年4月 - 2023年3月

菊池壮太郎
生物学的相分離の制御機構

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2020年4月 - 2023年3月

森英一朗, 吉澤拓也, 齋尾智英, 菊池壮太郎

菊池壮太郎

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研究分野

経歴

論文

MISC

共同研究・競争的資金等の研究課題

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