寺本翔太 (Shota TERAMOTO) - マイポータル

基本情報

所属: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構作物研究部門任期付き研究員

学位: 博士（農学）(2014年7月京都大学)

研究者番号: 20815534
J-GLOBAL ID: 201801017388788486
researchmap会員ID: B000300639

イネを実験材料とした研究に従事しています。
作物、育種、環境、生態などに興味があります。

資格：
博士（農学）
危険物取扱者（甲種）
エックス線作業主任者

研究分野

環境・農学 / 遺伝育種科学 /

経歴

2020年4月 - 現在

国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構作物研究部門（旧：次世代作物開発研究センター）任期付き研究員
2018年4月 - 2020年3月

国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構次世代作物開発研究センター特別研究員
2015年4月 - 2018年3月

東京大学農学生命科学研究科特任研究員
2014年8月 - 2015年3月

京都大学農学研究科特別研究員

受賞

2022年9月

学術奨励賞根研究学会

寺本翔太
2019年3月

優秀発表賞日本育種学会

寺本翔太, 高安聡子, 宇賀優作
2012年10月

優秀発表賞日本育種学会

寺本翔太, 築山拓司, 寺石政義, 谷坂隆俊, 奥本裕

論文

Rice immediately adapts the dynamics of photosynthates translocation to roots in response to changes in soil water environment

Yuta Miyoshi, Fumiyuki Soma, Yong-Gen Yin, Nobuo Suzui, Yusaku Noda, Kazuyuki Enomoto, Yuto Nagao, Mitsutaka Yamaguchi, Naoki Kawachi, Eiji Yoshida, Hideaki Tashima, Taiga Yamaya, Noriyuki Kuya, Shota Teramoto, Yusaku Uga

Frontiers in Plant Science 13 2023年1月18日
Four-dimensional measurement of root system development using time-series three-dimensional volumetric data analysis by backward prediction

Shota Teramoto, Yusaku Uga

Plant Methods 18(1) 2022年12月9日査読有り筆頭著者
Identification of a unique allele in the quantitative trait locus for crown root number in japonica rice from Japan using genome-wide association studies

Shota Teramoto, Masanori Yamasaki, Yusaku Uga

Breeding Science 72(4) 222-231 2022年3月査読有り筆頭著者
Improving the efficiency of plant root system phenotyping through digitization and automation

Shota Teramoto, Yusaku Uga

Breeding Science 72(1) 48-55 2022年2月査読有り筆頭著者
Plant root PET: visualization of photosynthate translocation to roots in rice plant

Y. Miyoshi, Y. Nagao, M. Yamaguchi, N. Suzui, Y.-G. Yin, N. Kawachi, E. Yoshida, S. Takyu, H. Tashima, T. Yamaya, N. Kuya, S. Teramoto, Y. Uga

Journal of Instrumentation 16(12) C12018-C12018 2021年12月査読有り
RSAtrace3D: robust vectorization software for measuring monocot root system architecture

Shota Teramoto, Takanari Tanabata, Yusaku Uga

BMC Plant Biology 21(398) 2021年8月査読有り筆頭著者
iPOTs: Internet of Things‐based pot system controlling optional treatment of soil water condition for plant phenotyping under drought stress

Yuko Numajiri, Kanami Yoshino, Shota Teramoto, Atsushi Hayashi, Ryo Nishijima, Tsuyoshi Tanaka, Takeshi Hayashi, Taiji Kawakatsu, Takanari Tanabata, Yusaku Uga

The Plant Journal 107(5) 1569-1580 2021年7月査読有り
The transcriptomic landscapes of rice cultivars with diverse root system architectures grown in upland field conditions

Taiji Kawakatsu, Shota Teramoto, Satoko Takayasu, Natsuko Maruyama, Ryo Nishijima, Yuka Kitomi, Yusaku Uga

The Plant Journal 106(4) 1177-1190 2021年3月9日査読有り筆頭著者
Growth and nitrate reductase activity are impaired in rice osnlp4 mutantssupplied with nitrate.

Mengyao Wang, Takahiro Hasegawa, Marcel Beier, Makoto Hayashi, Yoshihiro Ohmori, Kenji Yano, Shota Teramoto, Takehiro Kamiya, Toru Fujiwara

Plant & cell physiology 62(7) 1156-1167 2021年3月6日査読有り
A Deep Learning-Based Phenotypic Analysis of Rice Root Distribution from Field Images

S. Teramoto, Y. Uga

Plant Phenomics 2020 1-10 2020年10月16日査読有り筆頭著者
De Novo Genome Assembly of the indica Rice Variety IR64 Using Linked-Read Sequencing and Nanopore Sequencing.

Tsuyoshi Tanaka, Ryo Nishijima, Shota Teramoto, Yuka Kitomi, Takeshi Hayashi, Yusaku Uga, Taiji Kawakatsu

G3 (Bethesda, Md.) 10(5) 1495-1501 2020年3月17日査読有り
High-throughput three-dimensional visualization of root system architecture of rice using X-ray computed tomography.

Shota Teramoto, Satoko Takayasu, Yuka Kitomi, Yumiko Arai-Sanoh, Takanari Tanabata, Yusaku Uga

Plant methods 16 66-66 2020年査読有り筆頭著者
Towards a deeper integrated multi-omics approach in the root system to develop climate-resilient rice

Kanami Yoshino, Yuko Numajiri, Shota Teramoto, Naoki Kawachi, Takanari Tanabata, Tsuyoshi Tanaka, Takeshi Hayashi, Taiji Kawakatsu, Yusaku Uga

Molecular Breeding 39(165) 2019年11月査読有り
Backhoe-assisted monolith method for plant root phenotyping under upland conditions.

Shota Teramoto, Yuka Kitomi, Ryo Nishijima, Satoko Takayasu, Natsuko Maruyama, Yusaku Uga

Breeding science 69(3) 508-513 2019年9月査読有り筆頭著者
Early Embryogenesis-Specific Expression of the Rice Transposon Ping Enhances Amplification of the MITE mPing

Shota Teramoto, Takuji Tsukiyama, Yutaka Okumoto, Takatoshi Tanisaka

PLOS GENETICS 10(6) 2014年6月査読有り筆頭著者
Loss-of-function of a ubiquitin-related modifier promotes the mobilization of the active MITE mPing

Takuji Tsukiyama, Shota Teramoto, Kanako Yasuda, Akira Horibata, Nanako Mori, Yutaka Okumoto, Masayoshi Teraishi, Hiroki Saito, Takatoshi Tanisaka

GENES & GENETIC SYSTEMS 88(6) 358-358 2013年12月査読有り
Loss-of-function of a ubiquitin-related modifier promotes the mobilization of the active MITE mPing

Takuji Tsukiyama, Shota Teramoto, Kanako Yasuda, Akira Horibata, Nanako Mori, Yutaka Okumoto, Masayoshi Teraishi, Hiroki Saito, Akiko Onishi, Kanako Tamura, Takatoshi Tanisaka

Molecular Plant 6(3) 790-801 2013年査読有り
イネ活性型トランスポゾンmPingのための信頼性の高いトランスポゾンディスプレイ法

寺本翔太, 築山拓司, 寺石政義, 谷坂隆俊, 奥本裕

作物研究 56 63-66 2011年査読有り筆頭著者
ダイズゲノムにおける活性型転移因子の探索

伊藤洋介, 寺石政義, 谷坂隆俊, 齊藤大樹, 羽生剛, 寺本翔太, 中崎鉄也, 北島宣

育種学研究 12 23 2010年3月26日査読有り

MISC

地中に隠れた作物根系のハイスループット・フェノタイピングを目指して—Towards high-throughput phenotyping of root system hidden underground—特集スマート育種の展開 : 現状と将来展望

寺本翔太, 宇賀優作

JATAFFジャーナル = JATAFF journal : 農林水産技術 10(12) 34-38 2022年12月
エックス線CTを用いたイネ根系計測のためのベクトル化ソフトウェアの開発

寺本翔太, 七夕高也, 宇賀優作

根の研究 31(1) 2022年
異なる根系を持つイネの品種間干ばつ応答発現プロファイルの比較

吉野花奈美, 沼尻侑子, 寺本翔太, 吉田沙樹, 西嶋遼, 宇賀優作, 川勝泰二

育種学研究 23 2021年
畑作条件で栽培した世界のイネ品種の根系フェノーム解析

寺本翔太, 高安聡子, 丸山奈津子, 木富悠花, 西嶋遼, 川勝泰二, 宇賀優作

育種学研究 23 2021年
畑作条件で栽培した世界のイネ品種のトランスクリプトーム解析

川勝泰二, 寺本翔太, 西嶋遼, 高安聡子, 丸山奈津子, 木富悠花, 宇賀優作

育種学研究 23 2021年
iPOTs:干ばつ条件での植物フェノタイピングを可能にするIoTベース土壌水分制御ポットシステムの開発

沼尻侑子, 吉野花奈美, 寺本翔太, 林篤司, 西嶋遼, 田中剛, 林武司, 川勝泰二, 七夕高也, 宇賀優作

育種学研究 23 2021年
RSAtrace3D:根系定量化のためのノイズに強い3次元ベクトル化ソフトウェア

寺本翔太, 七夕高也, 宇賀優作

育種学研究 23 2021年
X線CTを用いた高温ストレスに対する土中のイネ根系の可塑性の解明

吉田沙樹, 沼尻侑子, 寺本翔太, 七夕高也, 宇賀優作

育種学研究 23 2021年
深層学習を用いた画像解析によるフィールドでのイネ根系の多様性解析

寺本翔太, 宇賀優作

育種学研究 22 2020年
X線CTを用いたポット植え作物根の非破壊・迅速可視化技術

寺本翔太, 七夕高也, 宇賀優作

農研機構次世代作物開発研究センター成果情報(Web) 2020 2020年
エックス線CTを用いたイネ根系の4次元可視化パイプラインの構築

寺本翔太, 高安聡子, 宇賀優作

根の研究 28(4) 2019年
X線CTによるイネ根系のハイスループット3次元可視化

寺本翔太, 高安聡子, 宇賀優作

育種学研究 21 2019年
CT撮影によるX線照射の植物体への影響評価

西嶋遼, 鈴井伸郎, YIN Y., 三好悠太, 栗田圭輔, 山口充孝, 寺本翔太, 木富悠花, 七夕高也, 宇賀優作, 河地有木, 川勝泰二

育種学研究 21 2019年
Nanopore sequencingとLinked-read sequencingによるインディカ水稲品種「IR64」ゲノムのde novoアセンブリ

田中剛, 西嶋遼, 寺本翔太, 木富悠花, 林武司, 宇賀優作, 川勝泰二

育種学研究 20 2018年
X線CT計測システムによる土壌中イネ地下部の非破壊観察の条件検討

西嶋遼, 鈴井伸郎, YIN Y., 三好悠太, 栗田圭輔, 山口充孝, 寺本翔太, 木富悠花, 七夕高也, 宇賀優作, 河地有木, 川勝泰二

育種学研究 20 2018年
イネトランスポゾンmPingの転移活性を制御する因子の探索

寺本翔太, 築山拓司, 谷坂隆俊, 奥本裕

育種学研究 16 239 2014年9月26日
イネ品種銀坊主におけるmPing移転は時期・組織特異的なPingの発現上昇を伴う

寺本翔太, 築山拓司, 寺石政義, 谷坂隆俊, 奥本裕

育種学研究 15 76 2013年10月12日
イネユビキチン様タンパク質の機能喪失は活性型MITE・mPingの転移を促進する

築山拓司, 寺本翔太, 安田加奈子, 堀端章, 森奈々子, 奥本裕, 寺石政義, 齊藤大樹, 谷坂隆俊

日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 85th 92 2013年8月31日
個体発生過程におけるイネトランスポゾンmPingの転移時機

寺本翔太, 築山拓司, 寺石政義, 谷坂隆俊, 奥本裕

育種学研究 14 93 2012年9月14日
ユビキチン様タンパク質の機能喪失によって誘発されるゲノムの不安定化

築山拓司, 中井由実, 奥本裕, 中田有美, 寺本翔太, 寺石政義, 林秀行, 谷坂隆俊

育種学研究 12 90 2010年3月26日

講演・口頭発表等

深層学習を用いた根系セグメンテーションによるフィールドでのイネ根系の迅速定量化

寺本翔太, 宇賀優作

第55回根研究集会 2022年6月4日
畑作条件で栽培した世界のイネ品種の根系フェノーム解析

寺本翔太, 高安聡子, 丸山奈津子, 木富悠花, 西嶋遼, 川勝泰二, 宇賀優作

日本育種学会 2021年9月25日
RSAtrace3D：根系定量化のためのノイズに強い3次元ベクトル化ソフトウェア

寺本翔太, 七夕高也, 宇賀優作

日本育種学会 2021年3月19日
深層学習を用いた画像解析によるフィールドでのイネ根系の多様性解析

寺本翔太, 宇賀優作

日本育種学会137回講演会 2020年3月29日
Rapid four-dimensional imaging of root system architecture in rice by using X-ray computed tomography

寺本翔太

International Symposium on the Future Direction of Plant Science by Young Researchers 2019年12月16日招待有り
エックス線CTを⽤いたイネ根系の4次元可視化パイプラインの構築

寺本翔太, 高安聡子, 宇賀優作

根研究集会第50回記念 2019年11月23日
X線CTによるイネ根系のハイスループット3 次元可視化

寺本翔太, 高安聡子, 宇賀優作

日本育種学会135回講演会 2019年3月17日
イネ品種ハバタキの多収遺伝子座、 Gn1a 、 SCM2 、 qSUP8 の窒素施肥に応じた収量構成要素への影響

寺本翔太, 北野英己, 藤原徹

日本育種学会 133回講演会 2018年3月25日
トランスクリプトームとイオノームによるイネ低硝酸吸収突然変異体の特徴解析

寺本翔太, 大森良弘, 長谷川博, 藤原徹

日本育種学会 132回講演会 2017年10月8日
カルモジュリン結合受容体様細胞質キナーゼを介したイネの栄養吸収機構の研究

寺本翔太, 大森良弘, 長谷川博, 藤原徹

植物の栄養研究会第3回研究集会 2017年9月1日
イネ低硝酸吸収突然変異体の遺伝子マッピングおよび候補遺伝子の推定

寺本翔太, 大森良弘, 長谷川博, 谷坂隆俊, 藤原徹

日本育種学会 130回講演会 2016年9月25日
C/N比制御に異常を示すイネ突然変異体の単離とその特徴解析

寺本翔太, 田中伸裕, 大森良弘, 藤原徹

植物の栄養研究会第2回研究集会 2016年9月2日
イネの無窒素施肥栽培における減収量は多収遺伝子の導入で補償できる

寺本翔太, 北野英己, 藤原徹

日本育種学会 129回講演会 2016年3月21日
イネ低硝酸吸収突然変異体NUE13-1の遺伝解析

寺本翔太, 藤原徹

植物の栄養研究会第1回研究集会 2015年9月4日
イネトランスポゾン mPingの転移活性を制御する因子の探索

寺本翔太, 築山拓司, 谷坂隆俊, 奥本裕

日本育種学会 126回講演会 2014年9月27日
イネトランスポゾンmPingの転移機構の解明に迫る

寺本翔太

吉備国際大学地域創成農学部市民公開講座 2014年4月19日招待有り
イネ品種銀坊主における mPing 転移は時期・組織特異的な Ping の発現上昇を伴う

寺本翔太, 築山拓司, 寺石政義, 谷坂隆俊, 奥本裕

日本育種学会 124回講演会 2013年10月12日
個体発生過程におけるイネトランスポゾン mPing の転移時機

寺本翔太, 築山拓司, 寺石政義, 谷坂隆俊, 奥本裕

日本育種学会 122回講演会 2012年9月15日

所属学協会

2021年 - 現在

根研究学会
2012年 - 現在

日本育種学会

メディア報道

学会発表の内容について記事掲載

日本農業新聞 2016年3月18日新聞・雑誌

寺本翔太

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講演・口頭発表等

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