オートファジーはリソソームを分解の場とする細胞質成分の分解系であり、広範な生命現象に関与していることが明らかにされてきた。本課題では、オートファゴソーム形成、オートファゴソームとリソソームの融合、それに引き続くオートファゴソーム膜の分解の分子基盤を明らかにし、さらにマウスにおけるオートファジーの生理機能の解析、新規オートファジー活性評価レポーターの開発、新規オートファジー制御化合物の同定を行った。