角野歩 (Ayumi Sumino) - マイポータル

基本情報

所属: 京都大学大学院生命科学研究科准教授
: 金沢大学ナノ生命科学研究所客員准教授

学位: 博士（工学）

J-GLOBAL ID: 201301015102100830
researchmap会員ID: B000234251

研究分野

ライフサイエンス / 生物物理学 /

経歴

2025年6月 - 現在

京都大学, 大学院生命科学研究科, 准教授
2025年6月 - 現在

金沢大学, ナノ生命科学研究所, 客員准教授

委員歴

2022年1月 - 2024年12月

毒素シンポジウム運営委員
2020年1月 - 2020年12月

日本生物物理学会, 分野別専門委員
2018年4月 - 2020年3月

文部科学省科学技術予測センター, 平成30年度専門調査員
2017年1月 - 2018年12月

日本生物物理学会, 「生物物理」会誌編集委員会

受賞

2025年4月

文部科学大臣表彰若手科学者賞, 高速原子間力顕微鏡によるイオンチャネルの動作機構の研究, 文部科学省

角野歩
2025年3月

日本生理学会奨励賞, 日本生理学会

角野歩
2019年12月

はあざみ女性研究者賞若葉賞, 金沢大学

角野歩
2019年11月

ナノプローブテクノロジー奨励賞, 日本学術振興会ナノプローブテクノロジー第167委員会
2019年9月

毒素シンポジウム奨励賞, 毒素シンポジウム

角野歩
2018年3月

最優秀発表賞, 日本生物物理学会中部支部

角野歩
2015年6月

資生堂女性研究者サイエンスグラント, 株式会社資生堂

角野歩
2014年3月

優秀ポスター賞, 日本生理学会

角野歩
2014年3月

優秀論文賞, 福井大学医学部

角野歩
2013年3月

学生講演賞, 日本化学会

角野歩
2012年7月

最優秀ポスター賞, Seeing at the Nanoscale 2012

角野歩

論文

Structural dynamics of mixed-subunit CaMKIIα/β heterododecamers filmed by high-speed AFM

Mikihiro Shibata, Keisuke Matsushima, Takashi Sumikama, Taisei Suzuki, Mizuho Ito, Yutaro Nagasawa, Ayumi Sumino, Holger Flechsig, Tomoki Ogoshi, Kenichi Umeda …

2025年5月21日
High-Speed Atomic Force Microscopy Reveals Fluctuations and Dimer Splitting of the N-Terminal Domain of GluA2 Ionotropic Glutamate Receptor-Auxiliary Subunit Complex

Ayumi Sumino, Takashi Sumikama, Yimeng Zhao, Holger Flechsig, Kenichi Umeda, Noriyuki Kodera, Hiroki Konno, Motoyuki Hattori, Mikihiro Shibata

ACS Nano 2024年8月23日筆頭著者
Voltage sensors of a Na+ channel dissociate from the pore domain and form inter-channel dimers in the resting state

Ayumi Sumino, Takashi Sumikama, Mikihiro Shibata, Katsumasa Irie

Nature Communications (14) 7835 2023年12月19日査読有り筆頭著者責任著者
Functional Coupling of Biohybrid Photosynthetic Antennae and Reaction Center Complexes: Quantitative Comparison with Native Antennae.

Takehisa Dewa, Komei Kimoto, Genki Kasagi, Hiromi Harada, Ayumi Sumino, Masaharu Kondo

The journal of physical chemistry. B 127(48) 10315-10325 2023年12月7日
Imaging single CaMKII holoenzymes at work by high-speed atomic force microscopy.

Shotaro Tsujioka, Ayumi Sumino, Yutaro Nagasawa, Takashi Sumikama, Holger Flechsig, Leonardo Puppulin, Takuya Tomita, Yudai Baba, Takahiro Kakuta, Tomoki Ogoshi …

Science advances 9(26) eadh1069 2023年6月30日筆頭著者
Antithetic effects of agonists and antagonists on the structural fluctuations of TRPV1 channel.

Ayumi Sumino, Yimeng Zhao, Daichi Mukai, Takashi Sumikama, Leonardo Puppulin, Motoyuki Hattori, Mikihiro Shibata

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 120(20) e2301013120 2023年5月9日筆頭著者責任著者
Dynamics of Target DNA Binding and Cleavage by Staphylococcus aureus Cas9 as Revealed by High-Speed Atomic Force Microscopy

Leonardo Puppulin, Junichiro Ishikawa, Ayumi Sumino, Arin Marchesi, Holger Flechsig, Kenichi Umeda, Noriyuki Kodera, Hiroshi Nishimasu, Mikihiro Shibata

ACS Nano 2023年2月27日
High-Speed Atomic Force Microscopy Reveals Spontaneous Nucleosome Sliding of H2A.Z at the Subsecond Time Scale.

Shin Morioka, Shoko Sato, Naoki Horikoshi, Tomoya Kujirai, Takuya Tomita, Yudai Baba, Takahiro Kakuta, Tomoki Ogoshi, Leonardo Puppulin, Ayumi Sumino …

Nano letters 23(5) 1696-1704 2023年2月13日
Antibacterial Activity of Membrane-Permeabilizing Bactericidal Cyclodextrin Derivatives.

Hatsuo Yamamura, Tatsuya Hagiwara, Yuma Hayashi, Kayo Osawa, Hisato Kato, Takashi Katsu, Kazufumi Masuda, Ayumi Sumino, Hayato Yamashita, Ryo Jinno …

ACS omega 6(47) 31831-31842 2021年11月30日
Macrocyclic Peptide-Conjugated Tip for Fast and Selective Molecular Recognition Imaging by High-Speed Atomic Force Microscopy.

Leonardo Puppulin, Daiki Kanayama, Naohiro Terasaka, Katsuya Sakai, Noriyuki Kodera, Kenichi Umeda, Ayumi Sumino, Arin Marchesi, Wei Weilin, Hideo Tanaka …

ACS applied materials & interfaces 13(46) 54817-54829 2021年11月24日
Visualisation of helical structures of poly(diphenylacetylene)s bearing chiral amide pendants by atomic force microscopy.

Ayhan Yurtsever, Sandip Das, Tatsuya Nishimura, Rafael Rodríguez, Daisuke Hirose, Kazuki Miyata, Ayumi Sumino, Takeshi Fukuma, Katsuhiro Maeda

Chemical communications (Cambridge, England) 57(92) 12266-12269 2021年11月19日
Essential Requirements of Biocompatible Cellulose Solvents

Tetsuo Komori, Heri Satria, Kyohei Miyamura, Ai Ito, Magoto Kamiya, Ayumi Sumino, Takakazu Onishi, Kazuaki Ninomiya, Kenji Takahashi, Jared L. Anderson …

ACS Sustainable Chemistry & Engineering 9(35) 11825-11836 2021年9月6日査読有り
Plasma membrane anchored nanosensor for quantifying endogenous production of H2O2 in living cells.

Shigekuni Hosogi, Yoshinori Marunaka, Eishi Ashihara, Tadaaki Yamada, Ayumi Sumino, Hideo Tanaka, Leonardo Puppulin

Biosensors & bioelectronics 179 113077-113077 2021年2月査読有り
Urea-Assisted Reconstitution of Discoidal High-Density Lipoprotein

Ryosuke Fukuda, Mio Saito, Shiori Shibukawa, Ayumi Sumino, Minoru Nakano, Tatsuya Murakami

Biochemistry 59(15) 1455-1464 2020年4月21日査読有り
High-speed AFM reveals accelerated binding of agitoxin-2 to a K+ channel by induced fit

A. Sumino, T. Sumikama, T. Uchihashi, S. Oiki

Science Advances 5(7) 1-10 2019年7月査読有り
A concise method for quantitative analysis of interactions between lipids and membrane proteins

Masataka Inada, Masanao Kinoshita, Ayumi Sumino, Shigetoshi Oiki, Nobuaki Matsumori

Analytica Chimica Acta 1059 103-112 2019年1月査読有り
Lipid-Controlled Stabilization of Charge-Separated States (P+QB -) and Photocurrent Generation Activity of a Light-Harvesting-Reaction Center Core Complex (LH1-RC) from Rhodopseudomonas palustris

Tomoyasu Noji, Mikano Matsuo, Nobutaka Takeda, Ayumi Sumino, Masaharu Kondo, Mamoru Nango, Shigeru Itoh, Takehisa Dewa

Journal of Physical Chemistry B 122(3) 1066-1080 2018年1月25日査読有り
Channel Formation and Membrane Deformation via Sterol-Aided Polymorphism of Amphidinol 3

Masayuki Iwamoto, Ayumi Sumino, Eri Shimada, Masanao Kinoshita, Nobuaki Matsumori, Shigetoshi Oiki

SCIENTIFIC REPORTS 7(1) 10782 2017年9月査読有り
Oriented Reconstitution of the Full-Length KcsA Potassium Channel in a Lipid Bilayer for AFM Imaging

Ayumi Sumino, Takayuki Uchihashi, Shigetoshi Oiki

JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY LETTERS 8(4) 785-793 2017年2月査読有り
MorphologicaObservation of Specific Condensation Effect of Cholesterol on Dipalmitoyl Phosphatidyl Choline (DPPC) Monolayer by Dropping Method

Takashi Yokoyama, Daisuke Yoshida, Hiroya Mori, Masaya Okabe, Zameer Shervani, Keijiro Taga, Yasushi Yamamoto, Ayumi Sumino, Takehisa Dewa, Mamoru Nango …

Journal of Biophysical Chemistry 7 98-109 2016年10月14日査読有り

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MISC

High-speed AFM reveals fluctuations and dimer splitting of the N-terminal domain of GluA2-γ2

Ayumi Sumino, Takashi Sumikama, Yimeng Zhao, Holger Flechsig, Kenichi Umeda, Noriyuki Kodera, Motoyuki Hattori, Mikihiro Shibata

2023年12月20日
Interchannel dimerization of the dissociated voltage-sensor domains of voltage-gated Na+ channels in the resting state

Ayumi Sumino, Takashi Sumikama, Mikihiro Shibata, Katsumasa Irie

2023年5月9日
Evolutionarily acquired activity-dependent transformation of the CaMKII holoenzyme

Shotaro Tsujioka, Ayumi Sumino, Yutaro Nagasawa, Takashi Sumikama, Holger Flechsig, Leonardo Puppulin, Takuya Tomita, Yudai Baba, Takahiro Kakuta, Tomoki Ogoshi …

2023年1月10日
ディスク状脂質ドラッグキャリア1ステップ作製法の作動メカニズム

齊藤実央, 福田亮介, 福田亮介, 角野歩, 角野歩, 村上達也, 村上達也

日本DDS学会学術集会プログラム予稿集 35th 2019年
ディスク状脂質ドラッグキャリアの作製・保存法の開発

福田亮介, 齊藤実央, 島瑠美奈, 角野歩, 角野歩, 村上達也, 村上達也, 村上達也

日本DDS学会学術集会プログラム予稿集 35th 2019年
脂質/タンパク質ドラッグキャリアの1ステップ作製

齊藤実央, 福田亮介, 角野歩, 村上達也, 村上達也

日本DDS学会学術集会プログラム予稿集 34th 2018年
脂質とタンパク質からなる生体ナノ粒子のワンステップ再構成法

齊藤実央, 福田亮介, 角野歩, 村上達也, 村上達也, 村上達也

日本バイオマテリアル学会大会予稿集(Web) 39th 2017年
1P221 カリウムチャネルKcsAのゲート開閉と連動した膜中集合・離散(13C. 生体膜・人工膜:興奮・チャネル,ポスター,第52回日本生物物理学会年会(2014年度))

Sumino Ayumi, Yamamoto Daisuke, Iwamoto Masayuki, Dewa Takehisa, Oiki Shigetoshi

生物物理 54(1) S177 2014年
Gating-Coupled Clustering-Dispersion Dynamics of the KcsA Potassium Channel in a Lipid Membrane

Ayumi Sumino, Daisuke Yamamoto, Masayuki Iwamoto, Takehisa Dewa, Shigetoshi Oiki

BIOPHYSICAL JOURNAL 106(2) 746A-746A 2014年1月査読有り
2SCA-01 カリウムイオンチャネルKcsAのゲート開閉とリンクした脂質膜中での集合・離散ダイナミクス(2SCA 最新イオンチャネル1分子科学 : 素過程から疾患克服まで,シンポジウム,日本生物物理学会第51回年会(2013年度))

角野歩, 山本大輔, 炭竈享司, 岩本真幸, 出羽毅久, 老木成稔

生物物理 53(1) S93 2013年
2G1558 原子間力顕微鏡によるカリウムイオンチャネルKcsAの脂質膜中でのゲート開閉構造の直接観察(生体膜・人工膜,口頭発表,日本生物物理学会第50回年会(2012年度))

Sumino Ayumi, Sumikama Takashi, Iwamoto Masayuki, Dewa Takahisa, Oiki Shigetoshi

生物物理 52 S51 2012年
光合成再構成膜の高分解能AFM観察

須貝祐子, 角野歩, 藤井律子, 出羽毅久, 南後守, 橋本秀樹

日本化学会バイオテクノロジー部会シンポジウム講演要旨集 14th 109 2011年9月12日
異種の光合成細菌由来のアンテナおよびコア複合体を組み込んだ光合成再構成膜の高分解能AFM観察

須貝祐子, 角野歩, 浦上千藍紗, 藤井律子, 西岡孝訓, 出羽毅久, 木下勇, 南後守, 橋本秀樹

日本化学会講演予稿集 91st(3) 722 2011年3月11日
光合成アンテナタンパク質集合体の脂質膜中での構築とそのエネルギー移動評価

渡部奈津子, 角野歩, 佐々木伸明, 出羽毅久, 森井孝, 橋本秀樹, 南後守

日本化学会第91春季年会，神奈川大学横浜キャンパス，2011.3.26-29 2011年査読有り

書籍等出版物

High-speed atomic force microscopy of ion channels

Ayumi Sumino

2025年2月1日査読有り
高速原子間力顕微鏡（HS-AFM）によるチャネルタンパク質とリガンドの結合動態解析

角野歩

2023年8月査読有り
高速原子間力顕微鏡 (HS AFM) による膜タンパク質の構造動態観察

角野歩

2022年8月査読有り
原子間力顕微鏡による膜蛋白質の離合集散ダイナミクスの観察

角野歩

2019年2月
Lipid-Domain-Selective Assembly of Photosynthetic Membrane Proteins into Solid-Supported Membranes

Ayumi Sumino, Toshikazu Takeuchi, Masaharu Kondo, Takehisa Dewa, Hideki Hashimoto, Alastair T. Gardiner, Richard J. Cogdell, Mamoru Nango

2010年査読有り

講演・口頭発表等

Structural dynamics of ion channels studied by high-speed atomic force microscopy

Ayumi Sumino

ICMS (Ion Channel Modulation Symposium) Tokyo 2025年5月29日招待有り
Voltage Sensors of Na+ Channels Dissociate from the Pore Domain and Form Inter-Channel Dimers in the Resting State: Implications for Cooperative Activation

Ayumi Sumino, Takashi Sumikama, Mikihiro Shibata, Katsumasa Irie

第130回日本解剖学会・第102回日本生理学会・第98回日本薬理学会合同大会 2025年3月17日
BPS2025 - Visualizing single-molecule nanodynamics of AMPA-type glutamate receptors by high-speed atomic force microscopy

Mikihiro Shibata, Ayumi Sumino, Takashi Sumikama, Yimeng Zhao, Motoyuki Hattori

Biophysical Journal 2025年2月 Elsevier BV
Voltage Sensors of Na+ Channels Dissociate from the Pore Domain and Form Inter-Channel Dimers in the Resting State: Single-Molecule Observations Using High-Speed Atomic Force Microscopy

Ayumi Sumino

12th Singapore International Chemistry Conference 2024年12月11日招待有り
Structural Dynamics of Ion Channels Studied by High-Speed Atomic Force Microscopy

Ayumi Sumino

32nd International Colloquium on Scanning Probe Microscopy (ICSPM32) 2024年11月20日招待有り
Single-molecule nanodynamics of AMPA-type glutamate receptors by high-speed atomic force microscopy

Mikihiro Shibata, Ayumi Sumino, Takashi Sumikama, Yimeng Zhao, Motoyuki Hattori

Neuroscience 2024
High-speed atomic force microscopy studies on the structural dynamics of ion channels at the single molecule level

Ayumi Sumino

International Symposium of Nano Life Science: Nano Biotechnology, Biophysics and Computation (NanoBioCoM2024) 2024年9月25日招待有り
高速原子間力顕微鏡によるイオンチャネルの構造動態解析

角野歩

生理学研究所研究会「生理機能の理解に向けた膜タンパク質機能ダイナミクス研究の最前線と未来開拓」 2024年9月3日招待有り
高速原子間力顕微鏡による膜タンパク質のナノスケールイメージング

柴田幹大, 角野歩, 炭竃享司

第129回日本解剖学会総会・全国学術集会招待有り
休止状態の電位依存性Na＋チャネルにおける電位センサードメインのポアからの解離と二量体化によるチャネル間架橋

角野歩、炭竈享司、プップリン・レオナルド、柴田幹大、入江克雅

日本生理学会第100回記念大会 2023年3月14日
高速原子間力顕微鏡と人工脂質膜による膜機能タンパク質の動態観察

角野歩

第45回日本分子生物学会年会ワークショップ「細菌、ミトコンドリアの表情研究の最前線」 2022年12月2日招待有り
Dynamics of scorpion toxin binding to the K+ channel: single-molecule study using high-speed atomic force microscopy (HS-AFM)

Ayumi Sumino

2022 East Asian Single-Molecule Biophysics Symposium (EASMB 2022) 2022年10月18日招待有り
Structural dynamics of the cytoplasmic domain of transient receptor potential vanilloid1(TRPV1) in lipid bilayer observed by high speed atomic force microscopy (HS-AFM)

Daichi Mukai, Yimeng Zhao, Mikihiro Shibata, Motoyuki Hattori, Ayumi Sumino

第44回日本分子生物学会年会 2021年12月
高速原子間力顕微鏡による膜中TRPV1 チャネルの動態観察

向大地, Yimeng Zhao, 柴田幹大, 服部素之, 角野歩

第59回日本生物物理学会年会 2021年11月26日
高速AFMによるハブ毒液由来脂質分解酵素PLA2の膜認識機構の解明

神谷孫斗, 柴田幹大, 上田直子, 角野歩

第58回日本生物物理学会年会 2020年9月16日
INDUCED-FIT PATHWAY ACCELERATED BINDING OF AGITOXIN-2 TO A K+CHANNEL IMAGED BY HS-AFM

角野歩、炭竈享司、内橋貴之、老木成稔

米国生物物理学会第64回年会 2020年2月
高速AFMによるサソリ毒ペプチドが効率的にK+ チャネルを阻害する仕組みの解明

角野歩, 炭竈享司, 内橋貴之, 老木成稔

第42回日本分子生物学会年会ワークショップ 2019年12月5日招待有り
高速AFMによる膜関連分子の動態観察

角野歩

第42回日本分子生物学会年会フォーラム（チュートリアル企画） 2019年12月3日招待有り
High-speed AFM reveals ligand binding dynamics on membrane proteins: accelerated binding of agitoxin-2 to a K+ channel by induced fit

Ayumi Sumino

TRENDS IN MOLECULAR BIOPHYSICS OF LIVING CELLS 2019年11月20日招待有り
高速原子間力顕微鏡によるハブ毒液由来ホスホリパーゼA2の脂質膜分解動態の観察

角野歩, 神谷孫斗, 上田直子

第66回トキシンシンポジウム 2019年9月11日

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所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

連動する三種のイオンチャネルの活性化と集合離散動態

科学技術振興機構創発的研究支援事業 2024年6月 - 2027年3月
一分子動態観察による温度感受性チャネルの温度センシング機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2022年4月 - 2026年3月

角野歩
高速原子間力顕微鏡による電位依存性Na+チャネルの電位依存的活性調節機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 挑戦的研究(萌芽) 2022年6月 - 2024年3月

角野歩
膜タンパク質の配向と脂質膜の非対称性を制御した固定化平面膜の開発とAFM観察

科研費挑戦的研究（萌芽） 2018年4月 - 2021年3月

角野歩
高速AFMによるカリウムチャネルの構造‐機能ダイナミクスの解析

科研費若手研究（Ａ） 2017年4月 - 2021年3月

角野歩
光応答性DNAによるK+チャネルKcsAの集合・離散構造の制御と協同的機能の解明

科研費挑戦的萌芽研究 2016年4月 - 2018年3月

角野歩
チャネル機能発現における膜上集合・離散動態の新しい機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2014年4月 - 2017年3月

老木成稔, 炭竈享司, 岩本真幸, 角野歩
原子間力顕微鏡を駆使した膜中イオンチャネル集団動作機構の革新的理解

科学技術振興機構さきがけ 2013年9月 - 2017年3月

角野歩
高分解顕微鏡観察を主としたカリウムチャネルKcsAの柔軟な構造と機能の相関解明

科研費若手研究（Ｂ） 2014年4月 - 2016年3月

角野歩
高速AFMによるカリウムチャネルの密度がチャネル開閉に及ぼす影響の解明

株式会社資生堂資生堂女性研究者サイエンスグラント 2015年

角野歩
原子間力顕微鏡を用いたイオンチャネルの集団構造‐電流の同時計測

日本学術振興会特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2013年4月 - 2013年9月

角野歩
光合成膜タンパク質集合体機能解明のための超分子アレイの創成

日本学術振興会特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2011年 - 2012年

角野歩
光合成膜タンパク質集合体の分子レベルでの構築とその直接観察

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2008年 - 2010年

出羽毅久, 南後守, 杉浦隆太, 竹内俊和, 廣昭人, 角野歩, 佐々木伸明, 渡部奈津子

角野歩

基本情報

研究分野

経歴

委員歴

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

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