大久保智司 (Satoshi Ohkubo) - マイポータル

基本情報

所属: 東北大学大学院生命科学研究科特任助教

学位: 博士（人間・環境学）(2012年3月京都大学)

連絡先: s_ohkubome.com
J-GLOBAL ID: 201801002599122690
researchmap会員ID: B000314181

研究キーワード

研究分野

経歴

2022年4月 - 現在

東北大学, 大学院生命科学研究科, 特任助教
2022年1月 - 2022年3月

東北大学, 大学院生命科学研究科 (特任研究員)
2021年4月 - 2021年12月

東北大学, 大学院生命科学研究科, 学術研究員
2019年10月 - 2021年3月

東京農工大学, 大学院農学府, 産学官連携研究員
2017年10月 - 2019年9月

東京農工大学, グローバルイノベーション研究院, 産学官連携研究員
2016年4月 - 2017年9月

京都大学, 大学院農学研究科, 産学官連携研究員
2013年5月 - 2016年3月

埼玉大学, 大学院理工学研究科, 産学官連携研究員
2009年8月 - 2013年3月

京都大学, 大学院人間・環境学研究科相関環境学専攻, 研究員
2009年4月 - 2009年7月

京都大学, 大学院人間・環境学研究科相関環境学専攻, 研修員

学歴

2006年4月 - 2009年3月

京都大学, 大学院人間・環境学研究科, 相関環境学専攻
2004年4月 - 2006年3月

京都大学, 大学院人間・環境学研究科, 相関環境学専攻
2002年4月 - 2004年3月

京都大学, 総合人間学部, 自然環境学科
2000年4月 - 2002年3月

京都大学, 工学部, 地球工学科

論文

Metabolic diversity analysis and genome wide assessment of oxalate accumulation in the leaves of rice (<i>Oryza sativa</i>) cultivars

Atsuko Miyagi, Nobuhiro Tanaka, Matthew Shenton, Kaworu Ebana, Satoshi Ohkubo, Shunsuke Adachi, Taiichiro Ookawa, Maki Kawai-Yamada

Plant Biotechnology 2024年
Genome-wide association study of leaf photosynthesis using a high-throughput gas exchange system in rice

Sotaro Honda, Ayumu Imamura, Yoshiaki Seki, Koki Chigira, Marina Iwasa, Kentaro Hayami, Tomohiro Nomura, Satoshi Ohkubo, Taiichiro Ookawa, Atsushi J. Nagano …

Photosynthesis Research 2024年1月
葉のCO₂同化速度の簡便迅速測定システムの開発

本田爽太郎, 大久保智司, 新家寿建, 秋山重之, 青木直史, 田中佑, 安達俊輔

日本作物学会紀事 92(4) 289-299 2023年10月5日
野外時系列トランスクリプトームを利用したイネ草丈予測モデルの開発と検証

宮下大輝, 本田爽太郎, 大久保智司, 鹿島誠, 大川泰一郎, 永野惇, 安達俊輔

日本作物学会関東談話会報 38 40-41 2023年
Physiological and morphological factors affecting leaf sheath reinforcement and their contribution to lodging resistance in rice

Tomohiro Nomura, Satoshi Ohkubo, Atsushi J. Nagano, Ahmad Fahim Samadi, Shunsuke Adachi, Taiichiro Ookawa

Plant Production Science 1-17 2023年1月1日
Metabolomic analysis of rice brittle culm mutants reveals each mutant- specific metabolic pattern in each organ

Atsuko Miyagi, Kazuhisa Mori, Toshiki Ishikawa, Satoshi Ohkubo, Shunsuke Adachi, Masatoshi Yamaguchi, Taiichiro Ookawa, Toshihisa Kotake, Maki Kawai-Yamada

Metabolomics 18(12) 2022年11月19日
野外トランスクリプトームによるイネ個葉光合成速度予測モデルの改良と検証

宮下大輝, 本田爽太郎, 大久保智司, 岡村昌樹, 鹿島誠, 大川泰一郎, 永野惇, 安達俊輔

日本作物学会講演会要旨集 254 116-116 2022年9月18日
Draft Genome Sequence of the Cyanobacterium Synechococcus sp. Strain Nb3U1.

Christopher L Pierpont, Satoshi Ohkubo, Hideaki Miyashita, Scott R Miller

Microbiology resource announcements 11(5) e0025122 2022年5月19日
Evolution of rhizobial symbiosis islands through insertion sequence-mediated deletion and duplication

Haruka Arashida, Haruka Odake, Masayuki Sugawara, Ryota Noda, Kaori Kakizaki, Satoshi Ohkubo, Hisayuki Mitsui, Shusei Sato, Kiwamu Minamisawa

The ISME Journal 16(1) 112-121 2022年1月
Maintaining higher leaf photosynthesis after heading stage could promote biomass accumulation in rice

Sotaro Honda, Satoshi Ohkubo, Nan Su San, Anothai Nakkasame, Kazuki Tomisawa, Keisuke Katsura, Taiichiro Ookawa, Atsushi J. Nagano, Shunsuke Adachi

Scientific Reports 11(1) 2021年12月
Potential of rice landraces with strong culms as genetic resources for improving lodging resistance against super typhoons.

Tomohiro Nomura, Yoshiaki Seki, Makoto Matsuoka, Kenji Yano, Koki Chigira, Shunsuke Adachi, Francisco J Piñera-Chavez, Matthew Reynolds, Satoshi Ohkubo, Taiichiro Ookawa

Scientific reports 11(1) 15780-15780 2021年8月4日
Genomic Basis of Transcriptome Dynamics in Rice Under Field Conditions

Makoto Kashima, Ryota L Sakamoto, Hiroki Saito, Satoshi Ohkubo, Ayumi Tezuka, Ayumi Deguchi, Yoichi Hashida, Yuko Kurita, Koji Iwayama, Shunsuke Adachi …

Plant and Cell Physiology 2021年6月16日
Rice Cultivar Takanari Has Higher Photosynthetic Performance Under Fluctuating Light Than Koshihikari, Especially Under Limited Nitrogen Supply and Elevated CO2

Satoshi Ohkubo, Yu Tanaka, Wataru Yamori, Shunsuke Adachi

FRONTIERS IN PLANT SCIENCE 11 2020年9月査読有り筆頭著者
Microbial Community Structures in Terrestrial Subsurface Sediments from the Southern Kanto Plain, Japan

Satoshi Ohkubo, Takeshi Saito, Muhammad Abul Kalam Azad, Hiromitsu Kawai, Wataru Suda, Shin Kore-eda, Shoichiro Hamamoto, Hirotaka Saito, Takato Takemura, Toshiko Komatsu …

GEOMICROBIOLOGY JOURNAL 37(7) 595-602 2020年7月査読有り筆頭著者責任著者
Genetic determination for source capacity to support breeding of high-yielding rice (Oryza sativa)

Shunsuke Adachi, Satoshi Ohkubo, Nan Su San, Toshio Yamamoto

MOLECULAR BREEDING 40(2) 2020年2月査読有り
High-yielding rice Takanari has superior photosynthetic response to a commercial rice Koshihikari under fluctuating light

Shunsuke Adachi, Yu Tanaka, Atsuko Miyagi, Makoto Kashima, Ayumi Tezuka, Yoshihiro Toya, Shunzo Kobayashi, Satoshi Ohkubo, Hiroshi Shimizu, Maki Kawai-Yamada …

JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY 70(19) 5287-5297 2019年10月査読有り
A niche for cyanobacteria producing chlorophyll f within a microbial mat

Satoshi Ohkubo, Hideaki Miyashita

ISME JOURNAL 11(10) 2368-2378 2017年10月査読有り筆頭著者責任著者
Temperature change affected groundwater quality in a confined marine aquifer during long-term heating and cooling

Takeshi Saito, Shoichiro Hamamoto, Takashi Ueki, Satoshi Ohkubo, Per Moldrup, Ken Kawamoto, Toshiko Komatsu

WATER RESEARCH 94 120-127 2016年5月査読有り
Discovery of Chlorophyll d in Acaryochloris marina and Chlorophyll f in a Unicellular Cyanobacterium, Strain KC1, Isolated from Lake Biwa

Hideaki Miyashita

Journal of Physical Chemistry & Biophysics 4(4) 2014年
Composition of carotenoids and identification of aerial microalgae isolated from the surface of rocks in mountainous districts of Japan

Nobuhiro Aburai, Satoshi Ohkubo, Hideaki Miyashita, Katsuya Abe

ALGAL RESEARCH-BIOMASS BIOFUELS AND BIOPRODUCTS 2(3) 237-243 2013年7月査読有り

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MISC

イネの遺伝子発現量予測におけるサンプリング条件の影響解析

永壽暖, 前田太郎, 大久保智司, 鹿島誠, 京極大助, 橋田庸一, 渡邊渡邊, 安達俊輔, 永野惇, 永野惇 …

日本植物生理学会年会(Web) 65th 2024年
野外時系列トランスクリプトームを利用したイネ草丈予測モデルの開発と検証

宮下大輝, 本田爽太郎, 大久保智司, 鹿島誠, 大川泰一郎, 永野惇, 安達俊輔

日本作物学会関東談話会報(Web) 38 2023年
メタボローム解析から探るイネのカマイラズ変異体の代謝変動

宮城敦子, 宮城敦子, 森和久, 石川寿樹, 大久保智司, 安達俊輔, 大川泰一郎, 山口雅利, 小竹敬久, 川合真紀

日本植物生理学会年会(Web) 64th 2023年
シチズンサイエンスによる温室効果ガス削減微生物の探索

大久保智司

日本植物生理学会年会(Web) 64th 2023年
イネにおける遺伝子発現予測のためのサンプリング条件の最適化

永壽暖, 前田太郎, 大久保智司, 鹿島誠, 京極大助, 橋田庸一, 森直哉, 渡邊博之, 安達俊輔, 永野惇 …

日本植物生理学会年会(Web) 64th 2023年
土壌由来の温室効果ガス削減をめざす市民科学プロジェクト「地球冷却微生物を探せ」

大久保智司, 青木裕一, 加藤広海, 菊地美穂, 戸田聡一郎, 佐藤修正, 南澤究

日本生態学会大会講演要旨(Web) 70th 2023年
市民参加型研究プロジェクト「地球冷却微生物を探せ」の現状と展望土壌に眠る温室効果ガス消去微生物をみんなの力で掘り起こそう

大久保智司, 青木裕一, 青木裕一, 戸田聡一郎, 加藤広海

化学と生物 61(5) 2023年
土壌由来の温室効果ガス削減に向けた市民科学による微生物探索

大久保智司, 青木裕一

土と微生物 77(1) 2023年
GWASおよび代謝解析から探るイネのシュウ酸蓄積機構

宮城敦子, 宮城敦子, 田中伸裕, SHENTON Matthew, 江花薫子, 大久保智司, 大久保智司, 安達俊輔, 大川泰一郎, 川合真紀

日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM) 87th 2023年
土壌由来の温室効果ガス削減に向けた市民科学による微生物探索

大久保智司, 青木裕一

日本土壌微生物学会講演要旨集 2022 (CD-ROM) 2022年
土壌から発生するN₂O削減をめざす市民科学プロジェクト~地球冷却微生物を探せ~

大久保智司, 青木裕一, 戸田聡一郎, 菊地美穂, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集(Web) 68 2022年
土壌のN₂O発生削減をめざす市民科学プロジェクト「地球冷却微生物を探せ」

大久保智司, 青木裕一, 戸田聡一郎, 加藤広海, 菊地美穂, 佐藤修正, 南澤究

日本土壌肥料学会講演要旨集(Web) 68 2022年
イネ品種間差を利用したシュウ酸蓄積因子の探索

宮城敦子, 宮城敦子, 田中伸裕, SHENTON Matthew, 江花薫子, 大久保智司, 大久保智司, 安達俊輔, 大川泰一郎, 川合真紀

日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM) 86th 2022年
イネのカマイラズ変異体における代謝変動

宮城敦子, 森和久, 大久保智司, 安達俊輔, 大川泰一郎, 石川寿樹, 山口雅利, 小竹敬久, 川合真紀

日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM) 85th 2021年
深層学習によるイネの野外トランスクリプトームモデルの構築と他種への転移学習

前田太郎, 大久保智司, 鹿島誠, 京極大助, 橋田庸一, 田中克, 森直哉, 渡邊博之, 安達俊輔, 永野惇 …

日本植物生理学会年会(Web) 62nd 2021年
水稲の葉の光合成速度をトランスクリプトームから予測する

安達俊輔, 本田爽太郎, 大久保智司, 鹿島誠, SAN Nan Su, NAKKASAME Anothai, 齊藤大樹, 大川泰一郎, 永野惇

農作業研究 55 2020年
トランスクリプトームを用いた野外環境におけるイネ光合成速度の予測モデリング

本田爽太郎, 大久保智司, 鹿島誠, SAN Nan Su, NAKKASAME Anothai, 齊藤大樹, 大川泰一郎, 永野惇, 安達俊輔

日本作物学会講演会要旨集 249th 2020年
野外環境と遺伝子発現情報からイネ光合成速度を予測するモデルの構築と改良

大久保智司, 本田爽太郎, 鹿島誠, SAN Nan Su, NAKKASAME Anothai, 齊藤大樹, 大川泰一郎, 永野惇, 安達俊輔

日本作物学会講演会要旨集 250th 2020年
イネ個葉光合成速度と地上部バイオマスとの関係―染色体断片置換系統の生育期間を通じたガス交換測定に基づく解析―

富澤和紀, 寺崎千鶴, 大久保智司, 大川泰一郎, 安達俊輔

日本作物学会講演会要旨集 247th 162 2019年3月28日
光合成誘導反応のイネ品種間差に関わる生理的要因の解析

安達俊輔, 田中佑, 宮城敦子, 鹿島誠, 手塚あゆみ, 戸谷吉博, 小林俊造, 大久保智司, 清水浩, 川合真紀 …

日本作物学会講演会要旨集 247th 2019年

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講演・口頭発表等

土壌から出る温室効果ガスN2Oを削減する微生物の探索

大久保智司

第507回生存圏シンポジウム土壌・植物・大気を跨ぐ物質の循環と機能に関するワークショップ 2023年11月27日招待有り
市民の力を活用した温室効果ガス削減微生物の探索

大久保智司

公開シンポジウム「食・土・肥料－SDGs達成のための基礎科学として－」 2023年7月29日招待有り
地球冷却微生物を探せ

大久保智司

ジオ講演会 2023年1月8日招待有り

所属学協会

2004年10月 - 現在

日本微生物生態学会
2005年3月 - 現在

日本藻類学会
2011年5月 - 現在

日本光合成学会
2014年3月 - 現在

日本植物生理学会
2016年8月 - 現在

日本作物学会
2021年9月 - 現在

日本土壌肥料学会

メディア報道

地球温暖化を止める救世主は土の中「温室効果は二酸化炭素の300倍」一酸化二窒素を分解する“地球冷却微生物”とは

tbc東北放送 Nスタみやぎ 2023年10月27日テレビ・ラジオ番組
今夜みんなで大発見!?シチズンラボ生放送スペシャル

NHK 今夜みんなで大発見!?シチズンラボ生放送スペシャル 2023年8月18日テレビ・ラジオ番組
【研究】CO2の300倍!? 温室効果ガスN2Oを分解する地球冷却微生物とは

ミヤギテレビミヤギnews every. 2023年6月30日テレビ・ラジオ番組
目に見えない地球冷却微生物が温暖化から地球を救う東北大学のプロジェクト

khb東日本放送チャージ！ 2023年5月24日テレビ・ラジオ番組

大久保智司

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