大久保智司 (Satoshi Ohkubo) - マイポータル

基本情報

所属: 東北大学大学院生命科学研究科特任助教

学位: 博士（人間・環境学）(2012年3月京都大学)

連絡先: s_ohkubome.com
J-GLOBAL ID: 201801002599122690
researchmap会員ID: B000314181

研究キーワード

研究分野

経歴

2022年4月 - 現在

東北大学大学院生命科学研究科特任助教
2022年1月 - 2022年3月

東北大学大学院生命科学研究科 (特任研究員)
2021年4月 - 2021年12月

東北大学大学院生命科学研究科学術研究員
2019年10月 - 2021年3月

東京農工大学大学院農学府産学官連携研究員
2017年10月 - 2019年9月

東京農工大学グローバルイノベーション研究院産学官連携研究員
2016年4月 - 2017年9月

京都大学大学院農学研究科産学官連携研究員
2013年5月 - 2016年3月

埼玉大学大学院理工学研究科産学官連携研究員
2009年8月 - 2013年3月

京都大学大学院人間・環境学研究科相関環境学専攻研究員
2009年4月 - 2009年7月

京都大学大学院人間・環境学研究科相関環境学専攻研修員

学歴

2006年4月 - 2009年3月

京都大学大学院人間・環境学研究科相関環境学専攻
2004年4月 - 2006年3月

京都大学大学院人間・環境学研究科相関環境学専攻
2002年4月 - 2004年3月

京都大学総合人間学部自然環境学科
2000年4月 - 2002年3月

京都大学工学部地球工学科

論文

Physiological and morphological factors affecting leaf sheath reinforcement and their contribution to lodging resistance in rice

Tomohiro Nomura, Satoshi Ohkubo, Atsushi J. Nagano, Ahmad Fahim Samadi, Shunsuke Adachi, Taiichiro Ookawa

Plant Production Science 1-17 2023年1月1日
Metabolomic analysis of rice brittle culm mutants reveals each mutant- specific metabolic pattern in each organ

Atsuko Miyagi, Kazuhisa Mori, Toshiki Ishikawa, Satoshi Ohkubo, Shunsuke Adachi, Masatoshi Yamaguchi, Taiichiro Ookawa, Toshihisa Kotake, Maki Kawai-Yamada

Metabolomics 18(12) 2022年11月19日
野外トランスクリプトームによるイネ個葉光合成速度予測モデルの改良と検証

宮下大輝, 本田爽太郎, 大久保智司, 岡村昌樹, 鹿島誠, 大川泰一郎, 永野惇, 安達俊輔

日本作物学会講演会要旨集 254 116-116 2022年9月18日
Evolution of rhizobial symbiosis islands through insertion sequence-mediated deletion and duplication

Haruka Arashida, Haruka Odake, Masayuki Sugawara, Ryota Noda, Kaori Kakizaki, Satoshi Ohkubo, Hisayuki Mitsui, Shusei Sato, Kiwamu Minamisawa

The ISME Journal 16(1) 112-121 2022年1月
Maintaining higher leaf photosynthesis after heading stage could promote biomass accumulation in rice

Sotaro Honda, Satoshi Ohkubo, Nan Su San, Anothai Nakkasame, Kazuki Tomisawa, Keisuke Katsura, Taiichiro Ookawa, Atsushi J. Nagano, Shunsuke Adachi

Scientific Reports 11(1) 2021年12月
Potential of rice landraces with strong culms as genetic resources for improving lodging resistance against super typhoons.

Tomohiro Nomura, Yoshiaki Seki, Makoto Matsuoka, Kenji Yano, Koki Chigira, Shunsuke Adachi, Francisco J Piñera-Chavez, Matthew Reynolds, Satoshi Ohkubo, Taiichiro Ookawa

Scientific reports 11(1) 15780-15780 2021年8月4日
Genomic Basis of Transcriptome Dynamics in Rice Under Field Conditions

Makoto Kashima, Ryota L Sakamoto, Hiroki Saito, Satoshi Ohkubo, Ayumi Tezuka, Ayumi Deguchi, Yoichi Hashida, Yuko Kurita, Koji Iwayama, Shunsuke Adachi, Atsushi J Nagano

Plant and Cell Physiology 2021年6月16日
Rice Cultivar Takanari Has Higher Photosynthetic Performance Under Fluctuating Light Than Koshihikari, Especially Under Limited Nitrogen Supply and Elevated CO2

Satoshi Ohkubo, Yu Tanaka, Wataru Yamori, Shunsuke Adachi

FRONTIERS IN PLANT SCIENCE 11 2020年9月査読有り
Microbial Community Structures in Terrestrial Subsurface Sediments from the Southern Kanto Plain, Japan

Satoshi Ohkubo, Takeshi Saito, Muhammad Abul Kalam Azad, Hiromitsu Kawai, Wataru Suda, Shin Kore-eda, Shoichiro Hamamoto, Hirotaka Saito, Takato Takemura, Toshiko Komatsu, Jun-ichi Ohnishi

GEOMICROBIOLOGY JOURNAL 37(7) 595-602 2020年7月査読有り
Genetic determination for source capacity to support breeding of high-yielding rice (Oryza sativa)

Shunsuke Adachi, Satoshi Ohkubo, Nan Su San, Toshio Yamamoto

MOLECULAR BREEDING 40(2) 2020年2月査読有り
High-yielding rice Takanari has superior photosynthetic response to a commercial rice Koshihikari under fluctuating light

Shunsuke Adachi, Yu Tanaka, Atsuko Miyagi, Makoto Kashima, Ayumi Tezuka, Yoshihiro Toya, Shunzo Kobayashi, Satoshi Ohkubo, Hiroshi Shimizu, Maki Kawai-Yamada, Rowan F. Sage, Atsushi J. Nagano, Wataru Yamori

JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY 70(19) 5287-5297 2019年10月査読有り
A niche for cyanobacteria producing chlorophyll f within a microbial mat

Satoshi Ohkubo, Hideaki Miyashita

ISME JOURNAL 11(10) 2368-2378 2017年10月査読有り
Temperature change affected groundwater quality in a confined marine aquifer during long-term heating and cooling

Takeshi Saito, Shoichiro Hamamoto, Takashi Ueki, Satoshi Ohkubo, Per Moldrup, Ken Kawamoto, Toshiko Komatsu

WATER RESEARCH 94 120-127 2016年5月査読有り
Composition of carotenoids and identification of aerial microalgae isolated from the surface of rocks in mountainous districts of Japan

Nobuhiro Aburai, Satoshi Ohkubo, Hideaki Miyashita, Katsuya Abe

ALGAL RESEARCH-BIOMASS BIOFUELS AND BIOPRODUCTS 2(3) 237-243 2013年7月査読有り
Selective Detection and Phylogenetic Diversity of Acaryochloris spp. That Exist in Association with Didemnid Ascidians and Sponge

Satoshi Ohkubo, Hideaki Miyashita

MICROBES AND ENVIRONMENTS 27(3) 217-225 2012年9月査読有り
Genetic diversity of symbiotic cyanobacteria in Cycas revoluta (Cycadaceae)

Shuntaro Yamada, Satoshi Ohkubo, Hideaki Miyashita, Hiroaki Setoguchi

FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY 81(3) 696-706 2012年9月査読有り
Evidence of Global Chlorophyll d

Y. Kashiyama, H. Miyashita, S. Ohkubo, N. O. Ogawa, Y. Chikaraishi, Y. Takano, H. Suga, T. Toyofuku, H. Nomaki, H. Kitazato, T. Nagata, N. Ohkouchi

Science 321(5889) 658-658 2008年8月1日査読有り
Molecular detection of epiphytic Acaryochloris spp. on marine macroalgae

Satoshi Ohkubo, Hideaki Miyashita, Akio Murakami, Haruko Takeyama, Tohru Tsuchiya, Mamoru Mimuro

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY 72(12) 7912-7915 2006年12月査読有り

MISC

深層学習によるイネの野外トランスクリプトームモデルの構築と他種への転移学習

前田太郎, 大久保智司, 鹿島誠, 京極大助, 橋田庸一, 田中克, 森直哉, 渡邊博之, 安達俊輔, 永野惇, 永野惇

日本植物生理学会年会(Web) 62nd 2021年
水稲の葉の光合成速度をトランスクリプトームから予測する

安達俊輔, 本田爽太郎, 大久保智司, 鹿島誠, SAN Nan Su, NAKKASAME Anothai, 齊藤大樹, 大川泰一郎, 永野惇

農作業研究 55 2020年
トランスクリプトームを用いた野外環境におけるイネ光合成速度の予測モデリング

本田爽太郎, 大久保智司, 鹿島誠, SAN Nan Su, NAKKASAME Anothai, 齊藤大樹, 大川泰一郎, 永野惇, 安達俊輔

日本作物学会講演会要旨集 249th 2020年
野外環境と遺伝子発現情報からイネ光合成速度を予測するモデルの構築と改良

大久保智司, 本田爽太郎, 鹿島誠, SAN Nan Su, NAKKASAME Anothai, 齊藤大樹, 大川泰一郎, 永野惇, 安達俊輔

日本作物学会講演会要旨集 250th 2020年
イネ個葉光合成速度と地上部バイオマスとの関係―染色体断片置換系統の生育期間を通じたガス交換測定に基づく解析―

富澤和紀, 寺崎千鶴, 大久保智司, 大川泰一郎, 安達俊輔

日本作物学会講演会要旨集 247th 162 2019年3月28日
光合成誘導反応のイネ品種間差に関わる生理的要因の解析

安達俊輔, 田中佑, 宮城敦子, 鹿島誠, 手塚あゆみ, 戸谷吉博, 小林俊造, 大久保智司, 清水浩, 川合真紀, 永野惇, 矢守航

日本作物学会講演会要旨集 247th 2019年
ドキュメントスキャナによるイネ葉身画像取得法の確立

本田爽太郎, 大久保智司, 大川泰一郎, 安達俊輔

日本作物学会関東支部会報(Web) 34 2019年
新型迅速光合成測定装置を用いたイネ光合成日変化の評価

寺崎千鶴, 富澤和紀, 速水健太郎, 大川泰一郎, 大久保智司, 田中佑, 安達俊輔

日本作物学会講演会要旨集 246th 129 2018年9月4日
野外圃場で測定したイネの葉の光合成能力の品種間差

大久保智司, 大久保智司, 齊藤大樹, 齊藤大樹, 矢守航, 永野惇, 大川泰一郎, 安達俊輔

日本作物学会講演会要旨集 246th 132 2018年9月4日
イネ染色体断片置換系統を用いた,環境情報と遺伝子型に基づく遺伝子発現動態の予測

鹿島誠, 齊藤大樹, 坂本亮太, 大久保智司, 手塚あゆみ, 出口亜由美, 橋田庸一, 栗田悠子, 永野惇

日本植物学会大会研究発表記録 82nd 2018年
野外トランスクリプトームと数理モデリングを用いた,気象情報と遺伝子型に基づくイネの遺伝子発現動態の予測

鹿島誠, 坂本亮太, 齊藤大樹, 齊藤大樹, 大久保智司, 手塚あゆみ, 出口亜由美, 橋田庸一, 栗田悠子, 永野惇

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 41st 2018年
シアノバクテリアの進化とクロロフィルの多様化

宮下英明, 大久保智司, 神川龍馬

日本陸水学会大会講演要旨集 79th (Web) 2014年
PE-008 地下水中の微生物叢に対する地下温度上昇の影響(微生物群集構造,ポスター発表)

大久保智司, 斎藤健志, 濱本昌一郎, 大西純一, 小松登志子

(29) 118 2013年
PE-009 関東平野の地下帯水層土壌に含まれる真正細菌叢の網羅的解析(微生物群集構造,ポスター発表)

大西純一, Azad Mh.Abul Kalam, 大久保智司, 斎藤広隆, 竹村貴人, 濱本昌一郎, 小松登志子

日本微生物生態学会講演要旨集 (29) 119-119 2013年
PE-18 「天狗の麦飯」微生物群集構造の産地間比較(PE 微生物群集構造,ポスター発表)

坂本皆子, 高取淳哉, 大久保智司, 宮下英明

日本微生物生態学会講演要旨集 (28) 155-155 2012年
PGb-13 シアノバクテリアKC1株におけるクロロフィルf合成誘導条件の考察(PGb 増殖・生理・代謝(光栄養),ポスター発表)

松本翔吾, 大久保智司, 宮下英明

日本微生物生態学会講演要旨集 (28) 162-162 2012年
PA1-02 琵琶湖におけるAcaryochloris spp.の鉛直分布とクロロフィルdの適応的意義(PAa 水圏生態系(一般),ポスター発表)

酒井翔太, 成田隆造, 大久保智司, 石川加奈子, 宮下英明

日本微生物生態学会講演要旨集 (28) 132-132 2012年
PGb-10 温泉微生物マット内におけるクロロフィルfの分布(PGb 増殖・生理・代謝(光栄養),ポスター発表)

大久保智司, 松本翔吾, 宮下英明

日本微生物生態学会講演要旨集 (28) 162-162 2012年
PE-17 「天狗の麦飯」の主要構成微生物の門レベルでの識別(PE 微生物群集構造,ポスター発表)

金井眞知子, 坂本皆子, 幡野恭子, 大久保智司, 宮下英明

日本微生物生態学会講演要旨集 (28) 155-155 2012年
琵琶湖北湖におけるAcaryochloris spp.の鉛直分布とクロロフィルdの適応的意義

成田隆造, 酒井翔太, 大久保智司, 石川可奈子, 宮下英明

藻類 60(2) 2012年

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2016年8月 - 現在

日本作物学会
2014年3月 - 現在

日本植物生理学会
2014年 - 現在

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2011年5月 - 現在

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2005年3月 - 現在

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2004年10月 - 現在

日本微生物生態学会

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