遠藤玉樹 (Endoh Tamaki) - マイポータル

基本情報

所属: 甲南大学先端生命工学研究所准教授

学位: 博士（工学）

J-GLOBAL ID: 201801019551324150
researchmap会員ID: B000330751

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 応用生物化学 /

経歴

2016年4月 - 現在

甲南大学, 先端生命工学研究所, 准教授
2009年4月 - 2016年3月

甲南大学, 先端生命工学研究所, 講師
2006年4月 - 2009年3月

岡山大学, 大学院自然科学研究科, 特別契約職員助教

受賞

2017年3月

日本化学会第97春季年会若い世代の特別講演会特別講演証

遠藤玉樹
2013年9月

第7回バイオ関連化学シンポジウムバイオ関連化学シンポジウム講演賞

遠藤玉樹
2012年11月

The First International Symposium on Biofunctional Chemistry (ISBC2012) ISBC2012 Poster Award

遠藤玉樹
2012年11月

第39回国際核酸化学シンポジウム ISNAC Outstanding Oral Presentation Award for Young Scientist in 2012

遠藤玉樹
2012年3月

日本化学会第92春季年会優秀講演賞（学術）

遠藤玉樹
2008年5月

遺伝子・デリバリー研究会第8回シンポジウム奨励賞

遠藤玉樹
2008年3月

日本化学会第88春季年会優秀講演賞（学術）

遠藤玉樹
2006年3月

日本化学会第86春季年会学生講演賞

遠藤玉樹
2005年7月

The 6th International Conference on Intelligent Materials 高木賞

遠藤玉樹

論文

Contrasting effect of different crowding agents on pseudoknot RNA stability

Tamaki Endoh, Sagar Satpathi, Naoki Sugimoto

2024年4月22日
Guanidine modification improves functions of natural RNA-targeting alkaloids

Tamaki Endoh, Sagar Satpathi, Yutong Chen, Saki Matsumoto, Tatsuya Ohyama, Peter Podbevšek, Janez Plavec, Kazumitsu Onizuka, Fumi Nagatsugi, Naoki Sugimoto

New Journal of Chemistry 48(19) 8529-8533 2024年
Nearest-neighbor parameters for the prediction of RNA duplex stability in diverse in vitro and cellular-like crowding conditions.

Saptarshi Ghosh, Shuntaro Takahashi, Dipanwita Banerjee, Tatsuya Ohyama, Tamaki Endoh, Hisae Tateishi-Karimata, Naoki Sugimoto

Nucleic acids research 51(9) 4101-4111 2023年5月22日
核酸の構造及び安定性の制御に基づく新規の脳疾患抑制法の開発 [2020（令和2）年度分]

杉本直己, 遠藤玉樹, 高橋俊太郎, 建石寿枝

甲南学園平生太郎基金科学研究報告書 = The Hirao Taro Foundation of KONAN GAKUEN for Academic Research Report 14 87-126 2023年3月31日
核酸の構造及び安定性の制御に基づく新規の脳疾患抑制法の開発 [2021（令和3）年度分]

杉本直己, 遠藤玉樹, 高橋俊太郎, 建石寿枝

甲南学園平生太郎基金科学研究報告書 = The Hirao Taro Foundation of KONAN GAKUEN for Academic Research Report 14 127-169 2023年3月31日
Endogenous G-quadruplex-forming RNAs inhibit the activity of SARS-CoV-2 RNA polymerase.

Tamaki Endoh, Shuntaro Takahashi, Naoki Sugimoto

Chemical communications (Cambridge, England) 59(7) 872-875 2023年1月19日
Cladogenetic Orthogonal Light-Up Aptamers for Simultaneous Detection of Multiple Small Molecules in Cells.

Tamaki Endoh, Jia-Heng Tan, Shuo-Bin Chen, Naoki Sugimoto

Analytical chemistry 95(2) 976-985 2023年1月17日
High-temperature adaptation of an OsNRT2.3 allele is thermoregulated by small RNAs.

Yong Zhang, Hisae Tateishi-Karimata, Tamaki Endoh, Qiongli Jin, Kexin Li, Xiaoru Fan, Yingjun Ma, Limin Gao, Haiyan Lu, Zhiye Wang …

Science advances 8(47) eadc9785 2022年11月25日
非二重らせん核酸の多元機能環境応答性を示す非二重らせん核酸構造のスクリーニング法の構築

遠藤玉樹, 奥田修二郎, 凌一葦, 建石寿枝, 杉本直己

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 95回 2S09e-03 2022年11月
Applicability of the nearest-neighbour model for pseudoknot RNAs.

Sagar Satpathi, Tamaki Endoh, Naoki Sugimoto

Chemical Communications 58(40) 5952-5955 2022年5月17日
Correction to 'Improved nearest-neighbor parameters for the stability of RNA/DNA hybrids under a physiological condition'.

Dipanwita Banerjee, Hisae Tateishi-Karimata, Tatsuya Ohyama, Saptarshi Ghosh, Tamaki Endoh, Shuntaro Takahashi, Naoki Sugimoto

Nucleic acids research 49(18) 10796-10799 2021年10月11日
Transcriptome screening followed by integrated physicochemical and structural analyses for investigating RNA-mediated berberine activity.

Sagar Satpathi, Tamaki Endoh, Peter Podbevšek, Janez Plavec, Naoki Sugimoto

Nucleic acids research 49(15) 8449-8461 2021年9月7日
Triple-Helical Binding of Peptide Nucleic Acid Inhibits Maturation of Endogenous MicroRNA-197.

Tamaki Endoh, Nikita Brodyagin, Dziyana Hnedzko, Naoki Sugimoto, Eriks Rozners

ACS chemical biology 16(7) 1147-1151 2021年7月16日
Chemical Biology of Double Helical and Non-Double Helical Nucleic Acids: “To B or Not To B, That Is the Question”

Naoki Sugimoto, Tamaki Endoh, Shuntaro Takahashi, Hisae Tateishi-Karimata

Bulletin of the Chemical Society of Japan 94(7) 1970-1998 2021年7月15日
Improved nearest-neighbor parameters for the stability of RNA/DNA hybrids under a physiological condition.

Dipanwita Banerjee, Hisae Tateishi-Karimata, Tatsuya Ohyama, Saptarshi Ghosh, Tamaki Endoh, Shuntaro Takahashi, Naoki Sugimoto

Nucleic acids research 48(21) 12042-12054 2020年12月2日査読有り
Effects of Modifying Thioflavin T at the N3-Position on Its G4 Binding and Fluorescence Emission.

Yuka Kataoka, Hiroto Fujita, Tamaki Endoh, Naoki Sugimoto, Masayasu Kuwahara

Molecules (Basel, Switzerland) 25(21) 2020年10月26日
Nearest-neighbor parameters for predicting DNA duplex stability in diverse molecular crowding conditions.

Saptarshi Ghosh, Shuntaro Takahashi, Tatsuya Ohyama, Tamaki Endoh, Hisae Tateishi-Karimata, Naoki Sugimoto

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 117(25) 14194-14201 2020年6月23日査読有り
Signaling Aptamer Optimization through Selection Using RNA-Capturing Microsphere Particles.

Tamaki Endoh, Naoki Sugimoto

Analytical chemistry 92(11) 7955-7963 2020年6月2日査読有り
RNA-Capturing Microsphere Particles (R-CAMPs) for Optimization of Functional Aptamers

Tamaki Endoh, Tatsuya Ohyama, Naoki Sugimoto

Small 15(26) 2019年6月26日
Conformational dynamics of the RNA G-quadruplex and its effect on translation efficiency

Tamaki Endoh, Naoki Sugimoto

Molecules 24(8) 2019年4月24日

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MISC

四重鎖DNAを内包した人工ウイルスキャプシドの創製

石井楽乃, 稲葉央, 遠藤玉樹, 建石寿枝, 杉本直己, 松浦和則

日本化学会春季年会講演予稿集(Web) 104th 2024年
環境応答性を示す非二重らせん核酸構造のスクリーニング法の構築

遠藤玉樹, 奥田修二郎, 凌一葦, 建石寿枝, 杉本直己, 杉本直己

日本生化学会大会(Web) 95th 2022年
Nucleic Acids Chemistry and Engineering: Special Issue on Nucleic Acid Conjugates for Biotechnological Applications

Tamaki Endoh, Eriks Rozners, Takashi Ohtsuki

APPLIED SCIENCES-BASEL 11(8) 2021年4月
高圧力を用いた遺伝子発現を制御する核酸構造遷移の反応解析

高橋俊太郎, 遠藤玉樹, BHOWMIK Sudipta, 杉本直己

高圧討論会講演要旨集 59th 159 2018年11月13日
分子クラウディング環境下におけるFMNリボスイッチ由来のアプタマードメインの分子挙動

遠藤玉樹, RODE B.Ambadas, RODE B.Ambadas, 杉本直己

日本RNA学会年会要旨集 20th 30 2018年7月9日
脱ワトソン・クリックの核酸化学(43):G‐quadruplex構造を安定化させるN‐メチル化クロリン類の合成

永野泰伸, 遠藤玉樹, 小笠原伸, 杉本直己, 杉本直己, 民秋均

日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM) 98th ROMBUNNO.1PC‐130 2018年3月6日
脱ワトソン・クリックの核酸化学(43):G‐quadruplex構造を安定化させるN‐メチル化クロリン類の合成

永野泰伸, 遠藤玉樹, 小笠原伸, 杉本直己, 杉本直己, 民秋均

日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM) 98th ROMBUNNO.4D5‐04 2018年3月6日
疾患関連分子の認識技術の革新 mRNA構造のダイナミクスを考慮した疾患関連遺伝子の発現制御技術の構築

遠藤玉樹, 杉本直己

生命科学系学会合同年次大会 2017年度 [3AW23-3] 2017年12月
新しい遺伝子発現暗号細胞内環境によるmRNA構造の時空間調律

遠藤玉樹

化学と工業 70(8) 724‐725 2017年8月1日
転写・翻訳反応の教材模型の開発と活用

三村かおり, 藤田真梨子, 梅崎瞭, 建石寿枝, 高橋俊太郎, 遠藤玉樹, 藤井大雅, 杉本直己

日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM) 97th ROMBUNNO.3A4‐01 2017年3月3日
mRNA構造のダイナミクスを考慮した疾患関連遺伝子の発現制御技術の構築

遠藤玉樹, 杉本直己, 杉本直己

日本生化学会大会(Web) 90th ROMBUNNO.3AW23‐3 (WEB ONLY) 2017年
先制医薬学における核酸の非二重らせん構造の役割

建石寿枝, 遠藤玉樹, 杉本直己

Antisense 18(1) 8-19 2014年7月
生命分子の挙動に及ぼす分子環境の効果(49)転写途中に形成される準安定なRNA二次構造によるRNA四重鎖構造を介した翻訳抑制への影響

遠藤玉樹, 杉本直己

日本化学会講演予稿集 94th(3) 847 2014年3月12日
翻訳反応を調節し得るmRNA構造の熱安定性と構造特性との相関解析

遠藤玉樹

ひょうご科学技術協会研究成果報告書(Web) 2014 WEB ONLY 2014年
最新センサー材料・技術の開発事例〔開発事例〕RNAとタンパク質で発光する分子センサーの開発

遠藤玉樹, 杉本直己

工業材料 61(12) 22-25 2013年12月1日
RNAとタンパク質で発光する分子センサーの開発 (特集最新センサー材料・技術の開発事例)

遠藤玉樹, 杉本直己

工業材料 61(12) 22-25 2013年12月
タンパク質の分解を"コード"するmRNAの発見 : RNAはタンパク質のライフサイクルを制御しているのか?

遠藤玉樹, 杉本直己

化学 = Chemistry 68(8) 47-52 2013年8月
核酸の非二重らせん構造はどのような役割を担っているか?

杉本直己, 遠藤玉樹, 建石寿枝, 高橋俊太郎

Chromatography 34(Supplement 1) 5-6 2013年5月23日
Designed peptide with peptide nucleic acids for addressable precipitation of silica on DNA

Kenji Usui, Kazuma Nagai, Hiroto Nishiyama, Tamaki Endoh, Takaaki Tsuruoka, Satoshi Fujii

PROTEIN SCIENCE 21 122-123 2012年8月
Close Up実験法(Series 214) 可視光照射によるRNAiの時空間的制御法(GLIP-RNAi法)

石躍由佳, 遠藤玉樹, 大槻高史

実験医学 29(8) 1297-1302 2011年5月

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書籍等出版物

核酸科学ハンドブック

杉本直己, 日本核酸化学会, 講談社サイエンティフィク (担当:分担執筆, 範囲:第II部核酸科学の最前線 15. リボスイッチ)

講談社 2020年12月 (ISBN: 9784065207864)
生体分子化学―基礎から応用まで (エキスパート応用化学テキストシリーズ)

杉本直己, 内藤昌信, 橋詰峰雄, 高橋俊太郎, 田中直毅, 建石寿枝, 遠藤玉樹, 津本浩平, 長門石曉, 松原輝彦, 上田実, 朝山章一郎 (担当:共著)

講談社 2017年1月27日 (ISBN: 406156806X)
生体分子化学―基礎から応用まで (エキスパート応用化学テキストシリーズ)

杉本直己, 内藤昌信, 橋詰峰雄, 高橋俊太郎, 田中直毅, 建石寿枝, 遠藤玉樹, 津本浩平, 長門石曉, 松原輝彦, 上田実, 朝山章一郎, 杉本直己 (担当:共著)

講談社 2017年1月26日
生体分子化学 : 基礎から応用まで = biomolecular chemistry

杉本直己, 内藤昌信, 橋詰峰雄, 高橋俊太郎, 田中直毅, 建石寿枝, 遠藤玉樹, 津本浩平, 長門石曉, 松原輝彦, 上田実, 朝山章一郎, 講談社サイエンティフィク

講談社 2017年 (ISBN: 9784061568068)

講演・口頭発表等

バルジを含むRNA二重鎖と天然アルカロイドとの相互作用解析

遠藤玉樹、SATPATHI Saga、PODBEVŠEK Peter、PLAVEC Janez、杉本直己

第14回バイオ関連化学シンポジウム 2020年9月7日
Stability prediction of DNA duplexes available under diverse molecular crowding conditions

GHOSH Saptarshi、高橋俊太郎、大山達也、遠藤玉樹、建石寿枝、杉本直己

第14回バイオ関連化学シンポジウム 2020年9月7日
Development of the prediction method for stability of RNA/DNA hybrids under a physiological condition

BANERJEE Dipanwita、建石寿枝、大山達也、GHOSH Saptarshi、遠藤玉樹、高橋俊太郎、杉本直己

第14回バイオ関連化学シンポジウム 2020年9月7日
Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (57): Parameters for prediction of DNA duplex stabilities under the crowding conditions

S. Ghosh, S. Takahashi, T. Ohyama, T. Endoh, H. Tateishi-Karimata, and N. Sugimoto

日本化学会第100回春季年会 2020年3月22日
Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (59): Prediction method for the stability of RNA/DNA hybrid duplex under a physiological condition

D. Banerjee, H. Tateishi-Karimata, T. Ohyama, M. Trajkovski, M. Toplishek, S. Takahashi, T. Endoh, J. Plavec, and N. Sugimoto

日本化学会第100回春季年会 2020年3月22日
Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (60): Interaction analyses between natural alkaloids and RNAs with different structure motifs

T. Endoh, S. Satpathi, and N. Sugimoto

日本化学会第100回春季年会 2020年3月22日
Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (61): Effect of Neighboring Base Pairs of Cytosine Bulge on Berberine Induced RNA Stabilization

S. Satpathi, T. Endoh, and N.Sugimoto

日本化学会第100回春季年会 2020年3月22日
同時かつ連続的な生体反応系における動的核酸構造変化の重要性

遠藤玉樹

核酸化学懇話会2020（北海道・東北地区セミナー） 2020年1月9日招待有り
Light-up型蛍光小分子に結合する核酸配列の最適化技術の確立と応用

遠藤玉樹、村瀬裕貴、鬼塚和光、永次史、杉本直己

第19回東北大学多元物質科学研究所研究発表会 2019年12月12日
Sequence Optimization to Conditionally Regulate Functional RNAs for Biotechnological Applications

T. Endoh and N. Sugimoto

13th Anniversary International Symposium on Nanomedicine (ISNM2019) 2019年12月4日
Prediction method for DNA duplex stability in molecular crowding conditions

S. Ghosh, S. Takahashi, T. Ohyama, T. Endoh, H. Kateishi-Karimata, and N. Sugimoto

第46回国際核酸化学シンポジウム 2019年10月29日
Screening of transcriptomic RNAs that interact with thioflavin T derivative

T. Endoh, M. Kuwahara, Y. Kataoka, and N. Sugimoto

第46回国際核酸化学シンポジウム 2019年10月29日
Development of new prediction parameters for RNA/DNA hybrid duplex stability under a physiological buffer condition

D. Banerjee, H. Tateishi-Karimata, T. Ohyama, T. Endoh, S. Takahashi, and N. Sugimoto

第46回国際核酸化学シンポジウム 2019年10月29日
Conformational Dynamics of the RNA G-Quadruplex and its Effect on Gene Expressions

T. Endoh and N. Sugimoto

Advances in Noncanonical Nucleic Acids "ANNA2019" 2019年10月17日招待有り
RNA-capturing microsphere particles (R-CAMPs) for optimization of functional RNAs

T. Endoh and N. Sugimoto

10th RSC-CSJ Joint Symposium 2019年9月7日
生理活性分子に結合する天然RNAの網羅的スクリーニング

遠藤玉樹、杉本直己

第13回バイオ関連化学シンポジウム 2019年9月4日
Conformational dynamics of RNA G-quadruplex affects protein expression in Escherichia coli

T. Endoh and N. Sugimoto

The Commemorative International Symposium of Nucleic Acid Chemistry (CISNAC2019) 2019年7月22日
Interactions between Structured Nucleic Acids and π-conjugated Heterocyclic Chemicals

T. Endoh

Fourteenth International Workshop on Supramolecular Nanoscience of Chemically Programmed Pigments (SNCPP19) 2019年6月14日招待有り
Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (49): Validation of the nearest-neighbor model for self-complementary DNA duplex under molecular crowding

S. Ghosh, S. Takahashi, T. Endoh, H. Tateishi-Karimata, and N. Sugimoto

日本化学会第99回春季年会（2019） 2019年3月16日
Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (52): Optimization of RNA conformational switch using RNA-capturing microsphere particle (R-CAMP)

T. Endoh and N. Sugimoto

日本化学会第99回春季年会（2019） 2019年3月16日

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所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

いつ、どこで、どのように、核酸の高次構造は形成し機能するのかを予測する

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(S) 2022年4月 - 2027年3月

杉本直己, 松浦和則, 沼田圭司, 遠藤玉樹, 高橋俊太郎, 建石寿枝
生物種の分類枠組みを超えた網羅解析による多元応答深化の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(B) 2021年8月 - 2024年3月

遠藤玉樹, 凌一葦
多元応答ゲノム機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(B) 2021年8月 - 2024年3月

建石寿枝, 今西未来, 遠藤玉樹
細胞内環境で変化する非二重らせん構造の定量的機能解析と遺伝子発現制御

日本学術振興会科学研究費助成事業国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B)) 2018年10月 - 2023年3月

杉本直己, TENG Ye, 建石寿枝, 高橋俊太郎, 遠藤玉樹, GHOSH SAPTARSHI, 松本咲
細胞内で機能するRNA構造スイッチの最適化および合理的設計技術の構築

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2019年4月 - 2022年3月

遠藤玉樹
核酸構造のトポロジーによる遺伝子発現の化学的制御

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2019年4月 - 2022年3月

杉本直己, 建石寿枝, 高橋俊太郎, 遠藤玉樹
核酸構造の多様性に基づく新規の遺伝暗号Dimensional Codeの解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2016年4月 - 2019年3月

杉本直己, 遠藤玉樹, 高橋俊太郎, 建石寿枝, 藤井大雅
複数遺伝子の同時・並列転写制御によるヒト細胞内での遺伝子発現ネットワークの構築

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2014年4月 - 2017年3月

遠藤玉樹
遺伝子発現に重要な関与をする核酸の非標準構造のエネルギーデータベース化とその活用

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2012年4月 - 2015年3月

杉本直己, 遠藤玉樹, 建石寿枝
新生ＲＮＡの合理的な構造遷移速度制御に基づく細胞内におけるＲＮＡスイッチの機能化

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2012年4月 - 2014年3月

遠藤玉樹
Protein Folding Codonによるタンパク質機能調節機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2010年 - 2011年

杉本直己, 遠藤玉樹, 長門石曉
Protein-RNA conjugateによる細胞内代謝産物のイメージング

日本学術振興会科学研究費助成事業研究活動スタート支援 2009年 - 2010年

遠藤玉樹

産業財産権

特開2006-055017 核酸の検出方法

小畠英理, 三重正和, 遠藤玉樹

遠藤玉樹

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研究分野

経歴

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

所属学協会

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