寺本孝行 (Takayuki Teramoto) - マイポータル

基本情報

J-GLOBAL ID: 201401077144112955
researchmap会員ID: B000242653

外部リンク: http://kaken.nii.ac.jp/d/r/90571836.ja.html

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 遺伝学 /

経歴

2014年

九州大学, 理学(系)研究科(研究院), 研究員

受賞

2008年3月

最優秀ポスター賞, ゴードンカンファレンス
2008年3月

年間最優秀研究員賞, ノースウェスタン大学メディカルスクール (シカゴ)

論文

WormTensor: a clustering method for time-series whole-brain activity data from C. elegans

Koki Tsuyuzaki, Kentaro Yamamoto, Yu Toyoshima, Hirofumi Sato, Manami Kanamori, Takayuki Teramoto, Takeshi Ishihara, Yuichi Iino, Itoshi Nikaido

BMC Bioinformatics 24(1) 2023年6月16日
The SOCE system is critical for membrane bleb formation to drive avian primordial germ cell migration

Mizuki Morita, Manami Morimoto, Takayuki Teramoto, Junichi Ikenouchi, Yuji Atsuta, Daisuke Saito

2023年6月12日
Deducing ensemble dynamics and information flow from the whole-brain imaging data

Yu Toyoshima, Hirofumi Sato, Daiki Nagata, Manami Kanamori, Moon Sun Jang, Koyo Kuze, Suzu Oe, Takayuki Teramoto, Yuishi Iwasaki, Ryo Yoshida …

2022年11月18日
3DeeCellTracker, a deep learning-based pipeline for segmenting and tracking cells in 3D time lapse images.

Chentao Wen, Takuya Miura, Venkatakaushik Voleti, Kazushi Yamaguchi, Motosuke Tsutsumi, Kei Yamamoto, Kohei Otomo, Yukako Fujie, Takayuki Teramoto, Takeshi Ishihara …

eLife 10 2021年3月30日査読有り
Neuron ID dataset facilitates neuronal annotation for whole-brain activity imaging of C. elegans

Yu Toyoshima, Stephen Wu, Manami Kanamori, Hirofumi Sato, Moon Sun Jang, Suzu Oe, Yuko Murakami, Takayuki Teramoto, Chanhyun Park, Yuishi Iwasaki …

BMC biology 18(1) 30-30 2020年3月査読有り
An annotation dataset facilitates automatic annotation of whole-brain activity imaging of C. elegans

Yu Toyoshima, Stephen Wu, Manami Kanamori, Hirofumi Sato, Moon Sun Jang, Suzu Oe, Yuko Murakami, Takayuki Teramoto, ChanHyun Park, Yuishi Iwasaki …

2019年7月10日
Deep-learning-based flexible pipeline for segmenting and tracking cells in 3D image time series for whole brain imaging

Chentao Wen, Takuya Miura, Yukako Fujie, Takayuki Teramoto, Takeshi Ishihara, Koutarou D. Kimura

bioRxiv 2018年8月査読有り
Environmental responsiveness of tubulin glutamylation in sensory cilia is regulated by the p38 MAPK pathway.

Kimura Y, Tsutsumi K, Konno A, Ikegami K, Hameed S, Kaneko T, Kaplan OI, Teramoto T, Fujiwara M, Ishihara T …

Sci Rep. 8(1) 8392-8392 2018年5月査読有り
線虫の全中枢神経細胞活動データに対する因果性解析II

岩崎唯史, ジャンムンソン, 吉田亮, 飯野雄一, 石原健, 佐藤博文, 大江紗, 久下小百合, 寺本孝行, 徳永旭将 …

日本物理学会講演概要集 73 2315-2315 2018年
線虫の全中枢神経細胞活動データに対する因果性解析

岩崎唯史, 吉田亮, 飯野雄一, 石原健, 佐藤博文, 大江紗, 寺本孝行, 徳永旭将, 広瀬修, Wu S. …

日本物理学会講演概要集 73 2853-2853 2018年
An improved inverse-type Ca2+ indicator can detect putative neuronal inhibition in Caenorhabditis elegans by increasing signal intensity upon Ca2+ decrease.

Hara-Kuge S, Nishihara T, Matsuda T, Kitazono T, Teramoto T, Nagai T, Ishihara T

PloS one 13(4) e0194707 2018年査読有り
SPF-CellTracker: Tracking multiple cells with strongly-correlated moves using a spatial particle filter

Hirose Osamu, Shotaro Kawaguch, Terumasa Tokunaga, Yu Toyoshima, Takayuki Teramoto, Sayuri Kuge, Takeshi Ishihara, Yuich Iino, Ryo Yoshida

IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics 15(6) 1822-1831 2017年11月査読有り
線虫の全脳活動データに対する位相解析

岩崎唯史, 飯野雄一, 石原健, 寺本孝行, 大江紗, 徳永旭将, 広瀬修, Wu S., 豊島有, ジャンムンソン …

日本物理学会講演概要集 72 2817-2817 2017年
Large Graph Laplacian Matrix and Functional Map of Whole Brain of C. elegans

Hiromu Sakuma, Takayuki Teramoto, Sayuri Kuge, Takeshi Ishihara, Yuishi Iwasaki

Proceedings of 2016 International Symposium on Nonlinear Theory and Its Applications 696-699 2016年11月27日査読有り
Gonadal Maturation Changes Chemotaxis Behavior and Neural Processing in the Olfactory Circuit of Caenorhabditis elegans.

Fujiwara M, Aoyama I, Hino T, Teramoto T, Ishihara T

Current biology : CB 26(12) 1522-1531 2016年6月査読有り
Accurate Automatic Detection of Densely Distributed Cell Nuclei in 3D Space,

Yu Toyoshima, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Manami Kanamori, Takayuki Teramoto, Moon Sun Jang, Sayuri Kuge, Takeshi Ishihara, Ryo Yoshida, Yuichi Iino

PLOS Computational Biology 12(6) 2016年6月査読有り
Automated detection and tracking of many cells by using 4D live-cell imaging data

Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Shotaro Kawaguchi, Yu Toyoshima, Takayuki Teramoto, Hisaki Ikebata, Sayuri Kuge, Takeshi Ishihara, Yuichi Iino, Ryo Yoshida

BIOINFORMATICS 30(12) 43-51 2014年6月査読有り
3P228 線虫の単一神経細胞におけるCa2+時空間ダイナミクス: 数理モデルとその解析(神経・感覚,ポスター,第52回日本生物物理学会年会(2014年度))

Yuishi Iwasaki, Sayuri Kuge, Takayuki Teramoto, Takeshi Ishihara

生物物理 54(1) S286 2014年
Forgetting in C. elegans Is Accelerated by Neuronal Communication via the TIR-1/JNK-1 Pathway

Akitoshi Inoue, Etsuko Sawatari, Naoki Hisamoto, Tomohiro Kitazono, Takayuki Teramoto, Manabi Fujiwara, Kunihiro Matsumoto, Takeshi Ishihara

Cell Reports 3(3) 808-819 2013年査読有り
An expanded palette of genetically encoded Ca²⁺ indicators.

Zhao Y, Araki S, Wu J, Teramoto T, Chang YF, Nakano M, Abdelfattah AS, Fujiwara M, Ishihara T, Nagai T …

Science (New York, N.Y.) 333(6051) 1888-1891 2011年9月査読有り

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MISC

空間粒子フィルタによる多数の細胞の同時追跡

広瀬修, 川口翔太朗, 徳永旭将, 豊島有, 寺本孝行, 久下小百合, 石原健, 飯野雄一, 吉田亮

電子情報通信学会技術研究報告 115(112(IBISML2015 1-26)) 137-141 2015年6月16日
密集した細胞核の高精度な自動認識手法

豊島有, 豊島有, 徳永旭将, 徳永旭将, 広瀬修, 広瀬修, 寺本孝行, 寺本孝行, 張文, 張文, 久下小百合 …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 37th WEB ONLY 2LBA-05 2014年11月
線虫C.elegansの全中枢神経のCa2+イメージングによる刺激に対する応答と無刺激時における神経活動の計測

寺本孝行, 寺本孝行, 徳永旭将, 徳永旭将, 広瀬修, 広瀬修, 豊島有, 豊島有, 飯野雄一, 飯野雄一 …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 37th WEB ONLY 2P-0712 2014年11月
生命動態システム科学 I.定量生物学 2.組織・個体の計測 1)神経(1)神経系の丸ごと観測による神経回路の解析

飯野雄一, 寺本孝行, 石原健

生体の科学 65(5) 416-417 2014年10月15日
4Dライブセルイメージングデータ内の非常に多数の細胞を自動追跡するための空間粒子フィルタ手法の開発

広瀬修, 川口翔太郎, 徳永旭将, 豊島有, 寺本孝行, 久下小百合, 石原健, 飯野雄一, 吉田亮

統計関連学会連合大会講演報告集 2014 43 2014年9月
3次元動画像内の非常に多数の細胞領域を自動追跡するための粒子フィルタ手法の開発

広瀬修, 川口翔太郎, 徳永旭将, 豊島有, 寺本孝行, 佐藤賢二, 池端久貴, 佐藤博文, 久下小百合, 石原健 …

人工知能学会全国大会論文集(CD-ROM) 28th ROMBUNNO.2C3-2IN-2C32in 2014年5月
逐次的カーネル密度推定法を用いた神経細胞カルシウムイオン分布の定量化

徳永旭将, 広瀬修, 池端久貴, 川口翔太郎, 豊島有, 佐藤博文, 寺本孝行, 久下小百合, 石原健, 飯野雄一 …

統計関連学会連合大会講演報告集 2013 146 2013年9月
Molecular analysis of the integration of two sensory signals in C. elegans

Yuta Yamamoto, Yoichi Shinkai, Takayuki Teramoto, Takeshi Ishihara

NEUROSCIENCE RESEARCH 71 E175-E175 2011年
In vivo imaging of Ras activity in olfactory neurons suggests its transient activation is important for olfactory behaviour

Takayuki Uozumi, Takaaki Hirotsu, Kazushi Yoshida, Takayuki Teramoto, Ryuji Yamada, Akiya Suzuki, Yuichi Ino, Takeshi Ishihara

NEUROSCIENCE RESEARCH 71 E79-E79 2011年
Regulatory mechanisms of sensory integration for behavioral choice in C. elegans

Takeshi Ishihara, Yoichi Shinkai, Yuta Yamamoto, Takayuki Teramoto

NEUROSCIENCE RESEARCH 71 E40-E40 2011年
P2-u21 Four-dimensional in vivo Ca2+ imaging of the C. elegans neural network

Takayuki Teramoto, Takeshi Ishihara

NEUROSCIENCE RESEARCH 71 E207-E207 2011年

講演・口頭発表等

Whole-brain imaging of C. elegans reveals multi-neuronal dynamics under non-stimulus condition.

Takayuki Teramoto, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Yu Toyoshima, Yuichi Iino, Ryo Yoshida, Takeshi Ishihara

Cold Spring Harbor Laboratory Meeting Wiring the Brain 2015年3月26日
線虫中枢神経系のまるごと計測および定量解析にむけた取り組み

寺本孝行, 吉田亮

定量生物の会第７回年会 2015年1月11日招待有り
4-D imaging of neuronal activities in a local circuit for C. elegans behavioral choice

寺本孝行, 石原健

包括型脳科学研究推進支援ネットワーク 2014年度シンポジウム「予測と意思決定」領域会議 2014年12月11日招待有り
線虫の全中枢神経のCa2+イメージングによる刺激に対する応答と無刺激時における神経活動の計測

寺本孝行, 徳永旭将, 広瀬修, 豊島有, 久下小百合, 吉田亮, 飯野雄一, 石原健

第37回日本分子生物学会年会 2014年11月26日
線虫C. elegansの全中枢神経のCa2+イメージングによる刺激に対する応答と無刺激時における神経活動の計測

寺本孝行, 徳永旭将, 広瀬修, 豊島有, 久下小百合, 飯野雄一, 吉田亮, 石原健

JST/CREST第3回領域会議 2014年10月30日
Tracking oｆ Ca2+ dynamics in a whole single neuron

久下小百合, 寺本孝行, 石原健

C. elegans Neuro 2014 2014年7月9日
4-D imaging of neuronal activities in the whole central nervous system visualizes correlative patterns between multiple neurons.

寺本孝行, 豊島有, 徳永旭将, 吉田亮, 飯野雄一, 石原健

C. elegans Neuro 2014 2014年7月7日
In vivo 4-D Ca2+ imaging of multi-neuronal activities in a local circuit for C. elegans decision-making

寺本孝行, 石原健

新学術領域研究「予測と意思決定」第７回領域会議 2014年6月7日招待有り

担当経験のある科目(授業)

2020年

生物学通論 (九州大学)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

線虫の意思決定を担う神経回路の立体ライブイメージングによる動作原理の解明

文部科学省科学研究費補助金(新学術領域研究(研究領域提案型)) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2014年 - 2015年

寺本孝行
線虫脳における自発活動の動作基盤の遺伝学的解析

文部科学省科学研究費補助金(基盤研究(C)) 基盤研究(C) 2012年 - 2014年

寺本孝行

寺本孝行

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研究分野

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受賞

論文

MISC

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

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