水口朋子 (Tomoko Mizuguchi) - マイポータル

基本情報

所属: 京都工芸繊維大学材料化学系准教授

学位: 博士（理学）(九州大学)

J-GLOBAL ID: 201801007225834027
researchmap会員ID: B000318919

外部リンク: http://www.cis.kit.ac.jp/~senzai/

研究分野

自然科学一般 / 生物物理、化学物理、ソフトマターの物理 /

経歴

2020年3月 - 現在

京都工芸繊維大学, 材料化学系, 准教授
2026年4月 - 2027年3月

Ege University, Department of Chemistry, 客員研究員
2025年4月 - 2026年3月

京都大学, 化学研究所, 客員准教授
2024年10月 - 2025年3月

新潟大学, 自然科学系, 非常勤講師
2023年8月 - 2024年2月

FAU Erlangen-Nürnberg, Institute for Multiscale Simulation, 客員研究員
2018年4月 - 2020年2月

京都工芸繊維大学, 材料化学系, 助教
2015年3月 - 2018年3月

京都工芸繊維大学, 大学戦略推進機構系グローバルエクセレンス, 助教
2014年7月 - 2015年2月

名古屋大学, 大学院工学研究科, 研究員（CMSI重点研究員）
2014年4月 - 2014年6月

大阪大学, 大学院基礎工学研究科, 特任研究員
2012年4月 - 2014年3月

分子科学研究所, 理論・計算分子科学研究領域, 特任研究員（CMSI拠点研究員）
2011年4月 - 2012年3月

日本学術振興会, 特別研究員PD
2011年5月 - 2012年1月

Université Lille 1, Unité Matériaux et Transformations, 客員研究員
2010年4月 - 2011年3月

日本学術振興会, 特別研究員DC
2010年4月 - 2010年9月

東京電機大学, 非常勤助手
2010年1月 - 2010年3月

九州大学, DC共同研究員

学歴

2008年4月 - 2011年3月

九州大学, 大学院理学府, 物理学専攻
2006年4月 - 2008年3月

九州大学, 大学院理学府, 凝縮系科学専攻
2001年4月 - 2006年3月

東京理科大学, 理学部第一部, 物理学科

委員歴

2024年4月 - 2025年3月

日本物理学会, 領域運営委員
2022年7月 - 2024年7月

日本シミュレーション学会, 理事
2022年5月 - 2024年7月

日本シミュレーション学会, 日本シミュレーション学会誌編集委員
2019年11月 - 2024年7月

日本シミュレーション学会, JASSE co-chief guest editor
2022年7月 - 2024年6月

日本学術振興会, 特別研究員等審査会専門委員
2020年7月 - 2022年7月

日本シミュレーション学会, 代議員

受賞

2017年10月

研究賞, 日本シミュレーション学会

水口朋子
2016年10月

JSST2016 Outstanding Presentation Award, 日本シミュレーション学会

水口朋子
2009年12月

第23回分子シミュレーション討論会学生優秀発表賞, 分子シミュレーション研究会

水口朋子

論文

Aging of glass-forming materials following a temperature jump

Ayata Ueno, Tomoko Mizuguchi, Takashi Odagaki

Journal of Non-Crystalline Solids 668 123755 2025年11月査読有り責任著者
Reactive molecular dynamics simulations of the intra- and intermolecular reactions of hydrogen-abstracted polyethylene chains

Haolun Li, Susumu Fujiwara, Hiroaki Nakamura, Tomoko Mizuguchi, Shinji Saito, Wataru Sakai

Molecular Simulation 51(2) 122-127 2025年1月22日査読有り
Molecular dynamics study on clustered DNA damage: AP sites on the same strand

Kazushi Terakawa, Susumu Fujiwara, Tomoko Mizuguchi, Hiroaki Nakamura, Ken Akamatsu, Naoya Shikazono, Yoshiteru Yonetani

Biophysical Chemistry 319 107394 2025年1月査読有り
パーフルオロアルキル鎖の鎖長による自己集合構造の違い

米森龍之輔, 水口朋子, 長谷川健

日本シミュレーション学会和文論文誌 16(1) 24-31 2024年6月査読有り招待有り責任著者
Kinetic description of water transport during spontaneous emulsification induced by Span 80

Mao Fukuyama, Tomoko Mizuguchi, Piangrawee Santivongskul, Yuri Ono, Motohiro Kasuya, Arinori Inagawa, Akihide Hibara

Nanoscale 16(8) 4056-4062 2024年2月査読有り招待有り責任著者
Determination of cooperatively rearranging regions in a binary glass former

T Mizuguchi, T Odagaki

Journal of Physics: Condensed Matter 35(33) 334003 2023年8月23日査読有り筆頭著者責任著者
分子動力学シミュレーションによるSpan 80逆ミセル中の水素結合解析

小野悠李, 水口朋子, 福山真央

日本シミュレーション学会論文誌 15(2) 36-41 2023年7月査読有り招待有り責任著者
The study on the stability of DNA structure by steered molecular dynamics simulations

Tomoko Mizuguchi, Naoto Fukushima, Takashi Aoki, Susumu Fujiwara, Masato Hashimoto

Journal of Advanced Simulation in Science and Engineering 9(1) 160-169 2022年4月査読有り招待有り筆頭著者責任著者
Structural change of damaged polyethylene by beta-decay of substituted tritium using reactive force field

Haolun Li, Susumu Fujiwara, Hiroaki Nakamura, Tomoko Mizuguchi, Ayako Nakata, Tsuyoshi Miyazaki, Shinji Saito

Japanese Journal of Applied Physics 60 2021年1月1日
Icosahedral order in liquid and glassy phases of cyclohexane

Tomoko Mizuguchi, Soichi Tatsumi, Susumu Fujiwara

Molecular Simulation 46(10) 721-726 2020年7月2日査読有り筆頭著者責任著者
Molecular dynamics study on DNA damage by tritium disintegration

Hiroaki Nakamura, Hisanori Miyanishi, Takuo Yasunaga, Susumu Fujiwara, Tomoko Mizuguchi, Ayako Nakata, Tsuyoshi Miyazaki, Takao Otsuka, Takahiro Kenmotsu, Yuji Hatano …

Japanese Journal of Applied Physics 59(SA) SAAE01-SAAE01 2020年1月1日査読有り
Hydrogen bond analysis of confined water in mesoporous silica using the reactive force field

Tomoko Mizuguchi, Katsumi Hagita, Susumu Fujiwara, Takeshi Yamada

Molecular Simulation 45(17) 1437-1446 2019年11月22日査読有り筆頭著者責任著者
Structural Change of Tritium-substituted Polymeric Materials By Beta Decays: A Molecular Dynamics Study

L. Haolun, S. Fujiwara, H. Nakamura, T. Mizuguchi, T. Yasunaga, T. Otsuka, T. Kenmotsu, Y. Hatano, S. Saito

Plasma and Fusion Research 14 3401106 2019年8月査読有り
Cavitation in thin films of amorphous polymers from the static melt induced by thermal treatment

Masato Hashimoto, Susumu Fujiwara, Nan Lin, Atsushi Doi, Nozomi Katayama, Junki Ootani, Tomoko Mizuguchi

Polymer Journal 51 569-577 2019年6月1日
Computational strategy for studying structural change of tritium-substituted macromolecules by a beta decay to helium-3

Fujiwara Susumu, Nakamura Hiroaki, Li Haolun, Miyanishi Hisanori, Mizuguchi Tomoko, Yasunaga Takuo, Otsuka Takao, Hatano Yuji, Saito Shinji

JOURNAL OF ADVANCED SIMULATION IN SCIENCE AND ENGINEERING 6(1) 94-99 2019年査読有り
Dissipative particle dynamics simulation for self-assembly of symmetric bolaamphiphilic molecules in a solution

S. Fujiwara, Y. Iida, T. Tsutsui, T. Mizuguchi, M. Hashimoto, Y. Tamura, H. Nakamura

Plasma and Fusion Research 13 3401095 2018年7月査読有り
Free-Energy Analysis of Peptide Binding in Lipid Membrane Using All-Atom Molecular Dynamics Simulation Combined with Theory of Solutions

Tomoko Mizuguchi, Nobuyuki Matubayasi

Journal of Physical Chemistry B 122(13) 3219-3229 2018年4月5日査読有り招待有り筆頭著者
Crystallization tendencies of modelled Lennard-Jones liquids with different attractions

L. C. Valdès, J. Gerges, T. Mizuguchi, F. Affouard

Journal of Chemical Physics 148(1) 014501 2018年1月7日査読有り
Critical nucleus size for crystallization of supercooled liquids in two dimensions

Tomoko Mizuguchi, Yuki Higeta, Takashi Odagaki

PHYSICAL REVIEW E 95(4) 042804 2017年4月査読有り筆頭著者責任著者
Dissipative particle dynamics simulation of self-assembly in a bolaamphiphilic solution

Susumu Fujiwara, Yu Takahashi, Hiroki Ikebe, Tomoko Mizuguchi, Masato Hashimoto, Yuichi Tamura, Hiroaki Nakamura, Ritoku Horiuchi

Plasma and Fusion Research 11(1) 2401073 2016年査読有り

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MISC

反応力場ReaxFFを用いたシリカ細孔内の水に関する分子動力学シミュレーション

水口朋子

日本シミュレーション学会誌 42(3) 2023年9月招待有り筆頭著者責任著者
Protein-ligand binding affinity calculation by replica exchange thermodynamic integration

O. Takarada, O. Ichikawa, K. Yamazaki, K. Fujimoto, T. Mizuguchi, A. Yamada, S. Okazaki

HPCI Research Report 2 53 2017年12月査読有り
ミセル内の小分子に対するミセル界面の揺らぎの影響

水口朋子, 松林伸幸

繊維学会誌 72(5) P-266-P-269 2016年招待有り筆頭著者責任著者
１成分単純液体のガラス転移

水口朋子

アンサンブル 14(3) 154-159 2012年招待有り筆頭著者責任著者

講演・口頭発表等

ローダミン6Gの脂質膜透過におけるアニオンの影響

島田壮真, 水口朋子

第75回高分子討論会 2026年9月
Analysis of Hydrogen Bonds inside Span 80 Reverse Micelles by Molecular Dynamics Simulations

T. Mizuguchi, Y. Ono, M. Fukuyama

International 4th Conference on Functional Materials Science and Engineering (FunMat-2026) 2026年6月4日
Molecular dynamics simulations of per- and polyfluoroalkyl oligomers with different chain lengths

Tomoko Mizuguchi

Pacifichem 2025 2025年12月15日招待有り
分子動力学法によるヒト血清アルブミンとパーフルオロアルキル化合物の結合シミュレーション

辻脇陽希, 水口朋子, 尾嶋拓

第３９回分子シミュレーション討論会 2025年11月24日
パーフルオロアルキル鎖のねじれ角と安定性に関する分子動力学研究

田中洸樹, 水口朋子

第３９回分子シミュレーション討論会 2025年11月24日
Molecular docking simulations of Kratom alkaloids to serotonin 5-HT receptors

Tomoko Mizuguchi

XI International Conference on Novel Psychoactive Substances 2025年11月3日
Molecular dynamics simulation of gapped DNA labeled with fluorescent dye molecules: Orientation factor analysis

Takumi Timothy Hashi, Susumu Fujiwara, Tomoko Mizuguchi, Yoshiteru Yonetani, Naoya Shikazono, Ken Akamatsu, Hiroaki Nakamura

The 19th Pacific Polymer Conference (PPC19) 2025年7月
パーフルオロアルキル鎖中のメチレン基が集合構造に与える影響

米森龍之輔, 水口朋子

2024年度高分子基礎物性研究会・高分子計算機科学研究会合同討論会 2024年12月19日
分子動力学法によるヒト血清アルブミンとパーフルオロアルキル化合物の結合シミュレーション

辻脇陽希, 水口朋子, 尾嶋拓

第３８回分子シミュレーション討論会 2024年12月3日
ガラス形成物質の温度変化後のエージングについて

上野綾大, 水口朋子, 小田垣孝

東京大学物性研短期研究会「ガラスに関連する分野の最先端研究」 2024年10月30日
分子動力学法によるヒト血清アルブミンとパーフルオロアルキル化合物の結合シミュレーション

辻脇陽希, 水口朋子, 尾嶋拓

JSST2024 and AsiaSim2024 2024年9月19日
蛍光色素分子で標識した脱塩基損傷DNAの分子動力学シミュレーション

増本晃太朗, 藤原進, 水口朋子, 米谷佳晃, 鹿園直哉, 赤松憲, 中村浩章

JSST2024 and AsiaSim2024 2024年9月19日
蛍光色素分子で標識したギャップ損傷DNAの配向因子解析

橋拓実ティモシー, 藤原進, 水口朋子, 米谷佳晃, 鹿園直哉, 赤松憲, 中村浩章

JSST2024 and AsiaSim2024 2024年9月19日
自由エネルギーランドスケープの遅延応答に基づくガラスのエージング

上野綾大, 水口朋子, 小田垣孝

日本物理学会第79回年次大会 2024年9月17日
脱塩基部位を有する損傷DNAの分子動力学シミュレーション

藤原進, 寺川和志, 水口朋子, 中村浩章, 米谷佳晃, 赤松憲, 鹿園直哉

第73回高分子学会年次大会 2024年6月5日
トラッピング拡散モデルにおけるエージング現象の待ち時間依存性

上野綾大, 小田垣孝, 水口朋子

日本物理学会2024年春季大会 2024年3月20日
Molecular dynamics simulations for the aggregate structures of perfluoroalkyl oligomers

Tomoko Mizuguchi

Pittcon2024 2024年2月27日招待有り
Molecular dynamics study of tacticity effect of polymer brushes on alanine dipeptide adsorption

Haolun Li, Tomoko Mizuguchi, Susumu Fujiwara

9th International Symposium on BioComplexity 2024年1月25日
Molecular dynamics simulation of fluorescent dye-labeled DNA with apurinic/apyrimidinic sites

Kotaro Masumoto, Susumu Fujiwara, Tomoko Mizuguchi, Yoshiteru, Yonetani, Naoya Shikazono, Ken Akamatu, Hiroaki Nakamura

9th International Symposium on BioComplexity 2024年1月25日
Analysis of orientation factors of gapped DNA labeled with fluorescent probes by molecular dynamics simulation

Takumi Timothy Hashi, Susumu Fujiwara, Tomoko Mizuguchi, Yoshiteru Yonetani, Naoya Shikazono, Ken Akamatu, Hiroaki Nakamura

9th International Symposium on BioComplexity 2024年1月25日

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所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

Computational investigation of ligand-receptor interactions between kratom alkaloids and the μ-opioid receptor

The Scientific and Technological Research Council of Türkiye (TÜBİTAK) 2221-Fellowships for Visiting Scientists and Scientists on Sabbatical Leave 2026年4月 - 2027年3月

MIZUGUCHI TOMOKO, NURSEL ACAR SELCUKI
有機フッ素材料の安全循環

公益財団法人旭硝子財団研究助成ブループラネット地球環境特別研究助成 2023年4月 - 2025年3月

長谷川健, 火原彰秀, 粕谷素洋, 水口朋子
ポリマーブラシの立体規則性がタンパク質吸着機構へ及ぼす影響の解明

一般財団法人生産開発科学研究所生研学術奨励資金生研学術奨励資金 2022年8月 - 2023年7月

水口朋子
反応分子動力学法を用いた炭素構造体中の過冷却水のダイナミクス解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2019年4月 - 2023年3月

水口朋子
大規模分子シミュレーションによる有機ナノチューブ・ナノベシクル形成機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2015年4月 - 2019年3月

藤原進, 水口朋子
単成分系のガラス転移ダイナミクスおよびポリアモルフィズム

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2010年4月 - 2012年3月

水口朋子

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MISC

講演・口頭発表等

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