檜垣匠 (HIGAKI TAKUMI) - マイポータル

基本情報

所属: 熊本大学大学院先端科学研究部教授

学位: 博士（生命科学）(東京大学)

J-GLOBAL ID: 201601015160259818
researchmap会員ID: B000254933

外部リンク: https://higaki-lab.net/

研究キーワード

研究分野

経歴

2022年4月 - 現在

熊本大学大学院先端科学研究部（理学系）教授
2021年10月 - 2022年3月

熊本大学大学院先端科学研究部（理学系）准教授
2017年8月 - 2021年9月

熊本大学国際先端科学技術研究機構准教授
2016年4月 - 2017年7月

東京大学大学院新領域創成科学研究科特任准教授
2011年4月 - 2016年3月

東京大学大学院新領域創成科学研究科特任助教
2009年4月 - 2011年3月

東京大学大学院新領域創成科学研究科特任研究員

委員歴

2021年1月 - 現在

日本バイオイメージング学会理事
2020年1月 - 現在

Journal of Plant Research Editorial Board Member
2017年6月 - 現在

Frontiers in Plant Science Associate Editor
2017年1月 - 現在

日本バイオイメージング学会評議員
2017年1月 - 現在

日本バイオイメージング学会ホームページ編集委員
2015年1月 - 現在

日本バイオイメージング学会和文誌編集委員
2022年1月 - 2023年12月

日本植物生理学会代議員
2018年1月 - 2019年12月

一般社団法人日本植物生理学会代議員
2014年1月 - 2015年12月

公益社団法人日本植物学会広報委員会・副委員長

受賞

2021年3月

日本植物生理学会奨励賞画像解析技術の援⽤による植物細胞⾻格研究日本植物生理学会
2020年12月

CYTOLOGIA奨励賞ライブイメージングと顕微鏡画像解析による植物細胞骨格の動態と機能の研究日本メンデル協会
2017年9月

奨励賞定量的画像解析に基づく植物細胞骨格の研究日本植物学会

檜垣匠
2017年4月

Young Scientist Travel Award Quantitative cell biology of plant stomata 日本バイオイメージング学会

檜垣匠
2013年9月

奨励賞日本バイオイメージング学会

桧垣匠
2012年8月

ベストイメージ・晝馬賞日本バイオイメージング学会

桧垣匠
2009年9月

若手奨励賞日本植物学会

桧垣匠
2009年3月

博士論文特別賞東京大学大学院新領域創成科学研究科

桧垣匠
2004年3月

小玉記念科学賞科学技術振興会(小玉財団)

桧垣匠

論文

105

Pacsin 2-dependent N-cadherin internalization regulates the migration behaviour of malignant cancer cells.

Haymar Wint, Jianzhen Li, Tadashi Abe, Hiroshi Yamada, Takumi Higaki, Yasutomo Nasu, Masami Watanabe, Kohji Takei, Tetsuya Takeda

Journal of cell science 2023年5月3日
At the Nexus between Cytoskeleton and Vacuole: How Plant Cytoskeletons Govern the Dynamics of Large Vacuoles

Hirotomo Takatsuka, Takumi Higaki, Masaki Ito

International Journal of Molecular Sciences 24(4) 4143-4143 2023年2月18日
Ab-GALFA, A bioassay for insect gall formation using the model plant Arabidopsis thaliana

Tomoko Hirano, Ayaka Okamoto, Yoshihisa Oda, Tomoaki Sakamoto, Seiji Takeda, Takakazu Matsuura, Yoko Ikeda, Takumi Higaki, Seisuke Kimura, Masa H. Sato

Scientific Reports 13 2554 2023年1月査読有り
Bone marrow imaging reveals the migration dynamics of neonatal hematopoietic stem cells

Yuji Takihara, Takumi Higaki, Tomomasa Yokomizo, Terumasa Umemoto, Kazunori Ariyoshi, Michihiro Hashimoto, Maiko Sezaki, Hitoshi Takizawa, Toshihiro Inoue, Toshio Suda, Hidenobu Mizuno

Communications Biology 5(1) 776-776 2022年12月
Disease-associated H58Y mutation affects the nuclear dynamics of human DNA topoisomerase IIβ.

Keiko Morotomi-Yano, Yukiko Hiromoto, Takumi Higaki, Ken-Ichi Yano

Scientific reports 12(1) 20627-20627 2022年11月30日
Machine learning and feature analysis of the cortical microtubule organization of Arabidopsis cotyledon pavement cells.

Daichi Yoshida, Kae Akita, Takumi Higaki

Protoplasma 2022年10月11日
EML2-S constitutes a new class of proteins that recognizes and regulates the dynamics of tyrosinated microtubules.

Takashi Hotta, Thomas S McAlear, Yang Yue, Takumi Higaki, Sarah E Haynes, Alexey I Nesvizhskii, David Sept, Kristen J Verhey, Susanne Bechstedt, Ryoma Ohi

Current biology : CB 32(18) 3898-3910 2022年9月26日
Two-step regulation of centromere distribution by condensin II and the nuclear envelope proteins

Takuya Sakamoto, Yuki Sakamoto, Stefan Grob, Daniel Slane, Tomoe Yamashita, Nanami Ito, Yuka Oko, Tomoya Sugiyama, Takumi Higaki, Seiichiro Hasezawa, Maho Tanaka, Akihiro Matsui, Motoaki Seki, Takamasa Suzuki, Ueli Grossniklaus, Sachihiro Matsunaga

Nature Plants 8(8) 940-953 2022年8月1日
Migration of prospindle before the first asymmetric division in germinating spore of Marchantia polymorpha

Yuuki Sakai, Takumi Higaki, Kimitsune Ishizaki, Ryuichi Nishihama, Takayuki Kohchi, Seiichiro Hasezawa

Plant Biotechnology 39(1) 5-12 2022年3月25日査読有り
Tracking metabolites at single-cell resolution reveals metabolic dynamics during plant mitosis.

Emiko Okubo-Kurihara, Ahmed Ali, Mika Hiramoto, Yukio Kurihara, Yasmine Abouleila, Eman Muhammad Abdelazem, Takayuki Kawai, Yuko Makita, Mika Kawashima, Tsuyoshi Esaki, Hiroaki Shimada, Tetsuya Mori, Masami Yokota Hirai, Takumi Higaki, Seiichiro Hasezawa, Yoshihiro Shimizu, Tsutomu Masujima, Minami Matsui

Plant physiology 189(2) 459-464 2022年3月18日
Two Kinesin-14A Motors Oligomerize to Drive Poleward Microtubule Convergence for Acentrosomal Spindle Morphogenesis in Arabidopsis thaliana.

Takashi Hotta, Yuh-Ru Julie Lee, Takumi Higaki, Takashi Hashimoto, Bo Liu

Frontiers in cell and developmental biology 10 949345-949345 2022年
Cell Cycle Synchronization and Time-Lapse Imaging of Cytokinetic Tobacco BY-2 Cells.

Keisho Maeda, Takumi Higaki

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 2382 245-252 2022年
Phosphorylation of NONPHOTOTROPIC HYPOCOTYL3 affects photosensory adaptation during the phototropic response.

Taro Kimura, Ken Haga, Yuko Nomura, Takumi Higaki, Hirofumi Nakagami, Tatsuya Sakai

Plant physiology 187(2) 981-995 2021年10月5日
Calcium signaling contributes to xylem vessel cell differentiation via post-transcriptional regulation of VND7 downstream events.

Eri Kamon, Chihiro Noda, Takumi Higaki, Taku Demura, Misato Ohtani

Plant biotechnology (Tokyo, Japan) 38(3) 331-337 2021年9月25日
Dynamic Rearrangement and Directional Migration of Tubular Vacuoles are Required for the Asymmetric Division of the Arabidopsis Zygote.

Hikari Matsumoto, Yusuke Kimata, Takumi Higaki, Tetsuya Higashiyama, Minako Ueda

Plant & cell physiology 62(8) 1280-1289 2021年6月2日
A Three-Dimensional Scanning System for Digital Archiving and Quantitative Evaluation of Arabidopsis Plant Architectures.

Itsuki Kunita, Miyo Terao Morita, Masashi Toda, Takumi Higaki

Plant & cell physiology 62(12) 1975-1982 2021年5月22日
Transcriptional regulators involved in responses to volatile organic compounds in plants

Ayumi Nagashima‐KASAHARA, Takumi Higaki, Takao Koeduka, Ken Ishigami, Satoko Hosokawa, Hidenori Watanabe, Kenji Matsui, Seiichiro Hasezawa, Kazushige Touhara

The FASEB Journal 35(S1) 2021年5月
The Boundary-Expressed EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-LIKE2 Gene Encoding a Signaling Peptide Promotes Cotyledon Growth during Arabidopsis thaliana Embryogenesis

Rina Fujihara, Naoyuki Uchida, Toshiaki Tameshige, Nozomi Kawamoto, Yugo Hotokezaka, Takumi Higaki, Rüdiger Simon, Keiko U Torii, Masao Tasaka, Mitsuhiro Aida

Plant biotechnology (Tokyo, Japan) 38(3) 317-322 2021年4月28日
Disruption of actin filaments delays accumulation of cell plate membranes after chromosome separation.

Keisho Maeda, Takumi Higaki

Plant signaling & behavior 16(4) 1873586-1873586 2021年4月3日
Discovery, characterization and functional improvement of kumamonamide as a novel plant growth inhibitor that disturbs plant microtubules.

Takashi Ishida, Haruna Yoshimura, Masatsugu Takekawa, Takumi Higaki, Takashi Ideue, Masaki Hatano, Masayuki Igarashi, Tokio Tani, Shinichiro Sawa, Hayato Ishikawa

Scientific reports 11(1) 6077-6077 2021年3月23日

もっとみる

MISC

109

微小管結合タンパク質RIC1過剰発現株の解析から探る葉のスムーズな形態形成

菊川琴美, 曽我康一, 今村寿子, 小竹敬久, 檜垣匠

バイオイメージング 31(2) 2022年
微小管結合タンパク質RIC1過剰発現による子葉器官および表皮細胞の形態変化

菊川琴美, 曽我康一, 今村寿子, 小竹敬久, 檜垣匠

日本植物生理学会年会(Web) 63rd 2022年
画像解析技術の援用による植物細胞骨格研究

檜垣匠

日本植物生理学会年会(Web) 62nd 2021年
シロイヌナズナ黄化芽生えの胚軸光屈性におけるNPH3脱リン酸化の意義

木村太郎, 芳賀健, 野村有子, 檜垣匠, 中神弘史, 酒井達也

日本植物生理学会年会(Web) 62nd 2021年
微小管結合タンパク質RIC1過剰発現による子葉器官および表皮細胞の形態変化

菊川琴美, 檜垣匠

日本植物生理学会年会(Web) 62nd 2021年
シロイヌナズナ子葉敷石細胞における微小管構造特徴と細胞形態の関係

吉田大一, BO Liu, 檜垣匠

日本植物生理学会年会(Web) 62nd 2021年
微小管結合タンパク質RIC1過剰発現による子葉器官および表皮細胞の形態変化

菊川琴美, 曽我康一, 今村寿子, 檜垣匠

バイオイメージング 30(2) 2021年
植物の立体再構成システムを用いたミオシンXI変異体草姿の定量解析

吉田大一, 國田樹, 戸田真志, 上田晴子, 檜垣匠

バイオイメージング 30(2) 2021年
植物細胞生物学を起点とした画像の定量評価と機械学習

檜垣匠

バイオイメージング 30(2) 2021年
シロイヌナズナ子葉における表皮細胞の形態形成初期の超微細構造解析

秋田佳恵, 高木智子, 檜垣匠, 馳澤盛一郎, 永田典子

バイオイメージング 30(2) 2021年
金属顕微鏡による子葉表皮細胞の経時観察手法の開発

檜垣匠, 渡辺明

日本建築学会大会学術講演梗概集・建築デザイン発表梗概集(CD-ROM) 2021 2021年
プロトンポンプAHA1の細胞膜輸送を担うPATROL1と相互作用因子

佐藤史弥, 橋本(杉本)美海, 佐藤雅彦, 射場厚, 門田慧奈, 馳澤盛一郎, 檜垣匠

バイオイメージング 29(1/2) 39-39 2020年
フラグモプラスト微小管配列を制御するアクチン繊維の解析

前田恵祥, 笹部美知子, 町田泰則, 馳澤盛一郎, 花俣繁, 檜垣匠

バイオイメージング 29(1/2) 41-41 2020年
植物における受精卵の極性化動態のライブイメージング

植田美那子, 植田美那子, 植田美那子, 木全祐資, 松本光梨, 檜垣匠, 小松大鳳, 田中小百合, 栗原大輔, 栗原大輔, 東山哲也, 東山哲也, 東山哲也

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 43rd 2020年
葉表皮細胞の形態形成初期における細胞内微細構造の解析

秋田佳恵, 高木智子, 檜垣匠, 馳澤盛一郎, 永田典子

Plant Morphology 32(1) 2020年
金属顕微鏡法による子葉表皮細胞の形態形成追跡法の開発

吉村和樹, 渡辺明, 檜垣匠

日本植物生理学会年会(Web) 61st 2020年
ゼニゴケ胞子の不等分裂に伴う微小管の動態

酒井友希, 酒井友希, 酒井友希, 檜垣匠, 西浜竜一, 河内孝之, 馳澤盛一郎, 馳澤盛一郎

日本植物生理学会年会(Web) 61st 2020年
生物画像の定量・分類・認識

檜垣匠

日本生態学会大会講演要旨(Web) 67th 2020年
植物の葉表皮細胞のジグソーパターンの木造継ぎ手への直接的応用に関する基礎的研究

有本清香, 川口健一, 中楚洋介, 檜垣匠, 出村拓, 堀口翔太

生産研究 72(3) 2020年
電子顕微鏡画像と機械学習の協働細胞生物学における画像の定量評価と機械学習

檜垣匠, 秋田佳恵

顕微鏡 55(3) 109-113 2020年

もっとみる

書籍等出版物

Photobook植物細胞の知られざる世界

永野惇, 桧垣匠, 三村徹郎, 三村徹郎, 西村いくこ, 西村いくこ, 西村幹夫, 西村幹夫, 真野昌二, 真野昌二 (担当:共著)

化学同人 2010年3月5日 (ISBN: 4759811974)

講演・口頭発表等

180

ライブイメージング解析によるシロイヌナズナ受精卵の極性化過程の解明

松本光梨, 木全祐資, 檜垣匠, 東山哲也, 植田美那子

日本植物学会第85回大会 2021年
植物感染性線虫の根こぶ形成におけるPUCHI遺伝子の機能解析

鈴木れいら, 檜垣匠, 相田光宏, 久保稔, 澤進一郎

日本植物学会第85回大会 2021年
クラスタリングを用いたシロイヌナズナ微小管関連変異株の子葉敷石細胞における表層微小管構造の定量解析

吉田大一, Bo Liu, 檜垣匠

日本植物学会第85回大会 2021年
シロイヌナズナ微小管関連変異体における気孔開閉運動および表層微小管構造の定量評価

亀園侑志, Bo Liu, 檜垣匠

日本植物学会第85回大会 2021年
アヅキ上胚軸回旋運動における表皮の伸長パターン

萩尾圭祐, 檜垣匠, 濱田隆宏, 高木慎吾

日本植物学会第85回大会 2021年
受精卵と初期胚における周期と変調から解き明かす植物の体軸形成機構

植田美那子, 小松大鳳, 田中小百合, 檜垣匠, 松本光梨, 木全祐資, 鎌本直也, 藤本仰一, 東山哲也

日本植物学会第85回大会 2021年
植物細胞生物学を起点とした画像の定量評価と機械学習

檜垣匠

第30回日本バイオイメージング学会学術集会 2021年
シロイヌナズナ子葉における表皮細胞の形態形成初期の超微細構造解析

秋田佳恵, 髙木智子, 檜垣匠, 馳澤盛一郎, 永田典子

第30回日本バイオイメージング学会学術集会 2021年
植物の立体再構成システムを用いたミオシンⅪ変異体草姿の定量解析

吉田大一, 國田樹, 戸田真志, 上田晴子, 檜垣匠

第30回日本バイオイメージング学会学術集会 2021年
金属顕微鏡法による子葉表皮細胞の経時観察手法の開発

檜垣匠, 渡辺明

2021年度日本建築学会大会 2021年
シロイヌナズナ子葉における敷石細胞の形態形成には表層微小管の束化と密度が関与する

吉田大一, Liu Bo, 檜垣匠

第70回九州沖縄植物学会 2021年
重力感受細胞におけるLZYタンパク質のライブイメージング

森祥伍, 中村守貴, 押田龍一郎, 四方明格, 西村岳志, 古谷将彦, 檜垣匠, 森田(寺尾)美代

第62回日本植物生理学会年会 2021年
シロイヌナズナ子葉敷石細胞における微小管構造特徴と細胞形態の関係

吉田大一, Liu Bo, 檜垣匠

第62回日本植物生理学会年会 2021年
シングルセルメタボロームによる植物細胞の分裂期の詳細な解析

栗原-大窪恵美子, Ahmed Ali, 平元美佳, 栗原志夫, Abouleila Yasmine, 川井隆之, 蒔田由布子, 川島美香, 島田浩章, 檜垣匠, 馳澤盛一郎, 松井南

第62回日本植物生理学会年会 2021年
シロイヌナズナ黄化芽生えの胚軸光屈性におけるNPH3脱リン酸化の意義

木村太郎, 芳賀健, 野村有子, 檜垣匠, 中神弘史, 酒井達也

第62回日本植物生理学会年会 2021年
微小管結合タンパク質RIC1過剰発現による子葉器官および表皮細胞の形態変化

菊川琴美, 檜垣匠

第62回日本植物生理学会年会 2021年
画像解析技術の援用による植物細胞骨格研究

檜垣匠

第62回日本植物生理学会年会 2021年
生物画像の定量・分類・認識

檜垣匠

日本生態学会第67回全国大会 2020年
ゼニゴケ胞子の不等分裂に伴う微小管の動態

酒井友希, 檜垣匠, 西浜竜一, 河内孝之, 馳澤盛一郎

第61回日本植物生理学会年会 2020年
金属顕微鏡法による子葉表皮細胞の形態形成追跡法の開発

吉村和樹, 渡辺明, 檜垣匠

第61回日本植物生理学会年会 2020年

もっとみる

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

気孔開閉運動を制御する膜小胞と微小管の多次元ライブセルAI画像解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2020年4月 - 2023年3月

桧垣匠
葉の力学的最適化過程における細胞平面充填の画像計測数理解析

日本学術振興会新学術領域研究(研究領域提案型) 2018年6月 - 2023年3月

桧垣匠
先端バイオイメージング支援プラットフォーム

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究（研究領域提案型）『学術研究支援基盤形成』 2016年 - 2021年

狩野方伸, 狩野方伸, 上野直人, 丸山めぐみ, 真野昌二, 菅谷佑樹, 平岡泰, 島貫瑞樹, 宮澤淳夫, 今村健志, 野中茂紀, 藤森俊彦, 松田道行, 鍋倉淳一, 稲葉一男, 東山哲也, 根本知己, 岡田康志, 古田寿昭, 光岡薫, 坂本浩隆, 中村桂一郎, 小池正人, 古瀬幹夫, 深澤有吾, 渡辺雅彦, 青木茂樹, 定藤規弘, 笠井清登, 内田誠一, 安永卓生, 馳澤盛一郎, 檜垣匠, 木森義隆
ライブセルイメージング計測の大規模化による器官形態形成機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2017年6月 - 2019年3月

桧垣匠
高CO2固定植物の作出に向けた気孔エンジニアリング技術の創出

キヤノン財団研究助成プログラム「産業基盤の創生」 2017年4月 - 2019年3月

桧垣匠
植物の気孔開閉を制御する神経伝達調節因子ホモログPATROL1の相互作用因子解析

住友財団 2016年度基礎科学研究助成 2016年11月 - 2017年11月

桧垣匠
高CO2による気孔分布パターン形成の解析

文部科学省科学研究費補助金(若手研究(A)) 2013年 - 2016年

桧垣匠
顕微鏡画像の多量取得解析とシミュレーションによる孔辺細胞の力学的応答解析

文部科学省科学研究費補助金(研究活動スタート支援) 2010年 - 2010年

桧垣匠
細胞骨格と生体膜の可視化細胞系を用いた高等植物細胞の分裂機構に関する研究

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2007年 - 2008年

桧垣匠

産業財産権

特許第4688954号特徴量選択方法、特徴量選択装置、画像分類方法、画像分類装置、コンピュータプログラム、及び記録媒体

馳澤盛一郎, 朽名夏麿, 桧垣匠, 松永幸大, 内山進, 真庭理香, アーニ, エグナガンベ, 福井希一
WO2008-129881 特徴量選択方法、特徴量選択装置、画像分類方法、画像分類装置、コンピュータプログラム、及び記録媒体

馳澤盛一郎, 朽名夏麿, 桧垣匠, 松永幸大, 内山進, 真庭理香, アーニ, エグナガンベ, 福井希一
特開2008-164551 細胞の評価方法、細胞測定用システム、及び細胞測定用プログラム

松永幸大, 内山進, 真庭理香, アーニエグナガンベ, 福井希一, 馳澤盛一郎, 朽名夏麿, 桧垣匠

檜垣匠

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

委員歴

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

産業財産権

メニュー

共著者の一覧