西山尚来 (Takara Nishiyama) - マイポータル

基本情報

所属: 東京科学大学総合研究院難治疾患研究所計算システム生物学分野プロジェクト助教

学位: 博士（理学）

研究者番号: 41007752
ORCID iD: https://orcid.org/0009-0007-7729-8705
J-GLOBAL ID: 202401019240448902
researchmap会員ID: R000069994

研究分野

経歴

2025年4月 - 現在

東京科学大学, 総合研究院難治疾患研究所計算システム生物学分野, プロジェクト助教
2023年4月 - 2025年3月

名古屋大学, 大学院理学研究科, 日本学術振興会特別研究員DC2

学歴

2022年4月 - 2025年3月

名古屋大学, 大学院理学研究科, 理学専攻
2020年4月 - 2022年3月

名古屋大学, 大学院生命農学研究科, 応用生命科学専攻
2016年4月 - 2020年3月

名古屋大学, 農学部, 応用生命科学科

論文

Modeling lesion transition dynamics to clinically characterize patients with clade I mpox in the Democratic Republic of the Congo

Takara Nishiyama, Fuminari Miura, Yong Dam Jeong, Naotoshi Nakamura, Hyeongki Park, Masahiro Ishikane, Shotaro Yamamoto, Noriko Iwamoto, Michiyo Suzuki, Ayana Sakurai …

Science Translational Medicine 2025年7月2日
Direct relationship between protein expression and progeny yield of herpes simplex virus 1.

Nobe M, Maruzuru Y, Takeshima K, Maeda F, Kusano H, Yoshimura R, Nishiyama T, Park H, Kozaki Y, Iwami S …

mBio 2025年5月5日
Prediction of cccDNA dynamics in hepatitis B patients by a combination of serum surrogate markers.

Kwang Su Kim, Masashi Iwamoto, Kosaku Kitagawa, Hyeongki Park, Sanae Hayashi, Senko Tsukuda, Takeshi Matsui, Masanori Atsukawa, Kentaro Matsuura, Natthaya Chuaypen …

PLoS computational biology 21(1) e1012615 2025年1月9日
Modelling the effectiveness of an isolation strategy for managing mpox outbreaks with variable infectiousness profiles.

Yong Dam Jeong, William S Hart, Robin N Thompson, Masahiro Ishikane, Takara Nishiyama, Hyeongki Park, Noriko Iwamoto, Ayana Sakurai, Michiyo Suzuki, Kazuyuki Aihara …

Nature communications 15(1) 7112-7112 2024年8月26日
Multiscale modeling of HBV infection integrating intra- and intercellular viral propagation to analyze extracellular viral markers.

Kosaku Kitagawa, Kwang Su Kim, Masashi Iwamoto, Sanae Hayashi, Hyeongki Park, Takara Nishiyama, Naotoshi Nakamura, Yasuhisa Fujita, Shinji Nakaoka, Kazuyuki Aihara …

PLoS computational biology 20(3) e1011238 2024年3月
Infectious virus shedding duration reflects secretory IgA antibody response latency after SARS-CoV-2 infection

Sho Miyamoto, Takara Nishiyama, Akira Ueno, Hyeongki Park, Takayuki Kanno, Naotoshi Nakamura, Seiya Ozono, Kazuyuki Aihara, Kenichiro Takahashi, Yuuki Tsuchihashi …

Proceedings of the National Academy of Sciences 2023年12月26日
Modeling COVID-19 vaccine booster-elicited antibody response and impact of infection history

Takara Nishiyama, Yuichiro Miyamatsu, Hyeongki Park, Naotoshi Nakamura, Risa Yokokawa Shibata, Shingo Iwami, Yoji Nagasaki

Vaccine 2023年12月
Maternal embryonic leucine zipper kinase (MELK) optimally regulates the HIV-1 uncoating process.

Nishiyama T, Takada T, Hiroaki Takeuchi, Iwami S

Journal of theoretical biology 2022年5月8日

主要な講演・口頭発表等

Clinical characterization of mpox-infected patients using a lesion transition dynamics model

Takara Nishiyama

Joint annual meeting of the Korean Society for Mathematical Biology and the Society for Mathematical Biology 2024年7月1日
Application of mathematical model to the COVID-19 cohort study

Takara Nishiyama

iTHEMS Biology Seminar 2023年12月19日招待有り
Quantitative analysis of the antiviral effect of Mucosal Antibody to suppress Infectious SARS-CoV-2 shedding

Takara Nishiyama, Hyeongki Park, Shingo Iwami

9th International Conference of Infection Diseases Dynamics 2023年11月29日
細胞侵入後におけるHBV動態の時空間解析

西山尚来, 岩本将士, 渡士幸一, 岩見真吾

第32回日本数理生物学会 2022年9月5日

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所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

環境履歴に基づく薬剤耐性表現型の定量的理解

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2026年4月 - 2029年3月

西山尚来
がん微小環境を定量的に理解する深層学習モデルの構築

日本学術振興会科学研究費助成事業研究活動スタート支援 2025年7月 - 2027年3月

西山尚来
細胞機能を利用する病原体の内在化動態の定量的理解

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2023年4月 - 2025年3月

西山尚来

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主要な講演・口頭発表等

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