塚本 卓

J-GLOBALへ         更新日: 18/10/25 10:32
 
アバター
研究者氏名
塚本 卓
 
ツカモト タカシ
ハンドル
takashi_tsukamoto
URL
http://altair.sci.hokudai.ac.jp/infana/
所属
北海道大学
部署
大学院先端生命科学研究院
職名
助教
学位
博士(生命科学)(北海道大学)
その他の所属
北海道大学
科研費研究者番号
30744271
ORCID ID
0000-0002-6348-6664

研究分野

 
 

経歴

 
2017年4月
 - 
現在
北海道大学 大学院先端生命科学研究院 助教
 
2014年7月
 - 
2017年3月
岡山大学 大学院医歯薬学総合研究科 助教
 
2014年4月
 - 
2014年6月
岡山大学 大学院医歯薬学総合研究科 研究員
 
2013年4月
 - 
2014年3月
名古屋大学 大学院理学研究科生命理学専攻 研究員
 
2010年9月
 - 
2010年11月
国立研究開発法人 物質・材料研究機構 インターンシップ研究員
 

学歴

 
2010年4月
 - 
2013年3月
北海道大学 大学院生命科学院 
 
2008年4月
 - 
2010年3月
北海道大学 大学院生命科学院 
 
2004年4月
 - 
2008年3月
北海道大学 理学部 生物科学科(高分子機能学)
 

委員歴

 
2018年1月
 - 
2018年12月
一般社団法人 日本生物物理学会  分野別専門委員
 
2017年1月
 - 
2017年12月
一般社団法人 日本生物物理学会  分野別専門委員
 
2015年1月
 - 
2015年12月
一般社団法人 日本生物物理学会  分野別専門委員
 

受賞

 
2005年10月
北海道大学 北海道大学新渡戸賞
 

論文

 
Tomomi Shionoya, Misao Mizuno, Takashi Tsukamoto, Kento Ikeda, Hayato Seki, Keiichi Kojima, Mikihiro Shibata, Izuru Kawamura, Yuki Sudo, Yasuhisa Mizutani
The Journal of Physical Chemistry B   122(27) 6945-6953   2018年7月   [査読有り]
Nakajima Y, Tsukamoto T, Kumagai Y, Ogura Y, Hayashi T, Song J, Kikukawa T, Demura M, Kogure K, Sudo Y, Yoshizawa S
Microbes and environments   33(1) 89-97   2018年3月   [査読有り]
Riho Takayama, Akimasa Kaneko, Takashi Okitsu, Satoshi P. Tsunoda, Kazumi Shimono, Misao Mizuno, Keiichi Kojima, Takashi Tsukamoto, Hideki Kandori, Yasuhisa Mizutani, Akimori Wada, Yuki Sudo
The Journal of Physical Chemistry Letters   9(11) 2857-2862   2018年5月   [査読有り]
Saki Inoue, Susumu Yoshizawa, Yu Nakajima, Keiichi Kojima, Takashi Tsukamoto, Takashi Kikukawa, Yuki Sudo
Physical Chemistry Chemical Physics   20(5) 3172   2018年   [査読有り]
Honda N, Tsukamoto T, Sudo Y
Chemical Physics Letters   682 6-14   2017年8月   [査読有り]
Tsukamoto T, Yoshizawa S, Kikukawa T, Demura M, Sudo Y
The Journal of Physical Chemistry. B   121(9) 2027-2038   2017年3月   [査読有り]
Niho A, Yoshizawa S, Tsukamoto T, Kurihara M, Tahara S, Nakajima Y, Mizuno M, Kuramochi H, Tahara T, Mizutani Y, Sudo Y
Journal of the American Chemical Society   139(12) 4376-4389   2017年3月   [査読有り]
Kanehara K, Yoshizawa S, Tsukamoto T, Sudo Y
Scientific reports   7 44427   2017年3月   [査読有り]
Doi S, Tsukamoto T, Yoshizawa S, Sudo Y
Scientific reports   7 41879   2017年2月   [査読有り]
Sakamoto A, Tsukamoto T, Furutani Y, Sudo Y, Shimada K, Tomita A, Kiyoi H, Kato T, Funatsu T
Journal of molecular cell biology   8(6) 553-555   2016年12月   [査読有り]
Tsukamoto T, Mizutani K, Hasegawa T, Takahashi M, Honda N, Hashimoto N, Shimono K, Yamashita K, Yamamoto M, Miyauchi S, Takagi S, Hayashi S, Murata T, Sudo Y
The Journal of biological chemistry   291(23) 12223-12232   2016年6月   [査読有り]
Doi S, Mori A, Tsukamoto T, Reissig L, Ihara K, Sudo Y
Photochemical & photobiological sciences : Official journal of the European Photochemistry Association and the European Society for Photobiology   14(9) 1628-1636   2015年9月   [査読有り]
Kikukawa T, Kusakabe C, Kokubo A, Tsukamoto T, Kamiya M, Aizawa T, Ihara K, Kamo N, Demura M
Biochimica et biophysica acta   1847(8) 748-758   2015年8月   [査読有り]
Inoue K, Tsukamoto T, Shimono K, Suzuki Y, Miyauchi S, Hayashi S, Kandori H, Sudo Y
Journal of the American Chemical Society   137(9) 3291-3299   2015年3月   [査読有り]
Tsukamoto T, Demura M, Sudo Y
The journal of physical chemistry. B   118(43) 12383-12394   2014年10月   [査読有り]
Inoue K, Tsukamoto T, Sudo Y
Biochimica et biophysica acta   1837(5) 562-577   2014年5月   [査読有り]
   2014年1月   [査読有り]
Tsukamoto T, Inoue K, Kandori H, Sudo Y
The Journal of biological chemistry   288(30) 21581-21592   2013年7月   [査読有り]
Tsukamoto T, Kikukawa T, Kurata T, Jung KH, Kamo N, Demura M
FEBS letters   587(4) 322-327   2013年2月   [査読有り]

Misc

 
水谷健二, 橋本直記, 塚本卓, 須藤雄気, 村田武士
KEK Progress Report (Web)   (2016-8) ROMBUNNO.242 (WEB ONLY)   2017年1月
塚本卓, 須藤雄気
生物物理   55(2) 092-094 (J-STAGE)-94   2015年
黒井邦巧, 塚本卓, 本田尚也, 須藤雄気, 古谷祐詞
分子科学討論会講演プログラム&要旨(Web)   9th ROMBUNNO.4P066 (WEB ONLY)   2015年
木崎皓太, 富張瑞樹, 大津航, 新敷信人, 塚本卓, 宮園耕介, 菊川峰志, 出村誠, 大塚弥生, 佐藤耕太, 高桑雄一, 稲葉睦
日本獣医学会学術集会講演要旨集   154th 338   2012年8月
山本愛弓, 塚本卓, 小橋川敬博, 内田毅, 出村誠, 稲垣冬彦, 石森浩一郎
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集   12th 63   2012年5月
菊川峰志, 小久保麻実, 塚本卓, 井原邦夫, 加茂直樹, 出村誠
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集   12th 130   2012年5月
木崎皓太, 富張瑞樹, 大塚弥生, 塚本卓, 新敷信人, 菊川峰志, 出村誠, 大津航, 佐藤耕太, 高桑雄一, 稲葉睦
日本膜学会年会講演要旨集   34th 63   2012年4月
塚本卓, LI Xiang Lan, 花方信孝, 出村誠
Abstr Annu Meet NMR Soc Jpn   48th 166-167   2009年11月
塚本 卓, 佐々木 貴規, 久保 恵美, 神谷 昌克, 相沢 智康, 河野 敬一, 出村 誠
生物物理   47(1)    2007年11月

講演・口頭発表等

 
Anion Concentration Dependency on the Photocycle of PsuACR1: Implications for the Impairment of its Fast Channel Function.
塚本 卓
18th International Conference on Retinal Proteins   2018年9月24日   
Substrate anion concentration significantly affects the fast channel function of Proteomonas sulcata anion channelrhodopsin-1
塚本 卓
日本生物物理学会第56回年会   2018年9月15日   
Photochemical Properties of Microbial Rhodopsin Pumps and Channels [招待有り]
塚本 卓
APSBMS 2018 Annual Meeting   2018年7月21日   
塩濃度に依存したアニオンチャネルロドプシンの光化学的性質の変化
塚本 卓
日本生物物理学会北海道支部例会   2018年3月17日   
Light-driven Cl- transport mechanism of Nonlabens marinus rhodopsin-3 studied by static and time-resolved spectroscopy
塚本 卓
日本生物物理学会第55回年会   2017年9月19日   
好熱性バクテリアのレチナールタンパク質:発見と物性解析のこれまでとこれから [招待有り]
塚本 卓
第54回日本生化学会北海道支部例会   2017年7月7日   
Structural basis for high thermal stability and efficient optogenetic function of thermophilic rhodopsin
塚本 卓
日本生物物理学会第54回年会   2016年11月   
Cl--pumping photoreaction of a bacterial halide-ion pumping rhodopsin with an archaeal-type TSA motif
塚本 卓
日本生物物理学会第54回年会   2016年11月   
微生物型ロドプシンの光応答性と応用技術への展開 [招待有り]
塚本 卓
新学術領域研究「人工光合成」若手育成シンポジウム〜生物から学び、応用する光反応〜   2016年11月   
微生物型ロドプシンの安定化機構の解明と光操作への展開
塚本 卓
CREST「ファイバーレス光遺伝学による高次脳機能を支える本脳機能の解明」第1回ワークショップ   2016年11月   
高度好熱菌Thermus thermophilus 由来サーモフィリックロドプシンの物性研究
塚本 卓
日本生物物理学会中四国支部講演会   2016年5月   
時間分解吸収分光法で膜タンパク質の反応中間体をとらえる
塚本 卓
第2回創薬標的膜タンパク質の移ろいを“み(見・診・覧)る”研究会   2015年10月   
X-ray Crystal Structure of TR: Implications for High Thermal Stability and High-Performance Optogenetic Availability
塚本 卓
日本生物物理学会第53回年会   2015年9月   
カロテノイドを光捕集系とするレチナールタンパク質の創成と展開
塚本 卓
新学術研究「人工光合成」第4回合同班会議   2015年6月   
Structural and Functional Characterization of Thermophilic Rhodopsin
塚本 卓
新学術研究「柔らかな分子系」第8回ワークショップ「やわらか光受容分子の理解と利用に迫るブレインストーミング研究会」   2015年1月   
高度高熱菌由来光受容膜タンパク質ロドプシンの機能・構造研究
塚本 卓
第1回創薬標的膜タンパク質の移ろいを“み(見・診・覧)る”研究会   2014年11月   
Physicochemical Characterization of a Light-Driven Proton Pump from an Extreme Thermophile
塚本 卓
16th International Conference on Retinal Proteins   2014年10月   
Temperature-Dependent Irreversible Structural Transition of Thermophilic Rhodopsin
塚本 卓
日本生物物理学会第52回年会   2014年9月   
骨芽細胞膜タンパク質IFITM5の分子機構:翻訳後修飾,相互作用,および細胞機能
塚本 卓
分子・物質合成プラットフォーム平成25年度シンポジウム   2014年3月   
生理的温度条件下における高度好熱菌由来ロドプシン・TRの物性に関する研究
塚本 卓
分子研研究会「ロドプシン研究の故きを温ねて新しきを知る」   2013年11月   
Thermophilic rhodopsin: The first light-driven proton pump from an extreme thermophile
塚本 卓
日本生物物理学会第51回年会   2013年10月   
高度好熱菌Thermus thermophilus由来微生物型ロドプシンの分光学的解析
塚本 卓
2012年度生物物理学会中部支部講演会   2013年2月   
Homo-trimeric structure of Gloeobacter rhodopsin is regulated by the protonation state of Asp121, a counterion of the protonated Schiff base
塚本 卓
15th International Conference on Retinal Proteins   2012年10月   
Homotrimeric assembly of a cyanobacterial ion-pump Gloeobacter rhodopsin
塚本 卓
日本生物物理学会第50回年会   2012年9月   
DDM可溶化系におけるGloeobacter rhodopsinの多量体形成に関する研究
塚本 卓
日本生物物理学会2011年度北海道支部例会   2012年3月   
Study of the oligomeric assembly of Gloeobacter rhodopsin in DDM solution
塚本 卓
9th Japan-Korea Bilateral Symposium on Biological NMR   2012年3月   
The role of cysteines in the first transmembrane domain of IFITM5 for the intermolecular interaction with FKBP11
塚本 卓
第34回日本分子生物学会年会   2011年12月   
Role of Ser171 for the stabilization of NpHR trimer
塚本 卓
日本生物物理学会第49回年会   2011年9月   
Trimerization of halorhodopsin by the aromatic-interemolecular interaction and its functional modulation in detergent system
塚本 卓
日本生物物理学会第48回年会   2010年9月   
Trimer formation of N. pharaonis halorhodopsin is stabilized by the intermolecular interaction among Phe150 residues and leads to functional modulation in detergent solution
塚本 卓
14th International Conference on Retinal Proteins   2010年8月   
Expression, purification and characterization of osteoblast-specific membrane protein IFITM5 in detergent solubilized system
塚本 卓
第10回日本蛋白質科学会年会   2010年6月   
膜タンパク質IFITM5の立体構造研究;溶液NMR法による立体構造解析に向けた試料調製
塚本 卓
第48回NMR討論会   2009年11月   
ハロロドプシンNpHRの三量体構造はF150残基の対称性によって安定化される
塚本 卓
日本生物物理学会第47回年会   2009年10月   
Structural study of IFITM5, a human double transmembrane protein; sample preparation for NMR analysis
塚本 卓
日本生物物理学会第47回年会   2009年10月   
Structural study of halorhodopsin: What makes its trimeric assembly stable in the DDM-solubilized system?
塚本 卓
7th Japan-Korea Bilateral Symposium on Biological NMR   2009年7月   
Molecular dynamics of photo-excited halorhodopsin in the monomer and trimer states
塚本 卓
Hokkaido University – Mahidol University Joint Symposium   2009年5月   
Molecular interaction and functional modulation of light-driven anion pump - halorhodopsin
塚本 卓
第9回日本蛋白質科学会年会   2009年5月   
Molecular dynamics of photo-excited halorhodopsin in the monomer and trimer states
塚本 卓
揺らぎと生体機能第2回公開シンポジウム   2009年3月   
Is the photoactivity of halorhodopsin modulated by the assembly of homotrimer?” 3P-097
塚本 卓
日本生物物理学会第46回年会   2008年12月   
Trimer assembly of Natronomonas pharaonis halorhodopsin, NpHR, in lipid bilayer and detergent
塚本 卓
13th International Conference on Retinal Proteins   2008年6月   
ハロロドプシン三量体の界面活性剤中での解離
塚本 卓
日本生物物理学会第45回年会   2007年12月   

担当経験のある科目

 
 

競争的資金等の研究課題

 
イオン輸送型ロドプシンのアミノ酸変異による輸送方式の変換とその分子機構の解明
日本学術振興会: 科学研究費補助金
研究期間: 2018年4月 - 2020年3月    代表者: 塚本 卓
光駆動細胞内向きプロトン輸送タンパク質の分子機構の解明と応用技術
ノーステック財団: 若手研究人材・ネットワーク育成補助金(ノースタレント補助金)
研究期間: 2017年6月 - 2018年3月    代表者: 塚本 卓
北海道大学: スタートアップ経費
研究期間: 2017年4月 - 2018年3月    代表者: 塚本 卓
高度好熱菌ロドプシンにおける構造安定性の追求(研究課題番号:15K18519)
日本学術振興会: 若手研究(B)
研究期間: 2015年4月 - 2018年3月    代表者: 塚本 卓
カロテノイド結合型ロドプシンの2光子吸収による活性化の可能性調査
科学技術振興機構: 戦略的創造研究推進事業・さきがけ 特定課題調査
研究期間: 2016年10月 - 2017年3月    代表者: 塚本 卓
時間分解赤外分光法によるレチナールタンパク質の構造ダイナミクスの解析
自然科学研究機構分子科学研究所: 平成28年度自然科学研究機構分子科学研究所共同利用研究(前期)
研究期間: 2016年4月 - 2016年9月    代表者: 塚本 卓
岡山大学: 若手研究者スタートアップ研究支援事業
研究期間: 2014年7月 - 2016年6月    代表者: 塚本 卓
時間分解赤外分光法によるレチナールタンパク質の構造ダイナミクスの解析
自然科学研究機構分子科学研究所: 平成27年度自然科学研究機構分子科学研究所共同利用研究(後期)
研究期間: 2015年10月 - 2016年3月    代表者: 塚本 卓

社会貢献活動

 
ひらめき☆ときめきサイエンス
【講師】  日本学術振興会  ひらめき☆ときめきサイエンス  2017年8月8日 - 2017年8月8日
高校生限定プログラム
【講師】  北海道大学  オープンキャンパス  2017年8月7日 - 2017年8月7日
物理化学分野『色を感じる視覚のふしぎ』
【講師】  リケジョへの誘い 岡大方式サイエンス・トライアル  2014年10月25日
中高生理系選択支援事業『理系応援キャラバン隊』
【講師】  北海道大学女性研究者支援室  中高生理系選択支援事業『理系応援キャラバン隊』  2007年 - 2012年
MISSION: 遺伝子コードを解読せよ!〜PCRと電気泳動で米の品種を特定する〜
【講師】  日本学術振興会  ひらめき☆ときめきサイエンス  2011年
タンパク質のイロいろ
【講師】  第7回北大大学院生によるサイエンスライブ  2009年4月
タンパク質のはなし―いのちを支えるかたちとはたらき
【講師】  北海道大学平成遠友夜学校  2009年1月
生命のミステリー 〜生命分子のかたちと働き〜『アトムの磁力でタンパク質を調べつくす!〜生物だって実は分子からできている〜』
【講師】  日本学術振興会  ひらめき☆ときめきサイエンス  2009年
抗菌タンパク質リゾチームでバイ菌をやっつけろ!
【講師】  北海道大学  北海道大学オープンキャンパス  2009年
生命のミステリー 〜生き物のかたちと働き〜『アトムの磁力でタンパク質を調べつくす!〜生物だって実は分子からできている〜』
【講師】  日本学術振興会  ひらめき☆ときめきサイエンス  2008年