塚本卓 (Takashi Tsukamoto) - マイポータル

基本情報

所属: 北海道大学大学院先端生命科学研究院助教

学位: 博士（生命科学）(北海道大学)

研究者番号: 30744271
ORCID iD: https://orcid.org/0000-0002-6348-6664
J-GLOBAL ID: 201701018533416257
researchmap会員ID: B000273049

外部リンク: https://altair.sci.hokudai.ac.jp/infana/

研究キーワード

研究分野

経歴

2017年4月 - 現在

北海道大学, 大学院先端生命科学研究院, 助教
2014年7月 - 2017年3月

岡山大学, 大学院医歯薬学総合研究科, 助教
2014年4月 - 2014年6月

岡山大学, 大学院医歯薬学総合研究科, 研究員
2013年4月 - 2014年3月

名古屋大学, 大学院理学研究科生命理学専攻, 研究員
2010年9月 - 2010年11月

国立研究開発法人物質・材料研究機構, インターンシップ研究員

学歴

2010年4月 - 2013年3月

北海道大学, 大学院生命科学院
2008年4月 - 2010年3月

北海道大学, 大学院生命科学院
2004年4月 - 2008年3月

北海道大学, 理学部, 生物科学科（高分子機能学）

委員歴

2025年9月 - 現在

Guest Editor for "Membrane transporters, from molecular mechanisms to drug discovery", Scientific Reports
2019年6月 - 現在

Scientific Reports, Editorial Board Member
2020年1月 - 2023年12月

一般社団法人日本生物物理学会, 分野別専門委員
2017年4月 - 2020年3月

日本生物物理学会北海道支部, 役員、合同シンポジウム担当
2018年1月 - 2018年12月

一般社団法人日本生物物理学会, 分野別専門委員
2017年1月 - 2017年12月

一般社団法人日本生物物理学会, 分野別専門委員
2015年1月 - 2015年12月

一般社団法人日本生物物理学会, 分野別専門委員

受賞

2025年8月

Reviewer of the Month, Communications Biology
2005年10月

北海道大学新渡戸賞, 北海道大学

塚本卓

主要な論文

Proton-Coupled Gate Closing Mechanism in Guillardia theta Anion Channelrhodopsin 1

Miu Sudo, Sayo Inoko, Yuma Ito, Takuma Watanabe, Arisa Idenawa, Yuya Ohki, Keiko Ogawa, Makoto Demura, Hideki Kandori, Takashi Kikukawa …

Journal of Molecular Biology 438(16) 169856-169856 2026年8月査読有り最終著者責任著者
Thermodynamic Basis of Temperature Adaptation in Three Outward Proton Pump Rhodopsins Distributed Across Diverse Thermal Environments

Ryouhei Ohtake, Kaori Kondo, Shunsuke Nakano, Makoto Demura, Takashi Kikukawa, Takashi Tsukamoto

Biochemistry 65(8) 1314-1324 2026年3月31日査読有り最終著者責任著者
Contribution of Proteorhodopsin to Light-Dependent Biological Responses in Hymenobacter nivis P3T Isolated from Red Snow in Antarctica

Kaori Kondo, Ryouhei Ohtake, Shunsuke Nakano, Mia Terashima, Hisaya Kojima, Manabu Fukui, Makoto Demura, Takashi Kikukawa, Takashi Tsukamoto

Biochemistry 63 2257-2265 2024年9月17日査読有り最終著者責任著者
The preferential transport of NO3- by full-length Guillardia theta anion channelrhodopsin 1 is enhanced by its extended cytoplasmic domain.

Yuya Ohki, Tsukasa Shinone, Sayo Inoko, Miu Sudo, Makoto Demura, Takashi Kikukawa, Takashi Tsukamoto

The Journal of biological chemistry 105305-105305 2023年9月29日査読有り最終著者責任著者
Concerted primary proton transfer reactions in a thermophilic rhodopsin studied by time-resolved infrared spectroscopy at high temperature.

Kunisato Kuroi, Takashi Tsukamoto, Naoya Honda, Yuki Sudo, Yuji Furutani

Biochimica et biophysica acta. Bioenergetics 1864(3) 148980-148980 2023年4月18日査読有り筆頭著者
Preference of Proteomonas sulcata anion channelrhodopsin for NO3- revealed using a pH electrode method.

Chihiro Kikuchi, Hina Kurane, Takuma Watanabe, Makoto Demura, Takashi Kikukawa, Takashi Tsukamoto

Scientific reports 11(1) 7908-7908 2021年4月12日査読有り最終著者責任著者
Spectroscopic Characterization of Halorhodopsin Reconstituted into Nanodisks Using Native Lipids.

Ayumi Yamamoto, Takashi Tsukamoto, Kenshiro Suzuki, Eri Hashimoto, Yoshihiro Kobashigawa, Kousuke Shibasaki, Takeshi Uchida, Fuyuhiko Inagaki, Makoto Demura, Koichiro Ishimori

Biophysical journal 118(11) 2853-2865 2020年4月29日査読有り筆頭著者
Implications for the impairment of the rapid channel closing of Proteomonas sulcata anion channelrhodopsin 1 at high Cl− concentrations

Takashi Tsukamoto, Chihiro Kikuchi, Hiromu Suzuki, Tomoyasu Aizawa, Takashi Kikukawa, Makoto Demura

Scientific Reports 8(1) 13445-13445 2018年12月筆頭著者責任著者
Presence of a Haloarchaeal Halorhodopsin-Like Cl- Pump in Marine Bacteria.

Yu Nakajima, Takashi Tsukamoto, Yohei Kumagai, Yoshitoshi Ogura, Tetsuya Hayashi, Jaeho Song, Takashi Kikukawa, Makoto Demura, Kazuhiro Kogure, Yuki Sudo …

Microbes and environments 33(1) 89-97 2018年3月29日査読有り
Implications for the Light-Driven Chloride Ion Transport Mechanism of Nonlabens marinus Rhodopsin 3 by Its Photochemical Characteristics

Takashi Tsukamoto, Susumu Yoshizawa, Takashi Kikukawa, Makoto Demura, Yuki Sudo

JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B 121(9) 2027-2038 2017年3月査読有り筆頭著者責任著者
Demonstration of a Light-Driven SO42- Transporter and Its Spectroscopic Characteristics

Akiko Niho, Susumu Yoshizawa, Takashi Tsukamoto, Marie Kurihara, Shinya Tahara, Yu Nakajima, Misao Mizuno, Hikaru Kuramochi, Tahei Tahara, Yasuhisa Mizutani …

JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY 139(12) 4376-4389 2017年3月査読有り筆頭著者
X-ray Crystallographic Structure of Thermophilic Rhodopsin IMPLICATIONS FOR HIGH THERMAL STABILITY AND OPTOGENETIC FUNCTION

Takashi Tsukamoto, Kenji Mizutani, Taisuke Hasegawa, Megumi Takahashi, Naoya Honda, Naoki Hashimoto, Kazumi Shimono, Keitaro Yamashita, Masaki Yamamoto, Seiji Miyauchi …

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 291(23) 12223-12232 2016年6月査読有り筆頭著者
Irreversible Trimer to Monomer Transition of Thermophilic Rhodopsin upon Thermal Stimulation

Takashi Tsukamoto, Makoto Demura, Yuki Sudo

JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B 118(43) 12383-12394 2014年10月査読有り筆頭著者
Thermal and Spectroscopic Characterization of a Proton Pumping Rhodopsin from an Extreme Thermophile

Takashi Tsukamoto, Keiichi Inoue, Hideki Kandori, Yuki Sudo

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 288(30) 21581-21592 2013年7月査読有り筆頭著者
Salt bridge in the conserved His-Asp cluster in Gloeobacter rhodopsin contributes to trimer formation

Takashi Tsukamoto, Takashi Kikukawa, Takuro Kurata, Kwang-Hwan Jung, Naoki Kamo, Makoto Demura

FEBS Letters 587(4) 322-327 2013年2月14日査読有り筆頭著者
Homotrimer Formation and Dissociation of pharaonis Halorhodopsin in Detergent System

Takashi Tsukamoto, Takanori Sasaki, Kazuhiro J. Fujimoto, Takashi Kikukawa, Masakatsu Kamiya, Tomoyasu Aizawa, Keiichi Kawano, Naoki Kamo, Makoto Demura

BIOPHYSICAL JOURNAL 102(12) 2906-2915 2012年6月査読有り筆頭著者

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MISC

光で働く微生物のロドプシン-どのように?なんのために?を紐解いてきた50年

塚本卓, 出村誠

化学 76(4) 2021年招待有り筆頭著者責任著者
ヒト便試料の保存条件とメタボローム変動のNMR解析(Impact of sample storage conditions on NMR-based human fecal metabolomics)

宋子豪, 包克非, 北田直也, 清水由宇, 菊池摩仁, 熊木康裕, 大西裕季, 塚本卓, 菊川峰志, 出村誠 …

腸内細菌学雑誌 34(2) 148-148 2020年4月
カルモジュリン融合タンパク質システムを使用した安定同位体標識セクロピンP1の大量発現とNMR構造解析

GU Hao, 加藤貴純, 石田博昭, 熊木康裕, 塚本卓, 塚本卓, 菊川峰志, 菊川峰志, 出村誠, 出村誠 …

Abstracts. Annual Meeting of the NMR Society of Japan 59th 2020年
微生物型ロドプシンTRのX線結晶構造解析

水谷健二, 橋本直記, 塚本卓, 須藤雄気, 村田武士

KEK Progress Report (Web) (2016-8) ROMBUNNO.242 (WEB ONLY) 2017年1月
Identification of thermostabilizing mutations for the Thermophilic Rhodopsin based on statistical thermodynamics

Sayaka Nemoto, Satoshi Yasuda, Takashi Tsukamoto, Yuki Sudo, Masahiro Kinoshita, Takeshi Murata

第54回日本生物物理学会年会つくば国際会議場、2016年11月25-27日 2016年11月
好熱性細菌のレチナールタンパク質

塚本卓, 須藤雄気

生物物理 55(2) 092-094 2015年
時間分解赤外分光計測による好熱性ロドプシンTRの光反応解析

黒井邦巧, 塚本卓, 本田尚也, 須藤雄気, 古谷祐詞

分子科学討論会講演プログラム&要旨(Web) 9th ROMBUNNO.4P066 (WEB ONLY) 2015年
Molecular and evolutionary aspects of microbial sensory rhodopsins

Keiichi Inoue, Takashi Tsukamoto, Yuki Sudo

BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS 1837(5) 562-577 2014年5月
牛α‐スペクトリンの遺伝子多型(E91K置換)による分子構造と赤血球膜物性の異常

木崎皓太, 富張瑞樹, 大津航, 新敷信人, 塚本卓, 宮園耕介, 菊川峰志, 出村誠, 大塚弥生, 佐藤耕太 …

日本獣医学会学術集会講演要旨集 154th 338 2012年8月31日
ナノディスクを用いた膜タンパク質ハロロドプシンの機能解析

山本愛弓, 塚本卓, 小橋川敬博, 内田毅, 出村誠, 稲垣冬彦, 石森浩一郎

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 12th 63 2012年5月31日
ハロロドプシンの光反応サイクル中に起こるカロテノイドの吸光度変化

菊川峰志, 小久保麻実, 塚本卓, 井原邦夫, 加茂直樹, 出村誠

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 12th 130 2012年5月31日
牛α‐スペクトリン・アレルSpαBK91に起因するリピート1の構造異常と赤血球膜物性の変化

木崎皓太, 富張瑞樹, 大塚弥生, 塚本卓, 新敷信人, 菊川峰志, 出村誠, 大津航, 佐藤耕太, 高桑雄一 …

日本膜学会年会講演要旨集 34th 63 2012年4月27日
膜タンパク質Ifitm5の立体構造研究;溶液NMR法による立体構造解析に向けた試料調製

塚本卓, LI Xiang Lan, 花方信孝, 出村誠

Abstr Annu Meet NMR Soc Jpn 48th 166-167 2009年11月10日
1P091 ハロロドプシン三量体の界面活性剤中での解離(膜蛋白質,口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)

塚本卓, 佐々木貴規, 久保恵美, 神谷昌克, 相沢智康, 河野敬一, 出村誠

生物物理 47(1) S46 2007年11月20日