菅原武志 (Takeshi SUGAWARA) - マイポータル

基本情報

所属: 高知大学データサイエンスセンター

学位: 博士（学術）(2010年3月東京大学)

研究者番号: 60713005
J-GLOBAL ID: 201701010671243834
researchmap会員ID: B000275365

研究分野

経歴

2023年4月 - 現在

高知大学, データサイエンスセンター, 特任講師
2023年4月 - 2025年3月

東京大学大学院理学系研究科附属生物普遍性研究機構客員研究員
2021年4月 - 2023年3月

東京大学, 大学院理学系研究科附属生物普遍性研究機構, 特任研究員
2018年4月 - 2021年3月

東京大学, 大学院医学系研究科分子生物学分野, 特任助教
2017年8月 - 2021年3月

理化学研究所, 生命機能科学研究センター, 客員研究員
2017年3月 - 2018年4月

広島大学, 大学院理学研究科数理分子生命理学専攻, 研究員
2013年4月 - 2017年3月

広島大学, 大学院理学研究科数理分子生命理学専攻クロマチン動態数理研究拠点, 特任助教
2010年4月 - 2013年3月

国立遺伝学研究所, 新分野創造センター細胞建築研究室, 特任研究員

主要な論文

Chemophoresis engine: A general mechanism of ATPase-driven cargo transport.

Takeshi Sugawara, Kunihiko Kaneko

PLoS computational biology 18(7) e1010324 2022年7月査読有り筆頭著者責任著者
Reduction in chromosome mobility accompanies nuclear organization during early embryogenesis in Caenorhabditis elegans.

Ritsuko Arai, Takeshi Sugawara, Yuko Sato, Yohei Minakuchi, Atsushi Toyoda, Kentaro Nabeshima, Hiroshi Kimura, Akatsuki Kimura

Scientific reports 7(1) 3631-3631 2017年6月16日査読有り
Physical properties of the chromosomes and implications for development.

Takeshi Sugawara, Akatsuki Kimura

Development, growth & differentiation 59(5) 405-414 2017年6月査読有り筆頭著者
A diffusion model for the coordination of DNA replication in Schizosaccharomyces pombe

T. Pichugina, T. Sugawara, A. Kaykov, W. Schierding, K. Masuda, J. Uewaki, R. S. Grand, J. R. Allison, R. A. Martienssen, P. Nurse …

Scientific Reports 6(1) 2016年1月5日査読有り筆頭著者
Lfng regulates the synchronized oscillation of the mouse segmentation clock via trans-repression of Notch signalling.

Yusuke Okubo, Takeshi Sugawara, Natsumi Abe-Koduka, Jun Kanno, Akatsuki Kimura, Yumiko Saga

Nature communications 3 1141-1141 2012年査読有り
Chemophoresis as a driving force for intracellular organization: Theory and application to plasmid partitioning.

Takeshi Sugawara, Kunihiko Kaneko

Biophysics (Nagoya-shi, Japan) 7 77-88 2011年査読有り筆頭著者責任著者

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MISC

10aAR-6 細胞核内クロマチンダイナミクスの定量的解析(10aAR 領域12,領域11合同生物合同II,領域12(ソフトマター物理・化学物理・生物物理))

菅原武志, 升田賢太, 上脇隼一, 粟津暁紀, 西森拓, 上野勝

日本物理学会講演概要集 69.2.2 227 2014年
8pPSB-56 クロマチン高次構造のtoy model(8pPSB 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理・化学物理・生物物理))

菅原武志, 粟津暁紀, 西森拓

日本物理学会講演概要集 69.2.2 217 2014年
26aKL-8 染色体の空間構造の機能的役割について(生物合同2,領域11,領域12合同,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))

菅原武志, 粟津暁紀, 西森拓

日本物理学会講演概要集 68.2.2 241 2013年
1SD-04 線虫初期胚における染色体ダイナミクスの定量的解析(1SD 核内分子動態から観る遺伝子発現機構,シンポジウム,日本生物物理学会第50回年会(2012年度))

菅原武志

生物物理 52(supplement) S4-S5 2012年
20aED-4 「ケモフォレシス」によって駆動されるプラスミドダイナミクス(20aED 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))

菅原武志, 金子邦彦

日本物理学会講演概要集 65.1.2 361 2010年
28aPS-40 バクテリア染色体ダイナミクスと遺伝子発現ダイナミクスの関係について(領域11ポスターセッション,領域11,統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理)

菅原武志, 金子邦彦

日本物理学会講演概要集 64.2.2 230 2009年
気体放電モデルのパターンダイナミクス(修士論文(2003年度))

菅原, 武志

物性研究 83(4) 514-567 2005年1月20日査読有り筆頭著者責任著者

主要な講演・口頭発表等

液滴勾配による遺伝子誘導の数理モデル

菅原武志

第63回日本生物物理学会年会 2025年9月26日
液滴濃度場による遺伝子座制御の数理モデル

菅原武志

日本物理学会第80回年次大会 2025年9月17日
生成モデルを用いた3Dゲノム動態推定

菅原武志

日本物理学会2025年春季大会 2025年3月20日
遺伝子誘導の数理モデル

菅原武志

日本物理学会第79回年次大会 2024年9月18日
Prediction of 3D Genome Dynamics Using a Generative Model

Takeshi Sugawara

21st IUPAB & 62nd Biophysical Society of Japan Joint Congress 2024 2024年6月28日
生成モデルを用いた3Dゲノム動態予測

菅原武志

日本物理学会2024年春季大会 2024年3月20日
液滴-遺伝子相互作用の現象論モデル

菅原武志

日本物理学会2024年春季大会 2024年3月19日
液滴誘導型細胞内走化性の理論

菅原武志

第61日本生物物理学会年会 2023年11月16日
Chemophoresis Engine: Theory of ATPase-driven Cargo Transports

Sugawara T, Kaneko K

The 59th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan 2021年11月25日招待有り
Chemophoresis engine: Theory of cargo transports using ATP hydrolysis

Sugawara T, Kaneko K

EON Workshop: Sensors, Motors and Behaviors at the Origin of Life 招待有り
停滞/遍歴クロマチン動態

生命動態の分子メカニズムと数理招待有り
Stagnant, Itinerant Chromatin dynamics inside the Fission Yeast Nucleus

Sugawara T, Masuda K, Uewaki J, Awazu A, Tate S, Nishimori H, Ueno M

ICY14 2016年9月16日招待有り
細胞核内クロマチン動態の新奇現象

山口大学第2回理学部講演会 2016年8月19日招待有り
Stagnant, itinerant chromatin dynamics inside the fission yeast nucleus

Sugawara T, Masuda K, Uewaki J, Awazu A, Tate S, Nishimori H, Ueno M

International Symposium on Future Science (Hi-SFs) 2016 招待有り
ケモフォレシス・エンジン：ATP加水分解駆動型カーゴ輸送の理論

複雑生命システム動態研究教育拠点・複雑系生命システム研究センターセミナー 2015年10月29日招待有り
分裂酵母クロマチン核内配置・動態の数理的・定量的解析

光塾 2015年9月5日招待有り
Quantitative analyses of chromatin dynamics inside the fission yeast nucleus

Sugawara T, Masuda K, Uewaki J, Awazu A, Nishimori H, Ueno M

1st Advanced Workshop on Interdisciplinary Views on Chromosome Structure and Function
Quantitative analyses of chromosome dynamics in C. elegans early embryos

Sugawara T, Arai R, Kimura A

The 50th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan 招待有り

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共同研究・競争的資金等の研究課題

ケモフォレシス：生体高分子走化性の理論構築と生命現象への応用

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2025年4月 - 2028年3月

菅原武志
数理・データ・AI駆動の学内DXマルチモーダル基盤整備

高知大学学長裁量経費 2025年6月 - 2026年3月

菅原武志
ルシャトリエ原理に基づく熱力学的老化時計の構築

高橋産業経済研究財団研究助成 2025年4月 - 2026年3月

菅原武志
数理・データ・AI駆動の学内DXマルチモーダル推進

高知大学学長裁量経費 2024年5月 - 2025年3月

菅原武志
拡散モデルによる3Dゲノム動態予測

中部科学技術センター人工知能研究助成 2023年11月 - 2024年11月

菅原武志
数理データサイエンスに根ざした異分野融合型研究教育基盤の構築

高知大学学長裁量経費 2023年7月 - 2024年3月

菅原武志
ゲノム構造大域的遷移の数理的解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2017年4月 - 2023年3月

菅原武志
核内クロマチン構造のフラクタル次元と核内温度の同時イメージング技術の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2016年4月 - 2018年3月

新海創也, 菅原武志, 岡部弘基, 落合博, 武田駿介
走査型マイクロインジェクション顕微鏡の要素技術開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2015年4月 - 2018年3月

高見知秀, 岩田太, 高桑雄二, 菅原武志, 楯真一, 斉藤美佳子, 松岡英明