武部克希 (Katsuki Takebe) - マイポータル

基本情報

所属: 北海道大学大学院歯学研究科講師
: 大阪大学大学院薬学研究科量子生命情報薬学分野招聘教員
: (兼任)顎口腔腫瘍外科学講座招聘教員
: 近畿大学工学部非常勤講師
: 長崎大学歯学部非常勤講師

研究者番号: 61000104
J-GLOBAL ID: 202401007085828045
researchmap会員ID: R000065363

研究キーワード

研究分野

経歴

2026年4月 - 現在

北海道大学, 大学院歯学研究院口腔医学専攻口腔病態学講座微生物学教室, 講師
2024年4月 - 2026年3月

岡山大学, 学術研究院医歯薬学域歯科薬理学分野, 助教
2020年4月 - 2024年3月

大阪大学, 大学院歯学研究科顎口腔腫瘍学講座, 院生医員

受賞

2024年10月

第46回両備檉園記念財団奨励賞, サングイニスレンサ球菌の線毛連結機構を基にした薬剤開発, 両備檉園記念財団
2024年7月

令和5年度大阪大学歯学会優秀研究奨励賞, 大阪大学歯学会
2024年3月

令和5年度研究科長賞（最優秀賞）, 大阪大学
2022年4月

第33回日本口腔科学会近畿地方部会新人賞, 口腔科学会
2022年4月

令和3年度研究科長賞（奨励賞), 大阪大学

論文

Bacterial collagenase harnesses collagen geometry for processive cleavage

Hiroya Oki, Katsuki Takebe, Adjoa Bonsu, Kazunori Fujii, Ryo Masuda, Nicholas Henderson, Takehiko Mima, Takaki Koide, Mahmoud Moradi, Osamu Matsushita …

Nature Communications 2026年4月2日査読有り
Insights into the taste of organic acids via TAS1Rs

Yuko Yamase, Katsuki Takebe, Kengo Horie, Yoshihiro Mitoh, Atsuko Yamashita, Ryusuke Yoshida

Journal of Oral Biosciences 68(1) 100731-100731 2026年2月査読有り
Evaluation of Mycobacterium-derived plasmids for application in oral Actinomyces species

Sakiko Ohara, Yijuan Sheng, Yuki Nishiya, Ikue Tosa, Katsuki Takebe, Yuki Arimura, Hiroshi Mese, Naoko Ohara, Naoya Ohara

Journal of Oral Biosciences 68(1) 100718-100718 2026年2月査読有り
MMP-3 cleavage of lamin a induces pro-migratory nuclear deformity, nucleophagy, and their autophagic secretion with extracellular vesicles in metastatic cancer.

Takanori Eguchi, Eman A Taha, Keisuke Nakano, Vikas Tiwari, Katsuki Takebe, Tomohiro Inoue, Lizi Xing, Chiharu Sogawa, Kuniaki Okamoto, Stuart K Calderwood

Cell communication and signaling : CCS 2026年1月15日
Calcium ions play a critical role in calcification of Corynebacterium matruchotii.

Naoko Ohara, Midori Ogawa, Katsuki Takebe, Ikue Tosa, Serina Ono, Mitsumasa Saito, Naoya Ohara

Scientific reports 2026年1月6日査読有り
PGN_0298 in the Assembly and Insertion Machinery (Aim) Operon Is Essential for the Viability of Porphyromonas gingivalis

Shintaro Ono, Katsuki Takebe, Ikue Tosa, Yuki Nishiya, Masaaki Nakayama, Takayuki Wada, Shogo Takashiba, Naoya Ohara

Microbiology and Immunology 2025年11月2日査読有り
Combined structural and FMO-based insights into shaft pilin polymerization mechanism in Streptococcus sanguinis.

Katsuki Takebe, Shuhei Miyakawa, Takeshi Sangawa, Mamoru Suzuki, Airi Matsumoto, Yuichi Oogai, Masaya Yamaguchi, Tomoko Sumitomo, Kaori Fukuzawa, Shigetada Kawabata …

International journal of biological macromolecules 148264-148264 2025年10月12日査読有り筆頭著者
Identification of PilX, pilus component of Streptococcus sanguinis

Li Yixuan, Masanobu Nakata, Hirono Migita, Airi Matsumoto, Yuichi Oogai, Katsuki Takebe, Masaya Yamaguchi, Nobuo Okahashi, Tomoko Sumitomo, Shigetada Kawabata

Journal of Oral Biosciences 100664-100664 2025年4月査読有り
9型分泌装置の構造と歯周病原細菌の病原性における意義

武部克希

ファルマシア 61(3) 257-257 2025年3月査読有り筆頭著者責任著者
Herbal medicine Ninjinyoeito inhibits RANKL-induced osteoclast differentiation and bone resorption activity by regulating NF-kB and MAPK pathway

Kaung Htike, Kunihiro Yoshida, Takanori Eguchi, Katsuki Takebe, Xueming Li, Yaxin Qu, Eiko Sakai, Takayuki Tsukuba, Kuniaki Okamoto

Journal of Oral Biosciences 2024年10月査読有り
New Catalytic Residues and Catalytic Mechanism of the RNase T1 Family

Katsuki Takebe, Mamoru Suzuki, Yumiko Hara, Takuya Katsutani, Naomi Motoyoshi, Tadashi Itagaki, Shuhei Miyakawa, Kuniaki Okamoto, Kaori Fukuzawa, Hiroko Kobayashi

ACS Bio & Med Chem Au 2024年9月20日査読有り筆頭著者
Identification of the Acidification Mechanism of the Optimal pH for RNase He1

Katsuki Takebe, Mamoru Suzuki, Takeshi Sangawa, Naomi Motoyoshi, Tadashi Itagaki, Kana Kashima, Narikazu Uzawa, Hiroko Kobayashi

Biological and Pharmaceutical Bulletin 46(12) 1778-1786 2023年12月1日査読有り筆頭著者
Analysis of FctB3 crystal structure and insight into its structural stabilization and pilin linkage mechanisms

Katsuki Takebe, Mamoru Suzuki, Takeshi Sangawa, Bernd Kreikemeyer, Masaya Yamaguchi, Narikazu Uzawa, Tomoko Sumitomo, Shigetada Kawabata, Masanobu Nakata

Archives of Microbiology 206(1) 2023年11月23日査読有り筆頭著者
Reconstruction of the lower lip after resection of its venous malformation using a labial mucosal advancement flap – A case report-

Yoshio Ueno, Kazuhide Matsunaga, Akinori Takeshita, Akari Teramoto, Katsuki Takebe, Hitomi Kajikawa, Yoshihiro Morita, Narikazu Uzawa

Journal of Oral and Maxillofacial Surgery, Medicine, and Pathology 35(6) 513-517 2023年11月査読有り
Structural and Computational Analyses of the Unique Interactions of Opicapone in the Binding Pocket of Catechol O-Methyltransferase: A Crystallographic Study and Fragment Molecular Orbital Analyses

Katsuki Takebe, Mamoru Suzuki, Takao Kuwada-Kusunose, Satoko Shirai, Kaori Fukuzawa, Tomoko Takamiya, Narikazu Uzawa, Hiroshi Iijima

Journal of Chemical Information and Modeling 63(14) 4468-4476 2023年7月12日査読有り筆頭著者
Deep learning model for the automated evaluation of contact between the lower third molar and inferior alveolar nerve on panoramic radiography

Katsuki Takebe, Tomoaki Imai, Seiko Kubota, Ayano Nishimoto, Shigeki Amekawa, Narikazu Uzawa

Journal of Dental Sciences 18(3) 991-996 2023年7月査読有り筆頭著者
GATA6 regulates expression of annexin A10 (ANXA10) associated with epithelial–mesenchymal transition of oral squamous cell carcinoma

Shun Takayama, Yoshihiro Morita, Ayano Nishimoto, Junya Nishimura, Katsuki Takebe, Satoko Kishimoto, Yuka Matsumiya-Matsumoto, Kazuhide Matsunaga, Tomoaki Imai, Narikazu Uzawa

Archives of Oral Biology 144 105569-105569 2022年12月査読有り
Novel Functional Peptide for Next-Generation Vital Pulp Therapy

M. Watanabe, M. Okamoto, S. Komichi, H. Huang, S. Matsumoto, K. Moriyama, J. Ohshima, S. Abe, M. Morita, M. Ali …

Journal of Dental Research 102(3) 322-330 2022年11月22日査読有り
Biofilm Spreading by the Adhesin-Dependent Gliding Motility of Flavobacterium johnsoniae: 2. Role of Filamentous Extracellular Network and Cell-to-Cell Connections at the Biofilm Surface

Keiko Sato, Masami Naya, Yuri Hatano, Naoki Kasahata, Yoshio Kondo, Mari Sato, Katsuki Takebe, Mariko Naito, Chikara Sato

International Journal of Molecular Sciences 22(13) 6911-6911 2021年6月27日査読有り
Crystal structure of the C-terminal domain of envelope protein VP37 from white spot syndrome virus reveals sulphate binding sites responsible for heparin binding

Wasusit Somsoros, Takeshi Sangawa, Katsuki Takebe, Jakrada Attarataya, Kanokpan Wongprasert, Saengchan Senapin, Triwit Rattanarojpong, Mamoru Suzuki, Pongsak Khunrae

Journal of General Virology 102(6) 2021年6月1日査読有り

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MISC

Structural analysis of inactive hyaluronidase of Streptococcus pyogenes

山口雅也, 東孝太郎, 武部克希, 中田匡宣, 住友倫子, 川端重忠

日本細菌学雑誌 79(2) 268-268 2024年7月
ドラッグリポジショニングによる酸性環境において抗癌作用を有する薬剤の同定

千田正, 武部克希, 武部克希, 鵜澤成一

日本口腔科学会学術集会プログラム・抄録集 78th 2024年
ヤマブシタケ由来RNase He1の12残基改変体の構造と抗腫瘍活性

小林弘子, 武部克希, 千田正, 元吉尚美, 板垣正, 鵜澤成一, 鈴木守

日本薬学会年会要旨集(Web) 144th 2024年
COMTの反応機構と賦活化物質による立体構造変化

武部克希, 桑田(楠瀬)隆生, 鈴木守, 飯島洋, 飯島洋

日本薬学会年会要旨集(Web) 144th 2024年
立体構造と量子化学計算に基づくCOMT-リガンド分子間相互作用新規リガンド骨格を目指して

福澤薫, 白井智子, 武部克希, 高谷大輔, 飯島洋, 飯島洋

日本薬学会年会要旨集(Web) 144th 2024年
Streptococcus sanguinisが産生する線毛タンパク質のX線結晶構造解析

武部克希, 鈴木守, 東孝太郎, 山口雅也, 住友倫子, 川端重忠, 中田匡宣

Journal of Oral Biosciences Supplement 2023 [P1-25] 2023年9月
パノラマX線画像における下顎智歯-下歯槽管頬舌的位置関係の自動判定深層学習モデル構築の試み

桂尚[渕端], 武部克希, 窪田星子, 西元彩乃, 今井智章, 鵜澤成一

日本口腔科学会雑誌 72(2) 89-89 2023年7月
切除可能口腔癌に対する術前PCE療法の効果についての検討

竹下彰範, 松永和秀, 森田祥弘, 松宮由香, 梶川ひとみ, 西元彩乃, 武部克希, 千田正, 柏木孝文, 加島佳奈 …

日本口腔腫瘍学会総会・学術大会プログラム・抄録集 41st 2023年
ヤマブシタケ由来RNase He1改変体のX線構造解析と抗腫瘍活性

武部克希, 千田正, 森田祥弘, 西村遵也, 西元彩乃, 鵜澤成一, 小林弘子

日本口腔科学会学術集会プログラム・抄録集 77th 2023年
カテコールO-メチル転移酵素の配座構造の変化

飯島洋, 武部克希, 鈴木守, 桑田(楠瀬)隆生, 高宮知子, 鵜澤成一

日本薬学会年会要旨集(Web) 143rd 2023年
ヤマブシタケ由来RNase He1の至適pHに関与するアミノ酸残基の検討

小林弘子, 武部克希, 元吉尚美, 板垣正, 鵜澤成一, 鈴木守

日本薬学会年会要旨集(Web) 143rd 2023年
Labial mucosal advancement flapを用いて口唇再建を行った下唇血管腫の1例

寺本朱里, 上野祥夫, 松永和秀, 竹下彰範, 武部克希, 梶川ひとみ, 鵜澤成一

日本口腔科学会雑誌 71(2) 100-101 2022年7月
ヤマブシタケ由来RNase He1のグアノシン複合体のX線結晶構造解析

小林弘子, 寒川剛, 武部克希, 元吉尚美, 板垣正, 鵜澤成一, 鈴木守

日本薬学会年会要旨集 142年会 28PO5-01 2022年3月
当科における術後再発転移高リスク症例への対応の実際

竹下彰範, 松永和秀, 加藤逸郎, 今井智章, 森田祥弘, 松宮由香, 千田正, 梶川ひとみ, 武部克希, 鵜澤成一

日本口腔腫瘍学会総会・学術大会プログラム・抄録集 40th 2022年
賦活化化合物によるCOMTの生成物阻害の解除機構:結晶構造解析による検討

飯島洋, 武部克希, 桑田(楠瀬)隆生, 鈴木守, 高宮知子, 鵜澤成一

日本薬学会年会要旨集(Web) 142nd 2022年
COMT(カテコールO-メチル基転移酵素)-新規阻害剤の複合体の構造解析:Opicaponeは基質(SAM),生成物(SAH)とも安定な複合体を形成する

武部克希, 桑田(楠瀬)隆夫, 鈴木守, 高宮知子, 鵜澤成一, 飯島洋

日本薬学会年会要旨集(Web) 142nd 2022年
パノラマX線画像における下顎智歯と下歯槽管接触の自動判定深層学習モデルの構築

武部克希, 今井智章, 窪田星子, 窪田星子, 西元彩乃, 鵜澤成一

日本口腔科学会雑誌(Web) 71(1) 2022年
化膿レンサ球菌の不活性型ヒアルロン酸分解酵素の結晶構造解析と活性型変異体の構造予測(Structural analysis of Streptococcus pyogenes hyaluronidase and in silico analysis based on structural models)

東孝太郎, 山口雅也, 中田匡宣, 武部克希, 住友倫子, 鈴木守, 川端重忠

Journal of Oral Biosciences Supplement 2021 181-181 2021年10月
口腔癌の術前末梢血単核細胞を用いた腫瘍浸潤リンパ球のフェノタイプ予測

梶川ひとみ, 武部克希, 松永和秀, 鵜澤成一

日本口腔科学会雑誌 70(2) 145-145 2021年7月
口腔扁平上皮癌における腫瘍内T細胞と腫瘍浸潤様式の関連性

梶川ひとみ, 武部克希, 松永和秀, 鵜澤成一

頭頸部癌 47(2) 227-227 2021年5月

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講演・口頭発表等

X線構造解析を基軸とした微生物タンパク質の構造及び機能解析

武部克希, 宮川柊兵, 小林弘子, 中田匡宣

日本細菌学会総会 2026年3月22日招待有り
構造生物学の手法と CCN2 の結晶化

武部克希, 青山絵理子, 滝川正春

第 16 回日本 CCN ファミリー研究会 2025年9月2日招待有り
構造生物学に基づいた歯周病菌に存在するシャペロン様タンパク質の機能解明

武部克希, 佐藤啓子, 宮川柊兵, 土佐郁恵, Yujiang Chen, 加島佳奈, 大原直也

第98回日本細菌学会総会 2025年5月30日
細菌性コラゲナーゼの基質ほぐし及び切断機構について

武部克希, 美間健彦, 沖大也, 河原一樹, 松下治

第77回日本細菌学会中国・四国支部総会 2024年10月6日
COMT(カテコール-O-メチル基転移酵素)阻害剤の複合体 X 線結晶構造解析及び、FMO(Fragment molecular orbital)法を用いた活性中心における相互作用評価

武部克希

大阪大学歯学会第 137 回例会優秀研究奨励賞受賞講演 2024年7月25日招待有り
RNase T1ファミリーの新規触媒残基および、RNase活性と抗腫瘍活性の関係性

武部克希, 宮川柊兵, 原由美子, 鈴木守, 板垣正, 元吉尚美, 福澤薫, 岡元邦彰, 小林弘子

第41回創薬・薬理フォーラム岡山
COMTの反応機構と賦活化物質による立体構造変化

武部克希, 桑田-楠瀬隆生, 鈴木守, 飯島洋

日本薬学会第144回 2024年3月30日招待有り
パノラマ X 線画像における下顎智歯-下歯槽管接触関係の自動判定深層学習モデル構築の試み

武部克希, 西元彩乃, 桂(渕端)尚, 窪田星子, 今井智章, 鵜澤成一

.第68回日本口腔外科学会総会 2023年11月10日
Streptococcus sanguinis が産生する線毛タンパク質のX線結晶構造解析

武部克希, 鈴木守, 東孝太郎, 山口雅也, 住友倫子, 川端重忠, 中田匡宣

第65回歯科基礎医学会 2023年9月16日
ヤマブシタケ由来 RNase He1 改変体のX 線構造解析と抗腫瘍活性

武部克希, 千田正, 森田祥弘, 西村遵也, 西元彩乃, 鵜澤成一, 小林弘子

第77回日本口腔科学会 2023年5月
Investigation of hydrogen bond network in the active center of catechol O-methyltransferase by X-ray crystallography and FMO method

Katsuki Takebe, Tomoko Shirai, Yuma Handa, Kaori Fukuzawa, Mamoru Suzuki, Takao Kuwada-Kusunose, Tokomo Takamiya, Narikazu Uzawa, Hiroshi Iijima

CBI学会2022年大会 2022年10月
パノラマ X 線画像における下顎智歯-下歯槽管接触関係の自動判定深層学習モデル構築の試み.

武部克希, 今井智章, 窪田星子, 西元彩乃, 鵜澤成一

第76回日本口腔科学会 2022年4月招待有り
COMT（カテコールO-メチル基転移酵素）-新規阻害剤の複合体の構造解析: Opicaponeは基質（SAM）、生成物（SAH）とも安定な複合体を形成する

武部克希, 桑田(楠瀬) 隆夫, 鈴木守, 高宮知子, 鵜澤成一, 飯島洋

日本薬学会第142年会 2022年3月27日
パノラマX線画像における下顎智歯と下歯槽管接触の自動判定深層学習モデルの構築

武部克希, 今井智章, 西元彩乃, 窪田星子, 鵜澤成一

第33回日本口腔科学会近畿地方会 2021年12月6日
COMT/阻害剤複合体の結晶構造解析及び、量子化学計算による相互作用解析

武部克希, 福澤薫, 鈴木守, 楠瀬隆生, 鵜澤成一, 飯島洋

第48 回構造活性相関シンポジウム 2020年12月10日

担当経験のある科目(授業)

2025年4月 - 現在

生命工学 (近畿大学)
2024年4月 - 現在

薬理学演習 (岡山大学)
2024年4月 - 現在

歯科薬理学 (岡山大学)
2024年 - 現在

分子から生命体へ

所属学協会

2023年1月 - 現在

口腔科学会
2021年11月 - 現在

日本薬学会
2019年8月 - 現在

日本口腔外科学会
2018年5月 - 現在

歯科基礎医学会
2015年8月 - 現在

日本結晶学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

軟骨成長・アンチエイジング因子CCN2の健康維持への応用に向けた分子基盤の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2025年4月 - 2028年3月

滝川正春
歯周病細菌主要病原因子ジンジパインの宿主直接作用と必須新奇オペロンの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2024年4月 - 2028年3月

大原直也
膜ダイナミクスをターゲットとしたがん骨転移ニッチモデルと病態制御機構の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2024年4月 - 2027年3月

岡元邦彰
難治性癌の細胞外小胞によるマクロファージハイジャックと転移ニッチの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2023年4月 - 2026年3月

江口傑徳, 高橋賢, 河合穂高, 岡元邦彰, 冨樫庸介, 武部克希
レンサ球菌線毛先端蛋白質の構造解析に立脚した細胞付着機構の解明及び感染制御創薬

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2025年4月 - 2026年3月

武部克希
サングイニスレンサ球菌の線毛連結機構の解明及び、連結阻害に基づく感染制御の創薬

日本学術振興会科学研究費助成事業研究活動スタート支援 2024年7月 - 2026年3月

武部克希
サングイニスレンサ球菌の線毛連結機構を基にした薬剤開発

両備檉園記念財団第46回両備檉園記念財団奨励賞 2024年10月

武部克希

武部克希

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

受賞

論文

MISC

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

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