内田毅 (Takeshi Uchida) - マイポータル

基本情報

所属: 北海道大学大学院理学研究院化学部門物理化学分野准教授

学位: 博士（工学）(京都大学)

研究者番号: 30343742
J-GLOBAL ID: 200901018713222865
researchmap会員ID: 1000272476

外部リンク: http://barato.sci.hokudai.ac.jp/~stchem/

研究キーワード

研究分野

経歴

2013年6月

北海道大学, 理学(系)研究科(研究院), 准教授
2001年4月 - 2001年10月

岡崎国立共同研究機構分子科学研究所, 学術振興会特別研究員
1999年10月 - 2001年3月

アルバートアインシュタイン医科大学, 博士研究員
1998年4月 - 1999年9月

岡崎国立共同研究機構分子科学研究所, 大学等非常勤研究員
1998年 - 1999年

Part-time researcher for university or other academic organization

学歴

受賞

2009年

日本化学会北海道支部奨励賞

論文

103

Converting cytochrome c into a DyP-like metalloenzyme

Issei Omura, Koichiro Ishimori, Takeshi Uchida

Dalton Transactions 51(33) 12641-12649 2022年9月査読有り最終著者責任著者
Metal Sensing by a Glycine–Histidine Repeat Sequence Regulates the Heme Degradation Activity of PM0042 from Pasteurella multocida

Takeshi Uchida, Kazuki Ota, Akinobu Tatsumi, Syota Takeuchi, Koichiro Ishimori

Inorganic Chemistry 61(34) 13543-13553 2022年8月12日査読有り筆頭著者責任著者
Heme binding to cold shock protein D, CspD, from Vibrio cholerae

Dayeon Nam, Wataru Motegi, Koichiro Ishimori, Takeshi Uchida

Biochemical and Biophysical Research Communications 624 151-156 2022年7月査読有り最終著者責任著者
Regulation of the expression of the nickel uptake system in Vibrio cholerae by iron and heme via Fur

Kazuyoshi Muranishi, Koichiro Ishimori, Takeshi Uchida

Journal of Inorganic Biochemistry 111713-111713 2022年1月査読有り最終著者責任著者
Radical transfer but not heme distal residues is essential for pH dependence of dye-decolorizing activity of peroxidase from Vibrio cholerae

Takeshi Uchida, Issei Omura, Sayaka Umetsu, Koichiro Ishimori

Journal of Inorganic Biochemistry 219 111422-111422 2021年6月査読有り筆頭著者責任著者
Mechanistic insights into heme-mediated transcriptional regulation via a bacterial manganese-binding iron regulator, iron response regulator (Irr)

Dayeon Nam, Yuki Matsumoto, Takeshi Uchida, Mark R. O'Brian, Koichiro Ishimori

Journal of Biological Chemistry 295(32) 11316-11325 2020年8月7日査読有り
Osmotic pressure effects identify dehydration upon cytochrome c–cytochrome c oxidase complex formation contributing to a specific electron pathway formation

Wataru Sato, Seiji Hitaoka, Takeshi Uchida, Kyoko Shinzawa-Itoh, Kazunari Yoshizawa, Shinya Yoshikawa, Koichiro Ishimori

Biochemical Journal 477(8) 1565-1578 2020年4月30日査読有り
Spectroscopic Characterization of Halorhodopsin Reconstituted into Nanodisks Using Native Lipids.

Ayumi Yamamoto, Takashi Tsukamoto, Kenshiro Suzuki, Eri Hashimoto, Yoshihiro Kobashigawa, Kousuke Shibasaki, Takeshi Uchida, Fuyuhiko Inagaki, Makoto Demura, Koichiro Ishimori

Biophysical journal 118(11) 2853-2865 2020年4月29日査読有り
A single mutation converts Alr5027 from cyanobacteria Nostoc sp. PCC 7120 to a heme-binding protein with heme-degrading ability

Dojun, N, Muranishi, K, Ishimori, K, Uchida, T

Journal of Inorganic Biochemistry 203 110916 2020年2月査読有り最終著者責任著者
Role of conserved arginine in the heme distal site of HutZ from Vibrio cholerae in the heme degradation reaction.

Takeshi Uchida, Nobuhiko Dojun, Kazuki Ota, Yukari Sekine, Yuina Nakamura, Sayaka Umetsu, Koichiro Ishimori

Archives of biochemistry and biophysics 677 108165-108165 2019年11月30日査読有り筆頭著者責任著者
Structural basis for the heme transfer reaction in heme uptake machinery from Corynebacteria.

Norifumi Muraki, Chihiro Kitatsuji, Yasunori Okamoto, Takeshi Uchida, Koichiro Ishimori, Shigetoshi Aono

Chemical communications (Cambridge, England) 55(92) 13864-13867 2019年11月14日査読有り
Specific heme binding to heme regulatory motifs in iron regulatory proteins and its functional significance

Yudai Nishitani, Hirotaka Okutani, Yukiko Takeda, Takeshi Uchida, Kazuhiro Iwai, Koichiro Ishimori

Journal of Inorganic Biochemistry 198 110726-110726 2019年9月査読有り
コレラ菌のヘム獲得機構と生合成系

内田毅

生化学 91(3) 404-408 2019年6月査読有り筆頭著者最終著者責任著者
Role of His63 in HutZ from Vibrio cholerae in the heme degradation reaction and heme binding.

Takeshi Uchida, Nobuhiko Dojun, Yukari Sekine, Koichiro Ishimori

Dalton transactions (Cambridge, England : 2003) 48(16) 5408-5416 2019年4月16日査読有り筆頭著者責任著者
Subunit–subunit interactions play a key role in the heme-degradation reaction of HutZ from Vibrio cholerae

Takeshi Uchida, Kazuki Ota, Yukari Sekine, Nobuhiko Dojun, Koichiro Ishimori

Dalton Transactions 48(12) 3973-3983 2019年3月19日査読有り筆頭著者責任著者
Polyethylene glycol promotes autoxidation of cytochrome c

Wataru Sato, Takeshi Uchida, Tomohide Saio, Koichiro Ishimori

Biochimica et Biophysica Acta - General Subjects 1862(6) 1339-1349 2018年6月1日査読有り責任著者
Redox-dependent axial ligand replacement and its functional significance in heme-bound iron regulatory proteins

Mariko Ogura, Ryosuke Endo, Haruto Ishikawa, Yukiko Takeda, Takeshi Uchida, Kazuhiro Iwai, Kazuo Kobayashi, Koichiro Ishimori

Journal of Inorganic Biochemistry 182 238-248 2018年5月1日査読有り
Heme Binding to Porphobilinogen Deaminase from Vibrio cholerae Decelerates the Formation of 1-Hydroxymethylbilane

Takeshi Uchida, Takumi Funamizu, Minghao Chen, Yoshikazu Tanaka, Koichiro Ishimori

ACS Chemical Biology 13(3) 750-760 2018年3月16日査読有り筆頭著者責任著者
Heme Iron Coordination Structure of Heme Transport Protein HutB from Vibrio Cholerae

Takeshi Uchida, Takumi Funamizu, Mariko Ogura, Koichiro Ishimori

BULLETIN OF THE CHEMICAL SOCIETY OF JAPAN 90(8) 924-930 2017年8月査読有り筆頭著者責任著者
HmuS from Yersinia pseudotuberculosis is a non-canonical heme-degrading enzyme to acquire iron from heme.

Masato Onzuka, Yukari Sekine, Takeshi Uchida, Koichiro Ishimori, Shin-Ichi Ozaki

Biochimica et biophysica acta. General subjects 1861(7) 1870-1878 2017年7月査読有り

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MISC

電子伝達タンパク質シトクロムcを用いた難分解性色素分解酵素の設計

大村翼世, 石森浩一郎, 内田毅

生体分子科学討論会講演要旨集 47th 2021年
難分解性色素を分解可能なシトクロムcの設計と創製

大村翼世, 石森浩一郎, 内田毅

酸化反応討論会講演要旨集 53rd 2020年
コレラ菌由来DyP型ペルオキシダーゼ(VcDyP)の色素分解反応の機構解明と至適pHの変換

大村翼世, 石森浩一郎, 内田毅

酸化反応討論会講演要旨集 52nd 2019年
最適pHの変換による染料脱色ペルオキシダーゼ(DyP)の活性制御【JST・京大機械翻訳】

大村翼世, 石森浩一郎, 内田毅

金属の関与する生体関連反応シンポジウム講演要旨集 28th (Web) 2018年
ヘム生合成制御因子Irrにおけるヘムによる標的DNAへの結合制御機構

南多娟, 内田毅, 齋尾智英, O’BRIAN Mark R., 石森浩一郎

日本生化学会大会(Web) 90th 2017年
ヘムを制御分子とする細胞内鉄濃度制御機構の構造化学的解明

小倉麻梨子, 齋尾智英, 内田毅, 田中秀明, 田中秀明, 栗栖源嗣, 栗栖源嗣, 岩井一宏, 石森浩一郎

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 17th 2017年
ヘム分解酵素HutZへのヘム輸送タンパク質HutXの構造・機能解析

関根由可里, 石森浩一郎, 内田毅

日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM) 96th 2016年
ヘム分解酵素HutZにおけるヘム分解反応で生じた鉄による酵素活性の自己制御

道順暢彦, 関根由可里, 石森浩一郎, 内田毅

日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM) 96th 2016年
コレラ菌由来ヘム分解酵素HutZのヘム分解反応機構

関根由可里, 道順暢彦, 石森浩一郎, 内田毅

生体分子科学討論会講演要旨集 43rd 2016年
ナノディスクに再構成したVibrio cholerae由来シトクロムcbb3の構造,機能的評価

INOUE Masanao, SHIBATA Akihiro, IMAI Mizue, UCHIDA Takeshi, MURAMOTO Kazumasa, SHIRO Noritsugu, FURUKAWA Shinya, ISHIMORI Koichiro

生物物理(Web) 56(Supplement 1-2) 2016年
鉄キレート剤の添加によるコレラ菌由来ヘム分解酵素HutZの活性抑制機構

道順暢彦, 関根由可里, 松井敏高, 石森浩一郎, 石森浩一郎, 内田毅, 内田毅

東北大学多元物質科学研究所研究発表会講演予稿集 15th 2015年
Demetallation of Heme by Dye-Decolorizing Peroxidase from Vibrio cholerae

T. Uchida, K. Ishimori, T. Uchida, M. Sasaki, K. Ishimori

JOURNAL OF BIOLOGICAL INORGANIC CHEMISTRY 19 S295-S295 2014年3月
HutZの活性中心近傍に存在する水素結合によるヘム分解活性の制御

関根由可里, 内田毅, 松井敏高, 齋藤正男, 石森浩一郎

日本化学会講演予稿集 93rd(3) 2013年
ナノディスクを用いた膜タンパク質ハロロドプシンの機能解析

山本愛弓, 塚本卓, 小橋川敬博, 内田毅, 出村誠, 稲垣冬彦, 石森浩一郎

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 12th 63 2012年5月31日
Function of Heme Regulatory Motif in the Oxidative Modification for Transcriptional Regulation

TATSUKAWA Taira, UCHIDA Takeshi, ISHIMORI Koichiro

Peptide science : proceedings of the ... Japanese Peptide Symposium 2011 191-192 2012年3月1日
ステロール生合成を触媒するタンパク質CYP51のPGRMC1による活性化機構の解明

畦地翔, 内田毅, 加部泰明, 末松誠, 石森浩一郎

化学系学協会北海道支部冬季研究発表会講演要旨集 2012 2012年
コレラ菌由来ヘム分解酵素HutZのヘム周辺環境とその機能

関根由可里, 内田毅, 石森浩一郎

日本化学会講演予稿集 92nd(3) 2012年
コレラ毒素産生性Vibrio cholerae由来HutZにおけるヘム分解機構の解明

関根由可里, 内田毅, 石森浩一郎

化学系学協会北海道支部冬季研究発表会講演要旨集 2012 2012年
コレラ菌の鉄取り込み機構

内田毅, 関根由可里, 宗田壮一朗, 石森浩一郎

生体分子科学討論会講演要旨集 39th 2012年
コレラ菌由来HutZによるヘム分解反応とその構造化学的知見

関根由可里, 内田毅, 石森浩一郎

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 12th 2012年

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書籍等出版物

Heme binding characteristics of mouse PER1, a transcriptional regulatory factor associated with circadian rhythms

Nova Science Publishers 2011年

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

色素分解酵素DyPを利用した環境汚染物質の分解・環境浄化システムの構築

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2020年4月 - 2023年3月

内田毅
ナノディスクを用いた膜結合金属蛋白質の集積配列による活性制御

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2019年6月 - 2021年3月

石森浩一郎, 内田毅
ミトコンドリア呼吸鎖における電子伝達複合体の動的構造解析と電子伝達制御機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2016年4月 - 2019年3月

石森浩一郎, 内田毅, 齋尾智英
病原菌に特徴的な鉄の取り込みタンパク質に着目した新規な抗菌剤の開発

文部科学省科学研究費補助金(基盤研究(C)) 2016年4月 - 2019年3月

内田毅
膜結合性ヘムタンパク質PGRMC1の構造的制御による生理機能の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2015年4月 - 2018年3月

加部泰明, 内田毅
ナノディスクを利用したミトコンドリア呼吸鎖における電子伝達機構の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2013年4月 - 2016年3月

石森浩一郎, 内田毅, 齋尾智英
サブユニット特異的部分同位体ラベル化による巨大膜蛋白質の構造解析

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2013年4月 - 2015年3月

石森浩一郎, 内田毅
病原性細菌の鉄取り込みに関与するタンパク質の構造・機能に関する研究と創薬への応用

文部科学省科学研究費補助金(基盤研究(C)) 基盤研究(C) 2012年 - 2014年

内田毅
セグメントラベルと先端的NMR手法を駆使した高分子量蛋白質複合体の相互作用解析

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2011年 - 2012年

石森浩一郎, 内田毅
ヘムをシグナル伝達分子として機能する蛋白質制御系の構造化学的基盤

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2009年 - 2011年

石森浩一郎, 内田毅
転写制御因子NPAS2が酸化還元または一酸化炭素を利用し転写制御を行う機構の解明

文部科学省科学研究費補助金(基盤研究(C)) 基盤研究(C) 2008年 - 2010年

内田毅
電子伝達蛋白質複合体の構造化学的解明とその会合・解離の分子機構

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2008年 - 2009年

石森浩一郎, 内田毅
高圧分光法を用いた蛋白質における構造的揺らぎの解析

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2007年 - 2007年

石森浩一郎, 内田毅, 竹内浩
ヘム依存性転写制御複合体の構造と機能

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2006年 - 2007年

石森浩一郎, 内田毅
圧力を用いた分子体積プロファイル解析による蛋白質立体構造形成過程での水分子の寄与

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2006年 - 2007年

石森浩一郎, 内田毅
シトクロムcの翻訳後修飾を行うタンパク質システムの作用機構の解明

文部科学省科学研究費補助金(若手研究(B)) 若手研究(B) 2006年 - 2007年

内田毅
蛋白質動的高次構造検出法の開発及びそれを用いた蛋白質構造・機能相関の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業特別推進研究 2002年 - 2006年

北川禎三, 水谷泰久, 内田毅
時間分解紫外共鳴ラマン法によるセンサー蛋白の情報感知・伝達及び機能発現機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(S) 2002年 - 2002年

北川禎三, 内田毅

内田毅

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書籍等出版物

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