清水崇史 (Takafumi Shimizu) - マイポータル

基本情報

所属: 公益財団法人地球環境産業技術研究機構（RITE）バイオ研究グループ研究員

学位: 博士（農学）(東京大学大学院)

J-GLOBAL ID: 201601020479626680
researchmap会員ID: B000256667

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 生物有機化学 / 植物化学調節

経歴

2022年4月 - 現在

公益財団法人地球環境産業技術研究機構（RITE）, バイオ研究グループ, 研究員
2017年4月 - 2022年3月

奈良先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 助教
2017年4月 - 2022年3月

特定国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 客員研究員
2013年4月 - 2017年3月

特定国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 特別研究員
2012年4月 - 2013年3月

大阪市立大学, 大学院理学研究科生物地球系専攻, 特任助教
2011年4月 - 2012年3月

東京大学, 生物生産工学研究センター, 特任研究員

学歴

2008年4月 - 2011年3月

東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 応用生命工学専攻
2006年4月 - 2008年3月

東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 応用生命工学専攻
2004年4月 - 2006年3月

東京大学, 農学部, 生物生産科学課程
2002年4月 - 2004年3月

東京大学, 理科二類

受賞

2018年5月

2018年度JPR論文賞 Most-Cited Paper 賞, Identification of Arabidopsis thaliana NRT1/PTR FAMILY (NPF) proteins capable of transporting plant hormones., 日本植物学会
2017年10月

植物化学調節学会奨励賞, ジャスモン酸類の蓄積制御と生理作用発現機構に関する研究, 一般社団法人植物化学調節学会

清水崇史
2015年10月

植物化学調節学会第49回大会ポスター賞, ソラマメ葉におけるアブシシン酸の一細胞分析, 一般社団法人植物化学調節学会

宮川慎也, 清水崇史, 江崎剛史, 水野初, 升島努, 小柴共一, 瀬尾光範
2012年10月

植物化学調節学会第47回大会ポスター賞, イネの根の病害抵抗性発現におけるジャスモン酸の役割, 一般社団法人植物化学調節学会

清水崇史, 西野沙希, 藤川奈那央, 東條元昭, 岡田憲典, 山根久和, 飯野盛利

論文

Biological Activity of Anti-bolting Compound, alpha-(7Z,10Z,13Z)-hexadeca-7,10,13-trienoic Acid Monoglyceride to Reduce the Endogenous Amount of Gibberellins

Tsuyoshi Ogihara, Shunpei Shikama, Akihisa Ishii, Syotaro Hirota, Junichi Kashiwagi, Kaien Fujino, Yuki Mitsui, Takafumi Shimizu, Mitsunori Seo, Naoki Kitaoka …

JOURNAL OF PLANT GROWTH REGULATION 2023年4月
Arabidopsis NPF5.1 regulates ABA homeostasis and seed germination by mediating ABA uptake into the seed coat.

Takafumi Shimizu, Yuri Kanno, Shunsuke Watanabe, Mitsunori Seo

Plant signaling & behavior 17(1) 2095488-2095488 2022年12月31日
AtGH3.10 is another jasmonic acid‐amido synthetase in Arabidopsis thaliana

Jay C. Delfin, Yuri Kanno, Mitsunori Seo, Naoki Kitaoka, Hideyuki Matsuura, Takayuki Tohge, Takafumi Shimizu

The Plant Journal 110(4) 1082-1096 2022年3月4日査読有り最終著者責任著者
Arabidopsis NPF4.6 and NPF5.1 Control Leaf Stomatal Aperture by Regulating Abscisic Acid Transport

Takafumi Shimizu, Yuri Kanno, Hiromi Suzuki, Shunsuke Watanabe, Mitsunori Seo

Genes 12(6) 885-885 2021年6月8日査読有り筆頭著者
Targeted LC-MS Analysis for Plant Secondary Metabolites.

Takafumi Shimizu, Mutsumi Watanabe, Alisdair R Fernie, Takayuki Tohge

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 1778 171-181 2018年査読有り筆頭著者
GTR1 is a jasmonic acid and jasmonoyl-L-isoleucine transporter in Arabidopsis thaliana

Yasuhiro Ishimaru, Takaya Oikawa, Takeshi Suzuki, Syohei Takeishi, Hideyuki Matsuura, Kosaku Takahashi, Shin Hamamoto, Nobuyuki Uozumi, Takafumi Shimizu, Mitsunori Seo …

BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY 81(2) 249-255 2017年2月査読有り
AtSWEET13 and AtSWEET14 regulate gibberellin-mediated physiological processes

Yuri Kanno, Takaya Oikawa, Yasutaka Chiba, Yasuhiro Ishimaru, Takafumi Shimizu, Naoto Sano, Tomokazu Koshiba, Yuji Kamiya, Minoru Ueda, Mitsunori Seo

NATURE COMMUNICATIONS 7 13245 2016年10月査読有り
Live Single-Cell Plant Hormone Analysis by Video-Mass Spectrometry

Takafumi Shimizu, Shinya Miyakawa, Tsuyoshi Esaki, Hajime Mizuno, Tsutomu Masujima, Tomokazu Koshiba, Mitsunori Seo

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY 56(7) 1287-1296 2015年7月査読有り筆頭著者
Identification of Arabidopsis thaliana NRT1/PTR FAMILY (NPF) proteins capable of transporting plant hormones

Yasutaka Chiba, Takafumi Shimizu, Shinya Miyakawa, Yuri Kanno, Tomokazu Koshiba, Yuji Kamiya, Mitsunori Seo

JOURNAL OF PLANT RESEARCH 128(4) 679-686 2015年7月査読有り
The WRKY45-Dependent Signaling Pathway Is Required For Resistance against Striga hermonthica Parasitism

J. Musembi Mutuku, Satoko Yoshida, Takafumi Shimizu, Yasunori Ichihashi, Takanori Wakatake, Akira Takahashi, Mitsunori Seo, Ken Shirasu

PLANT PHYSIOLOGY 168(3) 1152-1163 2015年7月査読有り
Transcriptional regulation of the biosynthesis of phytoalexin: A lesson from specialized metabolites in rice

Miyamoto K, Shimizu T, Okada K

Plant Biotechnol 31(5) 377-388 2014年12月査読有り
Wound-induced expression of DEFECTIVE IN ANTHER DEHISCENCE1 and DAD1-like lipase genes is mediated by both CORONATINE INSENSITIVE1-dependent and independent pathways in Arabidopsis thaliana

Izabela Rudus, Haruka Terai, Takafumi Shimizu, Hisae Kojima, Kazuki Hattori, Yuka Nishimori, Hironaka Tsukagoshi, Yuji Kamiya, Mitsunori Seo, Kenzo Nakamura …

PLANT CELL REPORTS 33(6) 849-860 2014年6月査読有り
Overexpression of Phosphomimic Mutated OsWRKY53 Leads to Enhanced Blast Resistance in Rice

Tetsuya Chujo, Koji Miyamoto, Satoshi Ogawa, Yuka Masuda, Takafumi Shimizu, Mitsuko Kishi-Kaboshi, Akira Takahashi, Yoko Nishizawa, Eiichi Minami, Hideaki Nojiri …

PLOS ONE 9(6) e98737 2014年6月査読有り
Reverse-genetic approach to verify physiological roles of rice phytoalexins: characterization of a knockdown mutant of OsCPS4 phytoalexin biosynthetic gene in rice

Tomonobu Toyomasu, Masami Usui, Chizu Sugawara, Kazuko Otomo, Yuko Hirose, Akio Miyao, Hirohiko Hirochika, Kazunori Okada, Takafumi Shimizu, Jinichiro Koga …

PHYSIOLOGIA PLANTARUM 150(1) 55-62 2014年1月査読有り
OsJAR1 Contributes Mainly to Biosynthesis of the Stress-Induced Jasmonoyl-Isoleucine Involved in Defense Responses in Rice

Takafumi Shimizu, Koji Miyamoto, Kanako Miyamoto, Eiichi Minami, Yoko Nishizawa, Moritoshi Iino, Hideaki Nojiri, Hisakazu Yamane, Kazunori Okada

BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY 77(7) 1556-1564 2013年7月査読有り筆頭著者
OsWRKY28, a PAMP-responsive transrepressor, negatively regulates innate immune responses in rice against rice blast fungus

Tetsuya Chujo, Koji Miyamoto, Takeo Shimogawa, Takafumi Shimizu, Yuko Otake, Naoki Yokotani, Yoko Nishizawa, Naoto Shibuya, Hideaki Nojiri, Hisakazu Yamane …

Plant Molecular Biology 82(1-2) 23-37 2013年5月査読有り
Identification of rice Allene Oxide Cyclase mutants and the function of jasmonate for defence against Magnaporthe oryzae

Michael Riemann, Ken Haga, Takafumi Shimizu, Kazunori Okada, Sugihiro Ando, Susumu Mochizuki, Yoko Nishizawa, Utako Yamanouchi, Peter Nick, Masahiro Yano …

PLANT JOURNAL 74(2) 226-238 2013年4月査読有り筆頭著者
Stress-induced expression of the transcription factor RERJ1 is tightly regulated in response to jasmonic acid accumulation in rice

Koji Miyamoto, Takafumi Shimizu, Susumu Mochizuki, Yoko Nishizawa, Eiichi Minami, Hideaki Nojiri, Hisakazu Yamane, Kazunori Okada

Protoplasma 250(1) 241-249 2013年査読有り
WRKY76 is a rice transcriptional repressor playing opposite roles in blast disease resistance and cold stress tolerance

Naoki Yokotani, Yuko Sato, Shigeru Tanabe, Tetsuya Chujo, Takafumi Shimizu, Kazunori Okada, Hisakazu Yamane, Masaki Shimono, Shoji Sugano, Hiroshi Takatsuji …

Journal of Experimental Botany 64(16) 5085-5097 2013年査読有り
The potential bioproduction of the pharmaceutical agent sakuranetin, a flavonoid phytoalexin in rice

Takafumi Shimizu, Fengqiu Lin, Morifumi Hasegawa, Hideaki Nojiri, Hisakazu Yamane, Kazunori Okada

Bioengineered 3(6) 352-357 2012年11月査読有り筆頭著者

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MISC

酢で発現する植物ホルモンジャスモン酸の働きとは？

清水崇史

現代農業9月号 99(9) 56-61 2020年9月1日筆頭著者責任著者
植物科学における一細胞質量分析法:植物ホルモンの定量と今後の展望

清水崇史, 渡邊俊介, 鈴木洋弥, 竹林裕美子, 瀬尾光範

Journal of the Mass Spectrometry Society of Japan 68(2) 26-32 2020年筆頭著者
ジャスモン酸類の蓄積制御と生理作用発現機構に関する研究

清水崇史

植物の生長調節 53(1) 2018年
一細胞からの植物ホルモンの「定量」に向けた取り組み

清水崇史, 瀬尾光範

植物の生長調節 53(1) 2018年
一細胞からの植物ホルモン質量分析法微量な低分子化合物の内生量を細胞レベルで明らかにする

清水崇史, 瀬尾光範

化学と生物 54(7) 2016年
S07 バレイショ塊茎形成におけるジャスモン酸類の働き(オーラル発表,植物化学調節学会第50回大会)

井上悠敬, 清水崇史, 高橋公咲, 崎浜靖子, 瀬尾光範, 松浦英幸

植物化学調節学会研究発表記録集 50 29-29 2015年10月1日
P075 GTR1は傷害葉から非傷害葉へのJA-Ile移行に関与し、過剰なJA応答を抑制する(ポスター発表,植物化学調節学会第50回大会)

及川貴也, 石丸泰寛, 鈴木健史, 武石翔平, 松浦英幸, 高橋公咲, 浜本晋, 魚住信之, 清水崇史, 瀬尾光範 …

植物化学調節学会研究発表記録集 50 93-93 2015年10月1日
S08 JA-Ile輸送体候補遺伝子の探索と機能解析(オーラル発表,植物化学調節学会第50回大会)

清水崇史, 松井英譲, 玄康洙, 中神弘史, 瀬尾光範

植物化学調節学会研究発表記録集 50 30-30 2015年10月1日
22. ソラマメ葉におけるアブシシン酸の一細胞分析(口頭発表,植物化学調節学会第49回大会)

宮川慎也, 清水崇史, 江崎剛史, 水野初, 升島努, 小柴共一, 瀬尾光範

植物化学調節学会研究発表記録集 49 40-40 2014年10月1日
21. 一細胞からの植物ホルモン定量分析法の開発(口頭発表,植物化学調節学会第49回大会)

清水崇史, 宮川慎也, 江崎剛史, 水野初, 升島努, 小柴共一, 瀬尾光範

植物化学調節学会研究発表記録集 49 39-39 2014年10月1日
イネにおけるサクラネチン生合成酵素遺伝子のジャスモン酸依存的な発現制御機構の解明

小川哲史, 清水崇史, 山根久和, 山根久和, 野尻秀昭, 岡田憲典

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2014 2014年
輸送体研究における新たなアプローチ

清水崇史, 瀬尾光範

植物の生長調節 49(1) 2014年
イネの病害抵抗性を制御する転写因子OsWRKY53の標的遺伝子の同定

小川哲史, 宮本皓司, 清水崇史, 増田優花, 中条哲也, 西澤洋子, 南栄一, 山根久和, 野尻秀昭, 岡田憲典

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2013 2013年
92. イネの病害抵抗性を制御する転写因子OsWRKY53 の相互作用因子の探索と機能解析(口頭発表,植物化学調節学会第47回大会)

小川哲史, 宮本皓司, 清水崇史, 増田優花, 中条哲也, 西澤洋子, 南栄一, 野尻秀昭, 山根久和, 岡田憲典

植物化学調節学会研究発表記録集 47 109-109 2012年10月5日
イネの病害抵抗性を制御する転写因子OsWRKY53の相互作用因子の探索と機能解析

小川哲史, 宮本皓司, 清水崇史, 増田優花, 中条哲也, 西澤洋子, 南栄一, 野尻秀昭, 山根久和, 岡田憲典

植物の生長調節 47(Supplement) 2012年
イネの病害抵抗性を制御する転写因子OsWRKY53の機能発現機構の解析

小川哲史, 清水崇史, 宮本皓司, 宮本皓司, 西澤洋子, 南栄一, 増田優花, 中条哲也, 岡田憲典, 野尻秀昭 …

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2012 2012年
79. イネのサクラネチン生合成酵素OsNOMTの単離・同定(口頭発表,植物化学調節学会第46回大会)

清水崇史, 林鳳秋, 長谷川守文, 岡田憲典, 野尻秀昭, 山根久和

植物化学調節学会研究発表記録集 (46) 95-95 2011年10月3日
82. イネのJAシグナル伝達経路におけるJA応答性bHLH型転写因子RERJ1の役割(口頭発表,植物化学調節学会第46回大会)

岡田憲典, Valca Ioana, 宮本皓司, 清水崇史, 宮尾安藝雄, 廣近洋彦, Riemann Michael, Nick Peter, 山根久和

植物化学調節学会研究発表記録集 (46) 98-98 2011年10月3日
58.イネのosjar1変異体のキャラクタリゼーション(口頭発表)

清水崇史, 岡田憲典, 古賀仁一郎, 野尻秀昭, 山根久和

植物化学調節学会研究発表記録集 (45) 75-75 2010年10月1日
61.イネにおけるJA応答性bHLH型転写因子RERJ1の生理機能(口頭発表)

岡田憲典, 宮本皓司, 清水崇史, 北島竜也, 河本晃一, 宮尾安藝雄, 廣近洋彦, 野尻秀昭, 山根久和

植物化学調節学会研究発表記録集 (45) 78-78 2010年10月1日

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講演・口頭発表等

空気伝搬のメチルジャスモネートの植物における代謝 (その2)

榎亜加音, 大木克成, 北岡直樹, 清水崇史, 峠隆之, 松浦英幸

日本農芸化学会2022年度大会 2022年3月17日
シロイヌナズナAtGH3.10はジャスモン酸-アミノ酸結合酵素として機能する

清水崇史, デルフィンジェイカミソラ, 菅野裕理, 瀬尾光範, 北岡直樹, 松浦英幸, 峠隆之

日本農芸化学会2022年度大会 2022年3月17日
GH3.10はシロイヌナズナの花成や傷害応答においてJAR1と重複した機能を有する

Delfin Jay Camisora, 峠隆之, 清水崇史

第62回日本植物生理学会 2021年3月14日
シロイヌナズナDFL2の花成と傷害応答における機能解析

デルフィンジェイカミソラ, 峠隆之, 清水崇史

植物化学調節学会第55回大会 2020年11月15日
シロイヌナズナにおけるJA-Ile 輸送体NPF8.1/PTR1 のべと病感染下での機能解析

清水崇史, 浅井秀太, 松井英譲, 玄康洙, 菅野裕理, 中神弘史, 白須賢, 瀬尾光範

第61回日本植物生理学会年会
イネの塩ストレス応答時における代謝変動の多様性研究

都馬阿英夫, 峠隆之, 清水崇史

第61回日本植物生理学会年会
イネにおけるジテルペン型ファイトアレキシン産生能の多様性解析

小林智輝, 岡田憲典, 峠隆之, 清水崇史

第61回日本植物生理学会年会
寄生植物ストライガの新規吸器誘導物質の同定

和田将吾, 清水崇史, CUI Songkui, 峠隆之, 吉田聡子

第61回日本植物生理学会年会 2020年3月
気孔開度の調節に関与するシロイヌナズナNPFタンパク質の解析

清水崇史, 菅野裕理, 渡邊俊介, 瀬尾光範
Functional analysis of cholic acid on phytocassane specific phytoalexin production in rice

Tomoki Kobayashi, Takayuki Tohge, Takafumi Shimizu
多機能輸送体NPF2.10の基質選択制御に関する研究

石丸泰寛, 及川貴也, 竹内優輔, 清水崇史, 瀬尾光範, 上田実

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2018年3月5日
ジベレリンの輸送ができるシロイヌナズナのSWEET蛋白質の同定

第59回日本植物生理学会年会 2018年3月
ジャスモン酸類の蓄積制御と生理作用発現機構に関する研究

清水崇史

植物化学調節学会第52回大会 2017年10月27日招待有り
アブシシン酸輸送活性を有する新規NPFタンパク質の機能解析

清水崇史, 菅野裕理, 瀬尾光範

植物化学調節学会第51回大会 2016年10月7日
GTR1は傷害葉から非傷害葉へのJA-Ile移行に関与し,過剰なJA応答を抑制する

及川貴也, 石丸泰寛, 鈴木健史, 武石翔平, 松浦英幸, 高橋公咲, 浜本晋, 魚住信之, 清水崇史, 瀬尾光範, 太田啓之, 上田実

植物化学調節学会第50回大会 2015年10月1日
バレイショ塊茎形成におけるジャスモン酸類の働き

井上悠敬, 清水崇史, 高橋公咲, 崎浜靖子, 瀬尾光範, 松浦英幸

植物化学調節学会第50回大会 2015年10月1日
JA-Ile輸送体候補遺伝子の探索と機能解析

清水崇史, 松井英譲, 松井英譲, HYON Gang-Su, 中神弘史, 瀬尾光範, 瀬尾光範

植物化学調節学会第50回大会 2015年10月1日
ジャスモン酸塩シグナル伝達は菌類病原体に対する根の防御のためにイネにおいて必須役割を果す

第56回日本植物生理学会年会 2015年3月9日
ジャスモン酸輸送体は,非傷害部位での過剰な傷害応答を抑制する.

石丸泰寛, 及川貴也, 鈴木健史, 松浦英幸, 高橋公咲, 浜本晋, 魚住信之, 清水崇史, 瀬尾光範, 太田啓之, 上田実

第56回日本植物生理学会年会 2015年3月9日
一細胞からのアブシシン酸,ジャスモノイルイソロイシンの定量分析

清水崇史, 宮川慎也, 江崎剛史, 水野初, 升島努, 小柴共一, 瀬尾光範

第56回日本植物生理学会年会 2015年3月9日

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所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

イネにおけるコール酸応答の包括的理解と分子機構の解明研究

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究若手研究 2018年4月 - 2021年3月

清水崇史
イネのジャスモン酸によるフェノール性化合物生産誘導を介した防御応答機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2009年 - 2010年

清水崇史

産業財産権

特願2012-053131 ナリンゲニン7-O-メチルトランスフェラーゼ活性を有するポリペプチド及びそれをコードする核酸

山根久和, 野尻秀明, 岡田憲典, 清水崇史, 長谷川守文

社会貢献活動

植物を病気から守る、ジャスモン酸

講師

理化学研究所理研DAY：研究者と話そう 2015年4月
たたかうイネ～カビからお米を防衛せよ！～

講師

WEcafe vol.39 2014年1月

清水崇史

基本情報

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研究分野

経歴

学歴

受賞

論文

MISC

講演・口頭発表等

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

産業財産権

社会貢献活動

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