石塚匠 (Takumi Ishizuka) - マイポータル

基本情報

所属: 宮崎大学医学部医学科解剖学講座組織細胞化学分野学部講師

学位: 博士（工学）(2011年3月東京大学)

研究者番号: 50700085
J-GLOBAL ID: 201601009698026783
researchmap会員ID: B000250824

研究キーワード

研究分野

経歴

2022年4月 - 現在

宮崎大学医学部解剖学講座組織細胞化学分野学部講師
2021年4月 - 2022年3月

宮崎大学医学部解剖学講座組織細胞化学分野助教
2016年4月 - 2021年3月

宮崎大学医学部機能制御学講座物質科学分野助教
2013年1月 - 2016年3月

宮崎大学医学部機能制御学講座物質科学分野特任助教
2011年4月 - 2012年12月

理化学研究所生命分子システム基盤研究領域日本学術振興会特別研究員PD
2009年4月 - 2011年3月

東京大学先端科学技術研究センター日本学術振興会特別研究員DC2

学歴

委員歴

2016年4月 - 2019年3月

日本化学会生体機能関連化学部会若手の会九州支部幹事

受賞

2012年7月

Best Poster Award, International conference on Fluorescent Biomolecules and their Building Blocks (FB3)

Takumi Ishizuka
2008年3月

東京大学大学院工学系研究科長賞（修士）東京大学

石塚匠

論文

Pivotal role of High-Mobility Group Box 2 in ovarian folliculogenesis and fertility.

Shinichiro Shirouzu, Naohiro Sugita, Narantsog Choijookhuu, Yu Yamaguma, Kanako Takeguchi, Takumi Ishizuka, Mio Tanaka, Fidya, Kengo Kai, Etsuo Chosa, Yoshihiro Yamashita, Chihiro Koshimoto, Yoshitaka Hishikawa

Journal of Ovarian Research 15(1) 133-133 2022年12月20日査読有り
An Advanced Detection System for In Situ Hybridization Using a Fluorescence Resonance Energy Transfer-based Molecular Beacon Probe

Narantsog Choijookhuu, Yasuaki Shibata, Takumi Ishizuka, Yan Xu, Takehiko Koji, Yoshitaka Hishikawa

Acta Histochemica et Cytochemica 55(5) 119-128 2022年10月25日査読有り
Click chemistry for fluorescence imaging via combination of a BODIPY-based ‘turn-on’ probe and a norbornene glucosamine

Zhiyong He, Takumi Ishizuka, Yoshitaka Hishikawa, Yan Xu

Chemical Communications 58 12479-12482 2022年10月17日査読有り
Crucial role of high-mobility group box 2 in mouse ovarian follicular development through estrogen receptor beta.

Yu Yamaguma, Naohiro Sugita, Narantsog Choijookhuu, Koichi Yano, Deokcheol Lee, Makoto Ikenoue, Fidya, Shinichiro Shirouzu, Takumi Ishizuka, Mio Tanaka, Yoshihiro Yamashita, Etsuo Chosa, Noboru Taniguchi, Yoshitaka Hishikawa

Histochemistry and Cell Biology 157(3) 359-369 2022年3月査読有り
Systematic Approach to DNA Aptamer Design Using Amino Acid-Nucleic Acid Hybrids (ANHs) Targeting Thrombin.

Ji Hye Yum, Takumi Ishizuka, Koyuki Fukumoto, Daisuke Hori, Hong-Liang Bao, Yan Xu, Hiroshi Sugiyama, Soyoung Park

ACS Biomaterials Science & Engineering 7(4) 1338-1343 2021年4月12日査読有り
Improving Thermodynamic Stability and Anticoagulant Activity of a Thrombin Binding Aptamer by Incorporation of 8-trifluoromethyl-2′-deoxyguanosine

Hong-Liang Bao, Takumi Ishizuka, Atsushi Yamashita, Eiji Furukoji, Yujiro Asada, Yan Xu

Journal of Medicinal Chemistry 64(1) 711-718 2021年1月14日査読有り
Linear consecutive hexaoxazoles as G4 ligands inducing chair-type anti-parallel topology of a telomeric G-quadruplex

Shogo Sasaki, Yue Ma, Takumi Ishizuka, Hong-Liang Bao, Takatsugu Hirokawa, Yan Xu, Masayuki Tera, Kazuo Nagasawa

RSC Advances 10(71) 43319-43323 2020年12月査読有り
Characterization of Structure and Catalytic Activity of a Complex between Heme and an All Parallel-Stranded Tetrameric G-Quadruplex Formed from DNA/RNA Chimera Sequence d(TTA)r(GGG)dT

Kosuke Hayasaka, Tomokazu Shibata, Aya Sugahara, Atsuya Momotake, Toru Matsui, Saburo Neya, Takumi Ishizuka, Yan Xu, Yasuhiko Yamamoto

Bulletin of the Chemical Society of Japan 93(5) 621-629 2020年5月15日査読有り
Influenza Virus Z-RNAs Induce ZBP1-Mediated Necroptosis.

Ting Zhang, Chaoran Yin, David F Boyd, Giovanni Quarato, Justin P Ingram, Maria Shubina, Katherine B Ragan, Takumi Ishizuka, Jeremy Chase Crawford, Bart Tummers, Diego A Rodriguez, Jia Xue, Suraj Peri, William J Kaiser, Carolina B López, Yan Xu, Jason W Upton, Paul G Thomas, Douglas R Green, Siddharth Balachandran

Cell 180(6) 1115-1129 2020年3月19日査読有り
A Nucleoside Derivative 5-Vinyluridine (VrU) for Imaging RNA in Cells and Animals

Hong Shan Liu, Takumi Ishizuka, Makiko Kawaguchi, Ryuichi Nishii, Hiroaki Kataoka, Yan Xu

Bioconjugate Chemistry 30(11) 2958-2966 2019年10月22日査読有り
19F NMR Spectroscopy for the Analysis of DNA G-Quadruplex Structures Using 19F-Labeled Nucleobase

Takumi Ishizuka, Hong-Liang Bao, Yan Xu

Methods in Molecular Biology 407 2019年8月査読有り
Stability and properties of Z-DNA containing artificial nucleobase 2'-O-methyl-8-methyl guanosine.

Thananjeyan Balasubramaniyam, Takumi Ishizuka, Yan Xu

Bioorganic & Medicinal Chemistry 27(2) 364-369 2019年1月査読有り
2′-O-Methyl-8-methylguanosine as a Z-Form RNA Stabilizer for Structural and Functional Study of Z-RNA

Thananjeyan Balasubramaniyam, Takumi Ishizuka, Chao-Da Xiao, Hong-Liang Bao, Yan Xu

Molecules 23(10) 2572 2018年10月査読有り
A multi-functional guanine derivative for studying the DNA G-quadruplex structure

Takumi Ishizuka, Pei-Yan Zhao, Hong-Liang Bao, Yan Xu

ANALYST 142(21) 4083-4088 2017年11月査読有り
Antiparallel RNA G-quadruplex Formed by Human Telomere RNA Containing 8-Bromoguanosine

Chao-Da Xiao, Takumi Ishizuka, Yan Xu

SCIENTIFIC REPORTS 7(1) 6695 2017年7月査読有り
Structure-Dependent Binding of hnRNPA1 to Telomere RNA

Xiao Liu, Takumi Ishizuka, Hong-Liang Bao, Kei Wada, Yuma Takeda, Keisuke Iida, Kazuo Nagasawa, Danzhou Yang, Yan Xu

JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY 139(22) 7533-7539 2017年6月査読有り
A Simple and Sensitive 19F NMR Approach for Studying the Interaction of RNA G-Quadruplex with Ligand Molecule and Protein

Hong-Liang Bao, Takumi Ishizuka, Ayaka Iwanami, Takanori Oyoshi, Yan Xu

ChemistrySelect 2(15) 4170-4175 2017年5月査読有り
Unusual Topological RNA Architecture with an Eight-Stranded Helical Fragment Containing A-, G-, and U-Tetrads

Chao-Da Xiao, Takumi Ishizuka, Xiao-Qing Zhu, Yue Li, Hiroshi Sugiyama, Yan Xu

JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY 139(7) 2565-2568 2017年2月査読有り
Characterization of human telomere RNA G-quadruplex structures in vitro and in living cells using 19F NMR spectroscopy.

Bao HL, Ishizuka T, Sakamoto T, Fujimoto K, Uechi T, Kenmochi N, Xu Y

Nucleic acids research 45(9) 5501-5511 2017年2月査読有り
Studying DNA g‑Quadruplex aptamer by 19F NMR

Takumi Ishizuka, Atsushi Yamashita, Yujiro Asada, Yan Xu

ACS Omega 2(12) 8843-8848 2017年査読有り

もっとみる

MISC

パラコートとジクワットの医学教育

湯川修弘, 徐岩, 柿崎英二, 石塚匠, 落合秀信

法医学の実際と研究 (58) 237-249 2015年11月

書籍等出版物

In situ hybridization法

菱川善隆, Narantsog Choijookhuu, 石塚匠, 柴田恭明, 小路武彦 (担当:共著)

日本組織細胞化学会・中西印刷（株） 2022年7月
病理と臨床 2022年臨時増刊号(40巻): がんゲノム医療時代の分子腫瘍学

菱川善隆, Narantsog Choijookhuu, 石塚匠, 柴田恭明, 小路武彦 (担当:共著, 範囲:第1部がんの分子病理学（序論）:FISH・ISH)

文光堂 2022年4月
G-Quadruplex Nucleic Acids

Takumi Ishizuka, Hong-Liang Bao, Yan Xu (担当:共著, 範囲:Chapter 26: ¹⁹F NMR Spectroscopy for the Analysis of DNA G-quadruplex Structures using ¹⁹F-labeled Nucleobase)

Springer 2019年8月23日

講演・口頭発表等

蛍光共鳴エネルギー移動（FRET)を利用したin situ hybridization法

石塚匠, Narantsog Choijookhuu, 柴田恭明, 徐岩, 小路武彦, 菱川善隆

第64回日本顕微鏡学会九州支部集会 2022年12月17日
肝再生モデルマウスを用いたグアニン四重鎖構造の機能解明

石塚匠, Narantsog Choijookhuu, 矢野公一, 池ノ上実, 山隈優, 白水慎一郎, Fidya, 田中美緒, 菱川善隆

第39回分子病理学研究会 2022年7月8日
Ce(IV)/EDTA錯体によるRNA四重鎖構造の解析

石塚匠, 徐岩

日本化学会第100春季年会日本化学会
Fluorescence imaging in cell and in vivo by bioorthogonal reaction

Takumi Ishizuka, Hong-Shan Liu, Makiko Kawaguchi, Ryuichi Nishii, Hiroaki Kataoka, Yan Xu

第46回国際核酸化学シンポジウム/日本核酸化学会第3回年会日本核酸化学会
In-cell ¹⁹F NMR : Chemical method for investigating nucleic acid structure in living cells

Takumi Ishizuka, Yan Xu

第57回日本生物物理学会年会招待有り
生体直交型反応による細胞及び生体内の蛍光イメージング

石塚匠, 劉泓汕, 徐岩

第13回バイオ関連化学シンポジウム日本化学会生体機能関連化学部会
8位修飾グアノシン誘導体によるin vivo RNAイメージング

石塚匠, 徐岩

日本化学会第99春季年会日本化学会
RNA imaging in vivo with 8-position modified guanosine derivatives

Takumi Ishizuka, Chao-Da Xiao, Pei-Yan Zhao, Ryuichi Nishii, Yan Xu

第45回国際核酸化学シンポジウム/日本核酸化学会第2回年会日本核酸化学会
テロメアバイオロジーの解明を目指す核酸化学

石塚匠

第11回ChemBioハイブリッドレクチャー東京大学招待有り
8位修飾グアノシン誘導体によるRNAイメージング

石塚匠, 肖潮達, 趙珮妍, 西井龍一, 徐岩

第12回バイオ関連化学シンポジウム日本化学会生体機能関連化学部会
Studying G-quadruplex structures by ¹⁹F NMR

Hong-Liang Bao, Takumi Ishizuka, Yan Xu

日本化学会第98春季年会日本化学会
hnRNPA1のヒトテロメアRNAへの構造特異的な結合

竹田悠馬, 劉暁, 石塚匠, 徐岩

日本化学会第98春季年会日本化学会
RNA四重鎖構造を解析する化学プローブの開発

大立目真臣, 石塚匠, 徐岩

日本化学会第98春季年会日本化学会
Chemical probing of G-quadruplex structures by modified nucleosides

Takumi Ishizuka, Yan Xu

日本化学会第98春季年会日本化学会
Investigation of the thermodynamic stability and structure of oligonucleotides containing 2’-O-methyl-8-methylguanosine by CD and NMR

Thananjeyan Balasubramaniyam, Takumi Ishizuka, Yan Xu

日本化学会第98春季年会日本化学会
四重鎖構造を解析する機能性プローブの開発

石塚匠

非ワトソン・クリック型核酸に関する九州地区セミナー日本核酸化学会招待有り
ヒトテロメアの高次構造におけるケミカルバイオロジー

石塚匠

第3回生体分析化学講演会招待有り
To investigate human telomere DNA G-quadruplexes structures by ¹⁹F NMR

Hong-Liang Bao, Takumi Ishizuka, Yan Xu

第44回国際核酸化学シンポジウム/日本核酸化学会第1回年会日本核酸化学会
Novel RNA Architecture Formed by Eight RNA Strands Containing Fourteen G- A- and U-tetrads

Chao-Da Xiao, Takumi Ishizuka, Yan Xu

第44回国際核酸化学シンポジウム/日本核酸化学会第1回年会日本核酸化学会
Chemical Probe for Studying Human Telomere RNA G-quadruplex

Takumi Ishizuka, Masaomi Otatsume, Yan Xu

第44回国際核酸化学シンポジウム/日本核酸化学会第1回年会日本核酸化学会

もっとみる

担当経験のある科目(授業)

2019年 - 現在

遺伝子工学の基礎と応用 (宮崎大学)
2021年

遺伝子工学の基礎と応用 (宮崎大学)

所属学協会

2022年11月 - 現在

日本顕微鏡学会
2021年6月 - 現在

日本解剖学会
2021年6月 - 現在

日本組織細胞化学会
2017年11月 - 現在

日本核酸化学会
2016年6月 - 現在

日本光医学・光生物学会
2006年1月 - 現在

日本化学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

細胞内RNA四重鎖を標的とする構造プローブ法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2021年4月 - 2024年3月

石塚匠
細胞内グアニン四重鎖構造を定量的に測定するin situ検出法の開発

公益財団法人中谷医工計測技術振興財団令和3年度奨励研究助成 2022年4月 - 2023年4月

石塚匠
分子結合技術を用いた新たな造影剤による革新的がんMRI画像化技術の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2020年4月 - 2023年3月

平井俊範, 東美菜子, 片岡寛章, 佐藤裕之, 徐岩, 石塚匠
肝再生モデルマウスを用いた核酸高次構造の機能解明

公益財団法人住友財団 2021年度基礎科学研究助成 2021年11月 - 2022年11月

石塚匠
分子結合技術を用いた造影剤による革新的がんCT画像化技術の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2019年4月 - 2022年3月

水谷陽一, 平井俊範, 徐岩, 石塚匠, 片岡寛章, 東美菜子
高感度蛍光in situハイブリダイゼーション法によるmicroRNA発現解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2016年4月 - 2019年3月

菱川善隆, 石塚匠, 川口真紀子, チョウジョウフナランツオツク, ピューシンウー
ヒトテロメアRNA四重鎖構造に結合するタンパク質の探索と機能解明

公益財団法人武田科学振興財団 2016年度医学系研究奨励(基礎) 2016年9月 - 2018年9月

石塚匠
特殊な四重鎖構造の解析を可能とする新規化学修飾法の開発とその応用

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2016年4月 - 2018年3月

石塚匠
第6回四重鎖核酸国際学会

公益財団法人金原一郎記念医学医療振興財団第31回研究交流助成金 2017年6月 - 2018年3月

石塚匠
ヒトテロメアRNA分子における修飾の探索

日本学術振興会科学研究費助成事業研究活動スタート支援 2013年8月 - 2015年3月

石塚匠
PNA/DNAグアニン四重鎖形成および蛍光性クリック反応の拡張と応用

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2011年 - 2013年

石塚匠
PNAを応用した遺伝子工学ツールの拡張および二本鎖DNAを認識する新規分子の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2009年 - 2010年

石塚匠

石塚匠

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

委員歴

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

メニュー

共著者の一覧