2006年 - 2009年
フタバガキ科の系統地理学的研究と産地識別のための塩基配列データベースの構築
文部科学省 科学研究費補助金(基盤研究(A)) 基盤研究(A)
- 課題番号
- 18255010
- 体系的課題番号
- JP18255010
- 担当区分
- 連携研究者
- 配分額
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- (総額)
- 42,120,000円
- (直接経費)
- 32,400,000円
- (間接経費)
- 9,720,000円
- 資金種別
- 競争的資金
東南アジアの広域に分布するShorea leprosulaとS.parvifoliaを対象に分布域広域から集団材料を採取し、S.leprosulaではマレー半島、ボルネオ島,スマトラ島、ジャワ島で28集団を収集し、合計で920個体を採取した。S.parvifoliaは同様に4地域で13集団(個体数404個体)を収集した。遺伝解析用のマーカーとしてEST-SSRマーカーを40遺伝子座で開発した。また葉緑体DNA多型のスクリーニングでは17領域を探索して、S.leprosulaでは5領域(trnD-trnT、petB intron、petL-psbE、psbJ-petA、rps16-trnK)で多型がみられ、S.parvifoliaでは4領域(petL-psbE、psbJ-petA、rpl32-trnL、trnQ-rps16)で多型が見られた。22集団のS.leprosulaを34遺伝子座のEST-SSRで解析した結果、遺伝子分化係数はFst=0.0671でボルネオ島の集団とそれ以外が明瞭に分化していた。また葉緑体DNA多型の解析結果は21のハプロタイプが検出され、Fst=0.5851で、遺伝的分化大きく、核DNA同様にボルネオ島の集団とそれ以外が明瞭に分化していた。またボルネオ島の中でも特に東南部は遺伝的多様性が高い傾向が見られた。葉緑体DNAの多型性の結果から、ボルネオ島南部...
- リンク情報
- ID情報
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- 課題番号 : 18255010
- 体系的課題番号 : JP18255010