山田剛史 (Takeshi Yamada) - マイポータル

基本情報

所属: 東京医科歯科大学統合研究機構先端医歯工学創成研究クラスター核酸・ペプチド創薬治療研究センター特任講師

学位: 博士（理学）(東京工業大学)

研究者番号: 80633263
ORCID ID: https://orcid.org/0000-0003-3275-415X
J-GLOBAL ID: 201501020337489890
researchmap会員ID: B000245407

外部リンク: https://kaken.nii.ac.jp/d/r/80633263.ja.html

研究キーワード

研究分野

経歴

2023年4月 - 現在

東京医科歯科大学, 統合研究機構先端医歯工学創成研究クラスター核酸・ペプチド創薬治療研究センター, 特任講師
2020年1月 - 2023年3月

大阪大学, 産業科学研究所, 助教
2015年7月 - 2020年1月

大阪大学, 産業科学研究所, 特任助教
2014年8月 - 2015年6月

大阪大学, 産業科学研究所, 特任研究員
2013年4月 - 2014年7月

青山学院大学, 理工学部, 助教（専任）
2012年4月 - 2013年3月

青山学院大学, 理工学部, 助手（専任）
2011年4月 - 2012年3月

東京工業大学, 生命理工学部, 非常勤研究員

学歴

2008年4月 - 2011年3月

東京工業大学, 大学院生命理工学研究科, 分子生命科学専攻
2006年4月 - 2008年3月

東京工業大学, 大学院生命理工学研究科, 分子生命科学専攻

受賞

2022年3月

手島精一記念研究賞（発明賞）, 「2'水酸基修飾リボヌクレオシド誘導体」, 東京工業大学

関根光雄, 山田剛史, 實吉尚郎, 清尾康志
2013年2月

手島精一記念研究賞博士論文賞, 「核酸医薬を指向した新規オリゴリボヌクレオチドの合成と性質」, 財団法人手島工業教育資金団

山田剛史
2010年11月

Student Oral Award, The 37th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry, ISNAC

山田剛史

論文

NMR determination of the 2:1 binding complex of naphthyridine carbamate dimer (NCD) and CGG/CGG triad in double-stranded DNA

Takeshi Yamada, Kyoko Furuita, Shuhei Sakurabayashi, Makoto Nomura, Chojiro Kojima, Kazuhiko Nakatani

Nucleic Acids Research 2022年9月12日査読有り筆頭著者
Mismatch binding ligand upregulated back-splicing reaction producing circular RNA in a cellular model

Lu Ni, Takeshi Yamada, Asako Murata, Kazuhiko Nakatani

Chemical Communications 58(22) 3629-3632 2022年2月査読有り
Chemical Probing of Thymine in the TGG/CGG Triad to Explore the Deamination of 5-Methylcytosine in the CGG Repeat

Yuki Yagi, Takeshi Yamada, Kazuhiko Nakatani

Biochemistry 59(29) 2679-2683 2020年7月28日査読有り
Assembly of ruthenium complexes on double stranded DNA using mismatch binding ligands

Lu Ni, Takeshi Yamada, Kazuhiko Nakatani

Chemical Communications 56(39) 5227-5230 2020年査読有り
Expanding chemical space of DNA-binding molecules with three base-binding units

Yuki Yagi, Haruo Aikawa, Takeshi Yamada, Kazuhiko Nakatani

Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters 28(17) 2894-2898 2018年9月査読有り
Absorption Characteristics and Quantum Yields of Singlet Oxygen Generation of Thioguanosine Derivatives

Shoma Miyata, Takeshi Yamada, Tasuku Isozaki, Hideyuki Sugimura, Yao-Zhong Xu, Tadashi Suzuki

Photochemistry and Photobiology 94(4) 677-684 2018年7月査読有り
Acid Dissociation Equilibrium and Singlet Molecular Oxygen Quantum Yield of Acetylated 6,8–Dithioguanosine in Aqueous Buffer Solution

Shoma Miyata, Mina Hoshino, Tasuku Isozaki, Takeshi Yamada, Hideyuki Sugimura, Yao Zhong Xu, Tadashi Suzuki

The Journal of Physical Chemistry B 122(11) 2912-2921 2018年3月22日査読有り
CGG repeat DNA assisted dimerization of CGG/CGG binding molecule through intermolecular disulfide formation

Takeshi Yamada, Shouta Miki, Lu Ni, Kazuhiko Nakatani

Chemical Communications 54(93) 13072-13075 2018年査読有り筆頭著者
Synthesis of Naphthyridine Carbamate Dimer (NCD) Derivatives Modified with Alkanethiol and Binding Properties of G–G Mismatch DNA

Takeshi Yamada, Shouta Miki, Anisa Ul'Husna, Akiko Michikawa, Kazuhiko Nakatani

Organic Letters 19(16) 4163-4166 2017年8月査読有り筆頭著者
ChemInform Abstract: Stereoselective Access to (Z)-α,γ-Diazido-α,β-unsaturated Esters via Lewis Acid-Mediated 1,3-Diazidation of α,α-Dimethoxy-β,γ-unsaturated Esters with Trimethylsilyl Azide.

Naomi Kishii, Saeka Negishi, Takeshi Yamada, Hideyuki Sugimura

ChemInform 46(35) no 2015年8月
Stereoselective access to (Z)-α,γ-diazido-α,β-unsaturated esters via Lewis acid-mediated 1,3-diazidation of α,α-dimethoxy-β,γ-unsaturated esters with trimethylsilyl azide

Kishii, Naomi, Negishi, Saeka, Yamada, Takeshi, Sugimura, Hideyuki

Tetrahedron Letters 56(21) 2813-2816 2015年5月査読有り
ChemInform Abstract: Stereoselective Formation of Tetrahydrofuran Rings via [3 + 2] Annulation: Total Synthesis of Plakortone L.

Hideyuki Sugimura, Shougo Sato, Kensei Tokudome, Takeshi Yamada

ChemInform 45(50) no 2014年11月
Stereoselective Formation of Tetrahydrofuran Rings via [3+2] Annulation: Total Synthesis of Plakortone L

Hideyuki Sugimura, Shougo Sato, Kensei Tokudome, Takeshi Yamada

ORGANIC LETTERS 16(12) 3384-3387 2014年6月査読有り最終著者
Synthesis and exon-skipping activity of chemically modified RNAs

Yoshiaki Masaki, Takeshi Yamada, Hisao Saneyoshi, Akihiro Ohkubo, Kohji Seio, Mitsuo Sekine

Chemical Biology of Nucleic Acids: Fundamentals and Clinical Applications 497-510 2014年1月1日
Synthesis and properties of base or sugar modified RNA derivatives

Mitsuo Sekine, Yoshiaki Masaki, Takeshi Yamada, Youdai Ishii, Keishi Yamamoto, Natsuki Okaniwa, Takeshi Kanamori, Hisashi Saneyoshi, Hirosuke Tsunoda, Akihiro Ohkubo, Kohji Seio

Collection of Czechoslovak Chemical Communications 14 167-170 2014年招待有り
Synthesis and properties of oligonucleotides modified with 2 '-O-(2-carboxyethyl)nucleotides and their carbamoyl derivatives

Takeshi Yamada, Yoshiaki Masaki, Natsuki Okaniwa, Takashi Kanamori, Akihiro Ohkubo, Hirosuke Tsunoda, Kohji Seio, Mitsuo Sekine

ORGANIC & BIOMOLECULAR CHEMISTRY 12(33) 6457-6464 2014年査読有り筆頭著者
Synthesis of 2 '-O-[2-(N-Methylcarbamoyl)ethyl]ribonucleosides Using Oxa-Michael Reaction and Chemical and Biological Properties of Oligonucleotide Derivatives Incorporating These Modified Ribonucleosides

Takeshi Yamada, Natsuki Okaniwa, Hisao Saneyoshi, Akihiro Ohkubo, Kohji Seio, Tetsuya Nagata, Yoshitsugu Aoki, Shin'ichi Takeda, Mitsuo Sekine

JOURNAL OF ORGANIC CHEMISTRY 76(9) 3042-3053 2011年5月査読有り筆頭著者
Versatile Site-Specific Conjugation of Small Molecules to siRNA Using Click Chemistry

Takeshi Yamada, Chang Geng Peng, Shigeo Matsuda, Haripriya Addepalli, K. Narayanannair Jayaprakash, Md. Rowshon Alam, Kathy Mills, Martin A. Maier, Klaus Charisse, Mitsuo Sekine, Muthiah Manoharan, Kallanthottathil G. Rajeev

JOURNAL OF ORGANIC CHEMISTRY 76(5) 1198-1211 2011年3月査読有り筆頭著者
Synthesis and biological properties of 2'-O-modified oligoribonucleotide derivatives

Takeshi Yamada, Natsuki Okaniwa, Yoshiaki Masaki, Yasuhiro Okuno, Ryuta Miyasaka, Hiroyuki Tsunoda, Akihiro Ohkubo, Kohji Seio, Tetsuya Nagata, Yoshitsugu Aoki, Shin'ichi Takeda, Mitsuo Sekine

Collection of Czechoslovak Chemical Communications 12 240-243 2011年招待有り筆頭著者

MISC

7位修飾ナフチリジンカルバメートダイマーの合成と結合特性

櫻林修平, 山田剛史, 中谷和彦

日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM) 99th 2019年
配列選択的ピリミジン塩基の酸化を指向した,ナフチリジンカルバメートダイマー誘導体の合成とその評価

八木勇樹, 山田剛史, 中谷和彦

日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM) 99th 2019年
RNA切断活性をもつミスマッチ結合性リガンドの開発

三木翔太, 三木翔太, 山田剛史, 中谷和彦

日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM) 97th 2017年
筋ジストロフィー治療を指向した塩基部修飾2′-O-MCE RNAの合成と性質

石井陽大, 正木慶昭, 山田剛史, 岡庭夏己, 永田哲也, 武田伸一, 金森功吏, 大窪章寛, 清尾康志, 関根光雄

日本化学会講演予稿集 94th(3) 2014年
立体選択的なテトラヒドロフラン環形成反応を利用したPlakortone類の全合成研究

佐藤翔吾, 豊田親宏, 山田剛史, 杉村秀幸

日本化学会講演予稿集 93rd(4) 2013年
立体選択的THF環形成反応を用いたプラコルトンL,N,Pの全合成研究

山田剛史, 佐藤翔吾, 徳留健正, 豊田親宏, 杉村秀幸

天然有機化合物討論会講演要旨集(Web) 55th 2013年
塩基部修飾を導入した2′-O-[2-(N-メチルカルバモイル)エチル]修飾核酸の合成とその性質

石井陽大, 正木慶昭, LIU Tianai, 田胡信広, 岡庭夏己, 山田剛史, 永田哲也, 武田伸一, 金森功吏, 大窪章寛, 清尾康志, 関根光雄

アンチセンスシンポジウム講演要旨集 23rd 2013年
新規2′-O-修飾RNAの開発とそのエキソン・スキッピング活性

関根光雄, 正木慶昭, 山田剛史, 實吉尚郎, 岡庭夏己, 宮坂隆太, 石井陽大, 山本恵士, 大窪章寛, 清尾康志, 青木吉嗣, 永田哲也, 武田伸一

日本RNA学会年会要旨集 15th 2013年
2′-O-[(N-メチルカルバモイル)エチル]ウリジンを組み込んだRNAオリゴマーの合成と性質

山田剛史, 岡庭夏己, 角田浩佑, 大窪章寛, 清尾康志, 関根光雄

日本化学会講演予稿集 91st(3) 2011年
2’-O-(2-カルボキシエチル)リボヌクレオシドを組み込んだ修飾RNAの合成と性質

山田剛史, 岡庭夏己, 角田浩佑, 大窪章寛, 清尾康志, 関根光雄

日本化学会講演予稿集 90th(3) 2010年
2′水酸基修飾アンチセンスオリゴヌクレオチドの合成と筋ジストロフィーを対象としたエキソンスキッピング評価

山田剛史, 岡庭夏己, 角田浩佑, 大窪章寛, 清尾康志, 関根光雄

日本RNA学会年会要旨集 12th 2010年
2′-O-MCEオリゴヌクレオチドの合成と性質

山田剛史, 岡庭夏己, 武田伸一, 永田哲也, 實吉尚郎, 大窪章寛, 清尾康志, 関根光雄

アンチセンスシンポジウム講演要旨集 20th 18 2010年
プリンヌクレオシドへの2′-O-メチルカルバモイルエチル基の導入検討

山田剛史, 角田浩佑, 大窪章寛, 清尾康志, 関根光雄

日本RNA学会年会要旨集 11th 2009年
2’末端に極性をもった官能基を導入した修飾核酸の合成と性質

山田剛史, 山田剛史, 實吉尚郎, 大窪章寛, 大窪章寛, 清尾康志, 清尾康志, 関根光雄, 関根光雄

アンチセンスシンポジウム講演要旨集 17th 2007年
2’水酸基にアミド骨格構造を導入した修飾核酸の合成と性質

山田剛史, 山田剛史, 実吉尚郎, 大窪章寛, 大窪章寛, 清尾康志, 清尾康志, 関根光雄, 関根光雄

日本RNA学会年会要旨集 9th 2007年
アクリル酸エステルを利用した核酸2’-水酸基の新規修飾法の開発

實吉尚郎, 山田剛史, 清尾康志, 関根光雄

日本化学会講演予稿集 86th(2) 2006年

書籍等出版物

Synthesis and Exon-Skipping Activity of Chemically Modified RNAs. Chemical Biology of Nucleic Acids

山田剛史 (担当:共著)

Chemical Biology of Nucleic Acids, Springer 2014年5月 (ISBN: 9783642544514)

主要な講演・口頭発表等

Investigating new methods for up-regulating the production of circular RNA using cellular models

山田剛史, 倪露, 中谷和彦

日本核酸医薬学会第８回年会 2023年7月13日
NMRを用いた15N標識ナフチリジン誘導体のリピートD N Aへの相互作用解析

山田剛史, 杉浦徳昭, 櫻林修平, 中谷和彦

日本化学会第103春季年会 2023年3月25日
Synthesis and Properties of Naphthyridine-Azaquinolone Dimer

Takeshi Yamada, Qingwen Chen, Kazuhiko Nakatani

International symposium on nucleic acid chemistry (ISNAC) 2022 2022年11月2日
135

Regulation of circRNA expression in cell via RNA binding small molecule

○Takeshi YAMADA, Lu Ni, Asako MURATA, Kazuhiko NAKATANI

IS3NA-IRT Virtual Symposium 2021 2021年8月27日
65

NMR structural analysis of naphthyridine dimer derivatives

Takeshi Yamada

2nd Indo-Japan (NCBS/instem-ISIR, Osaka Universtiy) Meeting 2020年2月17日招待有り
Structural analysis and functionalization of naphthyridine dimer derivatives bound to CGG repeats

○Takeshi Yamada, Shuhei Sakurabayashi, Kyoko Huruitab, Chojiro Kojima, Kazuhiko Nakatani

The 23rd SANKEN INTERNATIONAL SYMPOSIUM 2020年1月8日
The methylation effect for binding of dimeric 2-amino-1,8-naphthyridine derivatives to CGG/CGG triad in DNA

○Takeshi Yamada, Shuhei Sakurabayashi, Kazuhiko Nakatani

The Commemorative International Symposium of the Japan Society of Nucleic Acids Chemistry (CISNAC 2019) 2019年7月22日
57

Repeat DNA assisted dimerization of mismatch binding molecules through intermolecular disulfide formation

Takeshi Yamada, Kazuhiko Nakatani

International Symposium on Nucleic Acids Chemistry (ISNAC) 2018 2018年11月7日
37

Repeat-Assisted Dimerization of Thiol Modified Mismatch Binding Ligand

○YAMADA Takeshi, NAKATANI Kazuhiko

International Roundtable of Nucleosides, Nucleotides, and Nucleic acids (IRT) 2018 2018年8月27日
57

Thiol Modified Naphthyridine Carbamate Dimer Accumulated on CGG Repeat DNA

Takeshi Yamada, Shouta Miki, Kazuhiko Nakatani

International Symposium on Nucleic Acids Chemistry (ISNAC) 2017 2017年11月17日
立体選択的 THF 環形成反応を用いたプラコルトン L, N, P の全合成研究

山田剛史, 佐藤翔吾, 徳留健正, 豊田親宏, 杉村秀幸

第５５回天然有機化合物討論会 2013年9月18日
2'-O-MCEオリゴヌクレオチドの合成と性質

山田剛史, 岡庭夏己, 武田伸一, 永田哲也, 實吉尚郎, 大窪章寛, 清尾康志, 関根光雄

第20回アンチセンスシンポジウム 2010年12月2日
Synthesis and Properties of 2'-O-[2-(N-methyl) carbamoyl]ethyl-RNAs

Yamada, T, Okaniwa, N, Saneyoshi, H, Ohkubo, A, Seio, K, Nagata, T, Takeda, S, Sekine, M

The 37th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry 2010 2010年11月10日
Conjugation strategies for RNAs using copper-catalyzed click chemistry

山田剛史

240th ACS National Meeting 2010年8月22日
2′水酸基修飾アンチセンスオリゴヌクレオチドの合成と筋ジストロフィーを対象としたエキソンスキッピング評価

山田剛史

第12回日本RNA学会年会 2010年7月23日
CONJUGATION STRATEGIES FOR RNAS USING CLICK CHEMISTRY

Takeshi Yamada, Paul Peng, Shigeo Matsuda, Haripriya, Jay Nair, Muthusamy Jayaraman, David Butler, Rajendra K. Pandey, Martin Maier, Klaus Charisse, Kathy Mills, Rajeev Kallanthottathil, Muthiah Manoharan

Joint Symposium of the 5th Annual Meeting of the Oligonucleotide Therapeutics Society and the 19th Antisense Symposium 2009年11月4日
プリンヌクレオシドへの2'-O-メチルカルバモイルエチル基の導入検討

山田剛史

第11回日本RNA学会年会 2009年7月27日
2’水酸基にアミド骨格構造を導入した修飾核酸の合成と性質

山田剛史

第9回日本RNA学会年会 2007年7月29日
2'末端に極性をもった官能基を導入した修飾核酸の合成と性質

山田剛史

第17回アンチセンスシンポジウム 2007年7月29日
（N-メチルカルバモイル）エチル基を2'水酸基にもつ修飾RNAの合成と性質

山田剛史

日本化学会第87春季年会 2007年3月25日
アクリル酸エステルを用いた核酸2'-水酸基の新規修飾法の開発

實吉尚郎, 山田剛史, 清尾康志, 関根光雄

日本化学会第86春季年会 2006年3月29日

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担当経験のある科目(授業)

2021年4月 - 2023年3月

学問への扉（産業と科学〜核酸科学の基礎と応用） (大阪大学)
2020年4月 - 2023年3月

ゲノム化学 (大阪大学)
2013年4月 - 2014年7月

化学・生命科学輪講 (青山学院大学)
2012年4月 - 2014年7月

有機化学実験 (青山学院大学)
2012年4月 - 2014年7月

化学基礎実験 (青山学院大学)

所属学協会

2023年4月 - 現在

日本核酸医薬学会
2006年1月 - 現在

日本化学会
2006年4月

日本核酸化学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

ミスマッチ結合分子の異常伸長リピート配列への結合経路と短縮誘導効果の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 基盤研究(A) 2022年4月 - 2025年3月

中谷和彦
環状RNAの生合成を促進するアンチセンスオリゴの開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2022年4月 - 2025年3月

山田剛史
異常伸長したリピートヘアピン上で自発的にオリゴマー化する低分子の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2019年4月 - 2022年3月

山田剛史
過剰伸長RNAリピートを選択的に加水分解する低分子の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 若手研究(B) 2017年4月 - 2020年3月

山田剛史
リピート結合分子をプローブとしたトリヌクレオチドリピート病の化学生物学研究

日本学術振興会科学研究費助成事業特別推進研究特別推進研究 2014年 - 2019年

中谷和彦, 堂野主税, 武井史恵, 村田亜沙子, 中森雅之, 相川春夫, 山田剛史, 柴田知範, 中森雅之, 高橋正紀, 永井健治
CAGリピートの過伸長を抑制する低分子リガンドの創成

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 若手研究(B) 2015年4月 - 2018年3月

山田剛史

産業財産権

特願2023-14938 一本鎖核酸及びその用途

山田剛史, Ni Lu, 中谷和彦
特表US 8962580 Chemical modifications of monomers and oligonucleotides with cycloaddition

Muthiah Manoharan, Kallanthottathil G. Rajeev, Takeshi Yamada, David Butler, Narayanannair, K. Jayaprakash, Muthusamy Jayaraman, Shigeo Matsuda, Rajendra K. Pandey, Chang Geng Peng
特許第5194256号 2'水酸基リボヌクレオシド誘導体

SEKINE Mitsuo, YAMADA Takeshi, SANEYOSHI Hisao, SEIO Kohji
WO2007-102581 2'-hydroxyl-modified ribonucleoside derivative

SEKINE Mitsuo, YAMADA Takeshi, SANEYOSHI Hisao, SEIO Kohji

山田剛史

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研究分野

経歴

学歴

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

主要な講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

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